雉科四族鸟类的分子系统发生研究

摘要：为了研究雉科4个族（鹑族Perdicini、雉族Phasianini、眼斑雉族Argusianin和孔雀族Pavocini）的系统发生,本研究分析了雉科4属7种鸟类线粒体DNAC01基因694bp序列,共发现210个变异位点,其中简约信息位点180个。4个族之间,眼斑雉族和孔雀族的遗传距离最小为0．145;眼斑雉族和雉族间的最大为0．192。4个族在系统发生树上聚成两个明显的分支,其中鹑族和雉族聚成一支,眼斑雉族和孔雀族聚成另一支。形态和分子的证据均表明眼斑雉族和孔雀族关系较近。     

Gallopheasants中协同进化性状的似然比检验

基于细胞色素b基因全序列的贝叶斯系统树，应用似然比检验方法比较研究了Gallopheasants类群的2个性状对的进化格局和过程．结果揭示了栖息地结构和海拔高度的密切关系．完全性成熟年龄和卵大小显示了协同进化格局；时序分析表明在进化过程中，前者先于后者出现．该结论暗示了生活史类型的转变．     

雉科四种鸟类线粒体DNAR的分子进化

采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序的方法分析了4种雉科(Phasianidae)鸟类的线粒体DNA(mtDNA)控制区基因(D-loop)415bp基因序列。4种鸟类遗传距离在5.90％--23．67％．变异位点数为116个，大石鸡和石鸡的遗传距离为5．90％，二者分歧时间大约是290万年．斑翅山鹑与环颈雉遗传距离为21．06％，分歧时间为1000万年，山鹑属与雉属的遗传距离为21．06％，与石鸡属的遗传距离为22．41％；雉属与石鸡属的遗传距离为22．85％．三者分歧时间在1000—1150万年间，与化石材料相符．在系统树中斑翅山鹑与环颈雉属同一枝，说明1)在雉科系统发生中，雉属与山鹑属是近缘属或2)环颈雉与斑翅山鹑的分化较晚，关系密切，也与Randi得出的斑翅山鹑称为小雉的结论相吻合。     

中国蛙科-新属——肛刺蛙属（蛙科：叉舌蛙亚科）

形态比较和分子系统学分析结果表明叶氏隆肛蛙Feirana yei具有较多独特性．其雄性个体肛部隆起，肛孔下方有两个布满黑刺的大的白色球形隆起、具单咽下内声囊、第一指具婚刺等外形特征可区别于隆肛蛙属已知的另2种和蛙科叉舌蛙亚科中的其他各属；在棘蛙族系统发育关系树上独立为一支，位于Quasipaa支系的基部，与该属其他种明显分开，构成姐妹群关系．这些特性表明叶氏隆肛蛙不宜划入隆肛蛙属或Quasipaa，适宜另立一新属，即肛刺蛙属Yerana gen．nov.     

16SrRNA基因序列变异和中国野鲮亚科鱼类单系性研究

形态和分子系统学的研究结果均表明,鲤科中的鲃系是一个单系类群,由鲃亚科、鲤亚科、裂腹鱼亚科和野鲮亚科组成,但它们各自的单系性及相互关系还没有系统发育证据.采用PCR方法获得了27种鱼类的16S rRNA基因序列,其中包括18种野鲮亚科鱼类,代表了中国野鲮亚科13个属.应用邻接法、最大简约法、最大似然法和Bayesian法分别构建其分支系统图.结果表明,野鲮亚科鱼类形成了一个单系类群,并且包括两个主要分支类群:其中一支包含鲮属、缨鱼属和墨头鱼属;另一个支系包括野鲮属、拟缨鱼属、异华鲮属、卷口鱼属、唇鲮鱼属、泉水鱼属、直口鲮属、盘鮈属、纹唇鱼属和华鲮属.分子系统学的研究表明,传统分类学中使用的一些形态特征,如口唇及其相关结构等,可能是趋同进化的结果,并不完全与其系统发育进化相一致.     

中国蟋蟀总科昆虫分类学研究概况

简述了中国蟋蟀总科昆虫的分类系统及其分类学的现状;在形态学方面,中国蟋蟀总科昆虫已知230种(亚种),隶属于10科69属;概述了蟋蟀鸣声和发声器、细胞分类学、分子系统学等3个方面的研究概况.     

在多匹配病例—对照研究中优比的小样本研究(英文)

Ｍｅｈｔａ等人（１９８５）指出了建立在计数统计基础上的多匹配病例—对照研究中优比的精确检验的重要性．这里提出了两种新的基于估计和似然比的精确检验法,对这三种精确检验法进行了比较,并把它们与渐近检验作比较,说明了在小样本设计的双边检验中基于似然比的精确检验具有优越性．     

中国蝗虫的分类学研究

综述了我国蝗虫分类学的历史和发展过程 .在传统分类方面 ,记述了解放前后的发展 .到目前为止 ,全国共计有蝗总科 8科 2 5 3属 10 5 3种 ,蚱总科 7科 5 2属3 10种 .在昆虫综合分类方面 ,记述了数值分类和支序分类、内部构造和超微结构、生理分类、细胞分类、发声器和鸣声研究、分子系统学等 6个方面的研究进展 .     

蚁科昆虫分子系统学研究进展

概述了蚁科昆虫分子系统学的研究进展，包括已测序的分类单元和序列片段，蚁科昆虫与其他远缘生物之间互利共生现象的比较研究，与蚁科昆虫相关的分子系统学研究方法的发展，并介绍用于分子系统学研究的昆虫标本的保存方法．     

基于线粒体细胞色素b基因序列的蜻亚科部分种类分子系统学研究(蜻蜓目:蜻科)

通过PCR及PCR产物的直接测序技术，测定了蜻蜓目蜻科蜻亚科的灰蜻属、宽腹蜻属和蜻属共7种蜻蜓的线粒体DNA细胞色素b基因的部分核苷酸序列（长度为576bp），探讨了蜻亚科的分子系统学．在所有序列中A＋T平均含量较高，为70．2％，而氨基酸密码子第3位点的A＋T平均含量最高，为85．4％．多态住点数为180个，占总位点数的31．25％，显示出DNA序列变异丰富．基于邻接法、最大简约法和贝叶斯法的分子系统发生，分析结果支持灰蜻属是较进化的类群，宽腹蜻属次之，蜻属是相对分化较早、较古老的类群，这3个属的关系是蜻属→宽腹蜻属→灰蜻属。     

利用trn L-trn F探讨文定果属的系统地位及其与若干近缘科属的系统发育关系

 运用克隆测序的方法测定了椴树科Tiliaceae、梧桐科Sterculiaceae、杜英科Elaeocarpaceae和大风子科Flacourtiaceae 21种以及外类群蔷薇科4种植物的叶绿体trn L-trn F序列,并结合GenBank中已公布的3科44个代表种的trn L-trn F序列进行系统发育分析。采用最简约法、最大似然法和Bayesian推测分析椴树科、梧桐科和杜英科科间和属内的系统发育关系。结果显示：①文定果属Muntingia构成一个独立于梧桐科和椴树科的分支,具有较高bootstrap的支持率和后验概率,表明建立文定果科Muntingiaceae具有合理性;②滇桐属Craigia与梧桐科翅子树属Pterospermum、肖槿属Thespesia、苹婆属Sterculia、可乐果属Cola、梧桐属Firmiana和银叶树属Heritiera的关系密切。支持将滇桐属归于梧桐科的观点;③杜英属Elaeocarpus和猴欢喜属Sloanea均为杜英科的主要成员,应归于杜英科;④椴树科、梧桐科和杜英科有较近的亲缘关系。特别是,椴树科和梧桐科的关系非常密切,两科并没有构成两个独立的单系群,而是形成复系群。     

中国斑腿蝗科线粒体基因的分子系统学研究(英文)

使用线粒体基因COⅠ,COⅡ,Cytb分析并建立中国斑腿蝗科部分种属的系统发育关系,其中对7个新种(Apalacris eminifronta,Caryanda pseudodentata,Caryanda bannaensis,Caryanda ruiliensis,Longchuanacris fui,Longchuanacris xiaoheis-hanensis,Podismodes dabieshanensis)的归属从分子角度也做了讨论。本研究将实验所获得的56条序列与NCBI中所收录的斑腿蝗科序列进行联合分析,采用最大似然法、贝叶斯推论等系统分析方法并综合P距离进行分析,最终得出以下几点结论:①龙川蝗属Longchuanaceis Zheng et Fu划归卵翅蝗亚科Caryandinae;②蹦蝗属Sinopodisma Chang、云秃蝗属Yunnanacris Chang均为华秃蝗属Podismodes Ramme的同物异名;③不支持Storozhenko将豫蝗属Yupodisma Zhang et Xia并入安秃蝗属AnapodismaDovnar-Zapolskii,从本研究所建的系统发育树来看,豫蝗属仍应作为秃蝗亚科Podisminae的一个独立属;④前人利用形态特征鉴定的七个新种与分子系统发育分析结果一致,新种独立有效。     

Phylogenetic studies of Chinese labeonine fishes (Teleostei:Cyprinidae) based on the mitochondrial 16S rRNA gene

The mitochondrial 16S ribosomal RNA gene is sequenced from 24 ingroups taxa, including 18 species from Labeoninae grouped in 13 genera. Phylogenetic analyses are subjected to neighbor joining, maximum parsimony, maximum likelihood and Bayesian analyses. Phylogenetic analysis indicates that Labeoninae is basically a monophyletic assemblage and can be divided into 2 major clades: one comprising the genera Cirrhinus, Crossocheilus and Garra; and the other consisting of the genera Labeo, Sinilabeo, Osteochilus, Pseudoorossocheilus, Parasinilabeo, Ptychidio, Semilabeo, Pseudogyricheilus, Rectori and Discogobio. According to our present analysis,the features such as the presence of the adhesive disc on the chin and the pharyngeal teeth in 2 rows used in the traditional taxonomy of Labeoninae provide scarce information for phylogeny of labeonine fishes.     

基于线粒体蛋白编码基因探讨飞虱科Delphacidae13属系统发育关系

飞虱科昆虫隶属于半翅目蜡蝉总科,是世界上最重要的农业害虫之一.昆虫的线粒体基因是昆虫分子与进化研究中常用且有效的分子标记.本研究基于线粒体蛋白编码基因探讨了飞虱科13属18种的系统发育关系,分别采用距离法、最大似然法和贝叶斯法构建的系统发育树得到的结论是一致的,即在飞虱科13属中,Ugyops属较为原始,处于系统树的基...     

基于2个独立二项分布的风险比的信仰推断

两个独立二项分布参数之间的风险比的非劣效性检验在医学统计研究中是一个非常有意义的问题. 常用的限制性极大估计方法在大多数情况下都不能控制第一类错误. 本文提出用基于信仰推断法来解决基于两个独立二项分布参数之间的风险比的非劣效性检验问题. 模拟结果显示: 在小样本的研究情况下,这种基于信仰推断法的MF检验方法能很好地控制第一类错误, 检验功效也不差.     

在多匹配病例-对照研究中优比的小样本研究

Ｍｅｈｔａ等多（１９８５）指出了建立在计数统计基础上的多匹配病全－对照研究中优化的精确检验的重要性。这里提出了两种新的基于估计和似然比的精确检验法,对这三种精确检验法进行了比较,并把它们与渐近检验作了比较,说明了在样本设计的双国检验中基于似然比的精确检验具有优越性。     

左截断右删失数据中泊松分布的贝叶斯推断

研究了左截断右删失数据中泊松分布的贝叶斯推断问题。主要给出了参数的极大似然估计和贝叶斯估计,同时给出了相应的置信区间。最后给出了贝叶斯推断的随机模拟检验,通过检验发现:在小样本的情况下,贝叶斯估计精度比极大似然估计的精度高一些,而在大样本的情况下,这2种估计的精度相差不大。在置信区间的构造方面,不论是小样本还是大样本,最大后验密度置信区间确实比传统的置信区间有效。