肩袖腱病环状RNA表达特征与内源竞争RNA调控网络构建的研究

目的探究肩袖腱病中差异表达的环状RNA(circular RNA,circRNA)及其调控靶基因的预测和生物信息学分析。方法取2018年6月—2019年6月因冈上肌腱损伤行手术治疗的10例患者自愿捐赠肩袖组织,经MRI、关节镜检查以及组织学染色,确定为正常肩袖或肩袖腱病组织,再依据患者年龄、体质量以及Bonar评分进行配对分组。通过高通量测序对肩袖组织进行circRNA检测,筛选差异表达的circRNA,对circRNA靶基因进行预测,并进行富集分析和内源竞争RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络构建。结果在P0.05、log2差异表达倍数(fold change,FC)绝对值2条件下,共筛选出94条在正常肩袖及肩袖腱病组织中差异表达的circRNA,其中肩袖腱病组织中有31条表达上调、63条表达下调。基因本体(gene ontology,GO)分析发现差异基因最显著富集于环磷酸腺苷应答;京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析发现,差异基因主要富集在细胞外基质-受体交互、蛋白消化及吸收、细胞循环、NF-κB信号通路等。ceRNA网络揭示了差异表达的circRNA和miRNA、mRNA之间可能的相互作用,其中自由能最高的ceRNA调控轴为circRNA.8951-has-miR-6089-DNMT3B。结论肩袖腱病中存在差异表达的circRNA,可能与肩袖腱病发生发展密切相关,有望为临床诊断、治疗提供潜在靶点。     

基于RNA-seq的脓毒症相关性脑病小鼠海马转录组分析及竞争性内源性RNA调控网络的构建

目的采用转录组测序技术(RNA-seq)筛选脓毒症相关性脑病(SAE)小鼠海马差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)及mRNA, 构建竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络。方法清洁级健康雄性C57BL/6小鼠10只, 6～8周龄, 体质量20～25 g, 采用随机数字表法分为2组(n=5):假手术组(Sham组)和脓毒症组(Sepsis组)。Sepsis组采用盲肠结扎穿孔(CLP)法制备小鼠脓毒症模型, Sham组只开腹不进行盲肠结扎和穿孔。分别于术前1 d及术后3 d时行Morris水迷宫实验和条件恐惧实验检测小鼠认知功能。随后Sham组随机处死3只小鼠, Sepsis组处死认知功能测试最差的3只小鼠, 取海马组织, 通过BGISEQ-500平台行转录组测序, 得到差异表达的mRNA和lncRNA, 测序结果通过深圳华大基因科技服务有限公司提供的Dr.Tom平台行可视化分析, 利用Cytoscape软件构建ceRNA调控网络。结果与Sham组比较, Sepsis组逃避潜伏期延长, 靶向限停留时间百分比和僵直时间百分比降低(P<0.05)。转录组数据分析共获得差异表达的l...     

肝脏缺血再灌注损伤的ceRNA网络构建和潜在治疗药物筛选

背景与目的 肝脏缺血-再灌注（I/R）损伤是肝移植和肝切除手术过程中常涉及的共同病理生理变化。竞争性内源性RNA（ceRNA）调控网络可参与多种疾病的发生发展。然而ceRNA网络在肝脏I/R损伤中的功能仅有少量报道。本研究旨在应用生物信息学方法构建与肝脏I/R损伤相关的ceRNA网络,同时基于差异表达基因筛选潜在治疗药物。方法 从GEO数据库获取肝脏I/R损伤的mRNA及miRNA表达芯片数据。使用R语言中的limma包进行基因差异表达分析,并使用ggplot2包进行散点图、火山图和热图绘制。使用String数据库及Cytoscape软件进行蛋白互作（PPI）网络构建。利用Metascape数据库对筛选出的差异mRNA进行GO/KEGG功能富集分析。通过转录调控网络数据库分析可能调控这些差异基因的转录因子。使用miRTarBase数据库构建miRNA-差异表达基因网络。通过starBase：ceRNA数据库构建ceRNA网络。使用比较毒物基因组学数据库（CTD）筛选对关键差异基因表达具有潜在作用的天然药物。结果 从GEO数据库获得2个肝脏I/R损伤mRNA数据集（GSE10654和GSE117066）和1个肝脏I/R损伤miRNA数据集（GSE72315）。通过limma包及Venn图分析mRNA表达数据集,筛选到16个在I/R组上调表达,在缺血后适应（IPO）组下调表达的基因;7个在I/R组下调表达,在IPO组上调表达的基因。GO/KEGG功能富集分析结果显示差异基因主要参细胞死亡的正调控及对细胞外刺激反应的生物学过程,并参与MAPK信号通路。转录调控网络数据库分析获得6个转录因子（Trp53、Cebpb、Crebbp、Fos、Nfkb1及SP1）可能参与这些差异基因的调控。通过miRTarBase数据库分析,并结合GSE72315数据集中miRNA在I/R损伤后的差异表达,获得两个可能在肝脏I/R损伤中发挥重要的作用miRNA-mRNA轴（mmu-miR-32-5p-Btg2与mmu-miR-9-5p-Mt2）。通过starBase：ceRNA数据库分析,最终获得9条ceRNA网络,分别是：XIST/MEG8/LINC00963/MALAT1-miR-32-5p-Btg2轴、XIST/NEAT1-miR-132-3p-Btg2轴及HSPA9P1/RALGAPA1P1/RPS26P39-miR-9-5p-Dusp6轴。CTD数据库筛选到7种植物药（槲皮素、白藜芦醇、染料木黄酮、香豆雌酚、姜黄素、辣椒素及东莨菪碱）可降低关键基因的表达发挥潜在治疗作用。结论 通过生物信息学方法筛选了肝脏I/R损伤过程中的关键ceRNA网络及治疗的潜在天然药物,为进一步研究肝脏I/R损伤的发病机制及治疗药物提供重要依据。     

环状RNA在慢性HBV感染者不同时期的差异表达及生物信息学分析

目的 探讨环状RNA（circRNA）分子在慢性HBV感染者不同时期的差异表达及其作用.方法 收集泰州市人民医院感染病科2014年10月至2015年10月就诊的慢性HBV感染者7例,其中慢性乙型肝炎（CHB）患者4例,慢性HBV携带者3例,3名对照来自健康体检者.采集所有研究对象外周血单个核细胞（PBMC）,应用新一代circRNA表达谱芯片检测PBMC中circRNA分子的表达,并通过荧光定量PCR进行验证.采用微小RNA（miRNA）靶预测软件分析circRNA和miRNA的相互作用位点.应用基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）对其靶向miRNA及调控靶基因进行分析.采用SPSS 17.0软件对数据进行分析.结果 与健康对照者比较,CHB患者表达差异的circRNA分子有137个,其中上调89个,下调48个;慢性HBV携带者表达差异的circRNA分子有444个,其中上调130个,上调5倍以上的有34个,下调314个.CHB患者与慢性HBV携带者相比,差异表达的circRNA分子有1041个,其中上调663个,下调378个,下调超过5倍以上的有54个.差异表达的circRNA上具有miRNA应答元件,可与miRNA种子区域的碱基互补配对.靶基因预测分析显示,hsa_circ_0038646相关miRNA调控的靶基因有533个,hsa_circ_0087354分子相关miRNA调控的靶基因有249个.GO分析显示,hsa_circ_0038646分子相关miRNA调控靶基因的功能主要富集于激活素结合等,hsa_circ_0087354分子相关miRNA调控的靶标富集于犰狳重复区域结合等.KEGG分析显示,hsa_circ_0038646分子相关miRNA主要参与T细胞受体结合途径、雌激素受体信号通路等,hsa_circ_0087354分子相关miRNA主要参与粘附连接、MAPK信号途径等.结论 HBV感染不同时期患者circRNA的表达存在差异,差异表达的circRNA可能通过影响相关miRNA分子的多个靶基因及其信号途径参与慢性HBV感染者的免疫调控.     

探讨Circ_0000253在骨肉瘤中的诊断价值

目的:探讨circ_0000253作为骨肉瘤（osteosarcoma,OS）诊断和预后生物标志物的价值。方法:GEO数据库筛选OS中差异表达的circRNAs,预测和circRNA存在结合位点的微小RNA（MicroRNA,miRNA）进一步构建ceRNA网络,GO和KEGG分析筛选靶基因。qRT-PCR检测112例...     

阿托伐他汀预处理对脊髓缺血再灌注损伤大鼠损伤脊髓microRNA表达的影响

目的:检测他汀类药物预处理对脊髓缺血再灌注损伤大鼠损伤脊髓组织中microRNA(miRNA,miR)表达谱的影响,探讨他汀神经保护作用的机制.方法:18只雄性SD大鼠随机分为假手术组、手术组和药物组,每组6只,其中手术组和药物组以阻断腹主动脉的方法建立大鼠急性脊髓缺血再灌注损伤模型,假手术组在开腹后于腹主动脉上绕线而不阻断动脉.药物组大鼠给予胃内灌注10mg/kg/d阿托伐他汀14d后再行建模手术,手术组在建模术前仅给予等容量生理盐水.对各组分别在术后6、12、24和48h应用BBB评分评价脊髓神经功能.在术后48h处死动物,取腰骶段脊髓组织.对组织切片后采用HE染色和2,3,5,-triphenyltetrazoliumchloride (TTC)染色明确神经组织病理变化及损伤情况,对缺血面积和脊髓横断面面积行定量检测并计算缺血百分比;应用miRNA芯片检测组织中miRNA表达谱;分别用假手术组和手术组RNA为模板,采用实时定量PCR对芯片结果进行验证.结果:手术组在术后各时间点的BBB评分较假手术组显著下降(P＜0.05),药物组在术后各时间点的BBB评分均较手术组明显增高(P＜0.05)但仍低于假手术组(P＜0.05).HE染色显示手术组和药物组均存在脊髓缺血性损伤,但药物组较手术组减轻.TTC染色显示假手术组、手术组和药物组的缺血百分比分别为(2.1±0.1)％、(77.3±5.1)％和(43±3.2)％,手术组缺血百分比较假手术组显著增大(P＜0.05),而药物组缺血百分比与手术组比较显著缩小(P＜0.05)但仍显著高于假手术组(P＜0.01).芯片检测miRNA表达谱显示,手术组与假手术组相比,其中48种miRNA表达明显改变,38种上调1.6～4.9倍,另有10种miRNA表达下调;与手术组相比,药物组有13种miRNA表达发生改变,并可逆转缺血再灌注损伤后的8种miRNA,包括miR-365、miR-323、miR-672*、miR-760-5p、miR-376b-5p、miR-369-5p、miR-210和miR-199a.miRNA表达的实时定量PCR结果和芯片结果比较无显著性差异(P＞0.05).结论:阿托伐他汀预处理可对大鼠脊髓缺血再灌注损伤发挥神经保护作用,其机制可能与其对miRNA的调控有关.     

环状RNA在脑缺血性损伤中作用机制的研究进展

环状RNA(circular RNA,circRNA)是广泛存在于生物体内的一种非编码RNA,具有闭合环状结构,经过特殊剪切机制形成,在基因转录后水平发挥重要调控作用。哺乳动物中枢神经系统中存在大量circRNA,与神经细胞增殖、分化、凋亡及脑缺血后神经细胞损伤密切相关。有研究表明脑缺血性疾病发生时,circRNA表达模式显著改变,然而目前对触发circRNA表达改变的因素及其调控网络却知之甚少。文章分析总结现有研究结果,详细描述了circRNA的形成机制、功能作用、在脑组织中的表达特点及其在脑缺血性损伤中的作用和研究进展。随着分子生物学技术的发展及对circRNA临床应用研究的深入,circRNA有望成为脑缺血性疾病早期诊断治疗及评价预后的检查指标。     

三阴性乳腺癌与癌旁组织中差异表达环状RNA筛选及生物信息学分析

目的 筛选三阴性乳腺癌(TNBC)与癌旁组织中差异表达的环状RNA(circRNA),并对其下游可能结合的miRNA及靶基因进行生物信息学分析,预测circRNA在TNBC中可能的调控途径。方法 收集到1例于北京大学深圳医院甲状腺与乳腺外科接受TNBC手术治疗的病人手术样本,行转录组测序分析,并获得TNBC癌组织与癌旁组织的circRNA差异表达谱,分别选择表达上调、下调最显著的5个共10个circRNA。使用RegRNA 2. 0网站预测circRNA可能结合的下游miRNA,进一步通过三个生物信息学网站(miRDB、Target Scan、RNAInter)联合预测miRNA可能结合的下游的靶基因,并对所得mRNA进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。应用STRING在线工具分析预测出的靶基因PPI网络,将数据输出并导入Cytoscape软件,通过MCODE插件筛选出circRNA相关的TNBC的关键基因。用Kaplan-Meier Plotter在线数据库,分析关键基因表达水平与TNBC预后的关系。结果 TNBC与癌旁组织中差异表达的circRNA共6547个,其中表达上调2 311个,下调4 326个;表达显著上调及下调的5个circRNA下游共预测出1 161个mRNA; GO分析及KEGG分析结果显示,这些mRNA主要参与RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录负调控、染色质的共价修饰、转录调控等生物学进程;细胞信号通路方面主要参与到细胞内吞、缩宫素信号通路、Wnt信号通路及c GMP-PKG信号通路等;共筛选出5个关键基因(UBOX5、UBE2G2、DTX3L、FZR1、RNF19A),其中UBE2G2和DTX3L低表达提示TNBC病人总生存率不良; UBE2G2对应的上游miRNA和circRNA分别是hsa＿miR-93-3p和hsa＿circ＿0001361;DTX3L对应的上游miRNA和circRNA分别是hsa＿miR-2115-5p和hsa＿circ＿0002874。结论 TNBC细胞中差异表达circRNA所结合miRNA的下游靶基因中,可能的关键基因是UBOX5、UBE2G2、DTX3L、FZR1、RNF19A,其中UBE2G2、DTX3L与病人预后有关,它们对应的调控轴分别为hsa＿circ＿0001361/miR-93-3p/UBE2G2和hsa＿circ＿0002874/miR-2115-5p/DTX3L,提示二者可能参与到TNBC的发生发展。     

强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞微小RNA的差异表达

目的 探讨强直性脊柱炎患者和健康对照组外周血单个核细胞已知微小RNA(miRNA)差异表达.方法 分别构建10例强直性脊柱炎患者和9例健康对照组外周血单个核细胞小RNA文库,并运用新一代高通量Solexa测序技术,进行外周血单个核细胞已知miRNA的检测;运用实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)进一步验证部分差异miRNA表达.结果 在强直性脊柱炎患者与对照组中小RNA文库中,共获得小RNA总量分别是7511 859和10 178 958,比对上基因组部分小RNA分别是6052911 (80.58％)和8 476 243(83.27％);已知miRNA分别是267和231个,通过miRNA差异性分析,129个上调miRNA和28个下调miRNA,其表达水平差异有统计学意义(P＜0.05);FQ-PCR进一步验证了let-7b-3p、miR-146a-5p、miR-155-5p、let-7g-5p和miR-323a-5p差异表达水平与Solexa测序结果相似趋势.结论 强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞miRNA的差异表达,可能与强直性脊柱炎发病密切相关.     

非编码RNA在胃癌中的作用机制研究进展

胃癌是目前世界上恶性程度最高的肿瘤之一。近年来大量的研究证明非编码RNA在胃癌的发生、增殖、转移等生物过程中占据着重要地位,其中小RNA（miRNA）、环状RNA（circRNA）和长链非编码RNA（lncRNA）组成的非编码RNA调控网络涉及多种基因调控过程。目前对胃癌的诊断主要依赖于内镜检查,缺乏简单有效的筛查手段,针对晚期胃癌的治疗方法也十分有限。而非编码RNA的出现为胃癌的诊断和治疗提供了一个新的角度。miRNA可通过与mRNA结合导致mRNA的降解,从转录后水平上调节靶基因的表达。lncRNA、circRNA可竞争性与miRNA结合以拮抗miRNA的作用,从而间接调控基因的表达。肿瘤的产生可以认为是肿瘤细胞本身异常的生理特性、肿瘤微环境的形成及外部环境因素影响共同作用的结果。非编码RNA与胃癌细胞的增殖、凋亡、侵袭及转移密切相关。此外,非编码RNA还可参与细胞自噬调控过程,并影响肿瘤的干细胞特性及耐药性。肿瘤微环境包括肿瘤周围血管、间质细胞、免疫细胞、信号分子、细胞外基质等组成部分。一方面,非编码RNA可参与胃癌细胞诱导微环境形成的作用过程,例如诱导周围血管新生、免疫抑制;另一方面,非编码RNA可以外泌体形式参与微环境对胃癌细胞的作用,影响胃癌细胞的增殖、转移、耐药等生理过程。外部环境因素对诱导胃癌发生具有重要意义。幽门螺杆菌感染（HP）感染是导致胃癌的重要致病因素之一,非编码RNA与HP的致癌特性相关。氧化应激状态、EB病毒感染也可诱导胃癌发生,非编码RNA同样也参与这些机制。非编码RNA在胃癌中的重要地位使其可成为潜在的胃癌诊断分子标记物或治疗靶点。目前文献多报道的是以miRNA转录后调控基因作用为核心,circRNA、lncRNA为其上游调控分子的基因调控模式。lncRNA、circRNA均可竞争性结合miRNA,那么两者的调控关系仍未明确。circRNA在肿瘤中的作用是近年来才被初步认识的,在胃癌中的具体调控作用机制有待进一步研究。充分认识非编码RNA调控网络将有助于加深对肿瘤发生机制的理解,可为胃癌的临床诊疗提供新的思路和方法。非编码RNA在未来或可进一步用于细化对不同胃癌特征的描述,如同基因一样成为肿瘤的“身份证”,对精准医疗、个体化医疗的发展也具有重要意义。     

环状RNA在肝细胞癌中的差异表达研究

目的:探讨环状RNA(circ RNA)在肝细胞癌(HCC)与正常肝组织中表达谱的差异。方法:利用circ RNA芯片技术检测3例HCC组织和癌旁肝组织circ RNA的表达谱,经过对原始数据进行预处理、均一化后,找出差异表达的circ RNA(与癌旁肝组织比较,HCC组织中1.5倍以上变化并且差异有统计学意义的circ RNA定义为差异表达的circ RNA)。根据表达差异倍数较高和样本间一致性较好的原则筛选circ RNA,借助生物信息学软件预测可能受其调控的mi RNA,结合文献检索初步确定可能在HCC中具有重要作用的circ RNA。结果:与癌旁肝组织比较,HCC组织中的circ RNA表达谱发生了明显变化。HCC组织中,1.5倍以上变化的circ RNA共82条,其中上调21条,下调61条;5倍以上变化的circ RNA共3条,其中上调2条,下调1条。最终筛选出在HCC组织中明显上调的hsa-circ-0043278(8.15倍,P=0.002)、hsacirc-0006220(12.73倍,P=0.033)和明显下调的hsa-circ-0065214(6.28倍,P=0.019);生物信息学分析和文献检索显示,hsa-mi R-520可能受hsa-circ-0043278和hsa-circ-0006220调控而影响HCC的发生和进展。结论:HCC组织circ RNA表达谱发生了显著变化;hsa-circ-0043278和hsa-circ-0006220可能在HCC的发生和进展中发挥重要作用。     

环状RNA与甲状腺癌关系的研究进展

环状RNA（circRNA）是新近发现的一种内源性非编码RNA,在多种哺乳动物组织或细胞中广泛表达,且与传统线性RNA相比,circRNA为闭环结构,对RNA外切酶和终止子核酸外切酶降解无效,稳定性好,能在血清、尿液、唾液等体液中检测到。大量文献报道circRNA通过circRNA-microRNA（miRNA）-mRNA网络参与生物的胚胎发育及细胞的增殖、分化、凋亡等多种生物学过程,且与肿瘤的发生,侵袭和转移有关。近年研究证实,甲状腺癌组织中存在circRNA的表达失调,表达失调的circRNA通过充当miRNA的“分子海绵”,调节下游靶基因的表达参与甲状腺癌的发生发展。笔者通过收集circRNA的研究进展,对circRNA在甲状腺癌中的表达及其在甲状腺癌发生、发展、转移过程中的作用及其机制进行综述。     

肝内胆管细胞癌中hsa_circ_0089153的表达及其生物学功能

背景与目的:肝内胆管细胞癌(ICC)是仅次于肝细胞癌的第二大肝脏恶性肿瘤,其发病隐匿、恶性度高、预后差.环状RNA(circRNA)异常表达与多种恶性肿瘤的发生发展关系密切,但circRNA与ICC的关系研究较少.因此,本研究初步探讨ICC中差异表达circRNA及其生物学功能.方法:采用福建省立医院经病理确诊的5例I...     

The potential role of heat shock proteins in acute spinal cord injury

Purpose

This study aims to investigate the differential expression proteins profile of spinal cord tissues after acute spinal cord injury (ASCI), provide preliminary results for further study and explore the secondary injury mechanisms underlying ASCI.

Methods

Using Allen’s frame to establish ASCI model of Sprague–Dawley rats, then a stable isotope-labelled strategy using isobaric tags for relative and absolute quantitation (iTRAQ) coupled with two-dimensional (2D) liquid chromatography tandem mass spectrometry (2D LC–MS/MS) was performed to separate and identify differentially expressed proteins.

Results

A total of 220 differentially expressed proteins were identified in the spinal cord tissues of H-8 group (acute spinal cord injury after 8 h) compared with H-0 group (acute spinal cord injury after 0 h); Up to 116 proteins were up-regulated, whereas 104 proteins were down-regulated in the spinal cord tissues. Three of the differentially expressed Heat shock proteins (HSPs) namely, Hsp90ab1, Hspa4 and Hspe1 were down-regulated.

Conclusion

The differentially expressed proteins of spinal cord tissues after ASCI will provide scientific foundation for further study to explore the secondary injury mechanism of ASCI.     

Identification of potential circRNAs and circRNA‐miRNA‐mRNA regulatory network in the development of diabetic foot ulcers by integrated bioinformatics analysis

We aimed to explore the mechanism of circular RNAs (circRNAs) and provide potential biomarkers for molecular therapy of diabetic foot ulcers (DFU). Gene expression profile of {"type":"entrez-geo","attrs":{"text":"GSE114248","term_id":"114248"}}GSE114248, including five normal samples and five DFU samples, was downloaded from GEO database. Differentially expressed circRNAs (DEcircRNAs) between two groups were identified. Then, DEcircRNA‐miRNA and miRNA‐mRNA interaction was revealed, followed by the circRNA‐miRNA‐mRNA network construction. Moreover, functional and pathway analysis were performed based on mRNAs, followed by the DM‐related pathway exploration. Specific binding sites for key circRNAs and associated miRNAs were under investigation. Finally, RT‐qPCR was used to verify the candidate the relative expression level of circRNA between normal tissues and DFU. Totally, 65 DEcircRNAs were revealed between two groups, followed by 113 circRNA‐miRNA‐mRNA interactions explored. The mRNAs in these interactions were mainly assembled in functions like cell proliferation and pathways. Moreover, a total of 11 DM‐related pathways were revealed. Finally, circRNA‐miRNA specific binding‐site analysis revealed two key circRNAs, for example, circRNA_072697 and circRNA_405463, corresponding to their miRNAs. These two circRNAs were novel biomarkers for DFU. circRNA_072697 acted as a sponge of miR‐3150a‐3p in the progression of DFU via regulating KRAS. MAPK signaling pathway might contribute to the development of DFU.     

脊椎截骨后脊柱短缩安全范围的实验研究

目的 探讨单脊椎切除对脊髓形态和功能的影响,并确定脊柱短缩的安全范围.方法 采用120只4～5月龄健康雄性新西兰大耳白兔,随机分为单椎板切除(A)组、双椎板切除(B)组及三椎板切除(C)组,每组40只,行L3全脊椎切除术.再根据压缩L3椎体总体高度的25%、50%、75%及100%将每组分成4个亚组.每亚组10只.测量不同脊柱短缩程度下硬膜囊长度、迂曲最大处硬膜囊直径、硬膜囊-神经根交角、硬膜囊矢状位迂曲角、术中体感诱发电位变化情况及Tarlov评分.术后72 h处死动物,HE染色观察脊髓皱缩最严重部位病理改变情况.结果 压缩高度≤总体高度50%时,各组硬膜囊均出现一定程度的形变,但术中脊髓功能监护及术后Tarlov评分差异无统计学意义(P>0.05);病理切片仅A组可见脊髓出现少量出血灶.压缩高度为总体高度75%时,A组硬膜囊形变及Tarlov评分与术前相比差异均有统计学意义(P<0.05),且与B组及C组比较差异有统计学意义(P<0.05);A组病理切片可见髓内出血灶增多、白质水肿,而B组及C组仅出现少量髓内出血灶.完全压缩时,B组及C组硬膜囊形变及术后Tarlov评分差异有统计学意义(P<0.05);病理切片见A组出现大片出血、神经元皱缩,而B组及C组可见髓内较多出血灶.结论 脊柱短缩的高度及椎板切除范围对脊髓形态及功能有较大影响.单椎板切除组压缩安全范围仅为总体高度的50%,而双椎板及三椎板切除组可安全压缩至75%.同样压缩高度下,增加椎板切除范围町有效改善脊髓迂曲、避免术中脊髓皱缩造成的脊髓损伤.     

Identification of circular RNA expression profiles in renal fibrosis induced by obstructive injury

IntroductionAdvancing renal fibrosis is the common histopathological feature of chronic obstructive nephropathy, representing the final pathway of nearly all chronic and progressive nephropathies. Increasing evidences suggest that circular RNAs (circRNAs) are crucial regulatory molecules present at virtually every level of the cellular pathophysiological process. Nonetheless, there are a few evidences for the role of circRNAs in renal fibrosis induced by obstructive nephropathy.AimsWe performed RNA-seq analysis to analyze the expression profiles of circRNAs in the obstructed kidneys to identify the potential circRNAs and their network.MethodsWith silk ligated the left ureter to establish a mice unilateral ureteral obstruction (UUO) model. Renal tissue circRNAs were obtained and were screened by a circRNA microarray. The circRNA-miRNA-mRNA regulatory network and the target genes were visualized using Cytoscape software.ResultsThe microarray results showed that 5454 and 2935 circRNAs were detected in the control and UUO group, respectively. There were 605 circRNAs up-regulated and 745 circRNAs down-regulated in the obstructive kidneys. The top 5 up-regulated and down-regulated circRNAs were chosen for predicting the circRNA/miRNA/target mRNAs triple network. The GO (Gene Ontology) and KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) analysis showed that these circRNAs and the triple network were enriched in the process of apoptosis, p53 signaling pathway, cell growth and cell death, which might participate in the pathogenesis of obstructive nephrology.ConclusionOur results show that the dis-regulated circRNAs might play crucial roles in the pathogenesis of obstructive nephropathy, which proceeds to identify novel therapeutic targets for chronic kidney disease.     

大鼠脊髓损伤后Wnt信号分子的表达变化

目的:探讨大鼠脊髓损伤后不同时期Wnt信号分子Wnt-1、β-连锁蛋白(β-catenin)及糖原合成酶激酶-3β(GSK-3β)在脊髓损伤局部的表达情况.方法:50只成年雌性SD大鼠随机均分为对照组和实验组,麻醉下手术显露T9～T11椎板,切除T10全椎板,实验组大鼠用NYU打击器以10g×5cm的打击能量致伤T10脊髓,对照组只行全椎板切除,不致伤脊髓.分别于术后1d、3d、5d、7d、14d每组各取5只大鼠,取以损伤区为中心共15mm范围内(对照组取相应部位)脊髓组织,提取总RNA,采用半定量RT-PCR的方法检测脊髓组织中Wnt-1、β-catenin及GSK-3β的mRNA表达量.结果:脊髓损伤后1d和3d时Wnt-1和β-catenin出现高表达,5d后其表达逐渐减弱,14d左右其表达基本恢复到正常水平,而在脊髓损伤后1d和3d时GSK-3β呈低表达,5d后其表达逐渐增强,各时间点之间差异有显著性(P<0.05).对照组中Wnt-1和β-catenin及GSK-3β均呈低表达,各时间点表达无显著差异(P<0.05).结论:大鼠脊髓损伤后损伤局部脊髓组织中Wnt-1,β-catenin及GSK-3β的表达发生变化,提示Wnt信号在脊髓损伤后的早期被激活,其可能与脊髓损伤后的修复再生有关.     

川芎嗪对大鼠脊髓损伤后神经功能恢复作用的研究

目的探讨川芎嗪(TMP)对大鼠脊髓损伤后后肢运动功能恢复的影响。方法雄性成年SD大鼠24只,随机均分为假手术组、对照组及TMP治疗组。采用改良Allen法建立大鼠胸段脊髓打击模型,HE染色观察伤后4周伤段脊髓残存组织的面积,采用斜板试验和运动功能评分观察大鼠后肢运动功能的恢复情况。结果大鼠脊髓损伤后1～4周,TMP治疗组后肢运动功能评分明显高于对照组,两组间差异有显著性(P<0.05)。伤后4周,TMP组伤段残存脊髓组织的面积大于对照组(P<0.01)。结论TMP能明显减少脊髓损伤后伤区的坏死和萎缩,并促进大鼠后肢运动功能的恢复。