血清神经特异性烯醇化酶与脑胶质瘤患者术后脑损伤的相关性

目的探讨脑胶质瘤患者手术前、后血清神经特异性烯醇化酶(neuron-specific enolase, NSE)水平与脑组织损伤的关系。方法 48例经手术治疗的脑胶质瘤患者,于术前1 d及术后1、3、7 d分别检测血清NSE水平,并进行手术前、后比较;收集手术前、后影像学资料,采用Pearson或Spearman相关分析血清NSE水平与肿瘤体积、脑组织水肿体积及术后6个月KPS功能评分的相关性。结果术后1、3、7 d时患者血清NSE水平[(15.07±2.34)、(18.20±4.31)、(15.20±3.94)μg/L]均高于术前[(12.98±2.61)μg/L](P<0.05),术后3 d时高于术后1 d时(P<0.05),术后7 d与术后1 d比较差异无统计学意义(P>0.05);不同部位、不同级别脑胶质瘤患者手术前、后血清NSE水平比较差异均无统计学意义(P>0.05);术前血清NSE水平与瘤周水肿体积呈正相关(r=0.757,P<0.001),与肿瘤体积无相关性(r=0.190,P=0.195);术后3 d血清NSE水平与术后3 d脑水肿体积呈正相关(r=0.553,P=0.002),术后7 d血清NSE水平与术后6个月KPS评分(80分)呈负相关性(r=-0.821,P<0.001)。结论血清NSE水平可辅助评估脑胶质瘤手术患者的脑损伤程度变化。     

基于生物信息学建立室管膜瘤TGF-β通路相关基因预后风险模型及其应用

目的:基于生物信息学方法建立室管膜瘤中TGF-β信号通路相关基因的预后预测模型。方法:利用无监督聚类算法区分室管膜瘤的不同分子亚型;利用基因集变异分析(gene set variation analysis, GSVA)计算不同室管膜瘤分子亚型中TGF-β信号通路相关评分;利用乘积极限法(Kaplan-Meier analysis, KM)计算不同室管膜瘤分子亚型中患者的生存率;利用线性模型算法(linear models for microarray data, limma)分析不同室管膜瘤分子亚型间的差异基因;利用最小绝对收缩和选择算子算法(least absolute shrinkage and selection operator, LASSO)和COX比例风险模型(COX proportional-hazards model)构建室管膜瘤中TGF-β信号通路相关基因的预后预测模型;利用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve, ROC)评估预后预测模型的性能;利用皮尔逊相关性分析考察关键基因的相关性;利用qRT-PCR...     

长链非编码RNA LINC02447在胶质瘤发展及预后中的作用研究

目的 探讨长链非编码RNA LINC02447在胶质瘤发展及预后中的作用。方法 通过GEO数据集筛选差异表达且与预后相关的lncRNA;利用MTT实验、克隆形成实验、体内抑瘤实验以及免疫组化来检测GBM细胞系的生物学功能;通过数据库LncACTdb预测lncRNA的亚细胞定位,利用数据库NPInter及catRAPID预测lncRNA与其潜在结合对象的结合情况;Western blot检测细胞中ZBTB18的表达。结果GEO数据分析显示LINC02447在GBM中显著低表达,且与患者的不良预后相关;构建了过表达LINC02447的细胞系,结果显示过表达细胞较对照细胞增殖能力(P<0.01)和克隆形成能力(P<0.01)显著降低,体内肿瘤生长减慢(P<0.01),瘤组织中Ki67表达水平降低(P<0.01);数据库结果显示LINC02447定位于细胞核,与ZBTB18具有潜在的结合能力,并且它们在GBM中的表达呈负相关(P <0.05);LINC02447过表达细胞系中ZBTB18的表达降低(P <0.01),同时构建的ZBTB18敲低细胞系较对照细胞...