中国部分家鸭和野鸭遗传多样性及亲缘关系的微卫星分析

利用前期双重抑制PCR技术分离得到的10个鸭微卫星标记,分析了13个鸭品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的Nei氏遗传距离(DA)等遗传参数,并用类平均法进行了聚类分析。结果表明:10个微卫星座位中有7个具有多态,可作为有效的遗传标记用于各品种的遗传多样性和系统发生关系分析。7个微卫星座位在13个品种中共检测到51个等位基因;每个座位的等位基因数为5～12个,平均多态信息含量为0.402 3～0.601 5;各群体平均杂合度为0.407 0～0.707 0,说明各群体的遗传多样性较为丰富。采用DA/UPGMA法聚类分析,13个鸭群体聚为3类:Ⅰ类为8个家鸭品种和樱桃谷鸭;Ⅱ类为野鸭类;Ⅲ类为番鸭独成一类。结果提示:各类鸭群体间的聚类关系与其来源、分化、地理分布基本一致,而且绿头野鸭和斑嘴鸭在家鸭品种形成过程中均作出了贡献。     

苏太猪CAST基因多态性与肉质性状的相关性研究

采用PCR-RFLP方法对72头苏太猪的钙蛋白酶抑制蛋白(calpastatin,CAST)基因遗传多态性与肉质性状的相关性分析。对CAST基因第6内含子上MspⅠ、HinfⅠ、RsaⅠ三种酶切位点进行检测,结果表明:CAST基因第6内含子上,MspⅠ酶切位点的3种基因型间在肌肉的嫩度、pH值、系水力水平指标上均差异显著(P0.05);HinfⅠ酶切位点的3种基因型间在肌内脂含量指标上差异显著(P0.05),在肌肉嫩度上差异极显著(P0.01)。RsaⅠ酶切位点上也发现了3种基因型,但各基因型的不同性状间差异不显著(P0.05)。     

猪IGF2 Intron3 G3072A突变及其在背最长肌中差异表达

采用错配PCR-RFLP法检测胰岛素样生长因子2基因(IGF2)内含子3的G3072A位点变异对长×大杂交猪肌肉生长和脂肪沉积的影响,并采用实时荧光定量PCR法分析该变异对出生后的长×大杂交后代猪背最长肌中IGF2mRNA表达发育性变化的影响。结果显示:IGF2内含子3的G3072A位点变异(G→A)对猪背膘厚和活体瘦肉率均存在显著或极显著影响,表现为遗传父本A等位基因的个体能够增加活体瘦肉率和减少背膘厚;在长×大杂交后代的背最长肌中,IGF2mRNA的表达量在遗传父本A等位基因的个体中显著高于遗传父本G等位基因的个体,在42和180日龄时达显著水平(P<0.05),而在70、90和120日龄时达极显著水平(P<0.01)。     

海兰褐壳蛋鸡小黄卵泡颗粒细胞全长转录组测序分析

【目的】获取鸡小黄卵泡颗粒细胞(granulosa cells of small yellow follicle, SYFG)全长转录组数据,为深入挖掘鸡卵泡发育内在分子调控信息提供参考。【方法】采用PacBio高通量测序平台,对海兰褐壳蛋鸡SYFG进行测序、过滤、聚类和矫正原始数据,获取全长转录本序列。通过生物信息学软件对全长转录本数据进行功能注释、转录因子注释、编码区序列(coding sequence, CDS)预测、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)预测筛选、简单重复序列(simple sequence repeats, SSR)检测及可变剪接(alternative splicing, AS)和选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation, APA)分析。【结果】通过测序共获得52 311条海兰褐壳蛋鸡SYFG全长转录本,长度主要分布于1～3 500 bp。通过与GO、KEGG、COG、NR、Swiss-Prot和Pfam数据库比对,对转录本序列进行注释,其中GO数据库注释了26 525条转录本,KEGG数据...     

太湖鹅个体选育的原则和措施

太湖鹅原产于江苏长江三角洲太湖流域,具有体型小、产蛋多、成熟早、就巢性弱、肉质细嫩等优点,是我国蛋肉兼用白鹅之一。太湖鹅在其生长发育过程中表现出生长前期快,后期缓慢的特点,同时太湖鹅的群体遗传多样性丰富,是较好的鹅种之一,只是未进行有效的选育工作。本文叙述了南京绿草乡农业发展有限公司太湖鹅的个体选育措施,同时也给其他鹅种的选育工作以借鉴。     

不同饲养方式对草鸡屠宰性能和肉品质的影响

为探讨不同饲养方式对苏北草鸡屠宰性能及肉品质的影响,本试验选用60日龄体重相近的草母鸡180只,随机分为林地散养、低网床上平养两个组,每组设3个重复,每个重复30只鸡。210日龄从每个重复随机抽取4只、每组共12只鸡进行屠宰、取肉样,测定并比较屠宰性能和肉质等指标。结果显示:散养鸡肝脏重、肌胃重极显著高于网上平养鸡(P0.01);散养鸡的腹脂率、腺胃重极显著低于网上平养鸡(P0.01);散养鸡的胸肌黄度、腿肌红度、腿肌黄度显著或极显著高于网上平养鸡(P0.05或P0.01);散养鸡的腿肌肌内脂肪含量极显著低于网上平养鸡(P0.01)。结果表明:不同饲养方式对草鸡的屠宰性能和肉品质有一定影响,散养方式提升了草鸡的屠宰性能和肉品质。     

鸭血红素加氧酶-1（HO-1）基因表达及对蛋壳颜色的影响

以35周龄产绿壳蛋巢湖鸭、产白壳蛋巢湖鸭以及樱桃谷鸭为素材,采集每只鸭的肝脏和输卵管子宫部,提取总RNA进行cDNA反转录,利用实时荧光定量PCR（real-time PCR）方法检测样品中血红素加氧酶（heme oxygen-ase,HO-1）基因的表达水平,分析不同品种、品系间及同一品种不同器官中HO-1mRNA的表达差异。结果显示：不同品种间,HO-1基因在肝脏组织中相对表达量无显著差异（P〉0.05）,在子宫组织中表达量巢湖鸭极显著高于樱桃谷鸭（P〈0.01）。不同品系间,HO-1基因在肝脏组织中相对表达量无显著性差异（P〉0.05）;巢湖鸭2个品系在子宫中的相对表达量差异不显著,但均显著高于樱桃谷鸭。在同一品种内,HO-1基因在肝脏组织中的相对表达量均极显著高于子宫组织（P〈0.01）。     

鹅微卫星(TG)_n基序的克隆及序列比较分析

以(TG)10重复基序设计引物对鹅基因组DNA进行PCR扩增,PCR产物经12%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳后银染检测,共获得了7种基因型,4种等位基因;并且在各供试鹅品种上表现出多态性,可以实现遗传分类研究。对回收的不同条带进行纯化、克隆测序;测序结果显示各品种都有(TG)n基序存在,并且各个条带中重复数大于10。     

樱桃谷鸭生长曲线拟合与比较分析

用Logistic,Gompertz和Bertalanffy 3种非线性生长模型对不同性别樱桃谷鸭的生长发育进行拟合。研究结果表明,樱桃谷公、母鸭在7周龄前生长曲线基本一致,而7周龄后公鸭明显快于母鸭;3种模型的拟合效果均很好,尤以Logistic,Gompertz模型最佳;Gompertz模型对鸭初生重的拟合结果更加接近于实际测量值。公鸭的成年体重显著高于母鸭,但达到拐点的周龄较母鸭迟,公、母鸭的生长拐点分别为4.78周和4.25周。     

太湖鸡PRL、PRLR和FSHβ基因多态与前期产蛋性状关系研究

采用PCR-SSCP法对太湖鸡催乳素(PRL)、催乳素受体(PRLR)和促卵泡激素β亚基(FSHβ)基因进行多态性检测,并分析其与开产50%后20周产蛋性状的关系。结果表明:PRL和FSHβpro2的基因型频率都是AA型最高,BB型最低,等位基因频率也是A高于B,FSHβ基因exon3位点没有多态;PRLR只有两种基因型,外显子3是AA型频率高于BB型,外显子6是CC型频率高于DD型,且等位基因A和C的频率分别高于等位基因B和D的频率。太湖鸡PRL、PRLR和FSHβ基因开产50%后20周产蛋性状的不同基因型间差异均不显著(P>0.05),但是PRLR基因外显子3的开产50%后9~11周蛋重平均数基因型间差异接近显著(P=0.08)。基因间交互作用分析发现,催乳素受体基因外显子3和外显子6有极显著的交互作用(P<0.01),产蛋量较高的合并基因型AADD可以作为太湖鸡选育的参考。