新型冠状病毒COVID-19相关研究进展

冠状病毒是一个常见而又古老的病毒大家系,近年来多次在人群中暴发流行,分别有2003年引起严重急性呼吸综合征的严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、2004年和2005年分别被发现的人冠状病毒NL63(HCoV-NL63)和人冠状病毒HKU1(HCoV-HKU1)、2012年发现的中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV),及2019年12月在我国流行的新型冠状病毒(2019-nCoV),目前国际病毒分类委员会已正式命名该病毒为SARS-CoV-2。冠状病毒广泛存在蝙蝠体内,但在鸟、猫、犬、猪、鼠、马、鲸鱼、穿山甲和人类也有发现,此病毒多次暴发流行引起了各界人士的关注,其所致疾病引起了严重恐慌,研究其病原学,可有助于掌握引起流行原因,及时控制病毒蔓延,并致力于阻止病毒的肆虐。     

β-冠状病毒引起人类疾病的流行与控制

β-冠状病毒(Beta Coronavirus,β-CoV)可感染人和多种动物,引起宿主呼吸道、肠道、肝和神经系统疾病。自2002年出现由严重急性呼吸道综合征冠状病毒(severe acute respiratory syndromes coronavirus,SARS-CoV)所引起的传染性非典型肺炎在全球32个国家和地区暴发流行以来,先后又有该属其他种类的病毒引起人类中东呼吸综合征(Middle East respiratory syndrome,MERS)及人类冠状病毒HKU1肺炎。冠状病毒以其高的传播效率、严重的感染后果以及捉摸不定的流行时间对人类健康构成持续的威胁。本文综述了β-CoVs所引起的疾病在人群中流行的历史、病毒来源与传播方式以及对病毒应采取的检测与监控方法,旨在为更好地控制β-CoVs所致人类疾病提供依据。     

传染性非典型肺炎病原学研究注意事项

传染性非典型肺炎,国际上称之为严重急性呼吸道综合征(SARS) ,是一种新型冠状病毒———SARS冠状病毒(SARS CoV)感染引起的急性传染病。传统的冠状病毒具有嗜胃肠道、呼吸道和神经系统的特性,可以引起人类呼吸道和肠道感染和婴幼儿急性肠炎。SARS CoV与以往发现的冠状病毒相比,     

冠状病毒

冠状病毒(Coronavirus)属于Nidoviales目、冠状病毒科、冠状病毒属,于20世纪60年代中期被首次发现为人类疾病的病原微生物。因在电子显微镜下,该病毒包膜表面有棘刺状蛋白伸出,形状似王冠而得此名。冠状病毒是有包膜的线形正义单链RNA病毒,基因组RNA约为30kb,病毒颗粒为圆形,大小约80～120nm。冠状病毒可感染禽类及哺乳动物,引起呼吸道、肠道、心血管及神经系统疾病。目前爆发流行的非典型肺炎,即重症急性呼吸综合征     

传染性非典型肺炎病原学研究注意事项

传染性非典型肺炎，国际上称之为严重急性呼吸道综合征(SARS)，是一种新型冠状病毒——SARS冠状病毒(SARS—CoV)感染引起的急性传染病。传统的冠状病毒具有嗜胃肠道、呼吸道和神经系统的特性，可以引起人类呼吸道和肠道感染和婴幼儿急性肠炎。SARS-CoV与以往发现的冠状病毒相比，具有传染性强、传播速度快、临床过程凶险、病死率高等特点。     

儿童SARS、MERS和COVID-19的流行病学和临床特征

近年来,具有流行潜力和高死亡率的人类新病原体如严重急性呼吸系统综合征(SARS)、H5N1禽流感、中东呼吸综合征(MERS)、猪流感的出现严重威胁人们的健康。2019年12月,武汉市发现一种不明原因肺炎病例,国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)后来将引起此种疾病的病毒正式分类名为严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)。     

人类冠状病毒与SARS-CoV

冠状病毒(Coronavirus)于1937年首次从禽类分离,Tyrrell和Bynoe于1965年将人鼻腔洗液接种人胚气管,检测有病毒增殖,由于其外观形态似日冕,1968年鉴定为人类冠状病毒[1].2003年严重急性呼吸综合征(SARS)由SARS-冠状病毒(SARS-CoV)引起并大规模流行,SARS-CoV作为新出现病原体引起全球关注;2004年又出现新型冠状病毒.现就人类冠状病毒和SARS-CoV的类型、特性、受体、基因组和流行概况进行扼要回顾.     

呼吸道病毒检测：从传统方法到新一代测序技术

由呼吸道病毒引起的传染病是人类感染性疾病中最常见的一类,从常见的流感病毒、呼吸道合胞病毒到大规模暴发的严重急性呼吸综合征冠状病毒、中东呼吸综合征冠状病毒,以及新型冠状病毒等,对人类健康和社会安全造成巨大威胁。快速准确的病毒检测对于呼吸道传染病疫情的控制有重要意义。本文从传统的电镜技术和病毒分离培养,到免疫学技术、分子生物学技术、基因芯片技术以及高通量下一代测序技术进行综述。     

何为中东呼吸综合征

<正>自2012年以来,全球有1 000多人感染中东呼吸综合征(Middle East Respiratory Syndrome,MERS)并造成400多人丧生,部分国家和地区出现了聚集性疫情,2015年5月29日,中国广东省惠州市确诊了一例从韩国入境的中东呼吸综合征(MERS)病例。我国与韩国来往密切,公众担忧该病是否会因此传入我国,相关部门也对此高度重视。MERS全称是中东呼吸症候群冠状病毒感染症,是一种由新型冠状病毒感染所引起的、以急性呼吸道感染为主要临床表现的疾病,严重病例可出现急性呼吸     

新冠肺炎问答(一)

1.什么是新型冠状病毒?冠状病毒是一种单股正链RNA病毒,是自然界广泛存在的一大类病毒,因病毒包膜上有向四周伸出的突起,形如花冠而得名。冠状病毒与人和动物的多种疾病有关,可引起呼吸系统疾病、消化系统疾病和神经系统疾病,如人类的严重急性呼吸综合征(SARS)和中东呼吸综合征(MERS)。     

Effects of Coronavirus Infections in Children

The isolation of the coronavirus (CoV) identified as the cause of severe acute respiratory syndrome and the detection of 2 new human CoVs (HCoV-NL63 and HCoV-HKU1) have led to studies of the epidemiology and clinical and socioeconomic effects of infections caused by all HCoVs, including those known since the late 1960s (HCoV-229E and HCoV-OC43). HCoV infections can be associated with respiratory and extrarespiratory manifestations, including central nervous system involvement. Furthermore, unlike other RNA viruses, HCoVs can easily mutate and recombine when different strains infect the same cells and give rise to a novel virus with unpredictable host ranges and pathogenicity. Thus, circulating HCoVs should be closely monitored to detect the spread of particularly virulent strains in the community at an early stage and to facilitate the development of adequate preventive and therapeutic measures.     

新型冠状病毒肺炎实验室诊断技术研究进展

 

2019年12月,湖北省武汉市发现以肺部病变为主的新型冠状病毒感染,2020年2月11日世界卫生组织（WHO）将由新型冠状病毒引发的疾病正式命名为2019冠状病毒病（coronavirus disease 2019,COVID-19）,该病毒称为严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）。COVID-19短时间内扩散到全国,3月11日WHO宣布COVID-19已构成全球大流行。实验室检测是确诊COVID-19的重要依据,对于该病的治疗和防疫工作至关重要。本文对COVID-19实验室临床诊断技术相关进展进行整理综述。

     

Fatal Multisystem Inflammatory Syndrome in Adult after SARS-CoV-2 Natural Infection and COVID-19 Vaccination

We describe a fatal case of multisystem inflammatory syndrome in an adult with onset 22 days after a second dose of mRNA coronavirus disease vaccine. Serologic and clinical findings indicated severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 infection occurred before vaccination. The immunopathology of this syndrome, regardless of vaccination status, remains poorly understood.     

Effect of inactivated influenza vaccination on human coronavirus infection: Secondary analysis of a randomized trial in Hutterite colonies

BackgroundAlthough influenza vaccines provide protection against influenza viruses, concern has been raised that they may increase susceptibility to non-influenza respiratory viruses. As pandemic lockdowns end, temporal overlap of circulation of seasonal influenza viruses and severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is expected. Understanding the impact of influenza vaccination on risk of coronavirus infection is therefore of considerable public health importance.MethodsWe performed a secondary analysis of a randomized trial where children and adolescents in Canadian Hutterite colonies were randomly assigned by colony to receive the 2008–2009 seasonal inactivated trivalent influenza vaccine (TIV) or a control hepatitis A (HepA) vaccine. All 3273 colony members (vaccinated children and nonvaccine recipients) were followed for the primary outcome of RT-PCR confirmed seasonal coronavirus infection. Serum collected pre- and post-vaccination was analyzed for titers of IgG antibodies towards human coronaviruses (HCoV).ResultsThe incidence of coronavirus infection was 0·18/1000 person-days in the colonies that received TIV vs 0.36/1000 person-days in the control group, hazard ratio (HR) 0.49 [0.21–1.17]. The risk reduction among non-vaccine recipients in the TIV group compared to the control group was HR 0.55 [0.24–1.23]. There was an increase in the geometric mean fold change of HCoV-OC43 antibody titers following TIV compared to HepA vaccine (mean difference 1.2 [0.38–2.06], p = 0.007), and an increase in geometric mean HCoV-NL63 antibody titers post-TIV (262.9 vs 342.9, p = 0.03).ConclusionThe influenza vaccine does not increase the risk of a coronavirus infection. Instead, the influenza vaccine may reduce the rate of coronavirus infections by inducing cross-reactive anti-coronavirus IgG antibodies.     

Geographical structure of bat SARS-related coronaviruses

Bats are the natural reservoirs of severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) which caused the outbreak of human SARS in 2002–2003. We introduce the genetic diversity of SARS-related coronaviruses (SARSr-CoVs) discovered in bats and provide insights on the bat origin of human SARS. We also analyze the viral geographical structure that may improve our understanding of the evolution of bat SARSr-CoVs.     

儿童2019冠状病毒病的研究进展

2019冠状病毒病(COVID-19)是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)引起的以呼吸系统症状为主要表现的疾病,其发病机制可能与血管紧张素转换酶2(ACE2)受体有关。儿童作为一个较特殊的群体有自己的独特性,大部分感染SARS-CoV-2的儿童表现为无症状或者轻度症状,严重的患儿可表现为多系统炎症综合征。目前针对该疾病的治疗方案仍以一般治疗为主,相关药物治疗仍处在临床试验阶段。该文从流行病学、临床表现、实验室检查、影像学表现、诊断及治疗方案方面对儿童感染SARS-CoV-2进行综述。     

Strand-Specific Reverse Transcription PCR for Detection of Replicating SARS-CoV-2

We developed an assay that detects minus-strand RNA as a surrogate for actively replicating severe acute respiratory syndrome coronavirus 2. We detected minus-strand RNA in 41 persons with coronavirus disease up to 30 days after symptom onset. This assay might inform clinical decision-making about patient infectiousness.     

Lack of Susceptibility to SARS-CoV-2 and MERS-CoV in Poultry

We challenged chickens, turkeys, ducks, quail, and geese with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 or Middle East respiratory syndrome coronavirus. We observed no disease and detected no virus replication and no serum antibodies. We concluded that poultry are unlikely to serve a role in maintenance of either virus.     

2006—2009年广州急性呼吸道感染患者病毒病原学调查

目的 了解广州地区2006—2009年急性呼吸道感染(ARI)患者各病毒病原体的感染状况。方法 于2006年9月至2009年9月在广州医学院附属第二医院收集1554例ARI患者发病1～3d内的咽拭子和鼻拭子各1根,共收集1554份。应用荧光定量PCR方法检测标本中流感病毒A型和B型( FluA、FluB)、腺病毒(ADV)、鼻病毒(HRV)、呼吸道合胞病毒(RsV)、副流感病毒1、2、3型( HPIV1、HPIV2、HPIV3)、偏肺病毒(MPV)、冠状病毒(HCoV) 229E型(229E)、HCoV OC43感染等1 1种病毒的核酸。分析各病原体感染的流行病学特征及主要临床症状。结果 1554份标本的病毒总检出率为65.9％ (1024/1554),RSV检出率最高,为16.8％ (261/1554),其他病毒的检出率从高到低依次为HRV[13.9％ (216/1554)]、FluA[11.6％ (181/1554)]、MPV [6.5％ (101/1554)]、FluB[6.4％ (99/1554)]、HPIV[4.9％( 76/1554)]、ADV[3.5％( 55/1554)]、HCoV[2.3％( 35/1554)]。HPIV和HCoV在各年龄组人群中的感染率相近;FluA和FluB感染率在15 ～24岁人群中最高,分别为16.5％(29/176)、7.4％(13/176);MPV、RSV和HRV在4岁以下儿童中的感染率最高,分别为9.7％ (49/503)、21.7％( 109/503)、18.9％ (95/503);ADV的感染率在5～ 14岁人群中感染率最高,为6.0％(19/318)。HPIV和HRV的发病率无明显季节特征,FluA、FluB、RSV、ADV、MPV和HCoV的流行有一定的季节特征。ARI患者中存在22.2％( 227/1024)的患者合并感染其他呼吸道病毒。FluA、FluB、ADV感染患者出现高热症状的比例较高,分别为90.1％( 163/181)、88.9％( 88/99)、92.7％(51/55)。结论RSV是引起ARI的主要病毒病原体,新发现的病原体如MPV也是引起ARI的重要病原体;部分病原体的感染与年龄和季节有一定的关联;ARI患者中部分合并感染其他呼吸道病毒。     

Bordetella hinzii Pneumonia and Bacteremia in a Patient with SARS-CoV-2 Infection

Patients with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 infection may have bacterial co-infections, including pneumonia and bacteremia. Bordetella hinzii infections are rare, may be associated with exposure to poultry, and have been reported mostly among immunocompromised patients. We describe B. hinzii pneumonia and bacteremia in a severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 patient.