带信息熵反馈机制的免疫克隆文本聚类算法

为了有效提高文本聚类的质量,用聚类过程不断反馈的信息熵改进向量空间模型中特征词权重的计算,构造以文本相似性为基础的抗体-抗原亲和力和抗体浓度计算方法,提出用亲和力和抗体浓度控制的抗体克隆和变异策略寻找聚类中心,并将文本归入与聚类中心相似度最大的类簇.实验表明,该算法可得到聚类质量较高并且稳定性较好的聚类结果.     

AIS在入侵检测中的应用

AIS（artificial immune system）即人工免疫系统,是生物计算的一个新领域。本文对免疫算法与模型,如骨髓模型、负选择模型、克隆选择算法、亲和力成熟和免疫网络模型与应用领域进行了深入地研究。     

多模态函数优化的人工免疫应答优化算法

针对传统的人工免疫算法收敛速度较慢,搜索精度较低的问题,基于免疫应答原理提出一种多模态函数优化的人工免疫应答优化算法.该算法将初始抗体群分配为记忆抗体群和一般抗体群,对记忆抗体群实施高频变异算子进行局部精细搜索,并对一般抗体群执行趋同过程算子进行全局粗搜索,从而加快了进化过程.通过典型多模态函数对该算法进行性能测试,实验结果表明,该算法具有更快的收敛速度和更高的搜索精度.     

基于生物免疫系统克隆选择机理和免疫网络理论的免疫算法

提出一种基于生物免疫系统克隆选择机理和免疫网络理论的免疫算法.该算法通过抗体的克隆选择和变异过程,完成对入侵抗原的清除,实现免疫防御的功能;利用免疫网络调节的思想选择抗体记忆细胞,完成知识的学习和积累,实现免疫自稳的功能;利用所建立的抗体记忆矩阵实现对类似入侵抗原的快速应答,行使免疫监视识别功能.该算法利用生物变异机制实现抗体的自适应调节,使系统具有自适应、自学习能力.在加热炉状态识别的应用研究表明,本文所提出的算法在解决数据识别方面具有较好的效果.     

动态克隆选择和免疫网络结合的算法

提出了一种动态克隆选择算法和免疫网络相结合的新入侵检测算法。将基因库和高频变异加入动态克隆选择算法，提高检测器的进化速率。将免疫网络与动态克隆选择算法结合，消除成熟检测器中存在的冗余，提高检测器的生成效率。对算法中记忆检测器的生成加入变异和竞争，促进记忆检测器的进化，提高群体的亲和力水平。     

一种新的免疫克隆算法在CVRP问题中的应用

基于克隆选择学说,通过引入克隆算子提出一种新的免疫克隆算法,并将其用于求解CVRP问题.该算法采用了克隆增殖、高频变异和克隆选择算子的操作,增加了种群中优秀个体获得克隆增殖实现亲和度成熟的机会,提高抗体群分布的多样性,在深度搜索和广度寻优之间取得了平衡.仿真结果表明,该算法具有良好的全局收敛性和较快的收敛速度,能有效解决CVRP问题.     

硬骨鱼IgM结构和功能及其体液免疫应答

经典免疫学理论有2个基本模式阐述抗体免疫反应的发展和功能:（1）亲和力成熟依赖于机体本身的和通过突变形成的高亲和力抗体的抗原驱动选择过程；（2）抗体的生物效应功能是由抗体的类型所决定的.最近研究发现硬骨鱼的免疫系统通过调控结合抗原的亲和力大小来改变分泌的IgM抗体同质异构体结构的比例，从而影响其抗体在血清中的半衰期.这种独特性质的发现是对经典免疫学理论的补充和扩展.文章概述了硬骨鱼IgM抗体结构和功能的亲和力驱动调节，并介绍维持体液免疫记忆的长寿命浆细胞和记忆性B细胞的性质以及抗体分泌细胞（如原浆细胞、浆细胞）在体液免疫应答中的作用.了解硬骨鱼IgM结构和功能的关系，以及不同分化阶段B细胞维持体液免疫反应的机制，将有利于探索构建硬骨鱼免疫评价体系，并为高效的渔用疫苗开发和疫苗效果精确性评价奠定理论基础.     

ITAM两步磷酸化基础上的TCR识别模型

将T细胞受体(TCR)的活性与免疫酪氨酸受体激活基序(ITAM)活性联系起来，深入考虑了TCR与其配体的亲和力和离解率．结果表明抗原多肽上信号氨基酸部分的细小差别，将有效地引起截然不同的T细胞应答反应．发生在T细胞应答早期信号事件中的TCR与其配体的亲和力和离解率参与决定了最终的T细胞应答结果．     

具有免疫应答的HIV感染模型的稳定性

建立具有Holling Ⅱ感染率且考虑免疫应答的HIV模型,讨论系统解的非负性和有界性,得到确定模型动力学性态的基本再生数,最后通过分析模型在平衡点处相应的特征方程,利用微分方程基本理论,证明模型在正平衡点处是局部渐近稳定的。即人类免疫缺陷病毒HIV将在个体体内持续存在,并且免疫应答会持续起作用,并用数值模拟验证结果。     

基于IVR的齐市餐饮信息查询系统设计

介绍了基于IVR的齐市餐饮信息查询系统的设计过程,结合交互式语音应答（IVR）、Sql Server数据库、SQL查询语言等技术,着重讨论了数据库、信息管理模块以及用户模拟模块的设计。经测试,效果较好,具有一定的实际应用价值。     

Immune secondary response and clonal selection inspired optimizers

The immune system's ability to adapt its B-cells to new types of antigen is powered by processes known as clonal selection and affinity maturation. When the body is exposed to the same antigen, immune system usually calls for a more rapid and larger response to the antigen, where B cells have the function of negative adjustment. Based on the clonal selection theory and the dynamic process of immune response, two novel artificial immune system algorithms, secondary response clonal programming algorithm (SRCPA) and secondary response clonal multi-objective algorithm (SRCMOA), are presented for solving single and multi-objective optimization problems, respectively. Clonal selection operator (CSO) and secondary response operator (SRO) are the main operators of SRCPA and SRCMOA. Inspired by the clonal selection theory, CSO reproduces individuals and selects their improved maturated progenies after the affinity maturation process. SRO copies certain antibodies to a secondary pool, whose members do not participate in CSO, but these antibodies could be activated by some external stimulations. The update of the secondary pool pays more attention to maintain the population diversity. On one hand, decimal-string representation makes SRCPA more suitable for solving high-dimensional function optimization problems. Special mutation and recombination methods are adopted in SRCPA to simulate the somatic mutation and receptor editing process. Compared with some existing evolutionary algorithms, such as OGA/Q, IEA, IMCPA, BGA and AEA, SRCPA is shown to be able to solve complex optimization problems, such as high-dimensional function optimizations, with better performance. On the other hand, SRCMOA combines the Pareto-strength based fitness assignment strategy, CSO and SRO to solve multi-objective optimization problems. The performance comparison between SRCMOA, NSGA-II, SPEA, and PAES based on eight well-known test problems shows that SRCMOA has better performance in converging to approximate Pareto-optimal fronts with wide distributions.     

基于量子的免疫进化算法及收敛性

分析和探讨了量子计算的特点及免疫进化机制,并结合免疫系统的动力学模型和免疫细胞在自我进化中的亲和度成熟机理,提出了一种基于量子计算的免疫进化算法。该算法使用量子比特表达染色体,通过免疫克隆、记忆细胞产生和抗体相似性抑制等进化机制可最终找出最优解,它比传统的量子进化算法具有更好的种群多样性、更快的收敛速度和全局寻优能力。在此不仅从理论上证明了该算法的收敛,而且通过仿真实验表明了该算法的优越性。     

人工免疫C-均值聚类算法

通过借鉴生物免疫系统中的克隆选择原理和记忆机制，提出了一种人工免疫C-均值混合聚类算法．该算法采用了新的克隆选择方法，通过亲和度排序和个体浓度定义了个体的选择概率，从而可确定个体的适应值评价函数，以评价和选择个体．算法还集成了一种C-均值搜索算子，用于加快收敛速度．在聚类数目已知的情况下，所提算法能够得到给定数据集下的全局最优划分，与基于遗传算法的聚类方法比较，它具有更快的收敛速度和更高的收敛精度，并可扩展到性能指标能够表示为优化聚类中心函数的聚类模型之中．仿真结果表明，所提算法是有效性的．     

用于多峰值寻优的人工免疫克隆选择算法

提出了一种执行克隆选择原则的强有力的计算方法，算法思想中考虑到在免疫响应产生的较高亲和力的抗体中，选择改进的成熟后代。这种革新算法能关于机器学习解复杂问题，实例结果表明，克隆选择算法对多峰值寻优问题有优良能力。     

基于克隆选择的粗糙集属性约简方法

基于免疫克隆选择的原理，提出了一种新的粗糙集属性约简方法，将属性集合的分类近似质量作为进化目标，利用免疫反应的分布性特点通过局部并行搜索实现全局优化，并采用抗体更新和亲和力抑制手段来维持群体的多样性，保证了各抗体局部优化解的稳定性，从而获得了多个优化约简集合，通过机械故障诊断数据的实例应用，表明该方法可以获得多个符合分类质量要求的属性约简集合，因此满足了设备故障诊断的特征优化选择要求。     

基于人工免疫有序聚类的视频关键帧提取方法

针对现有的基于无监督聚类的视频关键帧提取方法没有考虑镜头内容的时序性、对初始类的划分较敏感、易陷入局部最优等问题,提出了一种新的基于人工免疫的有序样本聚类算法.在传统人工免疫聚类算法的基础上引入了抗原记忆识别机制及改进了抗体的克隆与超变异机制,并在此基础上给出了基于人工免疫有序聚类的视频关键帧提取方法.该方法将镜头帧序列看成一个入侵机体的抗原序列,然后基于首次应答与再次应答机制依次为每个抗原产生记忆细胞池,最终每个记忆细胞池能识别的邻近抗原对应一个类别并选取距其类中心最近的帧为关键帧.对大量不同类型的视频进行了试验.结果表明,该方法能得到较高的保真度和压缩率,能够十分有效地提取出反映镜头内容变化的关键帧.     

改进免疫克隆算法的Job Shop调度

提出了基于种群协同进化的并行免疫克隆算法,将种群中个体的亲和度计算并行在多个计算节点上同时进行。引入免疫记忆机制,使抗体种群的演化过程和记忆单元的演化过程并行进行,更好地实现了抗体间的相互协作,保证了解集从可行域内部和不可行域边缘向着最优解逼近。采用了克隆增殖变异和交叉算子的操作,增加了种群中优秀个体获得克隆增殖实现亲和度成熟的机会,提高抗体群分布的多样性,在深度搜索和广度寻优之间取得了平衡。从而保证了算法较强的收敛性以及搜索空间的多样性。利用标准问题库对算法进行测试,并分析算法参数对算法结果的影响,仿真结果表明,该算法对待寻优空间的全局搜索能力和局部搜索能力以及算法的稳定性与计算速率都要强于简单免疫克隆算法和遗传算法等优化算法。     

Somatic mutation and the maturation of immune response to 2-phenyl oxazolone

Studies on the development of the immune response suggest that the repertoire of expressed antibody specificities is strongly influenced by antigen (reviewed in ref. 1). One way in which this influence is manifested is by a progressive increase in the affinity of antibody for antigen with time after immunization. This phenomenon, termed the 'maturation' of the immune response, must be due to a change in the structure of the antibody being synthesized. However, the precise nature of the changes involved and the genetic mechanisms used to produce them have not been clearly defined. We have now investigated the maturation of the immune response to the hapten 2-phenyloxazolone by mRNA sequencing of specific hybridomas. We conclude that somatic mutation of germ-line encoded genes plays a major role in the generation of antibodies with increased affinity for oxazolone with time after immunization.