高分辨率熔解曲线法检测JAK2基因V617F突变及其应用

摘要:目的：探讨实时定量PCR方法和高分辨率熔解曲线法（HRM）在检测JAK2基因V617F突变中的应用。 方法：以JAK2基因V617F发生纯合突变的人红白血病细胞株（HEL）及不含JAK2基因V617F突变的人白血病细胞株（HL60）为阳性对照和阴性对照,优化HRM法检测条件,分别以优化的HRM法和直接测序法对63例临床疑似骨髓增殖性肿瘤（MPN）患者DNA标本进行JAK2基因V617F突变检测,评价2种检测方法结果的一致性。 结果：HRM法可检出系列混合样本中5%的突变型等位基因突变,且重复性较高。以测序法为金标准,HRM法的敏感性和特异性均为100％,两种方法结果一致。 结论：HRM法能够在单一闭管体系中实现对JAK2基因V617F突变的检测,具有较高的敏感性和特异性,可用于JAK2基因V617F突变的临床检测。     

Ph染色体阴性骨髓增殖性肿瘤患者JAK2基因第12外显子突变研究

目的 探讨Ph染色体阴性骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者JAK2基因第12外显子(JAK2 exon 12)突变情况及其与临床特征的关系.方法 采用等位基冈特异性聚合酶链反应(AS-PCR)检测573例Ph染色体阴性MPN患者JAK2 V617F突变,直接测序法检测JAK2 exon 12突变状态,克隆后测序鉴定突变类型.比较JAK2 exon 12突变与JAK2 V617F患者的临床和实验室特征,并研究该突变与表观遗传调节子基因突变及JAK2 46/1单倍型的关系.结果 在原发性血小板增多症(ET)、原发性骨髓纤维化(PMF)、骨髓增殖性肿瘤未分类型(MPN-U)及JAK2 V617F阳性真性红细胞增多症(PV)患者中均未发现JAK2 exon 12突变,在13例JAK2 V617F阴性PV患者中发现2例(15.4%)存在该基因突变,均为N542.E543del,即第542位天冬酰胺和第543位谷氨酸缺失.2例JAK2 exon 12突变的患者以红细胞增多为主要表现,白细胞及血小板计数增高不明显,骨髓以红系增生为主,血清促红细胞生成素(EPO)水平低于正常,造血干/祖细胞体外培养可检测到内源性红系集落(EEC),不伴有表观遗传调节子基因TET2、ASXL1、EZH2突变,其中1例患者46/1单倍型rs12340895和rs10974944位点均为CC基因型,另1例患者上述两个位点均为GC基因型.结论 JAK2 V617F阴性的ET、PMF、MPN-U患者无需再行JAK2 exon 12突变检测;JAK2 exon 12突变的PV患者具有特定的临床和实验室特征.     

AS-PCR检测慢性骨髓增殖性疾病JAK2 V617点突变及临床意义

目的等位基因特异性聚合酶链反应(alleles specific polymerase chain reaction,AS-PCR)检测慢性骨髓增殖性疾病(CMPD)中JAK2基因V617F点突变情况并应用于临床诊治。方法AS-PCR检测74例CMPD的患者骨髓或外周血白细胞JAK2V617F点突变。其中真性红细胞增多症(PV)20例、原发性血小板增多症(ET)52例、原发性骨髓纤维化(CIMF)2例。随机抽取其中20例基因测序验证。结果JAK2 V617F阳性率分别为:PV中19/20(95.0%),ET25/52(48.1%),CIMF为2/2(100%)。结论AS-PCR法检测JAK2 V617F敏感性和准确性较高,检测阳性率与国外报道相似;该方法简单易行,适合临床应用于CMPD的诊断分类治疗。     

骨髓增殖性肿瘤患者JAK2V617F基因突变与血栓栓塞相关性研究

目的 探讨骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者JAK2V617F点突变发生情况及与血栓栓塞之间的相关性.方法 回顾性统计分析107例MPN患者的临床及实验室检查资料,应用等位基因特异性-聚合酶链反应(AS-PCR)及序列测定方法,检测MPN患者JAK2V617F点突变发生情况,结合JAK2V617F点突变阳性与阴性两组患者血栓栓塞发生情况,探讨其在疾病诊断及与血栓栓塞发生之间的意义.结果 ①107例MPN患者中共检出71例患者存在JAK2V617F突变,总突变率为66.4%.107例MPN患者共发现34例患者存在血栓栓塞(发生率为31.8%).②血栓发生率真性细胞增多症(PV)组为34.8%,原发性血小板增多症(ET)组32.6%,原发性骨髓纤维化(PMF)组22.2%,三组间χ2=0.96,P＞0.05.34例血栓患者中,JAK2V617F阳性患者28例,阴性患者6例,两组间χ2=5.71,P＜0.05.65例年龄≥60岁患者27例并发血栓栓塞(41.5%),42例年龄＜60岁者中7例并发血栓栓塞(16.7%),两组间比较χ2=7.28,P＜0.01.结论 MPN患者JAK2V617F发生率较高,JAK2V617F阳性及高龄(≥60岁)患者更易并发血栓栓塞,对不明原因血栓患者进行JAK2筛查可明确是否存在早期不典型MPN.     

Ion Torrent PGM测序技术在MPN患者临床诊断中的方法学建立

目的:探讨通过自主设计定制的MPN致病相关基因的多重PCR引物试剂盒,使用Ion Torrent PGM第二代测序平台快速和准确地获取MPN患者基因突变信息的可行性和可靠性。方法:收集2015年1月至2015年10月就诊于南方医院血液科,经Sanger测序法检测JAK2V617F+和(或)CALR+、Ph-的10例MPN患者骨髓标本,然后使用Ion Torrent PGM第二代测序复核检测骨髓并对比两种方法结果的一致性。结果:Ion Torrent PGM第二代测序检测JAK2V617F、CALR和MPL就这3个基因而言,所有样本CALR基因52 bp缺失均未被检测出,其余测序结果与Sanger测序结果完全一致。结论:Lon Torrent PGM测序平台检测MPN患者多个基因突变,方法上具有可行性,能满足临床检测需求。本研究方法在1-2 d内可完成23个基因突变检测,具有灵敏、特异、快速、高通量及低成本的优势。     

JAK2V617F 基因突变的定量测定及在慢性骨髓增殖性疾病中的应用

目的：探讨荧光定量 PCR 的方法检测 JAK2V617F 基因突变并分析其在慢性骨髓增殖性疾病（CMPD）中的诊断价值。方法采用荧光定量聚合酶链反应（PCR）检测68例确诊 CMPD 患者骨髓标本中 JAK2V617F 基因突变的阳性率和相对定量,分析其在 CMPD 中的诊断价值以及和临床资料之间的联系。结果68例确诊患者的骨髓标本均成功扩增 JAK2V617F 野生型和突变型。JAK2V617F 基因突变的总阳性率为66．2％（45/68）,其中真性红细胞增多症（PV）患者阳性率75．0％（21/28）,原发性血小板增多症（ET）阳性率60．6％（20/33）,特发性骨髓纤维化（IMF）阳性率57．1％（4/7）。PV 患者 JAK2V617F 突变阳性率明显高于 ET 和 IMF 患者。PV 患者 JAK2V617F 的相对定量和血红蛋白数和白细胞数呈正相关。ET 患者中 JAK2V617F 的相对定量和患者的血小板计数呈正相关。结论荧光定量 PCR 的方法能够快速准确的检测 JAK2V617F 基因突变及其突变比例,为临床诊断 CMPD 提供有效的实验室指标,JAK2V617F 的相对定量和患者的临床血液学指标存在一定关系。     

特发性骨髓纤维化患者JAK2V617F突变研究

为了探讨特发性骨髓纤维化（IMF）JAK2V617F点突变发生率及其临床意义,运用等位基因特异性聚合酶链式反应（AS-PCR）检测12例IMF患者的JAK2V617F点突变,并探讨JAK2V617F变化与临床、血液学特征的相关性。结果显示：随访期2-15个月,12例患者JAK2V617F点突变检测阳性率为50%,而半数患有血栓史,其血小板数目及骨髓巨核细胞数目相对增多。另6例JAK2V617F点突变阴性患者仅1例有血栓史,血小板数目及骨髓巨核细胞数目相对较低。结论：JAK2V617F点突变阳性IMF患者多数具有典型的临床表现及血液学特点,其血小板数目及骨髓巨核细胞数目相对增多。     

160例骨髓增生异常综合征患者JAK2 V617F突变的检测及临床意义

2005年多个研究小组几乎同时报道在骨髓增殖性肿瘤(MPN)中发现JAK2 V617F突变,此类突变除发生在经典MPN外,还出现于慢性粒细胞白血病、慢性粒-单核细胞白血病、慢性中性粒细胞白血病、嗜酸粒细胞增多综合征、急性髓系白血病和骨髓增生异常综合征(MDS)中,但在MDS中发病率较低~([1-2]).关于其临床意义鲜见报道.为观察JAK2V617F在我国MDS患者中的发生率及其临床意义,我们采用等位基因特异性PCR(AS-PCR)技术检测了160例MDS患者骨髓标本,现将资料总结如下.     

骨髓增殖性疾病MPLW515L点突变研究

为了探讨MPLW515L和JAK2V617F点突变在南京地区骨髓增殖性疾病（MPD）中的突变情况，采用等位基因特异性聚合酶链反应（AS-PCR）及基因测序方法检测190例MPD患者的MPLW515L和JAK2V617F点突变。结果表明：102例原发性血小板增多症（ET）患者有1例存在MPLW515L点突变，突变率为1．0％；43例存在JAK2V617F点突变，突变率为42．2％。13例特发性骨髓纤维化（IMF）患者未检测到MPLW515L点突变；5例存在JAK2V617F点突变，突变率为38．5％。32例真性红细胞增多症（PV）患者未检测到MPLW515L点突变；20例存在JAK2V617F点突变，突变率为62．5％。43例慢性髓系白血病（CML）患者未检测到MPLW515L和JAK2V617F点突变。结论：AS—PCR检测MPLW515L和JAK2V617F点突变简便可靠。ET患者中可存在MPLW515L点突变，JAK2V617F点突变存在于PV、ET、IMF中，而CML患者不存在JAK2V617F点突变。     

骨髓增殖性肿瘤中JAK2V617F突变和TNF-α的表达及两者的相关性研究

本研究旨在探讨骨髓增殖性肿瘤（MPN）患者外周血单个核细胞中JAK2V617F突变和TNF-α因子的表达情况及两者之间的相关性,为临床诊断及治疗提供理论依据.选取山东大学附属省立医院血液科确诊的62名BCR-ABL阴性的MPN患者（35例ET患者,19例PV患者,8例MF患者）及15例健康成年人为研究对象,将患者及正常对照者的外周血单个核细胞分为两部分,分别提取细胞中的DNA及mRNA,并将mRNA反转录为cDNA.采用SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR分别检测JAK2V617F突变及TNF-α的表达量,并分析两者的相关性.结果表明,MPN患者JAK2V617F基因突变总体阳性率为64.52％ （40/62）,其中ET患者的JAK2V617F突变阳性率为54.28％ （19/35）,PV患者的JAK2V617F突变阳性率为94.74％（18/19）,MF患者的JAK2V617F突变阳性率为37.50％（3/8）;ET、PV、MF患者的JAK2V617F突变比例分别为0.838±0.419、4.417±0.658、2.746±2.009;ET、PV、MF患者TNF-α的表达分别是正常对照的1.7、7.0、8.2倍（P＜0.05）;且JAK2V617F突变负荷与TNF-α的表达水平呈线性相关（Pearson r =0.610,R2 =0.372,P=0.005）.结论：TNF-α在BCR-ABL阴性的MPN发病机制中有重要作用,在ET、PV、MF中表达升高且表达量不同,且与JAK2V617F突变呈线性相关.     

Rapid detection of JAK2 V617F mutation using high-resolution melting analysis with LightScanner platform

BackgroundDetection of the JAK2 mutation has recently been included under the essential diagnostic criteria for myeloproliferative neoplasm (MPN). High-resolution melt (HRM) curve analysis, a nongel-based, automated system, is introduced as a means of mutation scanning without the requirement of any post-PCR handling.MethodsWe studied the sensitivity and reproducibility of LightScanner? platform in the detection of JAK2 V617F mutation and the availability for diagnostic use in MPN.ResultsThe reproducible sensitivity of HRM analysis with LightScanner? platform was 5% for the detection of JAK2 V617F mutation. In the test of blind screening of 105 samples (48 Ph? MPN and 57 Ph+ chronic myeloid leukemia), the identical judgement was interpreted by two blinded investigators. HRM analysis of all cases was fully concordant with the results of PCR-RFLP and direct sequencing.ConclusionsThe HRM method developed here is an extremely sensitive, accurate and reliable technique and allows high-throughput, fast pre-screening to select for sequencing only those specimens that most likely contain mutant JAK2 V617F allele(s).     

骨髓增殖性肿瘤患者外周血细胞中JAK2V617F突变和p-STAT5蛋白表达及其与临床特征的相关性

本研究旨在探讨骨髓增殖性肿瘤（MPN）患者外周血细胞中JAK2V617F突变和p-STAT5蛋白表达的情况及二者与疾病临床特征之间的相关性,为临床实践及靶向治疗研究提供理论依据。选择山东大学附属省立医院血液科确诊的45名BCR-ABL阴性的MPN患者及15例健康成年人为研究对象,提取外周血单个核细胞的DNA及蛋白质,分别采用实时荧光定量聚合酶链反应和免疫蛋白印迹法定量检测研究对象的朋K2V617F突变比例及p-STAT5蛋白表达量,并结合收集的临床病例资料进行相关性分析。结果表明,MPN患者JAK2V617F突变总体阳性率为73．3％（33／45）,其中真性红细胞增多症（PV）的以K2V617F突变阳性率为83．3％（20／24）,原发性血小板增多症（ET）的阳性率为68．8％（11／16）,特发性骨髓纤维化（IMF）患者的阳性率为40．0％（2／5）;PV、ET、IMF患者的J14K2V617F突变比例分别为0．472±0．245,0．216±0．162,0．435±0．239;p-STAT5蛋白表达灰度值分别为1．396±0．758,0．760±0．623,0．792±0．612;JAK2V617F突变负荷与p-STAT5蛋白表达灰度值呈线性相关（P〈0．05）;在PV患者中,JAK2V617F突变负荷越高,白细胞计数、血红蛋白水平及红细胞压积越高,血小板水平越低;ET患者中JAK2V617F突变负荷越高者,年龄越大,白细胞计数、血红蛋白水平及红细胞压积越高,与血小板水平无明显相关性;IMF患者中JAK2V617F突变负荷越高者白细胞、血小板计数、血红蛋白水平及红细胞压积均较低。JAK2V617F突变阳性者更易发生脾肿大、出血及血栓事件。结论：JAK2V617F突变在BCR-ABL阴性的MPN患者中阳性率较高,突变负荷越高者其下游p-STAT5蛋白的表达量越大,发生脾肿大、血栓事件的几率越高。     

JAK2V617F点突变与真性红细胞增多症的临床相关性研究

为探讨真性红细胞增多症（polycythemia vera,PV）JAK2V617F点突变的临床意义,应用等位基因特异性-聚合酶链反应（AS—PCR）检测50例患者的JAK2V617F点突变,并分析比较JAK2V617F点突变阳性与阴性两组患者的临床特征及实验室指标。结果显示：50例PV患者中31例存在JAK2V617F点突变,突变率为62．0％。12例（24．0％）患者发生血栓及微血管障碍,3例存在核型异常。JAK2V617F点突变阳性和阴性两组患者初诊时的年龄（57．5±10．0 vs 45．6±14．9,P〈0．05）和白细胞计数（16．2±6．7 vs 9．0±5．2,p〈0．05）有统计学差异。结论：PV患者的JAK2V617F点突变阳性率为62．0％,JAK2V617F点突变阳性患者的年龄和白细胞计数高于阴性患者。     

骨髓增殖性疾病JAK2V617F点突变研究

本研究旨在对bcr／abl融合基因阴性的骨髓增殖性疾病（MPD）病人进行JAK2V617F点突变检测,探讨该突变在此类病人中的发生率和临床意义。采用逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）检测70例典型MPD病人bcr／abl融合基因,用等位基因特异性聚合酶链反应（As—PCR）检测样本JAK2V617F点突变,对有突变的病例进行测序验证。结果表明,慢性髓系白血病（CML）病人bcr／abl融合基因均为阳性,JAK2V617F突变为阴性;余bcr／abl融合基因均为阴性,JAK2V617F阳性率在真性红细胞增多症（PV）病人为75％,在原发性血小板增多症（ET）病人为30％,在特发性骨髓纤维化（IMF）病人为50％。JAK2V617F在CML和bcr／abl阴性MPD病人中的分布有显著性差异（P〈0．05）。结论：JAK2V617F可能为真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、特发性骨髓纤维化的特征性     

53例骨髓增殖性肿瘤的临床分析

目的 加强对骨髓增殖性肿瘤(MPN)的认识,提高其诊疗水平.方法 选择2007年3月至2012年2月江苏省兴化市人民医院收治的53例MPN患者为研究对象.回顾性分析其临床资料和相关实验室检查结果.结果 ①MPN发病高峰年龄为40～79岁,占86.79％(46/53);以慢性粒细胞白血病(CML)最为多见,占66.04％(35/53);临床表现不典型,脾大占77.36％.②MPN中不同疾病外周血血红蛋白(HB),RBC,WBC及PLT差异有统计学意义(P＜0.05).③6例真性红细胞增多症(PV)和4例原发性血小板增多症(ET)患者进行了JAK2V617F突变基因检查,阳性率分别为83.33％和75％;9例CML-慢性期患者检测了BCR/ABL基因,阳性率为100％.结论 MPN有发病年轻化的趋势,脾大为常见体征,血细胞持续增多结合JAK2V617F突变基因和BCR/ABL基因检测,可以准确诊断MPN,避免漏诊误诊.     

原发性血小板增多症90例患者JAK2基因突变的分析

目的研究原发性血小板增多症（ET）患者JAK2基因突变的发生情况及其与临床指标的相关性。方法采用等位基因特异性PCR方法及直接测序,检测90例ET患者外周血单个核细胞JAK2V617F的发生情况。结果90例ET患者中检出49例（54．4％）存在JAK2V617F突变;突变型组患者平均年龄为（55±16）岁。高于野生型组的（38±15）岁（P〈0．05）,突变型组患者的外周血白细胞计数[（18．9±8．2）×10^9／L]明显高于野生型组[（9．7±6．7）×10^/L机上患者（P〈0．01）,两组患者的血红蛋白水平及血小板计数的差异无统计学差异（．P〉0．05）突变型组患者血栓事件发生率（52．9％）明显高于野生型组（15．4％）患者（P〈0．05）。结论ET患者中JAK2V617F突变的发生率较高,JAK2V617F突变与ET患者年龄、外周血白细胞计数及血栓事件具有相关性。     

SOCS超甲基化与经典型慢性骨髓增殖性肿瘤的研究

目的 探讨细胞因子信号转导抑制蛋白(suppressor of cytokine signaling,SOCS)基因超甲基化在经典型骨髓增殖性肿瘤(MPD)中的临床作用及其机制.方法 采用甲基化特异性PCR方法检测SOCS1、2、3基因CpG岛甲基化发生情况,直接测序法检测100例MPD患者JAK2V617F突变情况,用实时定量PCR方法检测SOCS1、2、3的mRNA表达情况.结果 100例MPD患者中有27例(27％)存在SOCS1基因超甲基化,9例(9％)存在SOCS2基因超甲基化,34例(34％)存在SOCS3基因超甲基化.在100例MPN患者中,64例(64％) JAK2V617F突变阳性.MPD患者中SOCS1和SOCS3基因超甲基化组与未甲基化组相比,其SOCSl和SOCS3基因mRNA表达量明显减少(P＜0.05);SOCS1和SOCS3基因JAK2V617F突变组与野生型组相比,其SOCS1和SOCS3基因mRNA表达量明显减少(P＜0.05).结论 MPD患者中存在JAK2V617F突变及SOCS基因超甲基化,且JAK2V617F突变和SOCS基因甲基化导致SOCS mRNA表达水平降低,SOCS超甲基化和JAK2V617F突变可改变JAK-STAT信号通路等的转录活性而最终影响疾病的发展,这些改变可能代表了一种潜在的治疗方向.     

98例原发性血小板增多症Jak2基因突变的定量分析及其临床意义

为研究JAK2V617F在原发性血小板增多症（ET）患者中的发生率和突变类型,定量分析突变转录本水平并初步探讨其临床意义,采用ARMS（amplification—refractorymutationsequencing）PCR法检测JAK2V617F突变的发生率及其突变类型,采用毛细管电泳法定量分析JAK2V617F突变转录本水平。结果显示：98例ET患者中59例JAK2V617F为阳性,其中纯合突变18例。纯合突变及杂合突变患者的平均年龄均较野生型为高（P值均〈0．05）;18例纯合突变患者的白细胞计数高于41例杂合突变者,且二者均高于野生型（P值均〈0．05）。毛细管电泳定量分析显示,纯合突变患者JAK2V617F突变转录本水平为（89．9±6．7）％,高于杂合突变患者的（57．1±6．7）％（P〈0．05）;年龄小于60岁患者的JAK2V617F突变转录本水平为（62．3±16．5）％,低于年龄大于60岁患者的JAK2V617F突变转录本水平为（72．4±15．8）％（P〈0．05）。JAK2V617F阳性组中血栓的发生率高于阴性组,其中纯合突变者高于杂合突变者,发生血栓者的JAK2V617FF转录本水平高于无血栓者（P值均〈0．05）。结论：JAK2V617F阳性与阴性ET患者有着不同的临床特征,分析其突变类型及检测其转录本水平对明确疾病状态、观察疾病进展及指导治疗有重要意义。