Multi-parameter prediction of HLA class Ⅰ restricted cytotoxic T lymphocyte epitopes for human proliferating cell nuclear antigen

Objective To predict the HLA class Ⅰ restricted cytotoxic T lymphocyte epitopes for human proliferating cell nuclear antigen (PCNA). Methods By using 3 epitope prediction databases which including MHC binder ( BIMAS and SYFPEITHI databases) and proteasome cutting site ( PAProC databases), the epitopes of PCNA were predicted by analyzing several parameters and methods. Results After comprehensive analysis,we have obtained two possible HLA-A0201 restricted CTL epitopes SMSAD-VPLV (228-236, score 447 633. 595 ) and LINEACWDI ( 22-28, score 127 966.779);two HLA-A24 re-stricted CTL epitopos DYEMKLMDL ( 113-121, score 563 994.9 ) and EFARICRDL ( 143-151, score 40 540.7);two HLA-A1101 restricted CTL epitopes LTSMSKILK (72-80, score 1334. 2680 ) and DVPLV-VEYK (232-240,score 736.9236). Conclusion The multi-parameter epitope prediction method is feasi-ble for cytotoxic T lymphocyte epitope prediction.     

乳腺癌前哨淋巴结活检的临床意义

目的 评价应用蓝染料示踪剂识别乳腺癌前哨淋巴结（sentinel lymph node,SLN)的可行性和SLN预测腋窝淋巴结（axillary lymph node,ALN)转移的准确性。方法 应用专利蓝对42例临床腋窝淋巴结阴性的乳腺癌患者进行SLN定位和活检术。结果 37例找到SLN，SLN检出率88.1%，SLN的成功定位与患者的年龄有关。SLN预测ALN状态的准确率为93.8%，假阴性2例。结论 蓝染料示踪法定位乳腺癌SLN是成功率较高的方法，且操作简单，花费少，SLN活检能够准确预测腋窝淋巴结的转移状况，在将来治疗腋淋巴结阴性的乳腺癌中，这一技术可以免除患者接受不必要的腋淋巴结清扫术。     

三氧化二砷治疗急性早幼粒细胞性白血病研究进展

砷是一种广泛分布于自然界的非金属元素 ,在地表元素构成中居第 2 0位。自然界存在的砷通常以化合物的形式存在。常见的砷化合物有三氧化二砷 (As2 O3 ,俗称砒霜 ) ,雄黄 (As2 S2 )和雌黄 (As2 S3 )等。元素砷几乎无毒。将元素状态的砷作为一种强壮剂 ,服用可以强身壮体御寒。微量的砷化合物对人体也是无害的。自古以来 ,一些药物和美容化妆品中都含有适量的砷。但是 ,一旦人体摄入过量砷化合物 ,尤其是三价砷化合物 ,便会导致砷中毒。急性砷中毒会严重损害胃肠道、呼吸、神经系统等 ,严重者可出现昏迷、呼吸困难、心力衰竭甚至死亡。慢…     

基于TCGA SpliceSeq数据库可变剪接事件构建结肠癌患者预后风险模型

目的通过全基因组分析构建预后风险模型,预测结肠癌(COAD)患者预后。方法从癌症基因组计划(TCGA)数据库中下载COAD患者RNA-seq数据和临床信息;从TCGA SpliceSeq数据库下载7种类型的可变剪接事件;剪接因子(SF)数据从SpliceAid 2数据库中下载。用单因素Cox回归分析确定预后相关可变剪接事件(PASE),采用Lasso回归分析筛选变量,多因素Cox回归分析用于计算风险值并构建风险模型。用Cytoscape Reactome FI插件构建互作网络,寻找核心节点;用基因本体(GO)富集和KEGG通路进行基因功能注释和通路分析,Kaplan-Meier和受试者工作特征(ROC)曲线用于PASE风险模型的评估;用SF与其他基因的PASE构建预后相关互作网络。结果398例COAD患者中共有9085个基因发生了35391次可变剪接事件,有1811个基因发生了2015次PASE。由8个PASE构成的预后风险模型中,以0.919作为最佳临界值将患者分为高风险组和低风险组,2组间比较差异有统计学意义(P<0.001),ROC曲线下面积是0.860(1年生存率)。在单因素Cox回归分析中,患者肿瘤浸润、淋巴结转移、远处转移、临床分期、预后风险模型都与患者总体生存时间呈显著负相关(P<0.001)。经过多因素调整后,预后风险模型依然与患者总体生存时间呈显著负相关(P<0.001)。预后风险模型中,8个PASE与其对应基因mRNA的表达量无相关性(P>0.05)。结论通过TCGA-COAD全基因组分析了PASE对预后的影响,构建了可用于预测COAD预后风险模型。     

珍惜荣誉继往开来

期待中,充满希望与活力的2014年正向我们款款走来;暮然间,业界已迎来《中国防痨杂志》创刊80周年华诞!回顾2013年,《中国防痨杂志》在中国防痨协会的领导和全国同道的支持下,取得了骄人的业绩。主要工作有：（1）依靠和发动编委组织刊出了具有学术指导意义的高水平重点号5期。     

面对机遇 乘胜前进

充满丰收喜悦的金猪之年即将过去,我们将满怀憧憬迈进玉鼠新年。2019年是本刊胜利完成中国科协“学术创新引领项目”之年,在组织具有学术导向的高水平专题重点号、专题学术会议方面,以及编辑委员会与编辑部建设方面都取得了引以为傲的成绩。2019年本刊共计刊出了12个高水平的专题学术重点号,同时刊出了4个专家共识,分别是《学校结核病疫情流行病学调查和现场处置专家共识》《结核分枝杆菌耐药性检测专家共识》《耐药脊柱结核临床诊疗专家共识》《耐药结核病化疗过程中药品不良反应处理的专家共识》,在业界引起了巨大反响,彰显了我刊的学术导向与引领作用!     

翼状胬肉发病机制的研究进展

翼状胬肉是常见的眼表疾病，其病因和发病机制目前仍未明确。国内外诸多学者对翼状胬肉的发病机制作了深入的研究，本文就其发病机制的研究新进展作一综述。     

甲状腺癌颈淋巴结清扫术后乳糜漏的防治（附19例报道）

目的 探讨临床上更加有效地预防和治疗颈乳糜漏的方法 .方法 我科1988～2008年期间共收治593例行甲状腺癌颈淋巴结清扫术的患者,对术后出现乳糜漏的患者的临床资料进行总结分析.结果 共出现颈乳糜漏19例,占3.2%,其中17例采用持续负压吸引加局部加压包扎的保守治疗方法 治愈,2例采用淋巴管缝扎方法 治愈.结论 持续负压吸引加局部加压包扎是治疗甲状腺癌颈淋巴结清扫术后乳糜漏的主要治疗方法 ,对于引流量较大、持续时间较长的病例应采用手术治疗的方法 .