HMGN2抗菌结构域的研究

目的：本室从人外周血单个核白细胞分离获得一个新的抗菌多肽。其氮端氨基酸序列与人HMGN2相同。本研究HMGN2的抗菌谱和其功能结构域。方法：OMIGA蛋白结构软件分析HMGN2的二维结构。合成HMGN2氮端和碳端肽片段和α-螺旋结构域。检测各合成肽片段的抗菌活性。同时构建HMGN2全肽和α-螺旋结构域编码基因原核表达载体及制备其大肠杆菌重组表达产品。检测重组全肽和α-螺旋结构域的抗菌活性。结果：0MIGA蛋白结构软件分析发现HMGN2含1个从其氨基酸序列第17位到47位的跨膜α-螺旋结构域。     

“溴”结构域研究进展

“溴”结构域是近 10年来发现的广泛存在于等多种生物中的一种保守结构域 ,一般由 6 0～ 110个氨基酸残基组成。二级结构为双性α-螺旋 ,三级结构为左手上下四螺旋束状结构 ,含一个疏水穴。“溴”结构域是一种乙酰赖氨酸结合域 ,主要功能是介导蛋白质 -蛋白质间的相互作用。已经登录的“溴”结构域蛋白质家族有 5 0多种 ,其多数成员与基因的转录调控有关 ,涉及核小体的装配、基因的激活和 (或 )共激活、酶活性的调节诸多方面     

“minimA1”同源结构域的设计:N-末端臂调节同源结构域DNA结合的亲合力并能稳定其结构

同源结构域是一个保守的DNA结合区,特异地存在于从线虫到人类的发育调节蛋白中。从其一至三级结构和与DNA相互作用的模式中发现,在进化过程中它具有高度保守性。其60个氨基酸残基可形成3个α-螺旋和一个延伸的N-末端氨基酸臂。大部分同源结构域序列高度保守,构成一致性序列,具有促进其形成三级结构和调节DNA结合的能力。α-螺旋Ⅰ—Ⅲ区内的一致性序列构建了一个亲水核,保存其α-螺旋亲水与疏水的两性特征,而螺旋Ⅲ及N-末端氨基酸臂序列则与DNA接触。尽管同源结构域存在广泛的序列保守性,但含同源结构域的蛋白质仍然有其各自的功能,对此目前尚无恰当的解释。为此,作者以Msx-1蛋白质的同源结构域     

真核基因的反式调控蛋白及其结构与功能

本文综述了真核细胞反式调控蛋白的主要类型、结构与功能研究的最新进展。研究表明:各种反式调控蛋白要发挥其转录活性调节功能,必须具有两种活性结构域,即与DNA特异序列结合的DNA结合结构域和发挥其功能的转录活化结构域。前者目前已鉴定出四种-锌指结构、亮氨酸拉链结构、平衡结构域及碱性a-螺旋结构。转录活化结构域目前已发现酸性a-螺旋、富含谷氨酰胺及富含脯氨酸结构三种类型。其活性是受到多种机制的调节的,如磷酸化、糖基化以及蛋白质-蛋白质相互作用等。作者期望本文对促进国内此领域工作的开展有所裨益。     

子宫畸形患者HOXA13基因同源结构域分析

目的探讨中国子宫畸形患者中HOXA13基因同源结构域是否存在突变及其相关性分析。方法国外文献报道手-足-生殖器综合征（hand-foot-genital syndrome,HFGS）患者中发现HOXA13基因2号外显子同源结构域存在点突变,而此综合征的女性患者部分症状表现为子宫畸形,因此对58例中国子宫畸形患者和54例正常对照者进行HOXA13基因同源结构域检测,PCR扩增目的片断后自动化测序分析基因2号外显子同源结构域区域。结果HOXA13基因同源结构域直接自动化测序分析结果显示,在患者和对照者中均没有突变发生。结论中国妇女子宫畸形的发生可能与HOXA13基因同源结构域突变无关。     

巨噬细胞清除受体

巨噬细胞清除受体(包括Ⅰ型和Ⅱ型)为三聚体整合膜蛋白。Ⅰ型受体的单体由453个氨基酸组成,含6个连续结构域(Ⅰ-Ⅵ);Ⅱ型受体的单体由349个氨基酸组成,含5个结构域(Ⅰ～Ⅴ)。其结构中的两类超螺旋结构,即结构域Ⅳ的α-螺旋超螺旋和结构域Ⅴ的胶原三股螺旋在其与配体结合的特异性中起重要作用。清除细胞受体的研究使我们有了一个较为接近的统一理论,可藉以揭开胆固醇、抽烟、高血压、年龄和遗传因素都可引起动脉粥样硬化的谜底。     

药物靶蛋白结构域的特性研究

目的结构域是蛋白质的结构单位和功能单位,研究药物靶蛋白结构域的特性对预测新的药物靶蛋白具有重要的意义。方法利用蛋白质互作、蛋白质结构域及药物靶蛋白数据,通过统计学检验分析药物靶蛋白与非药物靶蛋白二者结构域是否存在差异。结果药物靶蛋白含有结构域的数量与非药物靶蛋白含有结构域的数量存在显著差异（P=1.03×10-6）,且药物倾向于靶向含有两个结构域的蛋白质。此外,药物靶蛋白结构域多以α螺旋为主或以α螺旋和β折叠混合的结构为主。结论研究结果表明药物靶蛋白与非药物靶蛋白二者含有结构域的个数存在显著差异,此结论为预测新的药物靶蛋白提供理论基础。     

PH结构域中的框架结构

目的研究17个PH结构域中的框架结构。方法利用蛋白质分析软件Clustalx1.83对17个PH结构域的一级结构进行了序列比较,同时也对Loop1,Loop2,Loop3以及β4-β5,β5-β6之间的序列进行比较。根据N-J方法对这17个PH结构域中β1、β2、β3和α螺旋进行聚类分析。结果β1,β2,β3,β4,β5,β6,β7,α螺旋中存在框架结构,分别是K/R-GY/WL-K/RQ,WK/R-RW/YF-L-,I/L-Y/WY/F,GVL/I,X-V/I/T,V/TF-XX,Y/F-F,EE-WI/L-X。结论在这17个PH结构域中存在由保守氨基酸残基构成的框架结构。     

同源盒基因与发育

同源盒基因最早在果蝇中发现，以果蝇同源盒序列为探针，在无脊椎动物、脊椎动物和人类中，均发现有同源盒基因，同源盒基因按其在染色体上排列的方式，分为Ａ－Ｐ型和非Ａ－Ｐ型两类。同源盒基因含有１８０ｂｐ的高度保守序列，对应６０个氨基酸，并构成螺旋－转角－螺旋结构的同源结构域，特异性的识别以５－ＴＡＡＴ－３’为核心的１０－１２ｂｐ的ＤＮＡ序列，作为转录调控因子起作用，同源盒基因在动物胚胎发育，机体成长和衰老     

同源盒基因与发育

同源盒基因最早在果蝇中发现，以果蝇同源盒序列为探针，在无脊椎动物、脊椎动物和人类中，均发现有同源盒基因。同源盒基因按其在染色体上排列的方式，分为Ａ－Ｐ型和非Ａ－Ｐ型两类。同源盒基因含有１８０ｂＰ的高度保守序列，对应６０个氨基酸，并构成螺旋－转角－螺旋结构的同源结构域，特异性的识别以５＇－ＴＡＡｔ－３＇为核心的１０～１２ｂＰ的ＤＮＡ序列．作为转录调控因子起作用、同源盒基因在动物胚胎发育、机体成长和衰老过程中，发挥重要的作用。     

原生动物阴道毛滴虫的酵酶长寿保障基因LAG1同源基因克隆和序列分析

为了探讨寄生性原虫阴道毛滴虫细胞生长和衰老相关基因,作者从阴道毛滴虫的cDNA表达文库中分离出一具910碱基对的cDNA克隆,其编码框长834 bp,推测蛋白质序列有277个氨基酸.序列分析显示该克隆与酵酶长寿保障基因LAG1同源性最高,其氨基酸序列中含有LAG1及其同源基因保守的Lag1结构域和TLC结构域以及6个跨膜螺旋区和一个C-未端的内质网保留信号域.因此推测该克隆系酵酶LAG1的同源基因,该基因可能参与阴道毛滴虫的神经酰胺生物合成以及调解细胞的生命期或细胞衰老.该基因的基因组DNA与其cDNA序列一致,提示该基因序列中可能无内含子.     

黄体生成素β Gly102Ser基因多态性与多囊卵巢综合征的相关性研究

目的探讨黄体生成素β(Luteinizing hormoneβ-subunit,LHβ)Gly102Ser及黄体生成素受体(Luteinizing hormone receptor,LHR)基因多态性与PCOS的相关性。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)检测LHβGly102Ser多态性,分析LHβ基因多态性与多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的相关性。结果 PCOS组中LHβGly102Ser基因有14例突变型,占3.3%。对照组中3例突变,占1.1%;PCOS组LHβGly102Ser基因突变率显著高于对照组(P=0.006);LHβGly102Ser基因突变型的血清基础LH水平低于对照组(P0.05),但突变组有降低趋势;PCOS组内血清LH2mmol/L的患者,LHβ基因Gly102Ser发生突变的比例显著增加(P=0.003)。结论 PCOS人群中存在LHGly102Ser基因多态性,此多态性与PCOS有明显的相关性。LHβGly102Ser基因多态性可能是PCOS发病的危险因素之一。     

具有PR/SET结构域的抑癌基因研究进展

含有 PR/ SET结构域的基因 ,在多种肿瘤中都可见其缺失 ,被认为是一个重要的抑癌基因家族。目前发现含有该结构域的基因具有抑癌基因作用 ,而缺失该结构域的基因具有癌基因的作用 ,即该基因家族有特殊的“阴阳”作用机制。此外含有 PR/ SET结构域的基因可以引起细胞 G2 / M期阻滞和细胞凋亡 ,在调节细胞生长、限制肿瘤发展方面发挥重要作用     

中国基因3型乙型脑炎病毒E基因分子特征

目的 以减毒活疫苗(SA14-14-2株)为对照,分析我国分离的基因3型乙脑病毒E基因区段核苷酸及氨基酸序列分子特征.方法 从GenBank中获取相应乙脑病毒株E基因区段核苷酸序列,通过Clustal X(1.81)、DNAStar、GENEDOC(3.2)等生物学软件进行核苷酸和氨基酸位点差异分析.以蜱传脑炎病毒可溶性蛋白晶体结构为模板进行乙脑病毒E蛋白氨基酸位点分析.结果 我国不同地域、不同宿主分离的基因3型乙脑病毒与SA14-14-2株核苷酸同源性分别在96%和95%以上,氨基酸同源性在95%和94%以上.在同一地域、同一宿主类型分离的毒株之间核苷酸和氨基酸同源性非常高.在E基因区段存在10处共同的氨基酸位点差异,在结构域Ⅰ(E160)、结构域Ⅱ(E123和E227)和两个未在结构域中的氨基酸位点(E441和E487)等5个位点在部分基因3型乙脑病毒中存在差异.结论 我国分离的基因3型乙脑病毒与减毒活疫苗株(SA14-14-2株)E基因区段同源性高,存在5处基因3型乙脑病毒特异的氨基酸位点差异,但现行减毒活疫苗株理论上可以保护我国分离的基因3型乙脑病毒野毒株.     

上游转录因子1基因多态性与代谢综合征研究进展

上游转录因子基因位于染色体上代谢综合征和2型糖尿病连锁分析重现率最高的区域(1q21-q25)内.该基因编码的蛋白属于碱性螺旋-环-螺旋-亮氨酸拉链家族的成员,可参与控制和调节糖、脂代谢相关基因的表达,因而可作为代谢综合征和2型糖尿病的重要候选基因.本文就上游转录因子1基因的结构、生物学特性以及与代谢综合征相关性状关系的研究进展进行了综述.     

上游转录因子1基因变异与代谢综合征相关性状研究进展

上游转录因子基因位于染色体上代谢综合征和2型糖尿病连锁分析重现率最高的区域（1q21-q25）内。该基因编码的蛋白属于碱性螺旋-环-螺旋-亮氨酸拉链家族的成员，可参与控制和调节糖、脂代谢相关基因的表达，因而可作为代谢综合征和2型糖尿病的重要候选基因。本文综述了上游转录因子1基因的结构、生物学特性以及与代谢综合征相关性状的研究进展。     

生肌调节因子及其作用机理

肌肉基因活化和转录受生肌调节因子调控,这些转录因子均有一高度保守的碱性区-螺旋-环-螺旋同源结构,与其它广泛表达的细胞因子相互作用,以平行二聚体结合于肌肉基因控制区,激活基因转录,促进肌肉分化。这些因于只在骨骼肌表达,可自身和相互激活,并可能受发育及其它细胞因子调控。     

黄体生成素对小鼠子宫生长发育及其相关基因表达的影响

目的：通过分析黄体生成素(LH)受体基因敲除小鼠子宫生长发育相关基因表达的改变,探讨LH对子宫生长发育的影响。方法：应用基因芯片和RT-PCR方法分析LH受体基因敲除鼠子宫基因表达。结果：155个基因表达改变超过3倍；与生长发育相关的基因中,10个基因表达上调、5个基因表达下调；细胞周期蛋白cyclin D基因上调、cyclin B基因下调,半定量RT-PCR分析证实了细胞周期蛋白基因表达的变化,表明LH受体基因敲除鼠子宫细胞生长发生阻滞,21 d雌二醇和孕酮替代疗法不能够使这些基因表达的改变完全恢复正常。结论：LH除促进卵巢类固醇激素合成调控子宫生长发育外,还对子宫生长发育直接起作用。     

Atoh1基因在哺乳动物听觉毛细胞再生中的作用的研究进展

Atoh1基因编码一种碱性螺旋-环-螺旋型(bHLH)转录因子, 参与哺乳动物听觉毛细胞和支持细胞的产生与分化、调节耳蜗上皮细胞增殖, 在感音神经性耳聋发病和恢复中具有重要作用。本文拟就Atoh1基因在听觉毛细胞再生中的最新研究进展进行阐述, 以期为感音神经性耳聋的毛细胞再生基因疗法研究提供参考。     

序列特异的RNA微螺旋物抑制细胞的生长

０５９　序列特异的ＲＮＡ微螺旋物抑制细胞的生长［英］／ＩｌｉｐｐｓＤ…／／ＥＭＢＯＪ．一１９９５，１４（１６）．一４０５０～４０５５ｔＲＮＡ的三级结构包括两个具有不同功能的结构域。其中受体微螺旋结构域能与氨酞化ｔＲＮＡ合成酶的催化结构域结合，催化产生...