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软体动物线粒体基因组在大小、结构和功能存在巨大变异,不同组装策略往往会得到差异的结果,明确适合软体动物的线粒体基因组组装策略对开展基于线粒体基因组的相关研究具有重要意义。通过基因组浅层测序技术获取了软体动物主要类群(双壳纲、腹足纲、多板纲、头足纲)代表种类的基因组数据,应用目前主流的线粒体基因组组装软件(NOVOPlasty、Ray、MitoZ、SPAdes、GetOrganelle和MEANGS)在相同条件下进行组装并比较各个软件的组装效果[运行时间、基因组覆盖度、准确性、线粒体重叠群(Contigs)数目、结果文件存储空间占用],探讨线粒体基因组的组装策略。结果表明,基于不同组装策略的线粒体基因组组装软件的组装效果与物种的生物学分类无关,而与线粒体基因组大小有关。基于参考序列组装策略的NOVOPlasty和基于从头组装策略的MEANGS、GetOrganelle和MitoZ更适用于组装有着常见线粒体基因组大小的软体动物类群, MEANGS、Ray和SPAdes更适用于组装线粒体基因组偏大的软体动物类群,MitoZ可以一次性完成线粒体基因组的组装、注释以及可视化工作。研究结果提示不同... 相似文献
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在2019年昌黎黄金海岸国家级自然保护区海域双壳纲软体动物调查的基础上,对该海域双壳纲软体动物含碳量进行了估算,同时分析了该保护区碳汇潜力与发展前景,以期为其他保护区海域碳储量估算提供参考依据.结果 表明,2019年昌黎自然保护区海域双壳纲软体动物含碳量约为391.79~ 414.54 t,等同于吸收了总量为1436.57~ 1520.00 t/a的CO2.年碳汇能力相当于21.80 ~ 23.07 ha的天然林地或23.47 ~ 24.83 ha的人工林地.按照2019年7个碳汇交易试点城市的平均交易价格计算,该保护区海域双壳纲软体动物每年产生的碳汇经济价值约为146677.6~155179.6元.今后应重点研究该保护区青岛文昌鱼及食物网其他层级含碳量及碳汇途径. 相似文献
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越南沿海的双壳纲软体动物 总被引:2,自引:1,他引:1
报道了越南沿海的双壳钢软体动物320种,隶属3亚纲,6目,26总科,41科,148属,从种类的组成中,帘蛤科有57种,蚶科32种,樱蛤科29种,贻贝科25种,鸟蛤科16种,牡蛎科14种,蛤蜊科13种,珍珠贝科和扇贝科各12种,紫云蛤科11种,竹蛏科10种,其他各科的种类均在7种以内,按种的性质而论,越南沿海主要是由热带种和亚热带种类组成,还有与珊瑚礁紧密联系的热带种,就越南沿海双壳纲软体动物分类区系而论,应属印度-西太平洋区的印尼-马来亚区。 相似文献
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