哈维氏弧菌VIB645毒性相关质粒的结构解析

哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)是水产养殖动物的常见致病菌。前期研究发现,哈维氏弧菌致病性最强的菌株VIB645含有2个核苷酸序列非常相似的溶血素基因—vhhA和vhhB,分别位于染色体DNA和1个大小约为65.6 kb的质粒上(命名为pVH1)。本研究用碱裂解法提取该菌株的毒性相关质粒pVH1,利用多种限制性内切酶进行酶切,构建随机DNA文库并测序。合计测序97.63 kb,覆盖度为148.3%,鉴定出125个ORF(开放阅读框,>150 bp)。这些预测的ORF,根据其功能主要分为以下几类:(1)毒力相关基因,包括RTX毒素钙离子结合蛋白、转铁蛋白结合蛋白A前体、外膜粘附蛋白;(2)结合转运相关基因,包括TraC、-D-、F-、G-、H-、I-、K-、N-、U-、W、TrbB-、C;(3)转座相关基因;(4)其他功能基因,如甲基转移酶,DNA结合蛋白,DNA复制蛋白DnaC等;(5)未知基因。本研究结果对揭示哈维氏弧菌的致病机理具有重要意义。     

气相分子光谱法测定水中硝酸盐氮的研究

硝酸盐是自然界本身存在的物质,水中适量的硝酸盐氮对人体并无直接危害,但是转化为亚硝态氮之后可能会造成婴儿患高铁血红蛋白症,作为一种新的测定水中硝酸盐氮浓度方法,气相分子吸收光谱仪法具有样品基本不需前处理、所需反应试剂易得、仪器操作过程简单以及测定结果准确等优点。采用气相分子吸收光谱仪测定水中硝酸盐氮,结果表明:硝酸盐氮检出限为0.005 8 mg/L,在0~4.0 mg/L范围内呈理想线性关系,相关系数r=0.999 8,相对标准偏差为0.45%,样品测定频率为60样/h,实际水样的加标回收率为99.7~103.5%,结论气相分子吸收法测定硝酸盐氮分析法简单快捷、准确、灵敏度高,在日常实验室水功能区的水质监测中,可用作中硝酸盐氮检测方法。     

基于双程波动方程的多次波照明分析方法研究

地震照明分析是地震数据采集和实际资料处理解释中的一种辅助手段,指在给定地下地质构造时,采用数值模拟的方法模拟出地震波在地下介质中的能量分布形态.自由表面相关多次波是海上地震数据中重要的波场信息,传统地震数据处理方法一直都将其视为干扰信息而进行去除,错失了很多有意义的构造信息.本文采用基于时间域有限差分法的双程波动方程进行波场数值模拟,将多次波能量考虑到波场照明中,通过单一透镜盐体模型试算表明,与传统一次波照明相比,多次波照明方法的波场信息更丰富、盐下构造照明更清晰、照明阴影区域更小.将多次波照明分析应用到Pluto速度模型,对比分析可以看出多次波照明分析方法更能适应复杂地质构造目标.通过多次波照明分析方法,我们能够对复杂地质构造的采集系统进行评价和优化,并预测地震偏移成像的质量.     

通用气象数据格式转换工具METPAD设计与实现

气象数据是现代天气预报和气候预测业务的重要基础支撑，种类众多格式复杂，针对气象数据应用研究中缺乏便捷通用的格式转换处理工具的问题，设计开发了一种通用气象数据格式转换工具，采用Python开发算法工厂并调用第三方气象数据处理库集成实现气象数据的解读分析和格式转换，支持多种主要气象数据的处理，面向应用场景，提供命令行和可视化应用终端。该工具已在北京高性能计算机应用中心网站发布，并在数值预报模式中试支撑环境中部署应用。