芥菜研究：从基因组到功能基因组学

植物学家们正在将要完成对一种有花植物──种名叫拟南芥菜（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ ｔｈａｌｉａｎａ）的野生芥菜的第一套遗传序列的测序。与此同时，在最后一批Ａ、Ｃ、Ｇ、Ｔ组成的遗传信息被存储入ＧｅｎＢａｎｋ之前，一组植物学家已经为下一阶段策划了一个雄心勃勃的计划：研究此种植物的所有２５０００种基因的功能。该计划于２０００年６月初公布，得到了美国国家科学基金会（ＮＳＦ）的赞助，还给芥菜研究界带来了另一个好消息：该计划出人意外地发表了一系列发现这些基因的分子标志。 拥有１３０百万碱基对的芥菜基因组将在２０…     

基于PC/Linux的分子生物信息数据库查询系统

随着人类基因组计划等大型国际项目的实施，分子生物信息的研究、开发和应用已经成为当前一个前沿领域和研究热点．ＤＮＡ序列测定技术的完善和应用，使核酸序列数据库迅速增长国际上著名的３大核酸序列数据库ＥＭＢＬ，ＧｅｎＢａｎｋ和ＤＤＢＪ的数据量以指数曲线增长．与此同时，国际上两大著名的蛋白质序列数据库ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ和ＰＩＲ的数据量也随之增长．Ｘ射线衍射和核磁共振结构测定技术的改进，使蛋白质空间结构测定的速度加快．ＰＤＢ数据库中以蛋白质为主的生物大分子结构数据已达１万多套．此外，Ｍｅｄｌｉｎｅ等文献摘要…     

人和鼠GRY-RBP cDNA的克隆

通过筛选人胎儿脑ｃＤＮＡ文库，克隆了编码一个新的ＲＮＡ结合蛋白的人ｃＤＮＡ，命名为ＧＲＹ－ＲＢＰ，人ＧＲＹ－ＲＢＰ ｃＤＮＡ的长度为２９３２ｂｐ，编码一个具６２３个氨基酸，分子量为６９．６ｋｕ的ＲＮＡ结合蛋白。ＧＲＹ－ＲＢＰ蛋白含有３个ＲＮＡ识别基序（ＲＮＡ Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ ｍｏｔｉｆｓ，ＲＲＭｓ）和一个富含甘氨酸（Ｇ）、精氨酸（Ｒ）、酷氨酸（Ｙ）的羧基端，经数据库比较发现该蛋白与许多ＲＲ     

人β-簇珠蛋白基因上游远侧端调控元件与GATA转录因子结合模式

用羟基脲诱导ＨＥＬ细胞，将诱导前后细胞核内蛋白质因子与人β－类珠蛋白基因ＬＣＲ调控元件内ＤＮａｓｅⅠ超敏感点Ⅲ和Ⅳ核心ＤＮＡ序列（ＨＳ３－１４７１６－－１４９９１ＢＰ和ＨＳ４－１８３０６－１８５８６ＢＰ）的结合模式进行了分析，Ｗｅｓｔｅｒｎｂｌｏｔ分析结果表明，随着羟基脲诱导ＨＥＬ细胞时间的延长，细胞核内ＧＡＴＡ－２的含暧渐减少；与之相反，ＧＡＴＡ－１的含量却随着诱导的时间而增加。结合竞争性ＥＭＳ     

人类肽-甲硫氨酸亚砜还原酶的cDNA克隆、组织表达谱特征及染色体定位

蛋白质结构中某些氨基酸的氧化和还原是生物体内对蛋白功能的一种调控方式．甲硫氨酸（Ｍｅｔ）被氧化则变为甲硫氨酸亚砜（Ｍｅｔ（Ｏ）），它可导致所在蛋白质的生物学活性降低或丧失，但肽－甲硫氨酸亚砚还原酶（Ｐｅｐｔｉｄｅ ｍｅｔｈｉｏｎｉｎｅ ｓｕｌｆｏｘｉｄｅ ｒｅｄｕｃｔａｓｅ， ｍｓｒＡ）则可使甲硫氨酸亚砜还原为甲硫氨酸，使其所在蛋白质重新恢复活性．为了研究人体中Ｍｅｔ氧化还原的机制，以牛ｍｓｒＡ ｃＤＮＡ序列为信息探针，筛选人ＥＳＴ数据库，依据若干同源ＥＳＴ的信息从人ｃＤＮＡ分子库中克隆到一个长１２５５ｈｐ的人ＭＳＲＡ ｃＤＮＡ．该ＣＤＮＡ包含一个长７０５ ｂｐ的可读框，它编码了 ２３５个氨基酸残基．同源性比较表明，该基因与牛和大肠杆菌的ｍｓｒＡ基因的氨基酸一致性分别为８８％和６１％．表达谱分析发现，该基因在人体大多数组织中均有一条长约１．６ｋｂ的转录本，并在肾中呈高表达．应用辐射杂种细胞株定位系统（ｒａｄｉａｔｉｏｎ ｈｙｂｒｉｄ ｍａｐｐｉｎｇ ｐａｎｅｌ， ＲＨ ｍａｐｐｉｎｇ）将该基因精确定位在人染色体８ｐ２２～２３区带的ＤＳＳ５１８和Ｄ８５５５０位标之间，由于此前已有Ｋｅｒａｔｏｌｙｔｉｃｗｉｎｔｅｒｅｒｙｔｈ     

维甲酸激活新基因RA28 及其编码蛋白的定位

基因ＲＡ２８是用全反式维甲酸诱导肺腺癌细胞系ＧＬＣ－８２，用消减杂交方法分离得到的一个新的ｃＤＮＡ序列。作为体内报告分子的绿色荧光蛋白（ｇｒｅｅｎ ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｔ ｐｒｏｔｅｉｎ，ＧＦＰ），在激发光４８８ｎｍ，不加任何底物时，能发出绿色荧光。     

鼻咽癌c-myc和c-erbB-2过表达与染色体多体性的关系

以往研究提示，ｃ－ｍｙｃ和ｃ－ｅｒｂＢ－２癌基因在鼻咽癌中有过表达．为了阐明这两种癌基因过表达的分子机制，应用当前肿瘤研究新技术──组织微阵列，结合间期双色荧光原位杂交（ＦＩＳＨ）和免疫组化（ＩＨＣ），对２６７例鼻咽癌组织、２４例癌旁组织和２９例鼻咽部慢性炎症组织进行了大样本研究．结果发现，鼻咽癌ｃ－ｍｙｃ和ｃ－ｅｒｂＢ－２癌蛋白过表达发生率分别为４８％～６３％和２０％～３８％；但ｃ－ｍｙｃ和ｃ－ｅｒｂＢ－２两个癌基因在鼻咽癌中均无扩增；８与１７号着丝粒探针杂交则分别显示有４３％～５０％和２０％～２７％的鼻咽癌染色体呈现多体性．　蛋白表达分析表明，ｃ－ｅｒｂＢ－２表达与１７号染色体多体性有关（Ｐ＜０．０００５）．     

液体宝石──一种新合成类似金刚石的聚合碳

液体宝石──一种新合成类似金刚石的聚合碳罗朝华译化学的新发现往往具有偶然性，液体宝石的合成也是如此。这一天对美国宾西法尼亚大学的两位化学家帕特里厦·比亚康尼（ＰａｔｒｉｅｉａＡ．Ｂｉａｎｃｏｎｉ）和格伦尼·维瑟（ＧｌｅｎｎＴ．Ｖｉｓｓｈｅｒ）来说，不...     

人神经元电压门控钙通道 γ -3基因的克隆

将小鼠Ｃａｃｎｇ２基因的编码区与ＥＳＴ数据库进行同源性分析，得到一个与小鼠Ｃａｃｎｇ２基因在４３５ｂｐ中有７５％同源的ＥＳＴ（ＧｅｎＢａｎｋ：Ｗ２９０９５）。在该ＥＳＴ中设计引物与ｃＤＮＡ文库载体臂上引物行巢式ＰＣＲ和ＲＡＣＥ反应，在人脑前叶皮质ｃＤＮＡ文库和人脑Ｒｅａｄｙ ｃＤＮＡ中获得ｃＤＮＡ序列１５４５ｂｐ，其中包含一个９４８ｂｐ的可读框，编码３１５个氨基酸。该可读框经确证命名为ＣＡＣＮＧ３     

会说话的“废物”──“垃圾”DNA最终能传递信息

会说话的“废物”──“垃圾”ＤＮＡ最终能传递信息ＨａｙｌｅｙＢｕｃｈｂｉｎｄｅｒ著吴经灿译人们谈起ＤＮＡ（脱氧核糖核酸），总会想到那些包含一系列碱基对，能编译密码、制造细胞中蛋白质的基因。但是，由这种基因组成ＤＮＡ的，在人类细胞中只占３％。另外９７％...     

FMRP与TDG蛋白的相互作用

脆性Ｘ智力低下蛋白ＦＭＲＰ表达的缺乏可以导致最常见的遗传性智力低下疾病—脆性Ｘ综合征。用酵母双杂交体系筛选与ＦＭＲＰ相互作用的蛋白质，以期通过相互作用的蛋白质研究与ＦＭＲＰ相关的生化途径。从小鼠胚胎ｃＤＮＡ文库中得到一个与ＦＭＲＰ特异相互作用蛋白的ｃＤＮＡ（Ｇｅｎｂａｎｋ号ａｆ１０２８５７）。该ｃＤＮＡ编码的蛋白与人的Ｇ／Ｔ错配ＤＮＡ胸腺嘧啶糖苷酶（ｈＴＤＧ）高度同源通过多种ＦＭＲＰ造反剪接异构体     

蛋白质对核酸专一性识别的一种可能的方式

对来自几种基因启动子上的７组蛋白质结合位点进行了分析，暗示着蛋白质对双螺旋核酸专一性识别的一种可能方式。这种识别方式涉及双链ＤＮＡ的一种特别的拓扑性质，称为ＤＮＡ片面的碱基空间模式（ｂａｓｅ ｓｐａｔｉａｌ ｐａｔｔｅｒｎ，ＢＳＰ），它是仅由双链ＤＮＡ片段上的碱基在空间中的排列方式所决定的一种空间拓扑性质。     

一个猪免疫球蛋白 IgG H 链基因的克隆、序列分析及表达

用ＲＴ－ＰＣＲ方法从猪脾脏中分离到于段１４２５ｂｐ的ＤＮＡ片段，该片段编码免疫球蛋白基因。经全序列分析证明此片段与前人报道的序列有较高同源性，其Ｃ区属于猪Ｉｇγ链基因亚类３。用ＥｃｏＲＩ和ＮｓｉＩ切点将该片段切焉插入ｐＥＴ－３ｂ（ＮＳＥＢ）（－＿中，表达出约５２ｋｕ的蛋白质，表达量约为２１％。     

人白血病细胞株中Gsα转录物的新型异常剪接

Ｇｓα是与激活腺苷酸环化酶信号转导途径相关的蛋白质,不同的ＧｓαｍＲＮＡ是由不同形式的剪接或利用不同的启动子产生的。报道人白血病细胞株中Ｇｓα转录物的一种新型民学剪接。以来自Ｊｕｒｋａｔ细胞株的人白血病文库ｃＤＮＡ及人白血病细胞株ＨＬ－６０ｍＲＮＡ反转录后的ｃＤＮＡ第一链模板,ＰＣＲ扩增出Ｇｓα基因完整编码区,ＤＮＡ序列分析表明,ＧｓαＬｅｕ与正常Ｇｓα相比有２个区域发生不改变阅读框架的缺失,一个     

新型钙钛矿ABO3 型B 位含铋混合导体透氧膜

研究与合成了系列新型的钙钛矿型Ｂ位铋掺杂混合导体透氧膜材料，对其结构与透氧性能进行了测定．发现ＢａＢｉ_（０．２）Ｃｏ_ｙＦｅ_（０．８－ｙ）Ｏ_（３－δ）（ｙ≤０．４）及ＢａＢｉ_ｘＣｏ_（０．２）Ｆｅ_（０．８－ｘ）Ｏ_（３－δ）（ｘ＝０．１～０．５ ）都可以形成立方晶相的钙钛矿型复合氧化物．透氧测定表明此系列材料具有非常高的氧渗透能力．ＢａＢｉ_（０．２）Ｃｏ_（０．３５）Ｆｅ_（０．４５）Ｏ_（３－δ）导体膜，在膜片一端为空气氛另一端为氦气氛情况下，９００℃时透氧量高达０．７７ × １０~（－６） ｍｏｌ／（ｃｍ~２·ｓ）以上，远远高于相同条件下其他的含铋透氧膜材料．并发现透氧量随着钴含量的增加而增加，而与铋含量无简单的关系．Ｏ_（２）－ＴＰＤ测定表明，材料具有优良的氧吸附脱附可逆性．长时间透氧测定表明，ＢａＢｉ_（０．２）Ｃｏ_（０．３５）Ｆｅ_（０．４５）Ｏ_（３－δ）ＢａＢｉ_（０．３）Ｃｏ_（０．２）Ｆｅ_（０．５）Ｏ_（３－δ）导体膜在８７５℃下都具有较稳定的氧渗透行为．     

CD2胞内区结合蛋白的分子克隆与鉴定

为了探讨 ＣＤ２分子的信号传递功能，以编码ＣＤ２胞内区（Ｔｈｒ２１１－Ｇ１ｎ３３６）肽段的ｃＤＮＡ为“钓饵”，采用酵母双杂交系统从激活的人Ｔ淋巴细胞ｃＤＮＡ文库中筛选与之相互作用蛋白的ｃＤＮＡ序列．并采用免疫共沉淀法鉴定该蛋白在体内与ＣＤ２胞内区结合的特异性．克隆并鉴定了一个与ＣＤ２胞内区特异性结合的胞内蛋白分子，与ｖ－ｆｏｓ转化效应蛋白（Ｆｔｅ－１）同源 Ｆｔｅ－１参与细胞转化、生长、蛋白合成及向线粒体转运蛋白质．蛋白数据库检索表明，Ｆｔｅ－１具有蛋白激酶ＰＫＣ的结合与作用位点，提示Ｆｔｅ－１参与ＣＤ２分子介导的信号传递     

大肠杆菌胞嘧啶脱氨酶基因克隆及其原核表达载体构建、表达

通过ＰＣＲ方法克隆出大肠杆菌株Ｈ－３０的胞嘧啶脱氨酶基因，并将其起始密码子ＧＴＧ突变为ＡＴＧ，构建了ＣＤ基因的原核重组表达载体ＰＢＶ２２０－ＣＤ，通过测定胞嘧啶脱氨酶活性筛选出ＣＤ高表达活性克隆Ｈ－３０ＣＤ－１１５－氟胸嘧啶对ＣＤ活性克隆有杀灭毒性，ＤＮＡ序列分析显示ＣＤ高表达活性克隆Ｈ－３０－ＣＤ－１１较基因文库中所报道的ＣＤ基因存在１６个位点碱基改变，引起肽链中氨基酸改变的位点有５人。     

俄罗斯计算机之王

俄罗斯计算机之王ＡｒｔｈｕｒＦｉｓｈｅｒ著许国平译“我国（俄罗斯）的计算机制造业已经停止了，实际上，完全可以这样说：它已经不存在了。”说这番话的是鲍利斯·巴贝安（ＢｏｒｉｓＢａｂａｉａｎ），他６０岁左右面容和蔼，身材魁梧，两眉粗黑，脸部很明显地带着斯...     

蟑螂浓核病毒全核苷酸序列与基因组结构

测定了黑胸大蠊浓核病毒（ｐｆＤＮＶ）复制型（ＲＦ）ＤＮＡ的核苷酸序列，确定ｐｆＤＮＶ基因组全长为５４５４个核苷酸，基因组两末端存在典型的发夹结构和侄 置重复序列，ＰｆＤＮＶ基因正链有４个大的可读框（ＯＲＦ），负链含３个大的可读框，并且可读框都集中在敏条链的５′端，两个可能的功能性启动了分别位于图距单位３和９７处，基因组存在基因重叠现象和内含子区域，半对ｐｆＤＮＶ基因组与同科其他细小病毒进行同源性比     

应用抑制性消减杂交技术克隆鉴定肾癌特异表达基因

应用抑制性消减杂交技术（ｓｕｐｐｒｅｓｓｉｏｎ ｓｕｂｔｒａｃｔｉｖｅ ｈｙｂｒｉｄｄｉｚａｔｉｏｎ，ＳＳＨ），成功地构建了高消减效率的人肾癌细胞与正常肾组织差异表达的ｃＤＮＡ消减文库，从中随机挑取２００个克隆进行酶切分析，结果显示其中１９０个均得到５０～４００ｂｐ插入片段，１０个无插入片段。对其中１０个插入的ｃＤＮＡ片段进行测序后经ＧｅｎＢａｎｋ检索表明１０个片段均为未知新序列，其中ＲＣＣ１８为