基于网络药理学和分子对接探讨紫苏籽抗癌抗肿瘤的分子机制

采用网络药理学和分子对接的方法对紫苏籽成分、靶点、通路与癌症肿瘤的治疗进行系统研究。借助TCMSP、Genecards、Uniprot数据库收集紫苏籽成分、靶点以及癌症和肿瘤的靶点,使用Cytoscape软件构建紫苏籽成分、靶点与癌症肿瘤之间的网络图;通过STRING数据库进行蛋白互作网络分析,并借助DAVID平台进行GO功能和KEGG富集,采用Auto Dock将紫苏籽的活性成分和抗癌抗肿瘤靶点进行分子对接。结果表明：共筛选出紫苏籽抗癌抗肿瘤作用的靶点72个,对应17种有效成分。KEGG信号通路涉及的癌种包括膀胱癌、甲状腺癌、胰腺癌等。分子对接结果显示木犀草素和TP53对接活性最好。结论：该研究通过构建紫苏籽成分—靶点—疾病网络,挖掘紫苏籽抗癌抗肿瘤的关键靶点,并模拟靶点蛋白和活性成分的分子对接,为紫苏籽在临床应用及机制研究等方面提供了方向和思路。     

药食资源山楂果防治2型糖尿病成分与作用靶点分析研究

目的 探究山楂果降血糖作用靶点及潜在的分子机制。方法 利用中药综合数据库(traditional Chinese medicines integrated database, TCMID)及中医药百科全书数据库(the encyclopedia of traditional Chinese medicine, ETCM)并结合文献报道获得山楂果活性成分, 通过Swiss Target Prediction数据库预测其作用靶点。使用GeneCards及在线孟德尔人类遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)获取2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus, T2DM)相关靶点, 与山楂果预测靶点取交集即为山楂果防治T2DM的治疗靶点。将交集靶点导入STRING数据库及Cytoscape 3.7.2进行蛋白质相互作用(protein protein interaction, PPI)、药物-靶点-疾病网络可视化, 并通过DAVID数据库平台进行基因本体(gene ontology, GO)功能分析及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集分析。结果 山楂果有效活性成分为12种, 其中槲皮素、熊果酸等作用较为重要, 对应157个靶基因与T2DM相关。PPI及文献检索结果显示磷脂酰肌醇-3激酶调节亚基1 (phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha, PIK3R1)、RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1 (RAC-alpha serine/threonine-protein kinase, AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3、8、14 (mitogen-activated protein kinase 3、8、14, MAPK3、MAPK8、MAPK14)等可能是山楂果防治T2DM的重要作用靶点。KEGG通路富集分析主要涉及磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B (PI3K/Akt)信号通路、叉头状转录因子O亚家族蛋白(FoxO)信号通路、催乳素(prolactin)信号通路等。结论 山楂果能多成分、多靶点、多途径的防治T2DM, 对其引起的胰岛素水平失调、炎症反应、免疫功能及糖脂代谢紊乱发挥关键的调节作用。     

基于LC-MS及网络药理学探讨茗酿养生酒功能成分影响高脂血症的作用机制

基于液相色谱-质谱(LC-MS)法和网络药理学方法选取茗酿养生酒的功能活性成分及其作用靶点，获取其和高脂血症疾病的交集靶点，构建“活性成分-交集靶点-疾病”网络图，使用STRING数据库进行蛋白互作(PPI)网络分析，并使用Metascape数据库进行基因本体论(GO)和京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析，研究茗酿养生酒中功能活性成分影响高脂血症的作用机制。结果表明，从茗酿养生酒中筛选得到21种活性成分，其与高脂血症有92个交集靶点，关键靶点包括肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)和血管内皮生长因子(VEGFA)等，其涉及对细菌的响应过程等1 100个GO条目和糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路等120条KEGG信号通路，说明茗酿养生酒中的功能成分影响高脂血症具有多成分-多靶点-多途径的作用特点。     

基于网络药理学和分子对接探讨肉苁蓉治疗帕金森病的作用机制

基于网络药理学及分子对接对肉苁蓉治疗帕金森疾病的作用机制进行研究。利用 TCMSP筛选肉苁蓉中的活性成分作为候选化合物,再利用PubChem和sea数据库获取肉苁蓉的靶点信息。在GeneCard数据库中获取帕金森病靶点信息,通过比对中药和疾病靶点,得到共有靶点基因信息。运用STRING进行靶点蛋白互作（protein-protein interaction,PPI）网络的构建,在DAVID6.8数据库中对关键靶基因进行基因本体（gene ontology,GO）富集和基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and geomes,KEGG）通路富集得出治疗靶基因,利用cytoscape软件构建中药-化合物-靶点网络图。并将该网络中的基因靶点以degree值高低进行排序,选择前5个关键靶点,最后利用AutoDock Vina工具将5个关键靶点与肉苁蓉有效活性成分进行分子对接。结果表明:从肉苁蓉中共筛选得到6个有效活性成分,分别为β-谷甾醇、花生四烯酸、脱水内酯、丁香树脂二甲醚、槲皮素、枫马京。交集获得308个预测靶点,将其进行PPI分析,并从中筛选出38个关键靶基因,对关键靶基因进行GO与KEGG通路富集。最终发现,GO富集中生物过程（biologica process,BP）包括细胞内信号转导等;细胞成分（cellular component,CC）分析主要为蛋白质复合物、线粒体等;分子功能（molecular function,MF）结果主要为腺嘌呤核苷三磷酸结合、蛋白质复合物结合等。KEGG通路富集主要包括磷脂酰肌醇-3-激酶（phosphatidylin-ositol-3-kinase,PI3K）/蛋白激酶B（Protein Kinase B,PKB/AKT）、微型核醣核酸（microRNAs,miRNAs）、缺氧诱导因子-1（hypoxia inducible factor-1,HIF-1）、肿瘤坏死因子（tumor necrosis factor,TNF）、叉形头转录因子O亚型（forkhead box O,FOXO）等相关信号通路。筛选前5个关键靶点分别为MAPK8、ESR1、SRC、JAK2、AKT1。分子对接结果显示肉苁蓉6个有效活性成分与5个关键靶点具有较好的结合活性,结合能均小于?5 kcal/mol。本研究得出肉苁蓉通过保护线粒体功能、调节蛋白质活动、调节自噬、抑制神经炎症反应等治疗帕金森病,发挥多成分、多通路、多靶点协同作用。     

基于网络药理学与动物实验探究肉苁蓉总苷对炎症性肠病的作用机制

目的：通过网络药理学及动物实验研究，探讨肉苁蓉总苷对炎症性肠病（IBD）的潜在作用机制。方法：应用Pubchem数据库及文献收集肉苁蓉总苷中7种主要活性成分的三维结构。通过PharmMapper,UniProt,GeneCards等数据库获取活性成分相关靶点与IBD相关的基因靶点信息。再将肉苁蓉活性成分靶点和IBD的靶点绘制韦恩图，得到交集靶点，并将交集靶点上传到String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）筛选分析。使用DAVID数据库将肉苁蓉总苷活性成分对IBD发挥保护作用的靶点进行基因本体（GO）功能富集、京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，采用Cytoscape3.8.0软件构建“活性成分-靶点-通路网络”，预测肉苁蓉总苷治疗IBD的作用靶点与途径，并构建IBD小鼠模型进一步验证。结果：肉苁蓉总苷活性成分对IBD具有防护作用的靶点有254个，PPI分析筛选出核心靶点30个。GO功能富集和KEGG通路富集发现肉苁蓉总苷可能主要通过调控癌症通路、mTOR通路、TGF-β通路、JAK-STAT通路、AMPK通路等，进而影响细胞信号传导、增殖、分化、凋亡来发挥作用...     

基于代谢组学及网络药理学分析天麻熟制过程中生物学活性变化

目的:通过代谢组学、网络药理学及分子对接技术阐述天麻在熟制过程中成分及其药理活性变化。方法:使用LC-QTOF-MS及R语言对天麻成分进行检测和分析;通过PubChem数据库及文献查找筛选出具有生物活性的成分;使用Swiss target prediction数据库及SEA数据库对成分靶点进行预测,GeneCards数据库和OMIM数据库获取疾病靶点;通过STRING 11.5数据库及Cytoscape3.8.2软件绘制药物-化合物-靶点网络及靶点蛋白互作网络,筛选关键成分及靶点;通过DAVID数据库和OmicShare Tools对交集靶点进行GO富集和KEGG通路注释分析。结果:在熟制天麻和新鲜天麻中找出89种在含量方面具有差异的成分;分别筛选出11种具有治疗惊厥作用的成分以及410个潜在靶点,5种具有治疗糖尿病及其并发症作用的成分及698个潜在靶点;GO和KEGG富集分析发现天麻通过IL-17信号通路、cAMP信号通路、神经活性物质受体信号通路、阿尔茨海默病信号通路以及多巴胺能神经突触信号通路治疗惊厥,通过AGE-RAGE信号通路、HIF-1、VEGF以及TNF信号通路治疗糖尿病...     

基于网络药理学和分子对接技术研究乌梅改善消化不良的作用机制

目的 利用网络药理学和分子对接法,研究乌梅改善消化不良的分子作用机制。方法 利用TCMSP数据库挖掘乌梅潜在活性成分,通过Sea和STP数据库预测相关作用靶点;通过DisGeNET、OMIM和GeneCards 数据库筛选消化不良的相关疾病靶点;通过Venny在线平台映射筛选成分与疾病的交集靶点,使用String数据库进行蛋白质-蛋白质互作分析,通过cytoscape分析连通度、节点紧密度和介数筛选关键靶点,并利用DisGeNET数据库分析靶点类型;使用Auto dock相关软件对关键靶点与对应成分进行分子对接;采用DAVID数据库对乌梅改善消化不良的潜在作用靶点进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果 筛选出乌梅11个潜在活性成分及其182个作用靶点,与消化不良相关的789个疾病靶点取交集,得到50个潜在作用靶点,包含SRC, EGFR, AKT1, PIK3R1等关键靶点;GO富集分析显示与生物过程相关的条目145个,与分子功能有关的条目51个,与细胞组分相关的条目有22个;KEGG通路分析显示与75条通路相关,涉及癌症中的蛋白多糖、催乳素信号通路、癌症通路、雌激素信号通路、PI3K-Akt 信号通路、Rap1 信号通路等信号通路;分子对接结果显示活性成分与关键靶点具有较好的结合活性。结论 乌梅改善消化不良作用具有多成分、多靶点、多通路的特点,可为其应用研究提供科学依据和参考。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨辣木叶抗肥胖的作用机制

目的：本研究基于网络药理学和分子对接技术预测和验证辣木叶活性成分抗肥胖的分子靶点和途径,探索辣木叶活性成分的抗肥胖作用及潜在机制。方法：利用PubChem、DisGeNET数据库和SwissADME、Swiss Target Prediction在线预测平台获取辣木叶活性成分靶点和肥胖相关靶点;利用Venny 2.0.1平台对活性成分靶点和肥胖相关靶点取交集,筛选出关键靶点,并利用STRING 11.0数据库进行PPI网络的核心靶点分析;采用Cytoscape3.8.2软件,构建“成分-靶点”相互作用网络,筛选出核心活性成分;基于David数据库进行GO功能富集和KEGG通路分析;最后,运用Auto Dock 4.2软件对通路富集靶点与核心成分进行分子对接。结果：筛选出辣木叶活性成分50个,共确定了126个辣木叶抗肥胖的核心靶点,其中主要活性成分为鼠李黄素、胆甾-5烯-3醇、杨梅素、木犀草素等。GO及KEGG分析结果显示,辣木叶活性成分通过RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、信号传导、基因表达的正调控、蛋白质磷酸化及凋亡表达的负调控等生物过程,通过HIF-1、胰岛素抵抗、二型糖尿病、胰岛...     

基于网络药理学和分子对接探讨刺老苞防治骨质疏松症的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接探讨刺老苞防治骨质疏松症的作用机制。方法:通过色谱-质谱联用得到刺老苞药材的化学成分信息,然后利用Stitch数据库预测其作用的靶点。应用GeneCards等数据库获取与骨质疏松症相关的疾病靶点。通过去异存同得出两者之间的交集靶点,对交集靶点进行基因本体注释（GO）及通路富集分析（KEGG）,分子对接对预测出的核心靶点与关联化合物进行验证。结果:经色谱-质谱联用分析和数据库预测,获得159个活性成分及525个作用靶点,与1636个骨质疏松症相关靶点取交集得到150个交集靶点。通过PPI网络筛选出IL6、AKT1、MAPK1等10个关键靶点。GO分析显示生物功能578个,涉及基因调控、细胞增殖与凋亡、炎症反应等。KEGG分析显示通路127条,PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路等可能为关键通路,乙肝、肺结核、类风湿关节炎、癌症等疾病也可能间接导致骨质疏松症。分子对接表明多数成分与关联靶点具有较好的对接能力,说明预测结果具有一定的可靠性。结论:刺老苞多种有效成分可通过促进成骨细胞的存活、增殖与分化,抑制破骨细胞的骨吸收,发挥对骨质疏松症的防治作用,PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路以及HIF-1信号通路在此过程中可能发挥重要作用,为今后分子机制的深入研究以及相应膳食补充剂的开发提供了参考。     

基于网络药理学与分子对接技术探究逍遥丸治疗乳腺增生的作用机制（网络首发、推荐阅读）

用网络药理学方法进行逍遥丸治疗乳腺增生过程的机制研究.通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)进行逍遥丸活性成分的搜集和筛选,将纳入的化合物成分通过TCMSP数据库进行成分的靶点预测;在GeneCards数据库,NCBI基因数据库以及OMIM数据库进行乳腺增生疾病靶点筛选;取药物靶点和疾病靶点作韦恩图,并利用共有靶点在String数据库中作PPI网络图,利用拓扑分析和MCODE聚类分析筛选核心靶点和核心基因;在cytoscape 3.8.0软件中进行关键活性成分的筛选;关键靶点使用String数据库进行GO分析和KEGG分析,将相关结果导入Cytoscape3.8.0绘制成分—疾病—通路—靶点网络图.结果表明,筛选得到逍遥丸各药活性成分及靶点,其中与乳腺增生相关的有169个靶点.STAT3、AKT1、MAPK1、JUN、MAPK3等20个靶点为该药治疗乳腺增生的关键靶点,HTR2A、IL2、TOP2A、PCNA、MMP1为该药治疗乳腺增生的核心基因.槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempferol)、叶黄素(luteolin)、柚皮素(naringenin)、甘草酮a(licochalcone a)、7-甲氧基-2-甲基异黄酮(7-Methoxy-2-methyl isoflavone)、芒柄花素(formononetin)、醋栗素(acacetin)等可能是逍遥丸治疗乳腺增生发挥作用的主要活性成分.GO富集分析总共富集到2328条生物过程,160项分子功能相关,47项细胞组成相关.通路富集分析显示与166条通路相关,涉及AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、TH17细胞分化、流体剪切应力与动脉粥样硬化等信号通路.分子对接验证结果说明关键活性成分与核心靶点均对接良好.     

免疫乳的研究与开发利用

免疫乳是一种新概念天然保健食品。本文对免疫乳和与其相关的初乳的概念、主要生理活性成份、生理作用以及国内外研究开发历史和现状进行了综述。93年起，我国一些科研工作者开始对免疫乳及其制品进行了较为深入的研究和中试开发。目前国内已有普通初乳产品，但尚无真正意义上的免疫乳制品生产。认为免疫乳及其制品具有很大的发展前景。     

壳聚糖和树脂同浴整理非织造布的抗菌性及柔软性能研究

采用壳聚糖和树脂整理剂配合,对纺粘法非织造布进行柔软和抗菌整理。通过实验,对整理剂用量、焙烘温度、pH值等工艺条件进行优化选择。非织造布经壳聚糖和树脂整理剂同浴处理后,抗菌和柔软性能大幅提高,符合绿色纺织品标准。     

抗性淀粉及其防治肥胖症的研究进展

抗性淀粉及其减肥功能是近年碳水化合物和健康领域两个研究热点。文章综述抗性淀粉的减肥机制及其在国内外防治肥胖方面的研究进展,通过总结已有文献,分析抗性淀粉影响餐后饱腹感、血脂水平的变化情况,并分别介绍产生该类影响的机制,揭示抗性淀粉具有有效预防控制肥胖症的功效,为抗性淀粉的应用和健康减肥提供理论依据并丰富该领域的资料库。     

牛仔产品艺术印染加工工艺探讨

针对牛仔织物上靛蓝染料对不同染化试剂会产生不同颜色、色调变化,结合传统的扎染、蜡染、蓝染等印染加工方法,使牛仔织物在感观和艺术格调上产生变化,以解决牛仔产品色彩花纹单调的问题。详述了扎染、蜡染等方法和工艺流程。     

22°晕和近假日的折射─衍射理论的探讨

简述了２２°晕和近假日的折射理论，论证了“三日同晖”不是正弦光栅衍射形成的，提出了２２°晕和近假日的折射─衍射理论．     

减少布面横挡的实践与体会

分析了产生布面横档的原因,介绍了从机械,操作等方面采取的降低布面横挡的有效措施。     

植物提取物用于果蔬植物防腐保鲜研究进展

致腐菌是诱发果蔬采后病害，造成果蔬腐败变质的主要原因。现对植物提取物对果蔬致腐菌的抑制作用，不同提取方法对致腐菌的抑制效果和提取物用于果蔬防腐保鲜的研究进展作一综述。     

漂烫及硬化处理对果块品质影响及机理研究

针对果脯加工中易褐变和软化的问题,以苹果为试材,通过考察漂烫温度、漂烫时间、硬化剂对产品中VC、酶活、硬度等指标的影响,研究漂烫和硬化处理对果块的影响和机理.结果表明:漂烫温度为100℃,漂烫时间为4min,可以起到较好的抑制褐变的目的,5?Cl2溶液硬化3h可以起到较好的硬化效果.     

葡萄酒成分分析与质量研究

通过对１９种葡萄酒的主要成分及其感官质量的分析评价，结果显示：葡萄酒中除含有糖、酒、酸、单宁、多酚外，还含有丰富的氨基酸、维生素Ｃ、矿物质及多种微量香味成分，其含量及感官质量因酒种及来源的不同而有所差异。在分析的基础上探讨了影响葡萄酒质量的主要因素，提出了提高国产葡萄酒质量的技术工艺措施；并建议加强对葡萄酒香味成分的分析研究，建立新的葡萄酒质量评价体系。