紫杉醇类似物的电子结构与抗癌活性关系的研究( Ⅰ )

应用MM3分子力学方法对R6=H的13个紫杉醇类似物进行几何优化,并采用MNDO法计算了化合物的电子结构,应用回归分析、神经网络等方法寻找其量化指数与抗癌活性的关系,结果表明,R2取代基、2-OBz中苯甲酰基（Bz)的碳氧原子的净电荷之和∑QBz、核-核排斥能Ep对活性影响较大,并得到显著性较好的QSAR：ID50（A）/ID50（T）（act)=71.20535 155.35016∑QBz,表明随着∑QBz减小,ID50（A）/ID50（T）值将减小,而化合物活性将增大,神经网络（BP网络）算法的结果表明,神经网络计算值R=0.992,神经网络的结果可精确地预测化合物的抗癌活性。     

芳基三唑啉酮类除草剂三维定量构效关系研究

使用比较分子场分析法（ＣｏＭＦＡ）,对１８种抑制原卟啉原氧化酶（ＰＰＯ）的芳基三唑啉酮类化合物进行了三维定量构效关系（ＱＳＡＲ）研究,得到了具有较强预测能力的ＱＳＡＲ模型．该模型显示空间场和静电场效应在抑制ＰＰＯ活性方面均起重要作用,模型对进一步设计、合成具有更高活性的新型除草剂具有指导意义     

人工神经网络用于苯砜基羧酸酯定量结构-活效关系研究

采用误差反传前向人工神经网络（artificial neural network,ANN）建立了56种苯砜基羧酸酯类化合物的结构与其对发光菌的急性毒性之间的定量关系模型（ANN模型）．以56种苯砜基羧酸酯类化合物的量子化学参数作为输入,急性毒性作为输出,所构建网络模型的交叉检验相关系数为0．9863、标准偏差为0．0753、残差绝对值≤O．20,应用于外部预测集,预测集相关系数为O．9880;而多元线性回归（multiple linear regression,MLR）法模型的相关系数为0．9472、标准偏差为0．1413、残差绝对值≤0．34．结果表明：ANN模型获得了比MLR模型更好的拟合效果．     

喹啉环取代喜树碱抗癌活性的定量构效关系研究

利用量子化学密度泛函理论(DFT)中的杂化泛函B3LYP对三个系列60个喹啉环取代的喜树碱衍生物(CPTs)进行了构型优化,在6-311+G(d,p)基组下计算出相应的电子结构参数;采用逐步多元回归方法对各组化合物建立了几个新的分子描述符与抗癌活性之间的定量结构-活性关系(QSAR)模型,探讨了影响化合物抗癌活性的主要结构因素及其作用机理.结果表明,所得QSAR模型具有良好的预测能力,影响药物活性的主要因素有分子极化率和原子净电荷以及及最高占据分子轨道能量.根据所建最佳QSAR可以较准确地预测喜树碱类衍生物的抗癌活性,这有助于未来设计合成新型高效抗癌喜树碱类似物以及改进和完善其作用机理.     

二氢叶酸还原酶抑制剂定量构效关系(QSAR)研究

对2，4-二氨基-5-甲基-6-(取代苯胺基)甲基吡啶[2，3-d]并嘧啶类二氢叶酸还原酶抑制剂进行了定量构效关系的量子化学研究，证明了偶极矩，LUMO能级和HOMO-LUMO能隙对其活性有着重要的影响．     

定量构性关系(QSPR)研究:一种新分子拓扑指数Y

基于分子距离与邻接矩阵提出了一种新颖表征有机物结构特征的分子拓扑指数Y。对饱和烷烃（n≤9，共74个分子）的计算结果及其与物性相关研究表明，与现有某些拓扑指数比较具有良好的结构选择性（简并度较小）和QSPR规律性。     

QSHR中理化参数描述矩阵的病态参数剔除

在定量构效关系（ＱＳＡＲ）研究中各理化参数ｘｉ构成的描述矩阵，由于参数之间的相关性往往呈病态性或奇异性，由此获得的ＱＳＡＲ回归方程则不稳定，本文提出了一种新方法即病态指标剔除法：选择一个适当的临界值α∈（０，１），找出相关系数大于或等于该临界值所涉及的指标，剔除部分病态指标；再作逐步回归从而获得稳定优良的ＱＳＡＲ回归方程，可望在ＱＳＡＲ中广泛应用．     

Computational approaches to structural and functional analysis of plastocyanin and other blue copper proteins

Computational techniques are becoming increasingly important in structural and functional biology, in particular as tools to aid the interpretation of experimental results and the design of new systems. This review reports on recent studies employing a variety of computational approaches to unravel the microscopic details of the structure-function relationships in plastocyanin and other proteins belonging to the blue copper superfamily. Aspects covered include protein recognition, electron transfer and protein-solvent interaction properties of the blue copper protein family. The relevance of integrating diverse computational approaches to address the analysis of a complex protein system, such as a cupredoxin metalloprotein, is emphasized.Received 9 May 2003; received after revision 24 November 2003; accepted 28 November 2003     

Quantitative structure activity relationship and toxicity mechanisms of chlorophenols on cells <Emphasis Type="Italic">in vitro</Emphasis>

3-(4,5-dimethylthiazd-2-yl)-2,5-diphenylentrazolium bromide (MTT) reduction assay was used to investigate the acute toxicity of 8 different chlorophenols (CPs) on rat connective tissue fibroblast L929 cells and human liver cancer HepG2 cells. Combined with the data from Quantitative Structure Activity Relationship (QSAR) approach of CPs by using the octanol-water partition coefficients (Kow),an effective model was deduced to evaluate the cytotoxicity of these chemicals. Furthermore, the relationship between the structures of CPs and their cytotoxicity was proposed.The results show that 2-chlorophenol (2-CP), 4-chlorophenol (4-CP), 2,6-dichlorophenol (2,6-DCP),2,4-dichlorophenol (2,4-DCP),2,4,6-trichlorophenol (2,4,6-TCP) and 2,3,4-trichlorophenol (2,3,4-TCP) induced apoptosis, whereas, 2,3,5,6-tetrachlorophenol (2,3,5,6-TeCP) and pentachlorophenl (PCP) demonstrated more characteristic of necrosis than apoptosis.These results establish a good experimental base both for developing the comparative evaluation of toxicity of CPs in vitro and for elucidating the toxicity mechanisms of them.     

核磁共振碳谱研究：烷烃的化学位移的估计与预测

依据Ｌｉｎｄｅｍａｎ ＬＰ和Ａｄａｍｓ ＪＱ给出的烷烃（Ｃ５－Ｃ９）所有异构体的核磁共振碳谱（Ｃ－１３ＮＭＲ）的化学位移数据，用来检验和改进及扩展ＧｒａｎｔＤＭ与Ｐａｕｌ ＥＧ估计与预测的核磁共振碳－１３谱化学位移参数，讨论了磁非等价性对碳谱化学位移的影响，给出了一种便利的相关关集，它能很好地将化学位移与烷烃分子结构相关性。