虹鳟体质量和主要体尺性状异速生长的遗传分析

采用联合异速生长遗传模型,对中国水产科学研究院黑龙江水产研究所渤海冷水性鱼类试验站培育的F1杂交虹鳟(Oncorhynchus mykiss)和F2杂交虹鳟的体质量和体尺性状异速生长进行了遗传分析,旨在为虹鳟及其他水产动物异速生长的遗传参数估计和实现体质量与体型的同步选育奠定理论基础。首先采用逐步回归分析法选择体尺性状对体质量的异速生长显著的性状,建立最优表型联合静态、动态异速生长指数模型,随后构建了两个用于遗传分析多个静态、动态异速生长的随机回归模型。虹鳟多个体尺性状相对体质量的异速生长遗传分析结果表明,体长与体质量具有较大的异速生长指数,为1.633 8,且为正异速生长,而其他体尺性状相对体质量呈现负异速生长;遗传方差大小顺序和表型的偏异速生长指数一致,体宽和背鳍基长的异速生长的遗传相关最大,为-0.867 5,其次为体长和体高,为-0.619 4,最小的是-0.021 7,为体高和体宽。体长与体质量的动态异速生长的加性遗传方差估计值为0.292 9。结果表明,虹鳟体质量和主要体尺性状的异速生长是由遗传机制决定的,遗传方差及遗传相关的估计能够用来筛选优良亲本,这为进一步利用异速生长理论指导虹鳟及其他水产动物体质量与体型的同步选育提供了理论基础。     

随机回归模型理论及其应用

随机回归模型在动物育种中已然成为分析纵向数据或者个体重复记录的一般方法。随机回归模型可分为基于重复率模型的随机回归模型、基于母体效应模型的随机回归模型、基于公畜模型的随机回归模型和二维随机回归模型等等。随机回归模型广泛应用于产奶性状、生长性状、生存性状、繁殖性状、基因型、环境互作的遗传分析;与此同时,人们也一直探索随机回归模型的优化问题,子模型函数的选择是其中热点之一。文章对随机回归模型的分类、优化及其在动物育种领域的应用进行了综述。     

不同比例复合益生菌对凡纳滨对虾生长、免疫及抗氨氮能力的影响

对从凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)肠道中分离出的鲍鱼希瓦氏菌(Shewanella haliotis)、蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)和双壳气单胞菌(Aeromonas bivalvium)3株有益菌株,利用正交设计得到9种复合比例,通过饲料中添加上述9种比例混合的菌体(菌数总量为109 cfu/g)饲喂凡纳滨对虾,经过28 d养殖实验,评价其对凡纳滨对虾生长、免疫指标的影响。随后,利用氯化铵调节水体氨氮浓度至26.67 mg/L,经过16 d的氨氮毒性实验,研究不同比例复合益生菌对凡纳滨对虾抗氨氮能力的影响。研究结果表明,9个复合益生菌实验组的增重率和特定生长率均显著高于对照组(P0.05),并且以3株菌菌数6︰1︰3比例效果较好;不同配比的复合益生菌能够显著提高酸性磷酸酶(ACP)、碱性磷酸酶(ALP)、总超氧化物歧化酶(T-SOD)活力(P0.05),并表现出了不同的影响效果,其中,3株菌菌数(菌数总量为109 cfu/g,下同)2︰3︰3、4︰2︰3及6︰1︰3比例对ACP活力具有显著促进作用(P0.05),3株菌菌数4:2︰3和6︰1︰3比例对ALP活力具有显著促进作用(P0.05);3株菌菌数2︰1︰1比例对T-SOD活力具有显著促进作用(P0.05);各比例的复合菌对溶菌酶活力的影响不显著(P0.05);氨氮浓度26.67 mg/L条件下,不同比例复合菌组对虾累计存活率显著高于对照组(P0.05),其中以3株菌菌数4︰3︰1和6︰3︰2比例组累计存活率较高,即抗氨氮效果较好。     

基于LASSO算法的多QTL定位的模拟研究

此篇文章中,应用一种基于LASSO的算法去同时定位多个数量性状位点(QTL)。在QTL定位方法中,迭代加权最小二乘法(IRLS)和极大似然法(ML)在参数估计准确性和检测效率方面效果几乎一致。但是在参数估计的稳健性和计算速度方面,迭代加权最小二乘法又明显优于极大似然估计。结合参数的先验分布信息,基于贝叶斯理论的极大似然估计能够分析多QTL模型。然而迭代加权最小二乘估计不能很好的检测多QTL。目前贝叶斯分析已经成为一个多QTL定位的重要的途径,但它主要缺点是计算时间过长,并缺乏简单有效的显著性检验。通过循环坐标下降的LASSO方法可将全模型的系数同时压缩并使之趋进于零,因此该方法能应用于快速同时估计整个基因组的非零遗传效应位点。在这个研究中,应用基于LASSO的算法去同时定位多QTL。模拟证明LASSO方法比迭代加权最小二乘法具有更高的估计精度和检测效率。     

动态性状候选基因检测效率分析

把组 织 器官 的生 长 发育 和随 生 命时 期 或某 些定 量因 素 变化 的 生产 性能 统 称为 动 态性 状。 本 研究 的目 的 是将 动 态性状基 因定 位分 析 的普 适 性方 法应 用 到动 态性 状 候选 基因 分 析中 。采 用 M onte C arlo 法 模拟 分析 抽 样个 体数 、测 定 日频 率、候选基因 频率 和遗 传 贡献 率 等因 素对 动 态性 状候 选 基因 检测 统 计效 率的 影 响。模 拟 试验 结 果表 明:4因素 对候 选 基因 检测 效 率的影响 存在 着差 异 ,它 们 的作 用大 小顺 序 为:累计 遗 传贡 献率 > 个体 数> 测 定日 频数 > 基因 频率 ;个体 数和 测定 日 频数 2因素对候 选基 因检 测 效率 表 现出 一定 的 交互 作用 。     

分类性状基因定位的多性状似然分析法

简单线性模型统计方法是业已被证明的与GLM法具有相近参数估计准确度和检测效率的一种二歧性状基因定位分析的简化方法。将适于二歧性状的一元线性模型推广到多类别分类性状基因定位分析中，文中提出采用多元线性模型对多类别分类性状进行基因定位分析。该方法首先将分类性状的各个类别转化为不同的二歧性状，并把每个二维数据看作是连续的，然后采用似然分析法，根据多性状联合定位的统计准则判断QTL的位置和估计QTL效应。模拟结果表明：新方法在大样本和中等遗传力条件下，能够以很高的计算效率相当准确地估计分类性状隐含变量给定的QTL位置和效应。     

轴套淬火开裂的原因及分析

１轴套加工工艺 ＧＣｒ１５钢制轴套是我厂ＢＢ１１２７Ａ单板刨切机中的一个重要零件，其硬度的技术要求为５８～６２ＨＲＣ，并应具有良好的耐磨性。其生产工艺流程为：下料→锻造→球化退火→车削加工→整体淬回火→稳定化处理→磨削加工→成品。 整体淬火工艺：箱式炉加热 ８４０℃、Ｎ３２号机油冷却， １８０℃回火。 淬火后发现，轴套的内孔及外圆面沿圆周方向分布有很多裂纹。２轴套裂纹原因分析２．１成份分析 于裂纹轴套上取样做化学分析，其结果与技术要求的成份对比见下表。 由上表可见，该材质化学成份符合技术要求。２．２淬…     

民猪保种群产仔数基因、基因型分布变化分析

本文检测了2002年民猪保种群中,雌激素受体(ESR)基因和促卵泡素β亚基(FSHβ)基因的基因与基因型分布,并将其与2000年保种群的检测结果进行了比较。结果表明:与2000年保种群相比较,两个基因的基因、基因型分布均发生了变化,意味着民猪的产仔性能也发生了变化,这同已有报道的生产性能统计结果相符。因为2000-2002年期间,群体只有部分个体更新,所以尽管上述频率变化经检验部分差异不显著(P>0.05),仍说明群体遗传结构发生了一定变化。这两个基因分布的检测分析可以作为标记辅助保种的参考依据。     

基于随机回归模型估计奶牛产奶量的遗传参数

文章用随机回归模型对奶牛泌乳性状中产奶量的遗传参数进行估计,在Bayesian理论的基础上用Gibbs抽样法估计方差组分。数据来自1988～1999加拿大奶牛育种中心,共计768 205个测定日记录,研究中处理后符合要求的个体为4 686个,测定日记录有43 661个。随机回归模型中加性遗传效应和永久环境效应分镶嵌了5阶和7阶Legendre多项式。5～330 d产奶性状的遗传力在0.2707到0.4291之间变化,0～22 d有明显下降,而在22～125 d迅速上升,在125～190 d有些微的下降而后有缓慢上升。     

不同虹鳟品系异速生长的比较分析

研究测量了渤海虹鳟、丹麦虹鳟、美国道氏虹鳟、美国加州虹鳟和挪威虹鳟等5个虹鳟品系4年龄148个个体体重和20个形态学性状。应用静态联合异速生长模型同时估计多个体型性状对体重、纵向性状对体长、垂直性状对体高和横向性状对体宽的异速生长指数。首先建立每个虹鳟品系相对性状的最优联合静态异速生长指数方程,采用Newman-Keuls t检验法进行虹鳟品系间每个最优异速方程中异速生长指数的多重比较。结果表明,每个虹鳟品系存在显著不同的偏异速生长指数分布,其中全长与体重、体高与体重间存在较高的异速生长关系。在5个虹鳟品系中,头长、头宽、眼径、吻长、尾柄长、臀鳍高和臀鳍基长等7个形态性状相对体重的异速生长指数都不显著。背吻距与体长和尾柄高与体高在5个虹鳟品系中都存在显著的异速生长关系,但是品系间的多重比较却完全显著。本文通过对不同虹鳟品系异速生长指数的统计比较,分析它们之间的形态变异特点,为虹鳟及其他水产动物品系的形态学鉴别提供了一种有效的理论方法。