Reconstructing gene regulatory networks with a memetic-neural hybrid based on fuzzy cognitive maps

Reconstructing gene regulatory networks (GRNs) plays an important role in identifying the complicated regulatory relationships, uncovering regulatory patterns in cells, and gaining a systematic view for biological processes. In order to reconstruct large-scale GRNs accurately, in this paper, we first use fuzzy cognitive maps (FCMs), which are a kind of cognition fuzzy influence graphs based on fuzzy logic and neural networks, to model GRNs. Then, a novel hybrid method is proposed to reconstruct GRNs from time series expression profiles using memetic algorithm (MA) combined with neural network (NN), which is labeled as MANN_FCM-GRN. In MANN_FCM-GRN, the MA is used to determine regulatory connections in GRNs and the NN is used to determine the interaction strength of the regulatory connections. In the experiments, the performance of MANN_FCM-GRN is validated on both synthetic data and the benchmark dataset DREAM3 and DREAM4. The experimental results demonstrate the efficacy of MANN_FCM-GRN and show that MANN_FCM-GRN can reconstruct GRNs with high accuracy without expert knowledge. The comparison with existing algorithms also shows that MANN_FCM-GRN outperforms ant colony optimization, non-linear Hebbian learning, and real-coded genetic algorithms.

     

芽孢杆菌Bacillus sp.dwc-2对模拟地下水中U(Ⅵ)的还原行为研究

在厌氧条件下研究了西南地区一种典型土壤微生物芽孢杆菌Bacillus sp.dwc-2对模拟地下水中U(Ⅵ)的还原行为，重点考察了时间、无机阴离子、腐殖酸（HA）及富里酸（FA）对还原的影响，并利用TEM、EDS、SAED和XPS对还原后的样品进行了表征。结果表明：在pH=7.0、c_NaHCO3=5 mmol/L和T=303 K条件下，Bacillus sp.dwc-2对U(Ⅵ)的还原率随时间的增加而增加，24 h内最大还原率为12.2%，此后则随时间的增加逐渐降低；HA和FA对U(Ⅵ)的微生物还原行为有一定影响，其中HA和FA浓度为25 mg/L时，U(Ⅵ)的还原在24 h最明显，其还原率分别为14.2%和16.2%，但随着HA和FA浓度的继续增加，因在U(Ⅵ)离子与HA、FA形成的配合物表面形成致密的腐殖层，抑制了电子的转移，阻止了U(Ⅵ)的还原。此外，研究表明HCO₃^-也会抑制U(Ⅵ)的还原。TEM-SAED和XPS分析证实了还原过程中U(Ⅳ)的存在。上述结果可为真实环境中微生物还原U(Ⅵ)提供基础数据和参考。     

Chemotherapy response of pancreatic cancer by diffusion-weighted imaging (DWI) and intravoxel incoherent motion DWI (IVIM-DWI) in an orthotopic mouse model

Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medicine - To investigate the value of using diffusion-weighted imaging (DWI) and intravoxel incoherent motion DWI (IVIM-DWI) to assess the...     

亲子乐园空调送风方式的数值模拟研究

大型综合室内亲子乐园属于高大空间,设有游乐设施和游戏的特殊性使得对空间的舒适性要求一致,但是送风气流遇阻严重,室内存在较多气流死角,影响室内空气质量和儿童健康。因此其空调设计不仅需要考虑温度、风速的空间均匀度,还要考虑各点的空气龄和PMV-PPD指标。以天津某亲子乐园为研究对象,利用scSTREAM软件对适用于该房间的辐射供冷加新风、置换通风、混合通风三种空调方式的送风效果进行数值模拟分析,从流场的均匀性、人员的热舒适性等方面对模拟结果进行探讨,研究结果表明辐射供冷加新风方式的空间均匀性和PMV指标最佳,混合通风方式的空气龄最小。     

飞机撞击下高温气冷堆乏燃料厂房损伤研究

本文针对典型高温气冷堆乏燃料厂房在双发商用飞机撞击载荷下的响应及结构完整性开展研究，并探讨结构特性对撞击损伤的影响。对乏燃料厂房及飞机分别建立有限元模型，通过弹体-目标相互作用分析模拟了飞机撞击过程，综合IAEA与NRC的评价准则对乏燃料厂房在飞机撞击下的损伤程度进行评估。数值结果表明：厂房上对应于机身及发动机的撞击位置发生可接受的局部损伤；乏燃料贮存井墙体对于提高构筑物抗飞机撞击能力有重要作用。此外，构筑物外形对损伤有很大影响，圆柱形壳体的抗飞机撞击能力显著强于方形厂房，是核电厂厂房设计的优化方向之一。     

论携号转网行为的私法规制

以电信用户入网协议为切入点,电信用户的携号转网行为应受到《合同法》《消费者权益保护法》等私法规范的保护与限制。该行为引起的格式条款解释、合同终止、违约责任、损失赔偿等问题,不能仅靠《电信条例》等公法规范来调整。应当积极引导广大消费者用户以私法领域相关规定为依据,转变争议解决思维,拓宽纠纷处理途径,合理选择维权手段,以保护自身合法民事权益,与行业监管部门共同推动电信行业有序发展。     

全尾砂和废石联合胶结充填体最佳配比及应用

针对红岭铅锌矿分级充填骨料来源不足、地表废石堆积污染环境的情况,提出将该矿选厂产生的全尾砂和地表废石作为充填骨料的联合胶结充填方案。分别测试了全尾砂和地表废石的物理化学性质,验证了碎石和全尾砂作为联合充填骨料的可行性。通过充填配比试验,分析了不同配比全尾砂废石充填体强度特性,得出了最佳充填配比。结果表明,充填试块的强度随灰砂比减小而减小,随养护龄期增加呈增大趋势,随充填料浆质量浓度增大而增大,最佳配比为: 胶结充填灰砂比1∶8、普通充填灰砂比1∶12,全尾砂∶废石配比4∶6,质量浓度78%。根据研究结果,在红岭铅锌矿进行了全尾砂废石充填技术工业应用,证实该技术可行。     

燃料电池空气电极的孔道结构调控

燃料电池是将化学能转化成电能的装置，其空气电极催化层的设计，既要包含丰富的、易于接近的反应活性位，也要具备高度连通的电子、质子以及反应物、产物传质通道，因此电极必须具有特定三维几何结构形貌和有序分布的各功能化孔道，确保催化活性位得以充分利用以及反应可以连续进行。针对催化剂孔道的几何结构调控，本文调研了最近报道的一系列研究工作，从模板法、高温相变法、模板/相变复合方法以及基于金属有机框架材料进行孔道设计等四种主要方法出发，综述了该领域的最新研究进展。