应用核DNA ITS序列探讨广义花楸属（Sorbus L.）属下系统关系

 花楸属属内杂交和多倍化现象比较普遍,分类处理一直存在争议。选取核基因的ITS序列对花楸属（Sorbus L.）的46个种进行测序,并选取栒子属（Cotoneaster multiforus,Cotoneaster horizontalis）、白鹃梅属（Exochorda racemosa）、蔷薇属（Rosa hugonis）和樱属（Cerasus glandulosa）作为外类群,基于最大简约分析（Maximum parsimony analysis,MP）,最大似然分析（Maximum likelihood analysis,ML）和贝叶斯推断（Bayesian inference,BI）对花楸属进行分子系统发育重建。结果表明：花楸属为自然的单系类群,并且得到很高的支持率;Aria、Micromeles和Sorbus,3个亚属各自不能形成单系,甚至单叶类群和复叶类群的分类学界限都不是很清楚,这说明目前的分子系统发育证据与花楸属属内的分类划分并不十分吻合。     

柑桔属植物若干分类群的分支分析

用２４个形态学性状，对柑桔属（ＣｉｔｒｕｓＬ．）植物的２４个分类群进行了相容性分支分析，得到了建立在１４个相容性状基础上的分支图。分支关系表明，施文格分类系统的真正柑桔亚属（Ｅｕｃｉｔｒｕｓ）是单系类群，其姐妹群是大翼橙（Ｐａｐｅｄａ）．田中系统的枸橼类（Ｃｉｔｒｏｐｈｏｒｕｍ）、柚类（Ｃｅｐｈａｌｏｃｉｔｒｕｓ）、蜜柑类（Ａｃｒｕｍｅｎ）和桔亚类（Ｍｉｃｒｏａｃｒｕｍｅｎ）是单系类群，而橙类（Ａｕｒａｎｔｉｕｍ）和真正蜜柑亚类（Ｅｕａｃｒｕｍｅｎ）是并系类群。根据分支关系，讨论了柑桔属植物系统演化关系及分类问题。     

苹果属植物不同居群分类性状的变异性分析

以观测的16个苹果属野外居群(含盖了12个分类群)果实和叶的28个数量性状为研究对象,采用散点图、系统聚类法、主成分分析等方法评估了各性状对苹果属分类的重要性,以期筛选出合适的性状来判断不同种之间的亲缘关系。结果表明:同一物种的居群内差异性小于居群间的差异性,支持将锡金海棠、三叶海棠划分为山荆子组,稻城海棠应归入花楸海棠组,筛选出8个性状作为苹果属分类的主要分类依据。     

柑桔属植物若干分类群的分支分析

用２４形态学性状，对柑桔属（Ｃｉｔｒｕｓ Ｌ．）植物的２４个分类群进行了相容性分支分析，得到了建立在１４个相容性状基础上的的分支图。分支关系表明，施文可分类系统的真正柑桔亚属（Ｅｕｃｉｔｒｕｓ）是单系类群，其姐妹群是大翼橙（Ｐａｐｅｄａ）。田中系的枸橼类（Ｃｉｔｒｏｐｈｏｒｕｍ）、柚类（Ｃｅｐｈａｌｏｃｉｔｒｕｓ）、蜜柑类（Ａｃｒｕｍｅｎ）和桔亚类（Ｍｉｃｒｏａｃｒｕｍｅｎ）是单系类群，而橙类（Ａ     

陕甘花楸叶绿体基因组及其与爪瓣花楸的系统关系

采用高通量测序技术分析了陕甘花楸(Sorbus koehneana)的叶绿体全基因组,并探讨其与爪瓣花楸(S.unguiculata)的关系.陕甘花楸叶绿体基因组全长159 873 bp,GC含量为36.60％,呈典型的四分体结构,包含1个小单拷贝区(SSC,19 218 bp),1个大单拷贝区(LSC,87 899 ...     

枇杷属植物分类新探

本文就枇杷叶背茸毛是否脱落和花期能否作为分类标准进行了讨论。同时,提出了一个以枇杷属植物雄蕊、柱头和叶片大小等形态学性状为主要依据,结合分子标记结果而制定的枇杷属植物分类系统。分为3个类群:①少雄蕊、小叶片类群;②多雄蕊、多柱头、大叶片类群;③多雄蕊、少柱头、中叶片类群。其中,第3个类群又分为4个亚类。     

中国兰属植物种间及品种间亲缘关系的RAPD分析

 利用RAPD分子标记分析中国兰属(Cymbidium ) 的28个原生种和部分种的不同品种及3个杂交种共50个材料间的亲缘关系。获得250条可明显区分的DNA扩增片段, 除S143-850 bp 1条带为全部材料共有外, 其余带均为多态性位点。这些带最大的为2 100 bp, 最小的为200 bp, 以集中在1 031～300 bp的带居多。UPGMA进行聚类分析显示: RAPD的聚类树状图所呈现出的亲缘关系大体与ITS系统发育树一致。建兰亚属可能为一自然类群。大花亚属并非自然类群, 其成员之一文山红柱兰(C. Wenshanense Y.S. Wu et. ) 偏离出去而与兰亚属聚在一起。兰亚属则为一高度异质性的类群, 分散成互不关联的3支。本结果和ITS系统发育分析表明, 有必要对经典分类的兰属属下分类, 特别是兰亚属进行修订。对3个亚属中各组的划分基本与传统分类的一致。春兰品种间的多样性高于其它测试品种。     

注意保护花楸资源

花楸S.pohuashanensis(Hance)Hedi、别名绒花树、山槐子,属蔷薇科、花楸属,主要分布于北温带的亚洲、欧洲、北美洲。我国有50余种,黑龙江省有二种1变种。①水榆花楸Sorbusalnifolia分布我省张广才岭、老爷岭山区,常生于林中或灌丛中,散生;②花楸树Sorbus Pohuasha nensis(Hance)-Hedl。生于海拔600—2500米山坡、山谷、杂木林内。我省主要分布在小兴安岭以南的山地,虽分布较广,但仅单株散生在较高海拔的山地暗针叶林(云冷杉林)内,数量不多,为此类寒温性针叶林特有的伴生阏叶树种;③无毛花楸(变种)rar、amuren-     

蔷薇科内不同属种嫁接苹果亲和力观察

利用当地蔷薇科的6属10个种作为苹果砧木,进行嫁接观察,结果表明:林檎、丽江山定子是当地苹果理想的乔化砧木;滇池海棠、栘(木衣)、华西小石积可作为苹果有望的半矮化、矮化砧试材;梨属、花楸属、火棘属植物不能作苹果砧木。     

基于ndhF序列的中国悬钩子属植物系统发育研究

悬钩子属植物种类繁多,属内系统演化规律一直存在争议。以近缘的同为蔷薇科蔷薇亚科的蔷薇属黄刺玫（Rosa xanthina）和草莓属野草莓（Fragaria vesca）为外类群,基于ndhF序列利用最大简约法和贝叶斯推论法构建了中国悬钩子属下3组17亚组的53个种（变种）的系统发育树。结果表明：ndhF序列在本研究涉及到的分类群中较保守,序列比对后长度为1 182 bp,其中变异位点88个（占7.44%）,信息位点47个（占3.97%）。空心莓组（section Idaeobatus）的序列变异速率较木莓组（sect. Malachobatus）和刺毛莓组（sect. Dalibardastrum）快。木莓组需要结合其他进化速率相对较快的序列进一步研究。系统树分析表明,木莓组和刺毛莓组聚为一支,空心莓组则被划分为4支（BI）,呈多系进化现象。中国悬钩子属植物的系统演化路线为复叶类群到单叶类群,空心莓组较木莓组原始,支持陆玲娣等对悬钩子属的系统演化观点。本研究结果有助于优良树莓种质的鉴定和分类,也为悬钩子属系统进化积累了分子依据。     

中国槭属植物的分类和系统发育研究

槭属(Acer Linn.)是槭树科(Aceraceae)中物种形态高度分化和分类处理十分困难的一个属。该属的系统发育、属下分类系统以及部分种的系统位置仍未明确。测定了槭属11个组47种植物53份样品的nrDNA ITS和cpDNA序列(matk、rbcL、trnH-psbA和trnL-trnF),并从Gen Bank下载9个组14个种的35条序列,构建了中国分布槭属的分子系统发育树,并对槭属组下分类系统以及部分争议种的分类地位进行了验证。结果发现:前人将鸡爪槭组、小果槭组和全缘叶槭组中的羽脉槭系合并为一个组是合理的;(2)中国槭属有3条进化支系,其中鸡爪槭组、尖齿槭组、穗状槭组、蔹叶槭组和梣叶槭组处于一条进化支系,槭组、茶条槭组、扁果槭组、全缘叶槭组、三小叶槭组和五小叶槭组处于第2条进化支系,桐状槭组、大花槭组和坚果槭组处于第3条进化支系;(3)槭属的性别分化、花序类型、花序着生方式、单复叶类型以及单叶的分裂数可以作为槭属系统发育研究的重要形态指标;(4)通过ITS条形码构建的系统关系,滇藏槭与传统形态分类不相符合;(5)支持将橄榄槭修订为秀丽槭,而锐齿槭、羊角槭、多果槭和昌化槭等的系统位置仍需进一步探讨。     

不同小生境缙云黄芩形态变异数量分析

运用方差分析、聚类分析及主成分分析等统计分析方法,对缙云山特有植物缙云黄芩(Scutellaria tsinyunensis)在不同小生境下的形态特征进行了研究,结果表明:在研究的36项形态性状中,有77.8%的性状表现出在居群之间差异显著,其中有61.1%的性状差异极显著.聚类分析和主成分分析显示,缙云黄芩的形态特征在整体水平上表现出分化上的无序性,即不同居群的个体常交叉聚在同一个表征群内,但在同一表征群内,同一居群的多数个体常能聚在一起,表明居群之间在形态特征上发生了一定程度的分化,而这种分化还不能清楚地区分不同的居群.     

中国华北和东北地区杓兰属植物的数量分类研究

 在对华北和东北地区杓兰属（Cypripedium L.）植物种质资源调查基础上,应用数量分类学 中的Q 型聚类分析法对38 份杓兰代表样本进行分类研究,并对20 个形态性状进行R 型聚类分析和主成 分分析。Q 型聚类分析将这38 份样品在Lq1 = 0.25 水平分为山西杓兰群和其他杓兰群两个类群,在Lq2 = 0.155 水平将其他杓兰群分为3 个亚群,结果显示大花杓兰（C. macranthos Sw.）与山西杓兰（C. shanxience S. C. Chen）亲缘关系最远,中间过度类型多为大花杓兰与黄囊杓兰（C. calceolus L.）之间的天然杂交后 代。R 型聚类分析树系图显示各性状分布较为分散,相互独立。主成分分析表明20 个性状特征综合成的 9 个主成分中前5 个主成分的累积贡献率高达80.81%,结合其与性状间的相关性,筛选出影响力大的13 个重要性状。     

海南部分荔枝种质的RAPD分析

 采用10个10碱基的随机引物，通过RAPD分析的方法，在分子水平上对海南30份荔枝种质进行鉴定、分类和亲缘关系分析。结果表明，大多数种质相似系数在55% ～80%之间，说明他们之间的亲缘关系较近；在相似系数为0.61的水平上，30份海南荔枝种质被分为4组，与以龟裂片特征为主要分类依据的形态分类有一定的相关性，但是RAPD分类比形态分类的分类范围更细。因此，传统形态分类不能完全反映出品种间的亲缘关系，有待结合RAPD分析方法进一步完善。     

山东密刺类黄瓜亲缘关系研究

用 15个形态性状指标和 11对AFLP引物组合对新泰密刺、长春密刺和山东密刺等 15份黄瓜品种遗传亲缘关系进行了研究。形态学分类将欧美品种、华南型品种和华北型品种分为 3个类群,华北型品种进一步分成 2组,新泰密刺、长春密刺和山东密刺聚为一组;AFLP分析计算出品种间的遗传距离在 0 .033 ~0. 686之间,聚类分析分为 8类,新泰密刺和山东密刺遗传差异较小,与长春密刺遗传差异较大。     

Comparison of the use of morphological,protein and DNA markers in the genetic characterization of Iranian wild Prunus species

In this study, the genetic diversity of four Iranian wild Prunus species including Prunus eleagnifolia, Prunus hauskenchtii, Prunus scoparia and Prunus lycioides were investigated using morphological, protein and DNA markers. DNA markers included nuclear and chloroplast SSRs and self-incompatibility (S) allele amplification. At the morphological level, leaf width showed significant differences between the four wild Prunus species. Concerning fruit and kernel characters, their values are relatively similar indicating the high degree of homoplasy described in Prunus. Nuclear SSR markers have been the most abundant markers with a higher polymorphism in comparison with morphological, protein and chloroplast SSR markers. Results also indicated the high variability present in the S locus. On the other hand, the correlation between the clustering based on DNA markers and protein were in general low. Dendogram performed using nuclear and chloroplast SSR indicated a more diffuse clustering between the wild almond species probably due to the natural introgression of genes observed in these wild almond species. Data from the analysis of the total protein seems to be more accurate to establish taxonomy relationships in these very close wild species.     

砧用南瓜种质资源形态学性状与SSR标记分析

搜集了设施黄瓜嫁接栽培中常用的47 份砧用南瓜种质资源,利用63 个形态标记和40 对南瓜SSR 标记,对其进行遗传多样性及亲缘关系鉴定。结果表明,砧用南瓜的8 个质量性状（嫩瓜皮色、瓜形、主蔓色、瓜面斑纹、叶面白斑、叶形、嫩瓜斑纹和嫩瓜斑纹色）和23 个数量性状的多样性指数大于1.00;SSR 标记共检测到167 个等位变异,平均每个SSR 位点的等位基因数为4.18 个,变幅2 ~ 8 个,平均多样性指数为0.62,变化范围0.16 ~ 1.18。非加权算术平均法（UPGMA）聚类分析表明,砧用南瓜63 个形态学性状将47 份种质划分为4 个类群,大部分品种集中于一个类群中;40 对多态性SSR 标记将所有种质划分为3 个类群,大部分品种的分子标记与形态学标记的聚类结果相似。已搜集的47 份砧用南瓜种质资源遗传多样性并不丰富,亲缘关系较近;SSR 标记CMTm11 具有极高的多态性,可用于砧用南瓜种质分子标记辅助选择;嫩瓜皮色等8 个质量性状和大部分数量性状都可以作为形态标记辅助种质资源评价及新品种选育。     

Genetic diversity evaluation of wild Persian shallot (Allium hirtifolium Boiss.) using morphological and RAPD markers

Persian shallot, a bulb producing plant from Alliaceae, is a wildly growing plant collected for its bulbs. Bulbs of Persian shallot, called “Mooseer” in Farsi, are oval, white skinned, usually of one and rarely of two main bulbs and are completely different from common shallot (Allium ascalonicum). There is no information about genetic diversity of this species; therefore, the diversity of 17 wild Persian shallot populations collected from different parts of Iran across the Zagross Mountains were evaluated by morphological and RAPD markers. Fifteen random decamer primers could amplify DNA well and produced polymorphic bands among populations. The most fragment number amplified by one primer was 27 out of which 15 fragments were polymorphic and the least was 11 with 6 polymorphic bands. At the similarity of 0.60 on dendrogram constructed on the base of RAPD data, the samples were divided into eight sub-clusters. The highest and lowest detected similarities were 0.73 and 0.49, respectively. Clustering based on morphological traits divided the populations into three groups. Result of cluster analysis based on RAPD data did not show any correlation with morphological characters based on Mantel’s test (r = 0.03). The mineral and fatty acid analysis for defining the nutrient composition of this plant also revealed some differences among populations.     

Evaluation of fruit and seed diversity and characterization of carob (Ceratonia siliqua L.) cultivars in Algarve region

The genetic diversity of 15 carob (Ceratonia siliqua L.) cultivars located in an experimental field from Algarve (Portugal) was evaluated over 7 years using 12 fruit and seed phenotypic characters, in order to characterize carob cultivars. The values of morphological traits obtained by cultivar were compared with those from other countries of the Mediterranean basin. Statistically significant differences were found between cultivars for all characters which were examined, what indicates a high genetic diversity. The relationship among these characters was analyzed by principal component analysis (PCA) resulting in the separation of these cultivars classed in four groups (clusters I–IV) and in four ungrouped cultivars. A three dimension of the model was found to be significant and explained 74.5% of the total variation, in which the first component accounting for 34.6% of the total variation is dominated by fruit characters, while the second component is dominated by seed characters. Cultivars plotted on the left-lower quadrant on the space determined by principal components 1 and 2 are characterized by fruits with high seed yield more appropriated for industrial rentability. The correlation analyses established by cultivar provided a specific understanding about the way how fruit and seed characteristics correlate within each cultivar. This approach can be useful for the development of a breeding programme, aiming to increase the seed yield, seed thickness, individual and total seed weight by fruit, characteristics that are determinant to improve the industrial exploitation of carob.