基于本体的神经信息学概念及其关系研究

目的：通过构建神经信息学本体,为神经信息学研究提供良好的信息整合、知识表示、文本挖掘、智能教育和数据共享服务。方法：分析生物医学领域已有的统一医学语言系统、基因本体、癌症本体、解剖学本体、疾病本体和药物本体的结构和内容,对神经信息学领域专业概念及其关系进行了探讨,提出了神经信息学本体的设计原则、标准和规范、构建方式和基本流程,并利用Protégé工具编制本体。结果：构建了基于多层次概念语义网络的、符合网络本体语言（web ontology language,OWL）规范的神经信息学本体。结论：神经信息学本体可以从不同层次的形式化模式上给出神经信息学领域概念和概念之间相互关系的明确定义,形成清晰的神经信息学理论框架,实现对相关领域知识的共同理解。     

慢性心瓣膜病

<正> 临床上引起慢性心瓣膜病的病因很多,除了先天性与风湿性心瓣膜病外,其它疾病,诸如感染性心内膜炎、结缔组织与遗传性疾病、非细菌性栓塞性心内膜炎、心瓣膜老化等亦常可导致慢性心瓣膜损害。由于病因及发病机制各异,其临床表现与心瓣膜病损所引起的血液动力学改变亦不尽相同,故应加以鉴别。本文综合有关文献,对除了先心病以外的常见慢性心瓣膜病概述如下。风湿性心瓣膜病风湿性心瓣膜病亦称慢性风湿性心脏病,是风湿热反复发作累及心脏时所遗留的慢性心瓣膜病变;它在成人心血管疾病住院构成比中常居首位,以20—40岁最为多见,女多于男。一般认为,风湿热与甲组乙型溶血性链球菌所致的变态反应有关,目前多倾向于毒素—免疫学假说。约50%风湿热首次发作者出现心脏炎。患者的心肌、心内膜、心包皆可受     

各种人造心瓣膜与生物心瓣膜的介绍

近二十多年来心脏外科发展很快,心脏瓣膜置换术是重要成就之一。过去许多不能治疗的严重心瓣膜疾病,如伴有重度瓣膜增厚和钙化的风湿性瓣膜狭窄和闭锁不全、先天性心内膜垫缺损、室间隔缺损伴有主动脉闭锁不全、先天性二尖瓣病变或     

老年性退行性心瓣膜病(附15例临床分析)

<正> 老年性退行性心瓣膜病是老年人常见的、颇有临床意义的心瓣膜疾病。国外文献报告其发生率甚高,英国Pomerance 报告尸检162例心力衰竭患者病因中心瓣膜钙化退行性变者占45%,仅次于冠心病居第二位。Wong     

基于“肺阴虚证”本体的中医证候知识库构建方法研究

在本体思想的指导下,以Protégé为工具建立基于“肺阴虚证”病机规则的资源描述框架（RDF）,以探讨应用本体技术构建中医证候知识库的可行性。本体研究将为中医领域内的知识组织提供一种新的方法。     

老年退行性心瓣膜病误诊为风湿性心瓣膜病9例分析

老年性退行性心瓣膜病是老年人常见的瓣膜疾病,由于瓣膜老化、退行性变、钙质沉积引起瓣膜狭窄合并关闭不全时易误诊为风湿性瓣膜病.近十年来我们收治误诊为风湿性主动脉瓣病的老年退行性主动脉瓣病 9 例,现分析如下.     

基于OWL的中医证候知识建模方法研究

万维网本体语言（Web Ontology Language,OWL）旨在构建内容丰富、逻辑严谨、可在万维网上共享的领域本体,为表达复杂的中医证候知识体系提供了潜在的解决方案。研究探索如何基于OWL对中医证候知识进行建模,提出了针对证候层次结构、证候特征、证候疾病复合概念及“证候加减”的知识建模方法。     

基于本体的孕产知识库构建及应用

将本体、知识库与孕产疾病知识结合构建基于本体的孕产知识库,阐述具体构建步骤,包括明确本体领域范围,列举概念术语,定义类、属性及类之间的关系,创建本体实例等方面,促进孕产知识复用与共享。     

心脏二尖瓣瓣膜疾病手术11例临床分析

目的: 探讨外科治疗心脏二尖瓣瓣膜疾病效果。方法: 分析11例心脏二尖瓣瓣膜疾病患者接受外科手术治疗的临床资料。术前心功能Ⅱ~Ⅳ级,心电图示心房颤动4例。均行二尖瓣置换,其中2例同时行三尖瓣成形术,置换瓣膜均为人工机械瓣。结果: 手术死亡1例,为低心排出量综合征。余随访3~6个月心功能明显改善。结论: 二尖瓣置换、三尖瓣成形术是治疗心脏二尖瓣瓣膜疾病的可靠、有效手段。     

糖尿病医案本体库的构建及应用研究

当前中医医案缺少规范统一的形式化描述方法,难以实现有效分析和检索,利用本体技术针对中医糖尿病医案进行分析和描述,通过改进的七步法构建糖尿病医案本体库,在protégé系统中完成了对本体中类实例、属性和关系的定义和实现。糖尿病医案本体库的构建步骤包括:确定本体的专业领域和范畴;复用现有的本体;收集医案书籍,获取糖尿病领域知识;定义糖尿病医案的类、属性及其关系,建立糖尿医案本体;本体的检验;本体的存储。     

卫生政策科研本体构建研究

在对现有科研本体和本体构建方法进行分析的基础上,利用Protege工具进行开发,选择0WL作为卫生政策科研本体描述语言,阐述了构建过程,初步设计了卫生政策科研本体模型,最后提出了问题和展望。     

基于本体的药学领域知识管理

本体作为领域知识的规范化形式语言,已成为领域知识管理的强有力工具。运用"七步法"构建思路,探讨了基于本体的药学领域知识构建和管理。     

Traditional Chinese Medicine (TCM) Domain Ontology: Current Status and Rethinking for the Future Development

The past twenty years have seen the increasingly important role of ontology in traditional Chinese medicine (TCM). However, the development of TCM ontology faces many challenges. Since the epistemologies dramatically differ between TCM and contemporary biomedicine, it is hard to apply the existing top-level ontology mechanically. “Data silos” are widely present in the currently available terminology standards, term sets, and ontologies. The formal representation of ontology needs to be further improved in TCM. Therefore, we propose a unified basic semantic framework of TCM based on in-depth theoretical research on the existing top-level ontology and a re-study of important concepts in TCM. Under such a framework, ontologies in TCM subdomains should be built collaboratively and be represented formally in a common format. Besides, extensive cooperation should be encouraged by establishing ontology research communities to promote ontology peer review and reuse.     

基于功能模块组织癌细胞系基因表达谱的关联规则

目的提出一种在功能模块化水平上组织大量基因表达谱关联规则的新方法.方法以高频出现在关联规则后件中的基因为基础分类关联规则,再选择显著聚集前件基因的GO基因功能类作为功能模块关联规则的前件,获得功能模块表达关联规则.结果根据NCI60数据,发现了一些与癌症相关的基因及相应的基因功能模块表达关联规则.结论利用功能模块表达关联规则可以有效地挖掘疾病基因表达谱.     

基于中国哲学与现代科学视域的中医学气本体论

本体论是研究宇宙本原的哲学问题,关乎一切存在的本性问题探讨.不同本性的本体论是通过与之相应的认识论而得到认识,且决定着不同的方法论,进而决定了不同思维模式的生成.关于对本体论的认识,气本体和物本体的生命认知路径是不同的.在中医学思想体系中,宇宙的本体是气,气本体比物本体更接近于宇宙本身.从气的基质、气化、多态、功用、感...     

Using the wisdom of the crowds to find critical errors in biomedical ontologies: a study of SNOMED CT

Objectives The verification of biomedical ontologies is an arduous process that typically involves peer review by subject-matter experts. This work evaluated the ability of crowdsourcing methods to detect errors in SNOMED CT (Systematized Nomenclature of Medicine Clinical Terms) and to address the challenges of scalable ontology verification.Methods We developed a methodology to crowdsource ontology verification that uses micro-tasking combined with a Bayesian classifier. We then conducted a prospective study in which both the crowd and domain experts verified a subset of SNOMED CT comprising 200 taxonomic relationships.Results The crowd identified errors as well as any single expert at about one-quarter of the cost. The inter-rater agreement (κ) between the crowd and the experts was 0.58; the inter-rater agreement between experts themselves was 0.59, suggesting that the crowd is nearly indistinguishable from any one expert. Furthermore, the crowd identified 39 previously undiscovered, critical errors in SNOMED CT (eg, ‘septic shock is a soft-tissue infection’).Discussion The results show that the crowd can indeed identify errors in SNOMED CT that experts also find, and the results suggest that our method will likely perform well on similar ontologies. The crowd may be particularly useful in situations where an expert is unavailable, budget is limited, or an ontology is too large for manual error checking. Finally, our results suggest that the online anonymous crowd could successfully complete other domain-specific tasks.Conclusions We have demonstrated that the crowd can address the challenges of scalable ontology verification, completing not only intuitive, common-sense tasks, but also expert-level, knowledge-intensive tasks.     

基于本体的向量空间模型在电子病历中的研究

电子病历在临床诊断与治疗中的应用日益广泛,如何有效利用电子病历系统中的大量数据辅助医生进行分析与诊断,是一个非常重要的问题.传统的基于索引的检索方法已不能满足对大型电子病历数据库检索的需要,将基于本体的向量空间模型引入到电子病历中进行研究,是一项非常有意义的工作.在分析传统电子病历检索方法不足的基础上,结合模糊本体概念,提出一种基于本体的向量空间模型.该方法充分利用了模糊本体中隶属度的概念,对查询语句和电子病历关键词向量空间模型进行模糊本体概念映射及概念相似度计算.最后通过数值实验,对该方法在查全率和查准率方面进行了性能分析,证明其具有良好性能.     

基于本体论的医疗设备技术培训在线学习平台的构建

目的：构建医疗设备技术培训在线学习平台,加强青年工程师的技术学习和经验交流。方法基于本体理论,采用OWA框架构建医疗设备技术知识体系;采用本体开发工具Protege和网络本体语言（OWL）创建基于XML的技术培训课程体系。结果该学习平台的应用,使医疗设备技术培训课程的知识体系规范化、系统化,便于后台管理与统计分析。结论该平台能够满足青年工程师的在线学习与经验交流的需求。     

构建中医药学领域本体的实践

以中医药一体化语言系统构建中医药学领域本体是近年国内中医药界开展的探索性工作。本文从中医药学领域本体构建的意义、思路和方法、实践、存在问题和展望等方面进行论述。