高丹草杂种及其亲本转录组SNP及等位基因特异性表达分析

为探究高丹草杂种及其亲本间单核苷酸变异与其杂种优势形成的关系, 以高丹草杂种及其亲本的根、茎和叶组织为试验材料, 采用Illumina Hiseq 2000进行转录组测序。对平均长度达58 122 160 bp的各测序样品序列信息进行检测后, 均检测到不少于58 000个SNP位点, 位于基因内的SNP个数显著多于位于基因间的SNP个数, SNP发生频率为1/741 bp, 平均转换颠换比为1.00∶1.53。在所有变异类型中, C/T和G/A发生频率最高。经过筛选得到198 (21%)个极显著偏向性等位基因表达偏向性SNP, 其中65%偏向父本白壳苏丹草, 并且很多在白壳苏丹草中具有高水平基因表达的转录本, 在高丹草杂种中的等位基因表达也偏向白壳苏丹草。在3种组织中, 分别有79%、78%和82%转录本的2个亲本等位基因表现出相对平衡的表达水平, 说明与顺式作用相比, 反式作用可能更多地影响了等位基因的特异性表达。选择6个极显著偏向性等位基因表达偏向性SNP-unigene进行qRT-PCR验证, 这些基因的差异基因表达模式与RNA-Seq分析结果一致。本研究采用Illumina 测序技术研究等位基因表达, 为高丹草杂种优势分析提供了依据, 也为其他饲草作物的相关研究提供了理论参考。     

基于COI条形码的根口水母科Rhizostomatidae水母分子系统进化研究

为探讨DNA条形码基因COI序列在根口水母科Rhizostomatidae水母物种鉴定中的有效性,分析了根口水母科3属6种水母及口冠水母科1属1种共计265条线粒体COI基因同源序列,利用MEGA 3.0计算根口水母科种内与种间的遗传距离,并基于邻接法(Neibour-Joining,NJ)、最大似然法(Maximum Likelihood,ML)和贝叶斯法(Bayesian,BI)构建了其分子系统进化树。结果表明:4个属7种水母种类COI基因同源序列长度为482 bp,种间遗传距离为0.065~0.235,平均遗传距离为0.198,种内遗传距离为0~0.032,平均为0.006,其中种间平均遗传距离(0.198)显著大于种内平均遗传距离(0.006),种间遗传距离是种内遗传距离的33倍;根口水母科水母种间遗传距离均大于Hebert推荐区分物种的最小种间遗传距离(0.02);采用NJ法、ML法和BI法构建的分子系统树拓扑结构基本一致,同一物种不同个体间均能聚成独立的单系群,表明COI基因可作为根口水母科水母种类准确鉴定的有效条形码基因;系统进化树显示,海蜇属为单系群,系统进化分析结果与形态分类学的观点并不十分一致。研究表明,COI基因序列在根口水母科不同阶元间变异较大,适合于根口水母科水母种类鉴定及群体水平的分子标记。     

基于线粒体COⅠ基因序列的辽宁沿海细纹子鱼群体遗传多样性分析

细纹子鱼(Liparis tanakae)主要分布于西北太平洋海域的朝鲜半岛、日本和我国渤海、黄海和东海,已成为黄渤海渔业资源的优势种类之一,并在黄渤海生态系统中的扮演着越来越重要的角色。因此,有必要对这一生态优势种的种群状况及遗传背景进行了解。根据线粒体COⅠ基因序列对辽宁沿海不同体色花纹的细纹子鱼辽东湾群体(n=20)和黄海北部群体(n=34)的遗传多样性和群体遗传结构进行了分析。结果表明,长度为623 bp的COⅠ基因片段,其A、T、G、C碱基的平均含量分别为22.3%,32.4%,26.9%,18.4%。在2个群体54 ind个体中共检测得到8个单倍型,其单倍型间遗传差异为0.2%~0.6%。两个群体的单倍型多样性指数和核苷酸多态性指数分别在0.56±0.06和0.70±0.05、0.001 0±0.000 9和0.001 7±0.001 3之间。分子方差分析显示两群体间无遗传分化。核苷酸不配对分析表明,细纹子鱼群体在50 000~116 000年前经历了群体扩张。     

牛磺酸对圆型臂尾轮虫种群增长及繁殖的影响

试验设4个处理,每个处理设4个重复,分别以0、0.4、0.8、1.2 g/L的牛磺酸处理轮虫,研究不同质量浓度的牛磺酸对圆型臂尾轮虫种群增长和繁殖的影响。试验期为264 h。结果表明：各处理组的轮虫种群增长均与对照组有显著差异,0.8 g/L处理组在整个试验周期内轮虫种群密度极显著高于其他各组。对照组种群密度和日平均增长率在试验进行至144 h时均达到最大值,而处理组种群密度最大值出现在168 h,且0.8 g/L处理组的种群密度峰值最大,168 h后对照组轮虫种群增长极显著下降。0~24 h时,对照组怀卵率迅速升高,而其余各组缓慢升高。168~264 h阶段内,对照组怀卵率迅速下降,而各处理组则缓慢下降。试验初步证实,牛磺酸可以促进圆型臂尾轮虫种群增长及繁殖,且当牛磺酸添加量为0.8 g/L时,轮虫的种群增长动态表现最好。     

温盐环境突变对海蜇幼体生存的影响

为配合2005年辽东湾渔场海蜇人工增殖放流项目，笔者对人工放流过程中，海蜇幼体由于从育苗室人海而引起的温盐环境突变以及在长途运输过程中引起的死亡率进行实验研究，其死亡率直接影响到海蜇的回捕率，进而对辽东湾渔场海蜇的资源量造成影响。实验中发现，在超出海蜇生存最佳盐度范围（20～30），海蜇在高温（30℃、35℃）条件下，较高盐度组（35、40）较较低盐度组（15、20）的海蜇幼体的生存状态好、成活率高。同时，在低温（10℃、15℃）条件下，较低盐度组（15、20）较较高盐度组（35、40）的海蜇幼体的生存状态好、成活率高。     

三峡库区小江流域水体富营养化的模糊评价

通过对三峡库区典型次级流域--小江水域水体实测,提出了三峡库区次级流域的评价体系及评价方法.考虑到富营养化评价标准和影响因子的不确定性,建立不同的评价指标所埘应的隶属度函数,确定其权重系数和模糊综合指数.并结合库区消落带水体实际情况,选用叶绿素a(Chla)、透明度(SD)、TP、TN和CODMn为参数进行模糊综合评价.结果表明:SD、Chla、TP、TN和CODMn含量差异很大,含量范围分别为:1.2～3.5 m、2.12～37.04 mg·m-3,0.026～0.103 mg·L-1、0.681～1.643 mg·L-1、1.15～3.05 mg·L-1.CODMn对水质富营养化的贡献率最小,Chla、SD、TP和TN是水体中主要的污染因子.在春夏季,水域大多处于中度富营养化状态.与其他评价方法相比,该方法具有操作简单、评价客观等优点.     

水温和光照对牙鲆亲鱼性腺成熟和产卵的影响

报道了不同水温和光照时间对牙鲆亲鱼性腺成熟和产卵的影响。通过提高水温和延长光照时间,可促使亲鱼提前1～5个月成熟和产卵,并得出促熟培育与光照时间和水温的相关方程式     

病毒诱导的基因沉默技术研究进展

病毒诱导的基因沉默技术(VIGS,Virus-induced gene silencing)是一种重要的生物技术,本文详细总结了VIGS技术的原理及发展、病毒载体的演化及其在植物抗病基因功能中的应用等方面的研究进展.     

黄斑海蜇的生态习性及移殖放流的可行性探讨

对黄斑海蜇的螅状体及水母体的生存适宜温度、盐度及营养因子进行研究，以探讨黄斑海蜇移植放流的可行性，水螅体及水母体的存活的下限温度用逐步副近法测得，适宜温度通过温度梯度实验测得，同时对螅状体设5个营养级别观察其横裂生殖率。结果表明，黄斑海蜇水螅体10℃以下不能存活，30℃是水螅体存活的最适温度。水母体在温度18－30℃、盐度12－30可正常生长。用黄斑海蜇的水母体做为检验海蜇水母体放流效果的标志种在理论上是可行的。