网状Meta分析在Stata软件中的实现

WinBUGS软件除了能够与R软件配合实现网状Meta分析外,还可以通过与Stata软件配合实现。与R软件不同的是,通过Stata软件实现时需先行创建相关的ADO脚本文件,从而极大地简化了操作过程。与R软件相同的是,在绘制网状关系图时,Stata软件亦需要另行加载一个程序包。本文简要介绍了如何使用Stata软件渊用WinBUGS软件实现网状Meta分析。     

基于使用的网状Meta分析软件的比较研究与选择

目的比较各种网状Meta分析（NMA）软件的特征及功能,为使用者选择软件提供参考。方法计算机检索PubMed、CNKI、Stata公司官方网站、R软件官方网站和Google,收集具有NMA功能的软件及程序包,检索时限截至2014年7月。下载软件和程序包及其使用指南,用示例进行计算。对软件的基本特征、功能和计算结果进行比较分析。结果共纳入11款软件,包括编程软件和非编程软件,主要基于贝叶斯学派和频率学派研发。大多数软件已具操作简单、易掌握、计算准确及图形绘制优良等优点,但无一款同时具备较佳计算能力与绘图功能的软件,必需多款软件联合来实现。结论建议使用者首先依据自身编程基础与习惯等选取,可考虑选用两种或三种软件相互配合来实现NMA。建议研发一款功能完备、操作简单的免费软件。     

应用R软件pcnetmeta程序包实现网状Meta分析

R软件pcnetmeta程序包是一款基于贝叶斯理论实现网状Meta分析的程序包,其融合了JAGS软件的优势计算功能与R软件特有的数据整合和强大的图形绘制等功能。pcnetmeta程序包通过调用JAGS软件来实现运算,提供了3种不同模型供操作者选取,每种模型均给出3种不同的效应量(RR、OR及RD)结果;同时可以绘制多种图形,极大程度上满足了使用者处理复杂网状Meta分析的客观需求。本文以实例方式展现该程序包的完整操作流程。     

R软件nlme程序包在网状Meta分析中的应用

nlme程序包是基于广义最小二乘法和线性混合效应模型研发的、可通过R软件实现广义线性和非线性混合效应模型下的Meta分析。该程序包实现Meta分析时,需要对数据先行转化为效应量的对数值才可进行。本文介绍了使用R软件nlme程序包实现网状Meta分析的过程,详细呈现了如何转化数据这一核心步骤。     

应用R语言netmeta程序包实现网状Meta分析

netmeta程序包是基于经典频率学派研发、在R语言框架下运行的专用于网状Meta分析的程序包。该程序包克服了基于贝叶斯统计学派研发的软件及程序包实现网状Meta分析时对先验设定的难点,同时具备操作流程简单、操作难度小等优点。此外,该程序包还能同时以随机效应与固定效应模型展现单个配对研究及Meta分析合并的结果,并能绘制森林图。本文通过实例展示了应用netmeta程序包实现网状Meta分析的过程。     

R软件gemtc程序包在网状Meta分析中的应用

R软件相关程序包对于网状Meta分析的理论原理大多是基于贝叶斯统计模型,也有少部分使用广义线性模型。R软件gemtc程序包通过调用对应的rjags程序包、BRugs程序包或R2WinBUGS程序包（软件依次为JAGS、OpenBUGS及WinBUGS）来执行网状Meta分析。同时,还可以为GeMTC软件生成相关的数据存储文件。其本质是调用基于MCMC法的软件进行网状Meta分析。本文简要介绍R软件gemtc程序包调用OpenBUGS软件进行网状Meta分析。     

R软件R2WinBUGS程序包在网状Meta分析中的应用

R软件是一个自由、免费及开放的统计软件,并具有强大的绘图功能,但其处理网状Meta分析数据的代码命令较为复杂,因此易错且不易掌握.WinBUGS软件是基于贝叶斯理论而开发的一款统计软件,具有强大的数据处理功能,在处理网状Meta分析数据时,代码编写易懂且操作方便,但对结果的绘图功能欠佳.为充分发挥R软件与WinBUGS软件各自的优势,开发者在R软件的基础上研发了R2WinBUGS程序包,构建了R软件与WinBUGS软件之间的“桥梁”,使网状Meta分析的过程和结果处理方便快捷又美观.本文以实例操作的方式展示使用R软件R2WinBUGS程序包进行网状Meta分析的过程.     

应用SAS软件PROCMCMC过程实现网状Meta分析

SAS软件是一款功能强大、国际认可度高的编程软件,其可以实现包括网状Meta分析在内的各种Meta分析。贝叶斯统计是一种重要的统计学方法,其可以通过马尔科夫-蒙特卡洛(Markov Chain Monte Carlo,MCMC)算法进行各种统计推断。在SAS软件中运用PROC MCMC过程实现网状Meta分析正是基于这一思想进行的,本文通过实例操作展示了该过程。     

R软件调用OpenBUGS软件实现网状Meta分析

R软件当前可通过R2OpenBUGS程序包、BRugs程序包和rbugs程序包来调用OpenBUGS程序包实现网状Meta分析。本文分别对这3种程序包实现网状Meta分析的过程进行演示。从结果来看,3种程序包的计算结果相近,但rbugs程序包无绘图功能,仅R2OpenBUGS程序包能绘制森林图。     

R软件Metafor程序包在Meta分析中的应用

R软件是一款免费使用且功能强大的统计软件,常用的Meta分析程序包有Metafor、Meta、Rrneta等.Metafor程序包可以方便地进行Meta分析,包括二分类及连续性变量的Meta分析、Meta回归、累积Meta分析及对发表偏倚的Begg's检验和Egger's检验等,以及绘制森林图、漏斗图、星状图、拉贝图、Q-Q正态分位图等图形.此外,Metafor程序包是R软件Meta分析程序包中唯一可以进行混合效应模型(包括单个、多个分类或连续性变量)拟合运算的,还可以检验模型系数并获得可信区间.本文结合实例对应用Metafor程序包进行Meta分析的具体操作方法进行详细介绍.     

网状Meta分析中网状关系图的绘制

网状关系图能够清晰地展示网状Meta分析时各干预措施间存在的直接比较关系。目前有较多绘制网状关系图的方法,但不同方法绘制的网状关系图所提供的信息量有所区别,且软件不同,其操作的友好程度亦不一样。本文简要介绍了如何应用R软件network程序包和gemtc程序包、Stata软件、ADDIS软件绘制网状关系图,并对其异同点进行了比较。