基于多维度临床数据整合分析揭示SLC25A12表达水平在急性髓系白血病患者中的预后价值

目的:研究分析SLC25A12在急性髓系白血病(AML)患者中的临床和预后价值。方法:本研究分别在2个队列中(n=46;n=290)比较了SLC25A12基因在AML患者和健康人骨髓或外周血细胞中的表达水平,利用2个独立AML研究队列(n=163;n=329)的基因组、转录组、临床和预后等多维度信息进行整合,分析SLC25A12的预后价值。结果:在AML患者白血病细胞中,SLC25A12的表达量明显高于健康人(P=0.0001;P=0.0238),单因素和多因素预后分析证实,SLC25A12高表达与患者较短的无事件生存(EFS,HR=1.605,P=0.018)和总体生存(OS,HR=1.818,P=0.002)显著相关。这进一步证实在预后危险度为预后良好和预后中等两个亚组中,SLC25A12高表达的患者无事件生存和总体生存同样显著降低。结论:SLC25A12高表达与AML患者的不良预后生存显著相关,这提示SLC25A12异常表达可作为AML预后评估的潜在的分子标志物。     

前列腺癌与前列腺增生的分类预测及癌症风险因素分析

背景 前列腺癌是男性泌尿生殖系统最常见的恶性肿瘤之一,其与前列腺增生之间的快速鉴别是临床面临的难题之一,需要可靠方法进行分类预测.目的 基于XGBoost算法构建前列腺癌与前列腺增生的分类预测模型,识别癌症风险因素并分析其在早期诊断中的应用价值.方法 于"前列腺癌数据集"(2019年由解放军总医院国家临床医学科学数据中心,国家人口与健康科学数据共享平台提供)中获取前列腺癌与前列腺增生患者的临床数据,在数据预处理基础上按照7:3划分训练集和测试集;应用XGBoost算法构建前列腺癌与前列腺增生的分类模型;基于训练集确定模型参数,并在测试集上完成模型的有效性验证,利用SHAP方法分析模型特征的临床意义.结果 共纳入前列腺癌患者1224例、前列腺增生患者1255例,平均年龄分别为65.86岁、67.70岁;选取年龄、体质量指数、前列腺特异性抗原(prostate specific antigen,PSA)系列指标及其他生化检验指标共23个特征构建分类模型.模型对前列腺癌预测的曲线下面积、准确率、召回率、精确率和F1值分别为0.81、0.74、0.70、0.72、0.74;游离PSA/总PSA、总PSA、无机磷、游离PSA是前列腺早期诊断中最重要的4个指标;SHAP分析结果表明游离PSA/总PSA≤0.132与无机磷 ≥1.09 mmol/L是前列腺癌诊断中需要被关注的分界值.结论 应用XGBoost算法可构建前列腺癌预测的有效分类模型,利用SHAP分析获取的特征指标分界值可为前列腺癌的临床早期筛查提供有益参考.     

SQLE基因表达水平在急性髓系白血病患者预后评估中的价值

目的:在大样本数据分析下确定SQLE表达水平与急性髓系白血病(AML)患者的预后关系.方法:对多个含大样本白血病患者数据的队列包括基因组、转录组、基因芯片表达数据以及临床信息资料进行统计分析.结果:SQLE在AML患者肿瘤细胞中的表达量明显高于健康对照者(P=0.001).在3个AML患者队列中SQLE高表达组比低表达...     

基于环形阵列的乳腺超声检测仿真及成像方法研究

目的 ：研究一种适用于环形阵列的乳腺超声仿真和成像方法，实现对数值体模超声扫查过程的三维快速仿真，并重建得到对应的声速分布图。方法：先使用k-Wave对环形阵列及乳腺体模进行三维仿真并获得超声反射波和透射波的波形数据。再采用改进的小波赤池信息量准则（wavelet Akaike information criterion,wavelet-AIC）法提取声波第一到达时间，采用最短路径法得到正向模型，采用将L2型正则化作为惩罚项的混合版本的最小平方QR分解（least squares QR-factorization,LSQR）法求解反问题，采用迭代更新初始声速分布的方法实现对体模的声速分布成像。结果：优化后的三维仿真方法相比优化前仿真时间缩短了约33%，空间占用减少了约98%；改进后的成像方法计算得到的声速分布图更加清晰且与实际声速分布情况更为接近，其与体模声速分布图之间的均方根误差、相关系数和结构相似性分别为10.90 m/s、0.856、0.836。结论：该方法提高了环形阵列超声成像三维仿真速度，且得到的声速分布图可以正确显示体模的结构和声速差异，为下一步采用实际获取信号进行成像奠定...