白草种子基因组DNA五种提取方法的比较

用5种方法 (传统CTAB法、改良CTAB法、高盐低p H法、改良SDS法、试剂盒法)对白草种子基因组DNA进行提取,分别用紫外分光光度计法、琼脂糖凝胶电泳法、PCR扩增检测提取的DNA的质量。结果表明,传统CTAB法提取的DNA浓度低,含有较多杂质,抑制PCR反应;改良SDS法和改良CTAB法提取的DNA纯度低,不符合检测要求;高盐低pH法和试剂盒法提取的DNA纯度高、完整性好,但试剂盒法成本高、DNA得率低。所以高盐低pH法为5种方法中最经济、效果最好的白草种子DNA提取方法。     

柳树DNA提取改良方法研究

高质量的DNA是进行林木分子生物学研究的基础与关键。该研究利用改良的CTAB法提取垂柳基因组DNA,并与常规CTAB法、CTAB-硅珠裂解法、SDS法和试剂盒法进行了比较。琼脂糖凝胶电泳检测显示,改良CTAB法提取的DNA浓度和纯度较高,质量优于其他4种提取方法。同时利用改良CTAB法提取了柳树16个自然种及杂交种基因组DNA,并经SSR-PCR扩增反应验证,表明改良CTAB法可作为一种柳树基因组DNA提取的通用方法。     

4种不同广玉兰基因组DNA提取方法的比较

采用常规CTAB法、常规SDS法、改良CTAB法、改良SDS法4种方法对广玉兰（Magnolia grandiflora）叶片基因组DNA的提取进行比较,并进行ISSR—PCR检测,结果表明：改良的CTAB法提取的基因组DNA效果比常规CTAB法、常规和改良SDS法都好,提取DNA的浓度和纯度高,无蛋白质和RNA等杂质影响,并且可以很好的应用于ISSR分子标记分析,ISSR—PCR反应体系中模板DNA的最佳浓度是30ng／20μl．     

平邑甜茶基因组DNA提取方法的比较

为获得高质量的基因组DNA,以平邑甜茶及其与扎矮山定子杂交所得四倍性矮生后代33#、45#新鲜叶片为试材,分别采用常规CTAB法、改良的CTAB法和基因组试剂盒法提取平邑甜茶总DNA,进行琼脂糖凝胶电泳,使用核酸蛋白仪对DNA质量和纯度进行检测。结果表明:利用基因组试剂盒法、常规CTAB法和改良CTAB法均可获得DNA,但获得的DNA质量和纯度存在一定的差异。试剂盒法和CTAB法可以获得较高质量的DNA。但由于基因组试剂盒法成本相对较高,改良CTAB法较耗时,建议采用常规CTAB法提取平邑甜茶及其杂交后代33#、45#品种基因组DNA。     

灰毡毛忍冬DNA不同提取方法的比较试验

以灰毡毛忍冬新品种——金翠蕾为试验材料，比较分析了SDS法、CTAB法、改良CTAB法对金银花总DNA提取的效果。结果表明：利用以上3种方法均能提取出完整的金银花基因组DNA，而DNA提取量从大到小依次为SDS法、改良CTAB法、CTAB法，DNA纯度依次为CTAB法、改良CTAB法、SDS法。CTAB法是灰毡毛忍冬DNA提取的适宜方法。     

两种方法提取杏基因组DNA的比较

以改良CTAB法和改良SDS法提取辽杏等6个杏品种的基因组DNA。经检测,结果表明:两种方法均可提取到较高质量的杏基因组DNA,可用于SSR-PCR扩增,满足后续分子生物学研究需要。改良CTAB法提取的各品种DNA产率和纯度具有更高的稳定性,因此,更适用于杏基因组DNA的提取。     

相思基因组DNA提取及其RAPD初步分析

以马占相思、大叶相思、厚荚相思幼苗的叶片为材料,采用SDS法、改良SDS法和改良CTAB法进行了基因组DNA的提取并对DNA提取方法作了比较,结果表明改良CTAB法提取效果最好。同时利用改良CTAB法提取出的DNA为模板进行了RAPD分析,鉴别了不同树种之间的多态性。其中有11个引物共扩增出117条谱带,树种间多态性比率为54.7%,遗传多态性明显高于种内。     

八角基因组DNA的提取方法

采用4种植物基因组DNA提取方法(CTAB法、SDS法、高盐法、试剂盒法)对八角基因组DNA进行提取试验.结果表明,对传统CTAB法稍加改良可以得到较为理想的提取效果,改良的内容包括①在加入CTAB提取缓冲液之前,先用CTAB-free缓冲液抽提1～2次;②将CTAB提取缓冲液中CTAB的用量从2％提高到3％;③提取缓冲液的用量由样品干重的10倍增加到60倍.用改良CTAB法提取的DNA经RAPD-PCR扩增,条带清晰,其质量能够满足分子标记的要求.     

金叶含笑叶片基因组DNA提取方法的比较

以金叶含笑叶片为实验材料,分别采用CTAB法、改良CTAB法、简易提取方法、高盐沉淀法和SDS法5种方法提取金叶含笑叶片的基因组DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计及ISSR扩增3种方法对所提取的DNA样品进行检测.DNA纯度、含量比较以及扩增结果表明:5种方法中简易提取法和SDS法提取的DNA纯度较高.高盐沉淀法得到的DNA产量较高.5种方法提取的DNA用于ISSR扩增,其扩增结果基本一致.简易提取方法操作简单.省时省力,是用于ISSR扩增的金叶含笑基因组DNA提取的最佳选择.     

金柑叶片和果实总DNA提取方法比较

为了研究不同提取方法对金柑总DNA提取质量的影响,以融安金柑等3个金柑品种的叶片和果实为材料,采用SDS提取法、CTAB提取法、试剂盒法提取金柑总DNA,并对所提取DNA的总浓度、A_(260/280)、A_(260/230)、凝胶电泳结果、SCo T扩增产物进行比较分析。结果表明:CTAB提取法和试剂盒提取法能较好地去除金柑叶片和果实中的蛋白质、RNA、多酚、多糖、单宁、色素等大分子物质以及盐类等小分子杂质。提取的总DNA浓度最高达178 ng/μL,A_(260/280)在1.82~1.94之间,A_(260/230)在1.89~2.04之间。SDS提取法、CTAB提取法和试剂盒提取法所提取的金柑叶片和果实总DNA的扩增效果图谱清晰,多态性高。3种提取方法中,CTAB提取法所提取总DNA浓度较高,纯度最好,可用于后续相关研究。     

马尾松针叶DNA提取方法研究

采用3种不同的方法（CTAB法、SDS法和试剂盒法）提取马尾松幼嫩针叶基因组DNA,并分别从取样材料类型、样品的保存、提取液中PVP含量、取样质量、抽提过程中提取程序的改进等方面进行提取马尾松基因组DNA效果的凝胶电泳比较．结果表明：CTAB法适合于在马尾松群体分子生物学研究中基因组DNA的提取：采用低温冷藏法保存的春季抽梢针叶0．2g,在CTAB的提取液中加入2％的PVP,常规CTAB法提取程序中添加等体积的混合液（V酚：V氯仿：V异戊醇=25：24：1）并在此前加入1／10体积的10×CTAB,可以有效地提高马尾松基因组DNA的提取质量,获得显带平直、纯度较高的马尾松基因组DNA,OD260／OD280值在1．8左右．这为马尾松群体分子生物学的研究提供了一个经济、简便而有效的DNA提取方法．     

适于AFLP分析的澳洲坚果DNA提取方法

利用SDS法和改良CTAB法对澳洲坚果两个品种的基因组DNA进行提取试验,结果表明:SDS法与改良CTAB法提取的基因组DNA完整性都比较好,但SDS法获得的DNA含有较多杂质,不能被限制性内切酶消化,改良CTAB法提取的基因组DNA可以完全酶切,DNA质量符合AFLP分析的要求。     

适于转录组测序的枣不同器官总RNA提取方法筛选

为获得适用于转录组测序的枣花、结果枝和果实的总RNA提取方法,以中秋酥脆枣为材料,比较分析了Ambiogen和Autolab 2种总RNA提取试剂盒和基于Autolab试剂盒改良的CTAB法的总RNA的提取效果。结果表明:3种方法提取RNA的OD260/OD280差别不大,但用2种试剂盒提取的RNA有降解,其中Ambiogen试剂盒提取的花、结果枝和果实3个器官的RNA质量浓度分别为126、284和222 ng/μL;Autolab试剂盒提取的RNA质量浓度分别为307、402和266 ng/μL;基于Autolab试剂盒改良的CTAB法提取的RNA质量浓度分别为401、417和296 ng/μL。与2种试剂盒相比,基于Autolab试剂盒改良的CTAB法提取出来的RNA完整性好、纯度和浓度高,能够满足转录组测序的要求。     

不同提取方法的铁线莲属叶片总DNA提取效果

以铁线莲属植物的叶片为材料,采用CTAB-SDS法、简易CTAB法、改良CTAB法等3种提取方法,比较耗时、纯度、得率、浓度和质量等指标,以期为铁线莲属植物叶片总DNA的提取筛选适宜方法.结果表明,在纯度和浓度方面CTAB-SDS法＞简易CTAB法＞改良CTAB法,在节省提取时间方面改良CTAB法＞CTAB-SDS法＞简易CTAB法.以CTAB-SDS法所提取的9种铁线莲DNA为模板,进行PCR扩增,CTAB-SDS法提取的DNA得率高、质量好,PCR扩增成功率也较高.综合比较,采用CTAB-SDS法进行铁线莲属叶片总DNA提取效果更佳.     

杜鹃基因组DNA提取方法的研究及应用

杜鹃是广泛分布于北亚热带地区的常绿或者落叶灌木。本研究以杜鹃成熟叶片为材料,比较了4种方法提取基因组DNA的效率,并分别采用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测所提取DNA的浓度和纯度,用ISSR和SSR两类分子标记进一步检测了DNA的质量。结果表明改良的3×CTAB法提取的基因组DNA效果最好,提取的DNA浓度为487.9μg/mL,得率为81.31μg/g,该种方法提取的DNA可直接用于分子标记扩增分析。因此,3×CTAB法是一种高效、可靠且非常适合杜鹃等灌木植物分子生物学研究的DNA提取方法。     

高质量丝栗栲基因组DNA的提取方法

为了促进丝栗栲分子生物学的研究,采用尿素法、柠檬酸钠法、改良CTAB法和SDS法4种方法提取丝栗栲叶片基因组DNA,并对提取效果进行了比较和分析。结果表明,改良CTAB法较适合丝栗栲基因组DNA提取,其提取的DNA产率高,凝胶检测条带整齐清晰,杂质少、无明显降解,OD260/OD280比值在1.8左右;而尿素法难以提取基因组DNA,SDS法提取的DNA得率较低,柠檬酸钠法有蛋白质、多糖等杂质污染均不太适用丝栗栲基因组DNA提取。采用改良CTAB法提取得到丝栗栲幼叶、老叶、嫩芽和幼茎基因组DNA,产率分别为177.3、167.1、242.0和156.7μg/g。酶切分析也证明,改良CTAB法提取的不同组织DNA适用于进行后续分子生物学研究。     

无患子总DNA提取方法研究

针对无患子富含多酚、多糖、蛋白质及其他次生代谢物质的特点,以无患子叶片为材料,分别采用改良的CTAB法和CTAB与SDS相结合法提取不同种源无患子的总DNA。结果显示,改良的CTAB法提取的总DNA,得率较高,纯度好,可用于酶切、PCR扩增等后续试验,并能获得清晰、稳定的扩增产物。而采用CTAB与SDS相结合的方法得到的基因组DNA效果不稳定,无法检测出DNA。改良的CTAB法具有简单、经济的特点,可用于无患子总DNA的提取,成功地进行SRAP分子标记分析,为研究无患子遗传资源多样性奠定基础。     

从白刺老干中提取高纯度DNA的方法

采用CTAB法、SDS法和匀浆CTAB法对白刺越冬老干进行基因组DNA提取,通过琼脂糖凝胶电泳及分光光度计对DNA纯度进行检测,结果表明,用常规的CTAB法和SDS法提取DNA纯度低,匀浆CTAB法得到高纯度的DNA,其OD260/OD280值为1.873～1.923。     

芒果总DNA提取方法比较分析

为了研究不同提取方法对芒果总DNA提取质量的影响,以‘紫花芒’等11个芒果品种的叶片为材料,采用SDS法、CTAB法、改良CTAB法提取芒果叶片总DNA,并对提取的总DNA浓度、OD260/280、OD260/230、琼脂糖电泳结果、ISSR扩增产物进行了比较分析。结果表明,改良CTAB法能较好地去除芒果叶片中的多酚、多糖、单宁和色素等杂质。提取的总DNA浓度高达387 ng/μL,OD260/280在1.81~1.87之间,OD260/230在2.01~2.09之间。SDS法、CTAB法提取总DNA的ISSR扩增产物条带少,改良CTAB法提取的总DNA的扩增效果图谱清晰,多态性高。3种提取方法的结果比较而言,以改良CTAB法提取总DNA的效果最好,可用于后续实验的研究。     

乌桕基因组DNA提取方法研究

以改良CTAB法和SDS法提取乌桕基因组DNA,对提取条件进行了正交试验,优化出乌桕基因组DNA提取的适宜条件,采用紫外分光光度检测、琼脂糖凝胶电泳分析及限制性内切酶进行了检测。结果表明:改良CTAB法的A1B2C2D2组合提取的基因组DNA纯度高,无拖尾现象,OD260/280值在1.8～2.0,OD260/230在2.0。