α干扰素抗病毒相关全基因组表达谱的生物信息学分析及其对新型冠状病毒肺炎潜在药物研究的意义

目的通过分析α干扰素抗病毒相关全基因组表达谱,探索其对新型冠状病毒肺炎的潜在治疗意义。方法应用R语言对来自基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)的α干扰素相关的全基因组表达谱开展差异分析、富集分析、蛋白互作分析,再应用自主研发的表观精准治疗预测平台（epigenomic precision medicine prediction platform,EpiMed）,寻找与α干扰素调控基因表达谱呈负相关的疾病类型,以及呈正相关的药物。结果α干扰素对基因组表达谱影响复杂,其调控的核心基因有OAS1、MX1、OASL、ISG15、IST1、IRF7等,参与病毒生命周期的负调控、B细胞受体信号通路、肝炎、双链RNA绑定、人类免疫缺陷病毒感染,以及JAK-STAT信号通路等。进一步分析,α干扰素调控的基因组表达谱与社区获得性肺炎和脓毒症等感染性疾病呈高度负相关,而与利托那韦、利巴韦林、奈韦拉平、氟伐他汀呈高度正相关。结论基于α干扰素抗病毒相关基因组表达谱的分析对于探索新型冠状病毒肺炎潜在治疗药物具有一定的借鉴意义。     

从"肾主生殖"角度评价腺嘌呤与氢化可的松诱导的肾阳虚模型

目的从“肾主生殖”角度，比较腺嘌呤诱导与氢化可的松诱导的SD大鼠肾阳虚模型的优劣，从而得到在形态学及性腺指标方面更符合中医“肾阳虚”证的动物模型，以供科研、教学使用。方法雄性SD大鼠100只，随机分成正常组、腺嘌呤组及氢化可的松低、中、高剂量组，每组20只。造模4周后通过HE染色，观察模型大鼠睾丸、精囊、前列腺、肾上腺、组织形态变化；放免法检测大鼠睾酮、雌二醇的改变情况。结果腺嘌呤制作的SD大鼠肾阳虚证动物模型在肾上腺、前列腺、精囊、睾丸组织形态改变及睾酮、雌二醇等性腺指标的变化较氢化可的松诱导组明显。结论腺嘌呤诱导的肾阳虚证SD大鼠模型在形态学与性腺指标方面更符合中医肾阳虚形态学表现。     

基于MEDLINE数据库挖掘高尿酸血症的中医药研究

正原发性高尿酸血症(hyperuricemia)是指在排除其他疾病的基础上,由于嘌呤代谢紊乱和(或)尿酸排泄障碍所致血尿酸增高,细胞外液尿酸盐呈超饱和的状态。37℃时,血清尿酸的饱和浓度约为416μmol/L,高于此值即为高尿酸血症~[1]。超高蛋白膳食是引起嘌呤代谢紊乱的重要原因,过量糖、脂肪、蛋白质、盐的摄入及大量饮酒与患病率增加有重要关系~[2]。近年来,随着生活水平的提高,饮食结构的变化,蛋白质摄入大量增     

冠状病毒感染相关心肌损伤机制的组学分析及治疗药物的预测

目的研究冠状病毒感染相关心肌损伤机制并预测可能有效的治疗药物。方法在基因表达数据库检索并筛选得到GSE59185数据集,根据不同的亚型分为wt组、ΔE组、Δ3组、Δ5组和对照组。用R语言Limma程序包对各组进行差异表达基因分析,将各组上调、下调表达基因分别取交集,作为共同差异表达基因,在DAVID数据库进行基因本体学(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用自主研发的表观精准治疗预测平台(EpiMed)进行治疗药物预测。用STRING数据库对共同差异表达基因构建蛋白质互作网络并筛选核心基因。结果各组差异表达基因分析,共交集上调基因191个,下调基因18个,共同差异表达基因共209个。GO富集分析发现,共同差异基因主要富集在病毒反应、病毒防御反应、Ⅰ型干扰素反应、γ干扰素调节、γ干扰素介导的信号通路、先天免疫反应调节等;KEGG通路富集主要与细胞因子与受体相互作用、病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体相互作用、TNF、Toll样受体、缺氧诱导因子1及白细胞介素17信号通路等有关。通过EpiMed预测的药物主要为白藜芦醇、利托那韦、维甲酸、连翘、鱼腥草等。网络分析筛选得到干扰素调节因子7、干扰素刺激基因15、抗粘液病毒基因1、β型蛋白酶体亚基8、干扰素调节因子9、 2′,5′-寡聚腺苷酸合成酶(OAS)1、OAS2、OAS3、含基本S腺苷蛋氨酸域2、2′,5′-寡聚腺苷酸合成酶样等核心基因。结论多个炎症通路的异常活化可能是冠状病毒感染后患者发生心肌损伤的原因。白藜芦醇、利托那韦、维甲酸、连翘、鱼腥草可能对此具有治疗作用。     

肾阳虚证的研究进展

中医认为肾为脏腑之本，是机体阴阳消长之枢纽，因此肾阳虚证的本质一直是研究重点。自20世纪80年代以来，许多学者进行了肾阳虚证的现代物质基础研究，并深入到神经生物学、亚细胞学、细胞分子免疫学、基因组学、蛋白质组学、代谢组学等领域，同时亦创立了多种肾阳虚证的造模方法，为中医基础理论的现代科学技术研究提供了有益的尝试。     

SARS病毒感染相关免疫损伤分子机制和干预药物的生物信息学预测及其对COVID-19的意义

目的:通过对SARS病毒转录组数据进行临床生物信息学分析,探讨免疫损伤组学机制,预测针对性治疗药物,并为COVID-19的临床治疗提供参考。方法:收集公共基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中的SARS病毒转录组数据并筛选差异基因,应用富集分析、蛋白质相互作用分析探讨SARS病毒感染相关免疫损伤机制,并应用表观精准治疗平台预测潜在治疗药物。结果:SARS病毒感染相关免疫损伤机制复杂,包括通过Toll样受体等信号通路影响免疫细胞的功能、通过Th17信号通路诱导血浆细胞因子水平升高,以及通过IL-6、NF-κB、TNF等分子生成自身抗体介导自身免疫应答等。川穹、益赛普等药物可能对SARS病毒感染相关免疫损伤具有治疗作用。结论:SARS病毒能够引起大量免疫相关分子及信号通路的异常,川穹、益赛普等药物可能对SARS病毒感染相关免疫损伤具有治疗作用。本研究可为COVID-19的临床治疗提供参考。     

穴位埋线对胆囊结石缓解期合并胆囊收缩功能不全患者胆囊收缩功能的影响

目的:观察穴位埋线对胆囊结石缓解期合并胆囊收缩功能不全患者胆囊收缩功能的影响。方法:采用实效性临床试验设计,将70例胆囊结石缓解期合并胆囊收缩功能不全患者按照本人意愿分为治疗组、对照组,每组35例。对照组予牛磺熊去氧胆酸治疗,治疗组在此基础上联合穴位埋线疗法(主穴为:右侧日月、胆俞、阳陵泉),两组疗程均为8周。观察胆囊排空指数(GBEF%)及中医证候疗效,比较中医证候积分变化情况,并进行安全性评价。结果:①试验过程中治疗组脱落2例,对照组脱落5例,最终完成试验者63例,其中治疗组33例、对照组30例。②治疗组GBEF%有效率为63.64%、对照组为36.67%,治疗组有效率优于对照组(P0.05);治疗组中医证候疗效总有效率为57.58%、对照组为33.33%,治疗组有效率优于对照组(P0.05)。③治疗后,治疗组右上腹痛、右上腹压痛、上腹饱胀、大便情况评分及中医证候总积分较治疗前均显著降低(P0.05),对照组右上腹痛、右上腹部压痛、上腹饱胀评分及中医证候总积分较治疗前降低(P0.05);治疗后,治疗组大便情况评分明显低于对照组(P0.05)。④两组均未出现明显不良反应。结论:穴位埋线可有效改善胆囊结石缓解期合并胆囊收缩功能不全患者的胆囊收缩功能;与牛磺熊去氧胆酸联用,有利于提高临床疗效并协同改善患者的临床症状,且安全性好。     

哮喘与中医体质关联性研究的系统评价与Meta分析

目的 系统评价哮喘与中医体质的关联性.方法 通过对中国生物医学文献数据库(Si-noMed)、中国知网(CNKI)、万方数据库(WanFang Database)、重庆维普中文科技期刊数据库(VIP)、PubMed及Web of Science数据库进行检索,搜集关于哮喘与中医体质关联性的横断面研究及病例对照研究等,检...     

高尿酸血症肾损害大鼠模型的建立

目的考察3种不同的造模方法,以建立高尿酸血症肾损害大鼠模型,确定建立高尿酸血症肾损害大鼠模型的有效实验方法。方法选用清洁级雄性SD大鼠24只,体质量（200±20）g,随机分为正常组、模型Ⅰ组、模型Ⅱ组、模型Ⅲ组,每组6只。正常组实验过程中正常饲养,模型Ⅰ组根据大鼠体质量以腺嘌呤(0.1 g/kg·d^-1)与氧嗪酸钾(1.5g/kg·d^-1)混悬液灌胃给药;模型Ⅱ组根据大鼠体质量以腺嘌呤(0.15 g/kg·d^-1)与氧嗪酸钾(0.6g/kg·d^-1)的混悬液,每日腹腔注射两次;模型Ⅲ组大鼠以腺嘌呤（20mg/d）和乙胺丁醇（50mg/d）的混悬液灌胃给药。连续给药28 d,检测第7天、第14天、第21天、第28天各组大鼠的血清尿酸（serum uric acid,SUA）、肌酐（creatinine,CRE）、尿素氮（urea nitrogen,BUN）,28 d后留取大鼠肾脏标本行H-E及MASSON染色,观察肾脏病理变化情况。结果模型Ⅰ组大鼠第7天、第14天、第21天及第28天的血尿酸较正常组升高（P<0.05）,血肌酐、尿素氮在第14天、第21天及第28天较正常组均升高（P<0.05）;模型Ⅱ组大鼠仅第14天及第28天的血尿酸值较正常组有所升高（P<0.05）,其血肌酐、尿素氮在第7天、第14天、第21天及第28天较正常组升高（P<0.05）;模型Ⅲ组大鼠仅第7 d的血尿酸值较正常组升高（P<0.05）,其余时间点无明显差异,其血肌酐在第7天、第14天、第21天及第28天较正常组升高（P<0.01）,血尿素氮在第14天、第21天及第28天较正常组升高（P<0.01）;肾组织病理结果提示各模型组可见明显肾小管和间质损伤,其中模型Ⅲ组肾脏组织结构存在广泛性损害。结论腺嘌呤和氧嗪酸钾联合灌胃的造模方法可以成功地制备出尿酸稳定升高、类似于人类尿酸性肾病的高尿酸血症肾损害大鼠模型。     

西多福韦治疗新型冠状病毒肺炎的组学预测分析

目的 探讨西多福韦治疗新型冠状病毒肺炎的组学机制.方法 应用R语言对基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中西多福韦相关的全基因组表达谱开展差异分析、富集分析、蛋白互作网络分析,应用自主研发的表观精准治疗预测平台(epigenomic precision medicine prediction platform,EpiMed)筛选与西多福韦关联的疾病和药物.结果 检索GEO并筛选得到GSE39293数据集,差异表达分析共筛选出585个差异表达基因,其中上调差异表达基因494个,下调差异表达基因91个.基因本体论富集条目共53条,主要与干扰病毒复制、I型干扰素作用、免疫调节等有关.京都基因与基因组百科全书富集条目共244条,主要与抗病毒、抗凋亡、免疫调节、凝血系统相关信号通路等有关.蛋白互作网络分析筛选出CDK1、CCNA2、CDC6、KIF11、MAD2L1、NDC80、RRM2、ASPM、NCAPG、CENPU为排名前10位的核心基因.EpiMed预测西多福韦调控的基因组表达谱与肺炎、严重急性呼吸综合征等疾病呈负相关,与利巴韦林、α-干扰素等药物呈正相关,与衣霉素、诺氟沙星等抗生素呈负相关.结论 西多福韦能够对机体全基因组产生影响,可能通过诱导感染细胞凋亡降低体内严重急性呼吸综合征冠状病毒-2数量,通过免疫调节、凝血系统相关信号通路等对机体免疫失调及重型患者出现的凝血功能异常进行调节,达到治疗新型冠状病毒肺炎的作用.