骨髓增生异常综合征患者SFRP5基因启动子区甲基化状态研究

背景:SFRP5基因启动子区的甲基化与急性髓系白血病的发生密切相关.作为白血病的前期,骨髓增生异常综合征患者中SFRP5基因启动子区的甲基化状态尚不清楚.目的:探索骨髓增生异常综合征中WNT/β-catenin信号传导通路拮抗基因分泌型卷曲相关蛋白5(SFRP5)基因的甲基化状态.方法:应用甲基化特异性PCR(MSP)法对43例骨髓增生异常综合征患者的骨髓或外周血进行SFRP5基因启动子区甲基化状况检测,并以70例门诊普通患者的外周血作为对照.结果与结论:113例样本均成功进行了MSP检测,进入结果分析.43例骨髓增生异常综合征患者中检出5例(11.6%)SFRP5的甲基化,70例正常对照中检出1例(1.4%)SFRP5的甲基化,并且均为不完全甲基化状态.SFRP5在骨髓增生异常综合征患者中的甲基化率显著高于正常对照(χ2=5.511,P=0.019).43例患者样本中,17例为骨髓样本,26例为外周血样本.而5例甲基化的样本中,2例为骨髓样本,3例为外周血样本.样本的来源(骨髓/外周血)对于甲基化状态的结果无显著差异(χ2=0.001,P=0.982).提示,SFRP5基因的甲基化与骨髓增生异常综合征有相关性,SFRP5基因的甲基化可能是引起骨髓增生异常综合征的分子机制之一.     

骨髓增生异常综合征患者SFRP5基因启动子区甲基化状态研究

背景：SFRP5基因启动子区的甲基化与急性髓系白血病的发生密切相关。作为白血病的前期,骨髓增生异常综合征患者中SFRP5基因启动子区的甲基化状态尚不清楚。 目的：探索骨髓增生异常综合征中WNT/β-catenin信号传导通路拮抗基因分泌型卷曲相关蛋白5(SFRP5)基因的甲基化状态。 方法：应用甲基化特异性PCR(MSP)法对43例骨髓增生异常综合征患者的骨髓或外周血进行SFRP5基因启动子区甲基化状况检测,并以70例门诊普通患者的外周血作为对照。 结果与结论：113例样本均成功进行了MSP检测,进入结果分析。43例骨髓增生异常综合征患者中检出5例(11.6%)SFRP5的甲基化,70例正常对照中检出1例(1.4%)SFRP5的甲基化,并且均为不完全甲基化状态。SFRP5在骨髓增生异常综合征患者中的甲基化率显著高于正常对照(χ²=5.511,P=0.019)。43例患者样本中,17例为骨髓样本,26例为外周血样本。而5例甲基化的样本中,2例为骨髓样本,3例为外周血样本。样本的来源(骨髓/外周血)对于甲基化状态的结果无显著差异(χ²=0.001,P=0.982)。提示,SFRP5基因的甲基化与骨髓增生异常综合征有相关性,SFRP5基因的甲基化可能是引起骨髓增生异常综合征的分子机制之一。     

两个单核苷酸多态位点与北方中国人前列腺癌的关联研究

背景与目的:近年来在不同人群的研究中,全基因组关联研究已经发现了许多与前列腺癌(prostate cancer,PCa)风险相关的单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs).本文探讨了两个SNPs,即rs17021918 (4q22)与rs 10090154 (8q24)和中国北方汉族人PCa的相关性.方法:采用病例对照的研究方法,本研究入选了124例PCa患者和111例健康对照者,采用聚合酶链反应-高分辨熔解曲线(PCRHRM)技术,并结合测序验证法,对rs17021918(4q22)与rs10090154 (8q24)进行基因型及等位基因频率的分析,并探讨其与确诊时的体重指数(body mass index,BMI)、Gleason评分、血清前列腺特异性抗原(prostate specific antigen,PSA)水平、肿瘤分期及年龄等临床特征之间的联系.结果:在风险等位基因、基因型及分层分析中,rs17021918虽然并未观察到有统计学意义的结果,但风险比(the odds ratio,OR)值多＜1,其中在BMI＞27.5 kg/m2(P=0.056; OR=0.292; 95％CI:0.078～1.095)和PSA浓度＜10.0 ng/mL组(P=0.068;OR=0.467; 95％CI:0.204～1.069),CC基因型携带者可能有较低的PCa发病风险;另外发现,rs10090154的T等位基因携带者与较低的肿瘤分期关联(P=0.012; OR=2.512; 95％CI:1.210～5.214),而在较高的肿瘤分期组,T等位基因携带者与非T等位基因携带者之间差异有统计学意义(P=0.039).结论:Rs17021918的CC基因型携带者可能与中国北方人PCa发病风险负关联;而rs10090154的T等位基因携带者可能与中国北方人PCa肿瘤分期正关联.     

NKX3.1基因rs1512268单核苷酸多态性与前列腺癌风险关系的初步研究

目的 探讨NKX3.1基因的常见变异rs1512268单核苷酸多态性与中国人前列腺癌发生的关系及相关危险因素的相互作用. 方法 选取122例前列腺癌患者和年龄匹配的105例男性(前列腺癌特异抗原＜4μg/L,且无前列腺癌家族史者)作为对照,采用聚合酶链反应-高分辨熔解曲线(PCR-HRM)技术结合测序验证法检测NKX3.1基因rs1512268单核苷酸多态性的分布. 结果 前列腺癌组中GG、AG和AA基因型分布分别为42例(33.4％)、66例(54.1％)和14例(11.5％);正常对照组中三种基因型分布分别为45例(42.9％)、51例(48.6％)和9例(8.6％);两组间基因型频率(x2=1.70,0.69,0.52)和等位基因频率(x2=1.575)的分布差异无统计学意义(P＞0.05).NKX3.1基因rs1512268单核苷酸多态性的不同基因型与前列腺癌患者的年龄、Gleason评分和PSA浓度以及临床分期等指标间均无相关性(P＞0.05). 结论 NKX3.1基因rs1512268单核苷酸多态性与中国人前列腺癌的发生无明显相关性,可能不是中国人前列腺癌发病的遗传危险因素.     

急性髓系白血病患者SFRP2基因甲基化的检测及临床意义

目的检测分泌型卷曲相关蛋白2(SFRP2)基因在急性髓系白血病(AML)患者中的甲基化状态,探讨SFRP2基因启动子区甲基化状态与AML发生的关系。方法收集了99例AML患者的骨髓或外周血样本,匹配以70例门诊普通患者的外周血作为对照。采用甲基化特异性PCR(MSP)方法对所有研究样本进行SFRP2基因启动子区甲基化状况检测。结果 99例AML患者中有27例检测到SFRP2基因的甲基化,甲基化率为27.3%;而正常对照组中未检出SFRP2基因的甲基化;两者比较差异有统计学意义(P<0.001)。SFRP2基因的甲基化状态与AML的年龄、性别、临床分型及样本来源(骨髓/外周血)间均未见显著关系(P>0.05)。结论 SFRP2基因启动子区的甲基化与AML的发生有相关性,可能是引起AML的分子机制之一。外周血中的SFRP2基因的甲基化可望作为一项新的分子标记物应用于AML的临床早期检测。     

骨髓增生异常综合征患者分泌型卷曲相关蛋白2基因启动子区甲基化状态研究

 目的　了解骨髓增生异常综合征（MDS）患者Wnt／β-catenin信号转导通路中拮抗基因分泌型卷曲相关蛋白2（SFRP2）的甲基化状态,研究其甲基化状态与染色体核型及生存的关系。方法　应用甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）对43例MDS患者的骨髓或外周血SFRP2基因启动子区甲基化状况进行检测,并以70例门诊普通患者外周血检测结果为对照,同时对部分患者进行随访。结果　43例MDS患者中检出10例（23.3 %）SFRP2甲基化,均为半甲基化状态,70例正常对照中未检出SFRP2的甲基化,组间差异有统计学意义（χ2＝17.86,P＜0.0001）。10例SFRP2甲基化的样本中, 5例来自骨髓,5例来自外周血,其中难治性贫血（RA）3例,伴环形铁粒幼细胞增多性难治性贫血（RAS）1例,难治性血细胞减少伴多系发育异常（RCMD）2例,原始细胞过多难治性贫血（RAEB）3例,MDS不能分类（MDS-U）1例。单因素分析结果显示不同性别、年龄、染色体核型、样本来源（骨髓／外周血）、危险度（WPSS≤2及>2）间甲基化率差异无统计学意义,疾病进展与稳定组甲基化率差异亦无统计学意义（均P＞0.05）。20例患者有染色体核型结果,16例进行了密切随访,3例转为急性髓系白血病（AML）,死亡11例中2例为SFRP2甲基化阳性,但甲基化与非甲基化组间生存率差异无统计学意义（χ2＝0.022,P＞0.05）。结论　MDS患者中SFRP2基因存在较高的甲基化修饰,这可能是MDS发病的分子机制之一;在MDS SFRP2的甲基化检测中,外周血有较好的代表性;该组患者例数较少,尚未发现甲基化与临床预后间的相关性。     

急性髓系白血病分泌型卷曲相关蛋白5基因启动子区甲基化状态研究

目的研究急性髓系白血病(AML)中WNT信号传导通路拮抗基因分泌型卷曲相关蛋白5(SFRP5)基因的甲基化状态。方法应用甲基化特异性PCR(MSP)法对99例AML患者的骨髓或外周血进行SFRP5基因启动子区甲基化状况检测,并以70例门诊普通病人的外周血作为对照。结果 99例AML患者中检出10例(10.1%)SFRP5的甲基化,70例正常对照中仅检出1例(1.4%)SFRP5的甲基化。SFRP5在AML患者中的甲基化率显著高于正常对照(P<0.05)。SFRP5基因的甲基化状态与年龄、性别无关(P>0.05),与AML的临床分型相关(P<0.05)。结论 SFRP5基因的甲基化与AML有相关性,SFRP5基因的甲基化可能是引起AML的分子机制之一。     

整合素α6、β-微精浆蛋白基因和染色体8q24区与前列腺癌的关联研究

目的 探讨整合素α6(ITGA6)基因(rs12621278,G)、染色体8q24区(rs10086908,T)和β-微精浆蛋白(MSMB)基因(rs10993994,T)与北京市居民中前列腺癌(PCa)的关联,了解PCa患者基因型和表型的关系.方法 收集112例PCa患者临床、遗传、膳食习惯、嗜好等表型,对PCa患者和91名正常对照者的ITGA6基因(rs12621278,G)、染色体8q24区(rs10086908,T)和MSMB基因(rs10993994,T)进行比较,并进行病例组的基因型-表型分析.结果 2组间相比,MSMB基因rs10993994,T风险等位基因频率差异有统计学意义(病例组56.4%,对照组46.2%;P=0.001,OR=1.97,95%CI为1.28～3.04).8q24区的rs10086908,T(病例组83.5%,对照组79.2%)和ITGA6基因的rs12621278,G(病例组27.2%,对照组27.0%)组间差异无统计学意义(P＞0.05).数量性状分析发现ITGA6风险基因型(G/G)的患者病程为(1.40±0.55)年,显著短于A/G型的(4.38±3.10)年和A/A型的(2.37±1.84)年(P=0.003).结论 MSMB基因变异和PCa易感性之间存在相关性,提示MSMB基因可能与PCa有关联.

Abstract：

Objective To explore the correlation between ITGA6 gene (rs12621278, G), MSMB gene (rs10993994, T), chromosome 8q24 (rs10086908, T) and prostate cancer (PCa) in Beijing residents, and to explore the correlation between genotype and phenotype in PCa patients. Methods PCa patient phenotypes were collected including clinical, genetic, dietary habits, hobbies and blood samples. ITGA6 gene (rs12621278, G), chromosome 8q24 (rs10086908, T) and MSMB gene (rs10993994, T) compared the allele distribution between 112 PCa and 91 healthy control age matched patients. The genotype and phenotype analysis was conducted in the 2 groups. Results Between the case and control groups, only rs10993994, T of MSMB gene (case 56.4%,control 46.2%) was significantly different (P=0.001; OR=1.97, 95%CI:1.28-3.04). The rs10086908, T of 8q24 (case 83.5%, control 79.2%) and rs12621278, G of ITGA6 gene (case 27.2%, control 27.0%) were not significantly associated with PCa in the study sample (P>0.05). Quantitative trait analysis showed that the disease duration of ITGA6 risk genotypes (G/G,1.40±0.55 years) in PCa patients was significantly shorter (P=0.003) than the other genotype carriers (A/G, 4.38±3.10 years; A/A, 2.37±1.84 years). Conclusion The genetic variation in MSMB is possibly associated with PCa susceptibility, suggesting that MSMB genes might be associated with PCa in a Chinese population.     

急性髓系白血病SFRP4基因启动子区异常甲基化研究

目的研究急性髓系白血病中SFRP4基因启动子区的异常甲基化状态,探讨其与急性髓系白血病发生的关系。方法应用甲基化特异性PCR法对99例急性髓系白血病患者的骨髓或外周血进行SFRP4基因启动子区甲基化状况检测,并以70例门诊普通患者的外周血作为对照。结果 99例急性髓系白血病患者中有17例SFRP4基因的启动子区发生了甲基化,甲基化率为17.2%;而正常对照组中未检出SFRP4基因启动子区的甲基化。SFRP4基因在急性髓系白血病患者中的甲基化率极显著的高于正常对照(P<0.001)。SFRP4基因的甲基化状态与急性髓系白血病患者的年龄、性别及临床分型间均未出现显著相关性(P>0.05)。结论 SFRP4基因启动子区的异常甲基化与急性髓系白血病的发生有相关性,SFRP4基因的甲基化可能是引起急性髓系白血病的分子机制之一。     

骨髓增生异常综合征患者SFRP5基因启动子区甲基化状态研究

背景：SFRP5基因启动子区的甲基化与急性髓系白血病的发生密切相关。作为白血病的前期,骨髓增生异常综合征患者中SFRP5基因启动子区的甲基化状态尚不清楚。目的：探索骨髓增生异常综合征中WNT/β-catenin信号传导通路拮抗基因分泌型卷曲相关蛋白5（SFRP5）基因的甲基化状态。方法：应用甲基化特异性PCR（MSP）法对43例骨髓增生异常综合征患者的骨髓或外周血进行SFRP5基因启动子区甲基化状况检测,并以70例门诊普通患者的外周血作为对照。结果与结论：113例样本均成功进行了MSP检测,进入结果分析。43例骨髓增生异常综合征患者中检出5例（11.6%）SFRP5的甲基化,70例正常对照中检出1例（1.4%）SFRP5的甲基化,并且均为不完全甲基化状态。SFRP5在骨髓增生异常综合征患者中的甲基化率显著高于正常对照（χ2=5.511,P=0.019）。43例患者样本中,17例为骨髓样本,26例为外周血样本。而5例甲基化的样本中,2例为骨髓样本,3例为外周血样本。样本的来源（骨髓/外周血）对于甲基化状态的结果无显著差异（χ2=0.001,P=0.982）。提示,SFRP5基因的甲基化与骨髓增生异常综合征有相关性,SFRP5基因的甲基化可能是引起骨髓增生异常综合征的分子机制之一。