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苹果LIM基因家族生物信息学及表达分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
【目的】在苹果全基因组中鉴定LIM,通过分析启动子作用元件、保守结构域、基因聚类、基因结构、染色体定位以及组织表达模式,为研究和利用苹果LIM奠定基础。【方法】利用苹果基因组数据库GDR和PLAZA,获得苹果LIM家族成员并进行编号。苹果LIM蛋白氨基酸序列的基本信息通过ExPASy Proteomics Server进行预测,利用Cell-PLoc进行亚细胞定位预测,利用CD-Search Tool进行LIM结构域分析,采用MEGA 7软件构建进化树,采用GSDS绘制基因结构,并利用TBtools软件对鉴定得到的MdLIM进行染色体定位,通过实时荧光定量RT-PCR对MdLIM的组织表达进行分析,并利用SPSS 18.0软件分析差异显著性。【结果】共鉴定得到11个苹果LIM家族成员,这些MdLIM蛋白包含96—222个不等的氨基酸残基,等电点分布在6.14—9.01。亚细胞定位结果显示,MdLIM蛋白在细胞核中均有分布。启动子作用元件分析表明,11个MdLIM启动子上分布有响应激素、环境适应性和逆境诱导的元件。蛋白保守结构域分析表明,11个MdLIM蛋白中除MdLIM8具有单LIM结构域外,其余10个均具有双LIM结构域。根据聚类分析结果可将MdLIM分为4组。染色体定位结果显示,MdLIM分布在苹果17条染色体中的7条,且MdLIM在7条染色体上的分布不均匀。花、叶、果皮和茎中的实时荧光定量RT-PCR结果显示,4个组织中均能检测到MdLIM的表达,且表达量具有一定差异。【结论】苹果LIM基因家族包括11个成员,进化上可分为4组,11个基因分布于7条染色体上,在不同组织中的表达具有多样性和特异性。  相似文献   
2.
【目的】筛选防止晚熟柑橘冬季落果的新药剂。【方法】以‘塔罗科’血橙和‘清见’橘橙为供试品种,以2,4-D为药剂对照(TCK)、以只喷咪鲜胺和乳化剂为空白对照(CK),以前期试验初步筛选出的2甲4氯钠(T1)、2甲4氯二甲铵盐(T2)、2甲4氯苯氧乙酸(T3)为药剂处理,在冬季对试验树果实进行喷布,调查落果率,成熟采收时分析果实药剂残留及品质。【结果】与空白对照落果率(‘塔罗科’血橙为34.65%、‘清见’橘橙为82.52%)相比,4种药剂均能显著降低落果率,虽然T1、T2、T3落果率高于2,4-D,但它们之间无显著差异;无论是‘塔罗科’血橙还是‘清见’橘橙,4种药剂处理后果肉中的药剂残留量均远远低于果皮,T1、T2和T3在果肉中的药剂残留量明显低于2,4-D,且所有处理果皮和果肉的药剂残留量均在国家规定范围之内。各药剂处理间的果实品质多数指标无显著差异。【结论】T1、T2、T3有望作为2,4-D的替补药剂用于防止晚熟柑橘冬季落果,且农药残留更低。  相似文献   
3.
【目的】探究芽变品种‘龙回红’脐橙生物学特性、叶绿素含量、光合作用参数、营养元素、果实品质和产量等与其母本‘纽荷尔’脐橙的差异。【方法】在同一果园相同栽培管理条件下,对2个品种的植株生长特性、绝对叶绿素含量、光合作用参数、叶片营养元素含量和果实品质进行了对比研究。【结果】和‘纽荷尔’脐橙相比,‘龙回红’脐橙干周、树体高度和冠径差异较小,但春梢、夏梢和秋梢叶片厚度、长度和宽度均差异较大;‘龙回红’春梢、夏梢和秋梢叶片绝对叶绿素含量分别比‘纽荷尔’脐橙高37.7%、27.6%和16.5%,差异达显著水平。其中‘龙回红’脐橙春梢叶片的净光合速率(P_n)、气孔导度(G_s)、胞间CO_2浓度(C_i)和蒸腾速率(T_r)分别比‘纽荷尔’脐橙高33.4%、55.6%、20.9%和33.1%,大多数参数间的差异达显著水平。‘龙回红’脐橙叶片营养元素除P和Z_n的含量显著低于‘纽荷尔’脐橙外,其他元素的含量均显著高于‘纽荷尔’脐橙;果实单果质量、纵径、横径、果形指数、果皮厚度、色差a/b值和固酸比显著高于‘纽荷尔’脐橙,而可滴定酸含量显著低于‘纽荷尔’脐橙。‘龙回红’脐橙单产比‘纽荷尔’脐橙高20%左右,且大多数果实品质指标优于‘纽荷尔’脐橙,特别是在果皮颜色和果型方面,优质果率明显提高。【结论】‘龙回红’脐橙是‘纽荷尔’脐橙的优良变异品种,具有很好的推广价值。  相似文献   
4.
以7个柑桔砧木盆栽实生苗为试材,对其根颈粗度、主根长度、侧根长度和植株高度进行调查研究。结果表明:不同品种的柑桔砧木,其根颈粗度、主根长度、侧根长度和植株高度差异较大,根颈粗度依次为:资阳香橙>卡里佐枳橙>宜昌橙>枸头橙>枳>红桔>印度酸桔;主根长度依次为:资阳香橙>卡里佐枳橙>枸头橙>宜昌橙>红桔>印度酸桔>枳;侧根长度依次为:资阳香橙>红桔>宜昌橙>卡里佐枳橙>枸头橙>枳>印度酸桔,植株平均高度依次为:资阳香橙>卡里佐枳橙>枳>宜昌橙>枸头橙>红桔>印度酸桔。相比较而言,资阳香橙和卡里佐枳橙生长势较好,而枳和印度酸桔生长势较弱。  相似文献   
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