合肥市某小学急性呼吸道感染疫情的病原学分析

目的分析合肥市某小学一起急性呼吸道感染疫情病原学,为疫情发生的生物学病因提供依据。方法采用实时荧光PCR方法(Real-time PCR)对采集的10份患者咽拭子标本进行流感病毒和腺病毒核酸筛查,检出的腺病毒核酸阳性标本经普通PCR扩增腺病毒六邻体基因片段以进行序列测定,测序结果在Genbank上进行Blast比较并作系统进化树分析,以确定其病毒型别。结果 10份咽拭子标本流感病毒核酸检测结果均为阴性,7份标本检出腺病毒核酸,进一步通过基因测序、序列比对、基因进化树分析确定为腺病毒3型。结论依据实验室检测结果并结合流行病学调查和临床症状,确认该起急性呼吸道感染疫情的病原体为人腺病毒3型。     

一起B型流感疫情的快速检测

目的：采用荧光定量RT-PCR法对疑似流感疫情标本进行快速检测,为疫情中病原体的确定提供快速准确的实验室依据。方法：采集疑似流感人员咽拭子分泌物标本,用荧光定量RT-PCR法快速检测标本中是否存在流感病毒核酸。同时接种MDCK细胞进行分离培养、分型鉴定。结果：共采集标本26份,H5亚型禽流感及甲型流感病毒荧光定量RT-PCR结果均为阴性。取其中10份进行B型流感病毒荧光定量RT-PCR检测,有7份阳性。26份标本中共有13份分离出病毒株,经鉴定均是B型流感病毒。结论：荧光定量RT-PCR法准确快速的检测出流感病原体,并且比组织培养敏感性要高,为疫情的处理提供了及时正确的指导方向。     

茂名市首例甲型H1N1流感病例的实时荧光RT—PCR检测

[目的]对茂名市首例甲型H1N1流感病例进行病毒核酸检测,为甲型H1N1流感疫情的防控提供参考。[方法]采用实时荧光逆转录PCR法对采集的病人咽拭子标本进行甲型H1N1流感病毒核酸检测。[结果]共采集病人2份咽拭子标本,其中1份咽拭子标本的实时荧光RT—PCR检测结果显示H1及N1的RT—PCR反应体系扩增曲线有明显对数增长且Ct值分别为25．21（H1）和25．07（N1）,为甲型H1N1流感病毒核酸阳性;另1份咽拭子标本则呈阴性。后采集第3份咽拭子标本连同第1分标本送广东省疾控中心复检,结果2份标本的甲型H1N1流感病毒核酸检测均为阳性。[结论]这名病人为福建省第2例甲型H1N1流感病毒感染者的密切接触者,由于及时采用灵敏度高,特异性强,检测时间短的实时荧光逆转录PCR方法检测,快速确诊了病例,为疫情的控制争取了时间,防止了2代病例的出现。     

一起由腺病毒和肠道病毒混合感染引起的发热呼吸道感染暴发疫情的实验室快速诊断

目的对一起婴幼儿不明原因发热呼吸道感染暴发疫情进行实验室快速诊断,探索病因。方法采集患儿咽拭子和痰液标本共19份,对所有标本进行核酸提取、运用荧光PCR和荧光RT-PCR法检测腺病毒等引起急性呼吸道感染的8种18型重要病毒的特异性基因片段。对腺病毒和肠道病毒核酸阳性标本进行序列测定,运用生物学软件对测定序列进行处理分析。结果 19份标本腺病毒(Adenovirus,Ad V)核酸阳性,11份标本肠道病毒(Enterovirus,EV)核酸阳性,4份标本鼻病毒(Rhinovirus,RHV)核酸阳性。Ad V的核酸检出阳性率均为100%,标本采集时间最长为发病后10天。EV在发病3天内痰液标本中核酸检出率为83.33%,发病3天后为42.86%。Ad V的基因型别为Ad V-B7型。结论本起发热呼吸道感染暴发疫情由Ad V-B7型和EV混合感染引起,并且Ad V-B7型感染时间长于EV。     

感染性腹泻疫情检测结果分析

目的明确一起感染性腹泻疫情的病原体和来源。方法通过流行病学调查,查明罹患率。采集疑似感染性腹泻患者肛拭子、生活饮用水、空气和环境涂抹拭子,用实时荧光定量RT-PCR法快速检测轮状病毒A群、B群、C群,诺如病毒GⅠ、GⅡ型和肠道腺病毒三种感染性病毒核酸,肛拭子采用细菌培养检测肠道致病菌,生活饮用水检测菌落总数和大肠菌群。结果共采集病例标本21份,生活饮用水2份,厕所空气样2份,环境标本标本厕所蹲位地面墙面、寝室门把手地面等涂抹拭子20份,病例标本13份、环境标本3份为诺如病毒核酸GⅡ型,其他轮状病毒A群、B群、C群,诺如病毒GⅠ型和肠道腺病毒核酸、肠道致病菌检测为均阴性,饮用水菌落总数和大肠菌群检测均未检出。结论该起疫情为诺如病毒感染所致。暴发的可能传播为人与人接触传播和空气气溶胶传播。实时荧光定量RT-PCR法准确快速的检测出诺如病毒GⅡ型病原体,为疫情的处理提供了及时正确的方向。     

吴起县学生群体性发热疫情的快速检测诊断

目的 搞清2006年吴起县学生群体性发热疫情的病原。方法采集了20例发热学生的鼻咽拭子和血液标本，使用美国QUICKVUE流感A＋B快检试剂进行现场检测；在国家级流感监测网络实验室（陕西省疾病预防控制中心），使用美国DHI公司呼吸道病毒抗原七项（甲、乙型流感病毒，副流感病毒1、2、3型，腺病毒，呼吸道合胞病毒）荧光检测试剂盒进行直接荧光抗原检测，用RT—PCR方法进行乙型流感病毒核酸检测。结果对13份鼻拭子标本进行了现场快速抗原检测，其中7份小学生标本显示乙型流感病毒抗原阳性，阳性率为53．85％；对12份鼻咽拭子进行了免疫荧光抗原检测，其中3份呈乙型流感病毒抗原阳性，阳性率为25．00％；对17份鼻咽拭子标本进行了RT—PCR检测，12份显示乙型流感病毒核酸阳性，阳性率为70．59％。结论根据以上实验室快速检测结果，引起此次学生群体发热的病原为乙型流感病毒。     

江西省一起腺病毒感染的出血性结膜炎疫情的分子流行病学溯源

目的 对江西省某地一起暴发出血性结膜炎人腺病毒进行Hexon基因特征分析,在基因层面对该疫情进行病原溯源,为防控策略提供技术支撑。方法 采集出血性结膜炎患者结膜拭子和咽拭子标本,采集排水口和浮板涂抹拭子标本。采用Real - time RT - PCR方法对所有标本进行人腺病毒（HAdV）和人肠道病毒（HEV）核酸检测,对核酸阳性的标本进行Hexon基因部分片段序列测定,运用Bioedit 7.0和MAGE 6.0等生物学软件对测定序列进行处理分析。结果 共采集出血性结膜炎5名患者结膜拭子标本4份,咽拭子标本1份,共检出人腺病毒核酸阳性标本4份,阳性率为80%,标本采集时间最长为发病后10 d。采集排水口和浮板涂抹拭子各1份,均为HAdV的核酸阳性。所有标本HEV核酸检测阴性。共获得4条病例标本Hexon基因部分片段序列,经Hexon基因测序鉴定均为HAdV - E4基因亚型。结论 该起出血性结膜炎疫情可能由HAdV - E4基因亚型污染游泳池水引起。     

徐州市某小学一起腺病毒引起的急性呼吸道感染暴发疫情调查

目的了解一起小学生急性呼吸道感染暴发疫情的病原和流行病学特征,为学校类似传染病暴发疫情的防控提供参考。方法制定病例定义,开展现场流行病学调查,并采集病例咽拭子标本进行病毒核酸检测。结果共报告病例22例,罹患率为1.05%,均为二年级同班学生,临床症状以发热(体温38.0℃~40.7℃)为主(100.0%),其次为咽痛(54.55%)和咳嗽(36.36%)。采集病例咽拭子标本12份,均为腺病毒核酸阳性。通过现场采取积极有效防控措施,及时控制了疫情的蔓延。结论该疫情是由腺病毒引起的急性呼吸道感染暴发,与患者密切接触可能是暴发的主要原因。     

北京市东城区一起GⅠ型诺如病毒感染暴发疫情的调查报告

目的 通过对某小学（以下称F小学）一起GⅠ型诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发疫情进行调查和分析,为有效控制学校内发生的急性胃肠炎暴发疫情提供科学依据和经验借鉴。方法 采用现场流行病学调查方法,对F小学的急性胃肠炎暴发疫情中病例进行个案调查,采集病例和餐饮人员样本和环境样本,采用实时荧光PCR方法检测肠道病毒核酸。结果 2018年10月19 - 22日,F小学共报告急性胃肠炎病例145例,罹患率为21.77%。采集呕吐物及粪便标本29份,采集环境涂抹标本10份, 经检测9份粪便标本和2份涂抹标本为GⅠ型诺如病毒病毒核酸阳性。结论 此次疫情为一起由GⅠ型诺如病毒引起的小学生急性胃肠炎暴发疫情,餐饮人员隐性感染可能与本次疫情有关。     

赣州市首例人感染 H7N9 禽流感病例的检测报告

摘要:目的　监测赣州市的H7N9禽流感疫情,为该市流感疫情的判定及制定防控措施提供依据。方法　从国家级流感病毒哨点监测医院中采集疑似流感样病例监测标本,用荧光PCR方法检测流感病毒各型核酸片段。结果　在日常监测标本中检出一份H7N9禽流感病毒核酸片段阳性标本。结论　在日常流感病毒监测中检出赣州市首例H7N9禽流感病例。     

实时荧光定量PCR法在流感病毒暴发疫情病原学检测诊断中的应用

目的对疑似流感病毒患者标本进行病毒核酸检测诊断,探讨实时荧光定量PCR法在流行性感冒检测诊断中的意义。方法采用WHO标准实时荧光定量PCR法对2010年10月本地区采集的8份疑似甲型H1N1流感患者咽拭子标本进行病毒核酸检测。结果 8份咽拭子标本中有6份呈甲型H1N1流感病毒核酸阳性,阳性率75%。结论实时荧光定量PCR法操作相对简单,耗时短,特异性强,灵敏度高,可作为基层疾控中心流感疫情可靠的快速诊断方法。     

2009年鞍山地区甲型H1N1流感疫情实验室检测

目的:对鞍山市流感样病例采样进行甲型H1N1流感病毒核酸检测,为甲型H1N1流感疫情防控提供依据。方法:采集鞍山地区出现流感样症状的病例采集咽拭子600份,提取标本核酸,采用实时荧光PCR试剂盒检测。疑似病例进行A型/B型流感初筛、H1/H3分型、甲型H1N1检测,出院病人进行甲型H1N1检测。结果:疑似病例600份,确诊新甲型H1N1 135例,重症病例15例,死亡2例,而出院病例标本均为甲型H1N1阴性。结论:实验室检测为鞍山地区甲型H1N1流感疫情的确认、防控以及病人的处理提供了依据,发展实验室检测技术具有重要的意义。     

成都市首例学校聚集性甲型H1N1流感疫情实验室检测结果分析

目的 对成都市首例学校聚集性甲型H1N1流感疫情标本进行核酸检测,为甲型H1N1流感疫情的防控提供依据.方法 采集成都市出现流感样症状的学生咽拭子11份,提取标本核酸,采用实时荧光PCR试剂盒检测.疑似病例进行A型/B型流感初筛、H1/H3分型、甲型H1N1检测,出院病人进行甲型H1N1检测.结果 疑似病例标本11例,确诊甲型H1N1 7例,而出院病例标本均为甲型H1N1阴性.结论 实验室检测为成都市首例学校聚集性甲型H1N1流感疫情的确认、防控以及病人的处理提供了依据,发展实验室检测技术具有重要的意义.     

一起学校宋内志贺菌群体感染中荧光PCR辅助检测及意义

目的:对一起学校疑似水源性群体感染事件相关标本进行荧光PCR检测,为明确病原、处置疫情提供参考依据。方法:采集现场病例及可疑水源标本,与常规检测同步,以实时荧光PCR试剂盒筛检可疑肠道病毒(诺瓦克病毒)与细菌(产毒素大肠杆菌、沙门菌、痢疾杆菌、副溶血弧菌)。结果:病例标本荧光PCR均检出痢疾杆菌,部分水样增菌4 h检出痢疾杆菌阳性,8 h后则均为阳性。常规检测从病例标本中分得宋内志贺菌。结论:荧光PCR用于暴发疫情实验室辅助检测,准确快速,有利于及早明确病原和及时处理疫情。     

株洲市一起学校乙型流感暴发疫情流行病学分析

目的通过对一起学校乙型流感暴发疫情的调查、分析,查找疫情发生的原因及特点,总结防控经验,为今后流感防控及流感暴发疫情处置提供依据。方法对学校流感暴发疫情开展现场流行病学调查,并采集部分病例咽拭子标本,进行流感病毒核酸检测(Real-Time PCR)。结果 2017年11月16日至12月5日,株洲市某小学累计报告78例流感样病例,全部为学生,总体罹患率2.72%。分布在18个班级,班级罹患率最高28.58%,最低1.76%。病例临床症状主要以发热(100.00%)、咳嗽(87.18%)、咽痛(56.14%)为主。采集14份病例咽拭子进行流感病毒核酸检测,其中9份标本检测结果为B型Yamagata流感病毒核酸检测阳性。结论此次疫情为一起乙型流感病毒引起的流感暴发疫情,提高学校发现和报告疫情的意识、严格落实病例隔离治疗、加强学校传染病防控知识宣传、合理安排和调整教学时间是防止学校流感暴发疫情的关键。     

北京某部7型腺病毒疫情流行病学调查

目的对北京某部7型腺病毒疫情进行流行病学调查,分析其流行因素和传播途径,为制定疫情防控措施提供依据。方法设计流行病学调查表,对某部疫情开展现场调查,描述流行特征;采集患者咽拭子和血清标本,利用普通PCR、荧光定量PCR、ELISA等技术确定病原。结果此次疫情累计发病375例,发病率为24.04%。男、女性发病率分别为27.86%和8.00%(P 0.01);无重症和死亡病例,临床表现为发热(≥37.8℃)(占100.00%),伴有咽痛、咳嗽(占88.68%)、头痛、肌痛(占78.65%)、乏力、呕吐、畏寒、恶心、腹痛和腹泻等症状;实验室检测92份标本,阳性率为73.91%。结论病毒分型鉴定该疫情是由7型腺病毒引起的新兵训练基地呼吸道传染病聚集性疫情。     

实时荧光RT-PCR法快速检测麻疹病毒核酸

目的采用实时荧光RT-PCR法快速检测麻疹病毒核酸,早期确诊麻疹疑似病例,为及时采取防控措施,减少麻疹的暴发流行提供科学的实验依据。方法对沈阳市2013年4月-11月63份麻疹疑似病例,在出疹3 d内采集静脉血和咽拭子。血清标本采用ELISA法检测麻疹Ig M抗体,咽拭子标本采用实时荧光RT-PCR法检测麻疹病毒核酸,核酸检测阳性的标本进行病毒分离。结果 63份麻疹疑似病例中麻疹病毒Ig M抗体有27份为阳性,阳性率为42.86%;麻疹病毒核酸有32份为阳性,阳性率为50.79%;核酸检测阳性标本中,4份分离到麻疹病毒,分离率为12.50%。麻疹Ig M抗体检测和实时荧光RT-PCR检测同为阳性27份,同为阴性31份;实时荧光RT-PCR检测阳性而麻疹Ig M抗体检测阴性的为5份,2种方法检测的总符合率为92.06%。结论实时荧光RT-PCR法是一种灵敏、准确、安全的快速检测麻疹病毒核酸的方法,可用于麻疹病毒感染的早期诊断。     

镇江地区流感哨点对新甲型H1N1流感的预警作用

目的应用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)快速检测技术对镇江地区流感哨点医院流感样病例定期检测,为预警疫情提供科学依据。方法每周采集镇江市3家哨点医院的流感样病例和暴发疫区现患病例的咽拭子标本以及部分流感样病例血清标本。应用实时荧光定量PCR方法进行核酸检测,对部分流感样血清标本用血凝抑制试验方法进行H1亚型抗体检测,并对检测结果进行趋势分析。结果 2229份哨点医院采集的标本中检测出流感核酸阳性标本750例,其中423份为新甲型H1N1,293份为H3N2,8份为H1N1,26份为B型;356份暴发疫情采集的标本中检测出流感核酸阳性标本165例,其中112份为新甲型H1N1,51份为H3N2,2份为B型。哨点医院流感时间趋势,2009年6～7月以B型流感为主,8～9月转变为H3N2型流感流行,10～12月新甲型H1N1普遍流行。暴发疫情6月份出现首例新甲型H1N1,7月和8月新甲型H1N1呈现局部暴发,9～12月新甲型H1N1病例显著增加。362份流感样病例检测出H1亚型抗体阳性标本85例,阳性率为23.48%。结论应用哨点医院的流感样病例检测结果,可预测流感的变化趋势,提前采取控制...     

GⅠ.P11-GⅠ.6型诺如病毒分子特征分析

目的 分析引起北京市丰台区某小学1起胃肠炎疫情的诺如病毒分型特征，为诺如病毒防控提供参考依据。方法 2021年10月在北京市丰台区某小学发生1起胃肠炎疫情，留取粪便标本做便常规检测和便隐血检测，并在便标本中提取核酸，使用荧光定量PCR技术进行诺如病毒核酸检测，采用一步法逆转录PCR扩增特异性核酸片段分析诺如病毒亚型。结果 共14例胃肠炎病例，14份粪便标本便常规结果正常，7份便隐血结果阳性，阳性率为50.0%。13份标本检测出诺如病毒阳性，基因型别为GⅠ.P11-GⅠ.6。结论 本次疫情检测出的诺如病毒型别引起的胃肠炎便隐血阳性率较高，超过其他文献报道的比率，并发现其在氨基酸水平上聚合酶区和VP1区都发生了关键位点的变异。需持续进行疫情监测和防控工作，以减少该类疫情的发生。     

一起人腺病毒14型所致成年人不明原因肺炎的病原学检测分析

摘要:目的　分析一起导致一名成年人不明原因肺炎的病毒性病原体,确立病原微生物载体与病人之间的相关性,为临床防治提供实验室依据。方法　将采集到的呼吸道标本采用实时荧光定量PCR（Real-time PCR）检测流感病毒、冠状病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、人偏肺病毒、人博卡病毒、人腺病毒和鼻病毒核酸,对检测结果为腺病毒阳性的核酸进一步采用腺病毒特异性引物通过PCR进行Hexon,Fiber和E1A区基因特异性扩增,产物进行核苷酸序列测定和比对分析并构建遗传进化树。结果　1份咽拭子和1份支气管灌洗液核酸经Real-time PCR检测均呈腺病毒阳性,扩增病毒基因序列经测序分析与人腺病毒14型同源性最高。结论　此起成年人不明原因肺炎是由人腺病毒14型感染所致。