天麻-丹参药对治疗高血压作用机制的网络药理学分析及实验验证

目的 基于网络药理学方法及动物实验验证探讨天麻-丹参药对治疗高血压的作用机制。方法 （1）通过TCMSP、BATMAN及TCMIP数据库筛选天麻-丹参药对活性成分及其作用靶点;通过Drugbank、Genecard、TTD、Disgenet数据库检索获得高血压疾病相关靶点;对药对的活性成分作用靶点与高血压疾病相关靶点取交集（共同靶点）,所得交集靶点即为天麻-丹参药对治疗高血压的潜在作用靶点。将天麻-丹参药对活性成分及其作用靶点导入Cytoscape 3.9.1软件,构建“中药-活性成分-靶点”网络,筛选关键活性成分;构建潜在作用靶点的蛋白互作（PPI）网络,筛选潜在核心靶点;使用Metascape平台对潜在作用靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析。选择关键活性成分与潜在核心靶点进行分子对接验证。（2）将30只雄性自发性高血压大鼠（SHR）随机分为模型组、西药组（坎地沙坦酯,0.72 mg·kg-1）及天麻-丹参药对低、中、高剂量组（2.25、4.50、9.00 g·kg-1）,另选雄性WKY大鼠为空白组,每组6只,每日1次,连续灌胃给药8周。分别在给药前及药物干预2、4、6、8周后检...     

基于网络药理学探究槲寄生-黄芪治疗老年高血压病的作用机制

背景：高血压是多种心血管疾病的重要风险因子之一,我国老年高血压病存在患病率高、控制率低的特点。益肾降压方为临床治疗老年高血压病的有效方剂,槲寄生与黄芪药对是组方的精髓,但其作用机制尚不明确。网络药理学能够阐明药理作用机制、寻找药效物质基础和潜在靶点。目的：基于网络药理学方法探究益肾降压方中槲寄生-黄芪药对治疗老年高血压病的作用机制。方法：检索TCMSP数据库,筛选槲寄生、黄芪的活性成分及靶点,利用UniProt数据库对靶点信息进行标准化,通过GeneCards数据库获取老年高血压病相关疾病靶点,在Venny 2.1.0在线平台上制作韦恩图,获得槲寄生、黄芪与疾病的共同靶点,通过Cytoscape软件构建药物-活性化合物-靶点-疾病网络,通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用DAVID数据库对交集靶点进行富集分析。结果：筛选得到槲寄生-黄芪药对治疗老年高血压病的核心成分为槲皮素、异鼠李素、刺芒柄花素、β-谷甾醇、山柰酚等,核心靶点包括白细胞介素（Interleukin,IL）-6、肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor,TNF）、丝氨酸/苏氨酸蛋白激...     

基于网络药理学与药理实验验证探讨黄葵胶囊治疗慢性肾炎的作用机制

目的：基于网络药理学和药理实验探索黄葵胶囊治疗慢性肾炎的药效及作用机制。方法：通过文献挖掘并结合PubChem数据库收集黄葵胶囊成分及相关信息，使用SwissTargetPrediction和GeneCards数据库分别预测药物靶点与慢性肾炎疾病靶点，利用STRING数据库和Cytoscape 3.8. 0软件进行蛋白互作和拓扑分析并筛选核心靶点，Metescape平台对核心靶点进行京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析和基因本体（GO）富集分析。32只SD大鼠建立慢性肾小球肾炎大鼠模型，随机分为模型组、氯沙坦钾组以及黄葵胶囊中剂量组（HKJ-M）、黄葵胶囊高剂量组（HKJ-H），每组8只；另取8只SD大鼠为正常组。各组分别给予相应药物灌胃4周，观察各组大鼠肾组织病理学变化，检测24 h尿蛋白含量、血肌酐、血尿素氮、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白介素-6(IL-6)、血清丙二醛（MDA）和超氧化物歧化酶（SOD）水平。结果：通过网络药理学收集整理得到57个黄葵胶囊治疗慢性肾炎潜在作用靶点，筛选出TNF、MMP9和IL2等炎症相关核心靶点及MAPK、TNF和IL-17等炎症信号...     

基于网络药理学探究枸杞子-菊花药对治疗糖尿病视网膜病变的作用机制

目的：基于网络药理学探究枸杞子-菊花药对治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy, DR)的干预机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索枸杞子、菊花的活性成分及相关靶点。利用Cytoscape 3.9.1绘制“药对-活性成分-作用靶点”网络图，并进行拓扑分析筛选枸杞子-菊花药对治疗DR的主要活性成分。利用GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库及药物靶标数据库检索DR相关靶点。将活性成分相关靶点与疾病靶点导入Venny 2.1在线平台，绘制韦恩图，交集靶点即为枸杞子-菊花药对治疗DR的潜在靶点。将潜在靶点上传至STRING数据库构建PPI网络关系，导入Cytoscape 3.9.1软件进行可视化，PPI网络拓扑分析筛选枸杞子-菊花药对治疗DR的核心靶点。将核心靶点输入Metascape在线平台进行基因本体(gene ontology, GO)富集分析及京都基因与基因组百...     

基于网络药理学及分子对接方法探讨大豆异黄酮治疗骨质疏松的机制

目的 基于网络药理学及分子对接方法探讨大豆异黄酮（SI）治疗骨质疏松（OP）的可能作用机制。方法 通过文献检索收集SI所含成分，并利用SwissADME数据库根据Lipinski类药五原则评估各成分的药代动力学参数，筛选SI有效活性成分。通过STITCH及SwissTargetPrediction数据库预测SI有效活性成分的作用靶点；通过TTD、DrugBank及DisGeNET疾病数据库获取OP疾病相关靶点。将SI活性成分靶点与OP疾病相关靶点导入Draw Venn Diagram在线平台，得到两者交集靶点（共同靶点），即SI治疗OP的潜在作用靶点。利用Cytoscape 3.7.1软件构建SI治疗OP的“活性成分-潜在作用靶点”网络。通过STRING数据库和Cytoscape软件对交集靶点进行蛋白相互作用（PPI）分析，并用cytoHubba插件筛选出核心靶点。利用Metascape平台对交集靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析。利用AutoDock Vina软件对SI有效活性成分与核心靶点进行分子对接。结果 共收集大豆异黄酮成分12种，通过SwissADME数据库筛选出3种有效...     

基于网络药理学及实验研究探究坤泰胶囊异病同治卵巢早衰及绝经综合征作用机制

目的：基于异病同治理论,采用网络药理学及动物实验分析坤泰胶囊治疗卵巢早衰和绝经综合征的作用机制。方法：在中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、中药分子机制生物信息学分析工具（BATMAN-TCM）获取坤泰胶囊活性成分和作用靶点,通过GeneCards、OMIM等数据库获得疾病靶点,取坤泰胶囊治疗卵巢早衰和绝经综合征的共同靶点。构建“药物-疾病-共同靶点”及蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,DAVID数据库分别进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。动物实验：制备卵巢早衰及围绝经期大鼠模型,随机分为空白组（假手术组）、模型组、补佳乐组（模型组+补佳乐干预）、坤泰胶囊组（模型组+坤泰胶囊干预）,每组8只。采用酶联免疫吸附测定（ELISA）方法检测各组大鼠卵泡生成素（FSH）、雌二醇（E2）及黄体生成素（LH）水平,同时比较各组大鼠血清中白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子-α（TNF-α）水平。结果：1）获得坤泰胶囊治疗卵巢早衰及绝经综合征共有靶点128个,包括甘油醛-3-磷酸脱氢酶（GAPDH）、原癌基因酪氨酸受体激酶（SRC）、IL-6、TNF、雌激素受体1（ESR1）等。核心靶点主要富集在癌症、HIF-1、PI3K-AKT、TNF等信号通路。2）实验结果显示：卵巢早衰及绝经综合征模型组较空白组（假手术）大鼠血清FSH、LH均明显增高,而E2显著降低。药物干预后,坤泰胶囊组较模型组大鼠血清FSH、LH水平均有所降低,E2水平升高;与空白组（假手术组）比较,模型组大鼠血清IL-6、TNF-α水平均明显上升(均P<0.05)。药物干预后,坤泰胶囊组大鼠血清IL-6、TNF-α水平较模型组明显下降(均P<0.05)。结论：坤泰胶囊治疗卵巢早衰和绝经综合征可能通过调控GAPDH、SRC、IL-6、TNF等核心靶点参与HIF-1信号通路、PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路等发挥治疗作用。     

基于网络药理学研究丹参-红花治疗冠心病的物质基础及作用机制

目的：基于网络药理学探讨丹参-红花治疗冠心病（CHD）的物质基础和作用机制。方法：借助中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索中药丹参、红花的化学成分,根据口服生物利用度和类药性筛选化学成分,通过PubChem、PharmMapper在线数据库预测化学成分的靶点,检索DisGeNET在线数据库获取CHD的相关靶点,利用Venny 2.1软件获得药物-疾病之间的共同靶点,在STRING 10.5数据库中导入共同靶点并进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析,使用Cytoscape 3.7.1软件构建药物-成分-靶点-疾病网络,最后通过DAVID 6.8在线数据库进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：从丹参-红花中筛选得到13个关键成分,10个核心靶点;通过GO分析得到292个生物过程(BP),25个细胞组分(CC),和62个分子功能(MF);通过KEGG分析得出富集通路115条。槲皮素、木犀草素、山柰酚、丹参酮Ⅱa、黄芩苷等成分可能是丹参-红花治疗CHD的核心成分;IL6、AKT1、VEGFA、CXCL8、PTGS2、IL1B、NOS3、CCL2、MMP9等为核心靶点;流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、HIF-1信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路、松弛素信号通路等为关键通路。结论：丹参-红花通过调节冠状动脉粥样硬化进程、减轻血管炎症反应、扩张冠状动脉、抗血栓形成、减轻心肌缺血缺氧损伤,从而发挥治疗CHD的作用。     

基于网络药理学探讨玉屏风散治疗肝细胞癌的作用机制

目的：通过网络药理学探讨玉屏风散治疗肝细胞癌（HCC）的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）对玉屏风散中所含药物进行检索，得到玉屏风散活性成分所对应的靶基因，再利用GeneCards数据库筛选肝细胞癌所对应的基因，利用Cytoscape 3.7.2软件绘制“药物-疾病-成分-靶点”网络图。使用STRING数据库将所得数据进行导入，构建玉屏风散治疗肝细胞癌的核心靶点的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，然后将以上所得数据导入至Cytoscape 3.7.2中进行网络拓扑参数分析，并以Degree值大于平均值进行筛选，最终得到玉屏风散治疗HCC的核心靶点的相关信息，将核心靶点在DAVID数据库中进行导入，以进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：玉屏风散的活性成分对应靶点共92个，其中有效成分包括细胞肿瘤抗原P53、凋亡调节剂Bcl-2、血管内皮生长因子受体2、白细胞介素-6（IL-6）等，在其治疗肝细胞癌中共筛选出IL-6、TP53、TNF、NOS3、ESR1、JUN、PTGS2等26个的核心靶点。结论：玉屏风散治疗肝细胞癌主要靶点与细胞核、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、MAPK级联反应的正调控、类固醇激素受体活性等有关。     

基于网络药理学研究五苓散治疗慢性肾衰竭的潜在机制

目的：基于网络药理学方法,研究五苓散治疗慢性肾衰竭的机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索五苓散活性成分,使用有机小分子生物活性（PubChem）数据库、瑞士生物信息学研究所(SIB)数据库进行靶点排查。根据GeneCards数据库得到疾病相关靶点。并利用Omicshare平台将药物及疾病靶点进行匹配。采用String Version 10.5数据库构建靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。利用Omicshare软件对关键靶点进行基因本体（GO）富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。采用CytoscapeVersion3.8.0对药物-成分-靶点-信号通路进行分析。结果：筛选得到五苓散活性成分532个,治疗靶点112个,五苓散治疗疾病的主要活性成分包括啤酒甾醇（Cerevisterol）,β谷甾醇（β-sitosterol）,泽泻醇（Alisol B）等;治疗疾病的核心靶点包括肿瘤坏死因子-α（TNF-α）、白细胞介素-6（IL-6）等;主要涉及的信号通路包括Toll-like Receptor（TLR）、T Cell Receptor（TCR）等,生物过程主要包括细胞凋亡过程、磷酸盐代谢过程等。结论：本研究以网络药理学方式探究了五苓散治疗慢性肾衰竭的多途径-多靶点的作用机制,推断五苓散主要通过调节TLR／NF-κB、T Cell Receptor等信号通路,抑制TNF-α、IL-6等相关炎症介质活性从而延缓慢性肾衰竭。为进一步的实验提供理论参考。     

基于网络药理学及分子对接探讨杜仲叶防治骨质疏松的作用机制

目的：采用网络药理学-分子对接预测杜仲叶防治骨质疏松症的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）及SwissTargetPrediction分析平台对杜仲叶活性成分及作用靶点进行筛选,使用GeneCards、在线人类孟德尔遗传（OMIM）数据库、治疗靶点数据库（TTD）对骨质疏松症的对应靶标进行筛选,将中药靶基因与疾病靶基因相交集,将交集靶点导入Cytoscape软件构建成分靶点网络,使用STRING分析平台及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,筛选核心靶点。对中药-疾病共同靶标进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）功能富集分析,得出中药-疾病共同靶标相关的信号通路,最后运用AutoDock与Pymol软件对预测靶标与其对应的成分进行分子对接。结果：筛选后得到杜仲叶治疗防治骨质疏松症的有效成分7个,杜仲叶-骨质疏松症共同靶标231个,并推断其作用机制可能与动脉粥样硬化信号通路的下游核因子κB信号通路,MAPK信号通路、TNF、PI3K-AKT、IL-17及HIF-1信号通路等有关,且MAPK1、STAT3、VEGFA、IL6、TP53、EGF、AKT1、JUN、MAPK8、EGFR、TNF基因可能起着关键的作用。结论：杜仲叶可能通过减轻氧化应激损伤、抑制破骨细胞形成、促进成骨细胞形成等作用发挥抗骨质疏松作用。