宏基因组学第二代测序技术对比传统实验室微生物培养在脓毒症病原学诊断中的优势

目的通过对宏基因组学第二代测序技术(mNGS)获得的病原体与实验室培养结果进行对比,了解mNGS在脓毒症病原学诊断中的优势及其临床指导意义。方法将入选的脓毒症患者的标本(肺泡灌洗液、痰液、血液、脑脊液、胸水、腹水、分泌物等)同时送检mNGS和实验室细菌培养,对结果进行对比分析,评价mNGS在脓毒症病原学诊断方面的临床价值。结果mNGS的阳性率为78.9%;细菌培养的阳性率为40.4%(P<0.05)。通过mNGS共检出致病病原体57种,其中细菌31种,真菌16种,病毒7种,非典型病原体3种;细菌培养共检出病原体24种,其中细菌18种,真菌6种。以培养结果为金标准,mNGS的敏感度为76.2%,特异度为29.8%,阳性预测值为42.3%,阴性预测值为64.8%。根据病原学结果的抗生素调整将患者分为三组:按mNGS调整为mNGS组、经验性调整为经验组、按培养结果调整为传统培养组。mNGS组ICU住院时间更短(P<0.05),培养组降钙素原下降更明显(P<0.05)。结论mNGS在感染性疾病病原体的诊断方面较传统微生物培养时间更短,阳性率更高,在少见病原体、罕见病原体诊断方面有显著优势,可缩短患者ICU住院时间。     

mNGS技术在儿童重症肺炎病原学诊断中的价值

目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在儿童重症肺炎病原学诊断中的价值。方法选取2017年12月至2020年6月武汉儿童医院收治住院治疗的219例社区获得性重症肺炎患儿临床资料,比较肺泡灌洗液mNGS检测与传统实验室病原检测对诊断儿童重症肺炎的诊断价值。结果 219例送检标本中mNGS共检出阳性病例190例(86.76%);而传统实验室病原共检出阳性病例173例(78.99%),两种检测方法比较,差异有统计学意义(P<0.05)。mNGS和传统实验室病原病原总检出率在各年龄段之间比较,差异有统计学意义(Χ²=76.488 7,P<0.05)。mNGS与传统实验室病原学检测均阳性患者163例,mNGS与传统实验室病原学检测均阴性患者22例,mNGS阳性而传统实验室病原学检测阴性患者27例,mNGS阴性而传统实验室病原学检测阳性患者7例。mNGS和传统实验室病原诊断儿童重症肺炎病原学灵敏度、特异度比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论二代测序技术较传统实验室病原检测可快速检测重症肺炎患儿病原学诊断,指导临床早期合理用药。     

宏基因组二代测序在食管气管瘘气道支架置入术后肺炎病原体检测中的价值

目的 观察食管气管瘘气道支架置入术后肺炎患者支气管肺泡灌洗液(BALF)、防污染样本毛刷(PSB)采样分别行宏基因组二代测序(mNGS)和病原体培养的病原体检出情况，探讨mNGS在病原学诊断中的价值。方法 2020年8月—2021年8月应急总医院诊治食管气管瘘气道支架置入术后肺炎患者48例，抗感染治疗前行支气管镜检查，采集BALF和PSB采样，分别行mNGS及病原体培养检查；采集痰标本行病原体培养检查。比较5种方法病原体检出率；分析5种方法检出病原体种类及分布情况；比较BALF mNGS与PSB采样mNGS检出主要病原体序列数。结果 BALF mNGS病原体检出率(95.83%)与PSB采样mNGS(95.83%)比较差异无统计学意义(χ²<0.001,P>0.999);BALF培养(37.50%)、PSB采样培养(33.33%)、痰培养(33.33%)病原体检出率比较差异无统计学意义(χ²=0.170,P>0.999),均低于BALF mNGS、PSB采样mNGS(P<0.05)。BALF mNGS共检出51种病原体...     

CT引导下经皮肺穿刺组织和支气管肺泡灌洗液宏基因组二代测序在肺部感染病原学诊断中的价值

目的 分析拟诊肺部感染患者CT引导下经皮肺穿刺活检组织宏基因组二代测序(mNGS)和支气管肺泡灌洗液(BALF)mNGS结果,探讨二者在肺部感染病原学诊断中的价值。方法 2020年6月—2021年5月河南省人民医院拟诊为肺部感染、传统病原学检测(CMT)未明确诊断的患者8例,均行CT引导下经皮肺穿刺活检组织mNGS,肺组织mNGS未明确诊断者行BALF mNGS。记录患者病史、胸部CT检查等临床资料,CMT、mNGS诊断结果及病原体检出率,治疗及预后情况。结果 8例患者中2例有类风湿关节炎病史,1例有肺结核病史,1例有慢性支气管炎病史,余4例既往体健。6例胸部CT主要表现为多发结节或团块影,伴或不伴空洞;2例表现为大片状高密度影。3例患者行肺组织mNGS,其中1例肺组织mNGS检出结核分枝杆菌复合群,CMT阴性,诊断为肺结核;1例肺组织mNGS阴性,CMT检出肺隐球菌,诊断为肺隐球菌病;1例肺组织mNGS、CMT均阴性,组织病理检查诊断为抗中性粒细胞胞浆抗体(ANCA)相关性血管炎。5例患者行肺组织mNGS和BALF mNGS,其中3例BALF mNGS分别检出耶氏肺孢子菌、黑曲霉+百...     

感染性心内膜炎瓣膜mNGS检测的病原学价值

摘要:目的评估 瓣膜宏基因组二代测序( metagenomie next generation sequeneing, mNGS) 对感染性心内膜炎( infective endocar-ditis, IE)的病原学诊断价值。方法收集于2022 年6月1日至11月30日在南京医科大学附属南京医院接受瓣膜手术患者25例，根据改良杜克标准确诊为IE患者20例,非IE患者5例。采集各患者的静脉血及瓣膜组织标本，同时进行血培养、瓣膜培养以及瓣膜mNGS检测,并进一步比较mNGS和传统诊断方法(血培养、瓣膜培养)诊断IE病原学的临床效能。结果在20例经病理诊断为IE的患者中,血培养阳性8例，瓣膜培养阳性3例,瓣膜mNGS阳性19例;血培养、瓣膜培养和瓣膜mNGS诊断IE的敏感性分别为40%、15%和95%。瓣膜mNGS与血培养或瓣膜培养的检测结果在细菌的属水平上相一致。瓣膜mNGS的属相对丰度(P=0.001)、种序列数(P=0.028)、覆盖率(P=0.003)与抗生素的使用时间有关。瓣膜mNGS可以指导培养阴性IE患者的抗生素治疗。结论瓣膜 mNGS对IE的病原学诊断具有较高的临床价值,为后续患者的抗生素治疗提供了依据。     

84例重症肺炎患儿痰培养病原学分析

目的 探讨重症肺炎患儿痰培养病原学构成特征。方法 回顾性分析2014年3月至2019年3月郑州中心医院收治的84例重症肺炎患儿临床资料,所有患儿均接受痰培养试验并进行血清抗原抗体检测,探讨重症肺炎病原学构成特征。结果 84例患儿痰培养试验检出明确病原菌35株,血清抗原抗体检测检出阳性例数18例,总体阳性率为63. 10%(53/84)。病原菌中细菌菌株31株,阳性率为58. 49%(31/53),其中革兰氏阳性球菌4种,革兰氏阴性杆菌6种,主要病原体为金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、流感嗜血杆菌和肺炎克雷伯菌;病毒阳性率为18. 87%(10/53),主要为呼吸道合胞病毒和柯萨奇病毒;真菌阳性率为7. 55%(4/53),主要真菌类型为白假丝酵母菌;支原体和衣原体阳性率分别为9. 43%(5/53)、5. 66%(3/53)。结论 我院重症肺炎患儿病原学构成以流感嗜血杆菌等革兰氏阴性杆菌为主,其次为呼吸道合胞病毒等病毒、肺炎支原体、真菌及肺炎衣原体。     

高通量测序在儿童重症肺炎病原学诊断中的应用

目的 探讨高通量测序在儿童重症肺炎病原学诊断中的应用价值.方法 选择2019年1月至2020年1月该院收治的99例儿童重症肺炎患儿作为研究对象,所有患儿均进行常规检测(血常规、超敏C反应蛋白、降钙素原)、常规病原学检测(肺炎支原体抗体滴度检测、咽拭子免疫荧光病毒检测、血培养),入院后第2天或第3天行支气管镜检查,采集肺泡灌洗液进行传统病原学检测(涂片显微镜检查和培养)及高通量测序病原学检查,分析并比较以上检测方法患儿病原体检出情况.结果 99例重症肺炎患儿传统病原学检测,检出病原体66例(66.67％),其中单一病原体55例,混合病原体11例;细菌24例(24.24％),肺炎支原体55例(55.56％),病毒8例(8.08％).肺泡灌洗液高通量测序检出病原体97例(97.98％),包括单一细菌10例,单一病毒17例,单一支原体28例,混合病原体42例.肺泡灌洗液高通量测序细菌和病毒的检出率均高于传统检测方法(P<0.05),而肺炎支原体的检出率虽然低于血清肺炎支原体抗体滴度检测的检出率,但差异无统计学意义(P>0.05).传统方法未培养出真菌,高通量测序方法检出真菌4例.结论 高通量测序能快速、准确地检测和鉴定病原体,有助于及时、准确地治疗儿童重症肺炎.     

宏基因组二代测序在异基因造血干细胞移植术后肺孢子菌肺炎和免疫相关肺炎诊断中的临床价值

目的 探索宏基因组二代测序（mNGS）在异基因造血干细胞移植术后肺孢子菌肺炎和免疫相关肺炎诊断中的临床价值。方法 纳入2019年8月—2021年8月于四川省人民医院医疗集团（成都东篱医院）行异基因造血干细胞移植术后出现肺部弥漫性、多发性病灶的患者。回顾性分析肺泡灌洗液的mNGS结果和传统病原学检测针对耶氏肺孢子菌的检出率、免疫相关肺炎的发生率，并总结临床特征与mNGS结果的相关性。结果 24例感染患者的mNGS结果中，有5例为单纯病毒，4例为病毒合并细菌、真菌，排除这9例患者。在可评估15例患者中8例（53.3%）检出肺孢子菌，均经标准剂量复方磺胺甲唑为基础的抗肺孢子菌肺炎治疗后康复；7例（46.7%）未检出明确病原菌的患者中，5例（33.3%）经过标准的糖皮质激素为基础的免疫抑制剂治疗后康复，2例（13.3%）经标准剂量复方磺胺甲唑为基础的抗肺孢子菌肺炎治疗后康复。结论 针对异基因造血干细胞移植后临床难以鉴别的肺部弥漫性、多发性病变，采用肺泡灌洗液mNGS的阳性结果可以精准、快速筛选出肺孢子菌肺炎患者，而其阴性结果可以在较大程度上提示免疫相关肺炎的可能性，具有很好的鉴别诊断意义。     

549例细菌性肝脓肿患者临床特征分析及mNGS技术在细菌性肝脓肿病原学应用研究北大核心CSCD

目的回顾性分析细菌性肝脓肿(pyogenic liver abscess, PLA)患者的临床特征, 并探讨宏基因组学二代测序(metagenomics next generation sequencing, mNGS)技术在肝脓肿运用, 为临床诊治提供参考。方法回顾性收集复旦大学附属中山医院2015年12月至2020年6月入院的549例肝脓肿患者资料, 描述其临床特点;在病原学检测结果为阳性的246例患者中, 依据是否检测出肺炎克雷伯菌, 将患者分为肺克组和非肺克组, 比较其临床特征, 同时在完善mNGS检测的患者中, 分析mNGS技术在肝脓肿的运用价值。结果 549例细菌性肝脓肿患者中, 主要临床症状为发热(n = 503, 91.6%), 其他临床症状有畏寒寒颤、腹痛等, 影像学检测提示多数患者脓肿单发(n = 464 , 84.5%), 位于右叶(n = 368, 67.0%), 大小在5~10 cm之间(n = 341, 62.1%)。所有患者中有阳性的病原学检测结果的共246例, 其中检出肺炎克雷伯菌菌株的肝脓肿202例(82.1%), 为肝脓肿的主要检出菌株。该类肝脓肿患者糖尿病、脂肪肝的患病率更高(P < 0.05), 但是检出非肺炎克雷伯菌菌株的肝脓肿患者更多的合并腹腔内易感因素(P < 0.001);109例传统微生物学结果阳性的患者中共有92例拟诊为肺炎克雷伯菌肝脓肿(检出肺炎克雷伯菌), 其中14例(15.2%)患者为多重耐药菌感染;17例患者拟诊为非肺炎克雷伯菌肝脓肿, 其中10例(58.8%)为多重耐药菌感染;非肺炎克雷伯菌肝脓肿患者中多重耐药菌感染发生率明显高于肺克肝脓肿患者(P<0.05)。血mNGS的阳性率为85.2%, 传统血微生物培养的阳性率为14.8%, 脓液mNGS的阳性率为96.2%, 传统脓液微生物培养的阳性率为65.4%, mNGS阳性率明显高于传统细菌培养(P <0.05)。结论细菌性肝脓肿多肝右叶、单发, 伴发热, 肺炎克雷伯菌是细菌性肝脓肿最常见的致病菌, 多见于糖尿病、脂肪肝患者, 非肺炎克雷伯菌肝脓肿相对多见于合并腹腔内易感因素的患者;二代测序阳性检出率高, 在病原检测上具有独特的优势。     

宏基因二代测序技术对脊柱感染病原学诊断的价值

目的:探讨宏基因二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术对脊柱感染病原学诊断的价值。方法:回顾性分析2018年1月至2019年12月复旦大学附属中山医院收治的24例疑似脊柱感染患者的病例资料,采用常规微生物培养法和mNGS技术检测脊柱组织标本。结果:mNGS总体检测阳性率高于常规培养法(62.5%vs 35.0%),mNGS平均耗时36～48 h,明显短于常规培养法的平均天数21.8 d。脊柱感染主要检出病原体为结核分枝杆菌、金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌。结论:mNGS能够快速检测脊柱感染病原体,为临床早期精准治疗提供重要的病原学依据。     

宏基因二代测序技术在非结核分枝杆菌感染的病原学诊断效能比较

目的：研究宏基因病原二代测序技术及传统培养法对非结核分枝杆菌的检出率差别,探讨宏基因检测法对非结核分枝杆菌病的病原学诊断价值。方法：回顾性收集2018年9月-2019年12月期间我院收治的非结核分枝杆菌检测阳性的病例共388例,比较传统培养法及宏基因检测法的阳性率差异及不同样本类型的亚组分析。结果：培养法及mNGS阳性率均不足50%,两者阳性率比较无统计学差异。对于痰液标本,培养法的阳性率明显高于mNGS检测法（56.6% vs 22.9%,p<0.0001）;相反,对于组织标本,培养法的阳性率明显低于mNGS检测法（7.8% vs27.8%,p<0.0001）。宏基因检测的各类标本中,肺泡灌洗液的检测阳性率高于其他标本,差异有统计学意义,p=0.01。结论：mNGS是一项具有前景的研究,但是在NTM的病原学检测领域敏感性较低,需重点改进以促进此技术更好的应用于临床。     

宏基因组二代测序技术在慢性肺曲霉病诊断中的价值

目的：评估宏基因组二代测序技术在慢性肺曲霉病诊断中的价值。方法：回顾性收集2017年9月至2019年9月在复旦大学附属中山医院感染病科住院的疑似慢性肺曲霉病患者,并同步采集标本进行传统培养、血清烟曲霉特异性抗体IgG检测及mNGS检测,分析mNGS在慢性肺曲霉病诊断中的价值。 结果：共有78例疑似慢性肺曲霉病的患者纳入分析,根据诊断标准,最终诊断CPA 35例,non-CPA 43例。送检的的78例样本中,痰标本55例、支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid, BALF)标本17例、肺组织标本6例。与最终诊断相比,mNGS诊断CPA的敏感度和特异度分别为65.7%和86.0%,烟曲霉特异性抗体IgG的敏感度和特异度分别为48.6%和90.7%,传统培养的敏感度和特异度分别为28.6%和93.0%,其中mNGS的敏感度显著高于传统培养方法(P=0.001)。对于临床诊断的CPA患者,mNGS检测的阳性率为50.0%。mNGS、烟曲霉特异性抗体IgG和传统培养方法的ROC曲线下面积(Area Under Curve, AUC)分别为0.759、0.696和0.608。在所有最终诊断为CPA的35例患者的样本中,痰标本、BALF标本和肺组织标本的mNGS阳性率分别为56.5%(13/23)、77.8%(7/9)和100%(3/3),但三组之间的差异无统计学意义。结论：在CPA的诊断中,mNGS的敏感度显著高于传统培养方法,在传统诊断方法无法确诊的患者中,mNGS仍有较高的阳性率,同时在检测时间上具有明显优势。     

宏基因组二代测序用于艾滋病患者中耶氏肺孢子菌感染的诊断价值

目的探讨宏基因组测序(mNGS)在艾滋病合并耶氏肺孢子菌感染患者中的诊断价值。方法回顾性研究。收集2019年1月至2021年6月长沙市第一医院艾滋病科诊断为艾滋病合并感染共236例患者的呼吸道和其他体液标本及其病例背景资料, 同时进行传统病原学六胺银染色、血清G试验和mNGS检测。采用Fisher精确检验统计分析其结果, 比较mNGS与六胺银染色和血清G试验的诊断性能差异。结果共收集艾滋病合并肺部感染的患者236例, 临床初步诊断耶氏肺孢子菌肺炎患者77例, 非耶氏肺孢子菌肺炎患者159例。艾滋病合并肺部感染患者中, mNGS检测出耶氏肺孢子菌阳性者77例, 检出率为32.63%(77/236), 六胺银染色法检测, 耶氏肺孢子菌阳性者10例, 检出率为4.24%(10/236), 血清G试验阳性者146例, 检出率为61.86%(146/236)。以临床治疗性诊断为标准, 77例耶氏肺孢子菌肺炎患者中, mNGS检测的敏感度为100%(77/77), 高于六胺银染色[12.99%(10/77), P=0.046]和血清G试验[58.44%(45/77), P=0.038]。mNGS检...     

高通量测序技术检测支气管肺泡灌洗液在婴幼儿肺炎病原学诊断中的价值

目的探讨高通量测序技术检测支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)在婴幼儿细菌性肺炎病原学诊断的临床应用价值。方法 43例重症或疑难细菌性肺炎婴幼儿均行纤维支气管镜检查,收集BALF,分别进行高通量测序细菌检测和普通细菌培养,比较2种检测方法的细菌检出率和敏感度。结果高通量测序法检出细菌39例(肺炎链球菌17例,非典型细菌6例,嗜血杆菌属5例,鲍特菌4例,其他细菌7例),未检出细菌4例;细菌培养法细菌培养阳性9例,阴性34例;高通量测序法细菌检出率(90.7%)和敏感度(90.7%)均高于细菌培养法(20.9%、20.9%)(P0.05)。结论高通量测序技术检测BALF在婴幼儿重症或疑难细菌性肺炎病原体诊断的敏感度高。     

宏基因二代测序技术对肝脓肿病原学诊断的价值

目的:探讨宏基因二代测序(metagenomics next-generation sequencing,mNGS)技术对肝脓肿病原学诊断的价值。方法:前瞻性纳入2020年2月至2021年4月复旦大学附属中山医院急诊科收治的35例肝脓肿患者,采用常规微生物培养法和mNGS技术分别检测血液和脓肿引流液样本。并将患者按是否出现休克分为两组,采用SPSS 25.0进行统计学分析,对比分析两组患者之间的差异。结果:mNGS技术在血液样本和引流液样本中总体检测阳性率显著高于常规培养法(血液：67.6% vs. 15.2%, P<0.05;引流液：100% vs. 55.2%, P<0.05)。35例肝脓肿病例中71.4%检出致病病原体为肺炎克雷伯菌。休克组患者脓肿引流液样本中mNGS检测出的致病病原体序列数显著高于非休克组( P<0.05)。 结论:mNGS能够快速准确的检测出肝脓肿的致病病原体,为临床精准治疗提供重要的病原学依据。     

老年人肺部感染支气管肺泡灌洗液细菌培养及药敏的意义

目的 探讨支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluids,BALF) 细菌培养及药敏试验在老年人肺部感染病原诊断和指导抗生素治疗的价值.方法 常规方法分离培养2010~2011年度91例住院的肺部感染老年患者痰和BALF病原菌,应用半自动细菌鉴定分析仪鉴定到种,药敏试验方法按CLSI规定的标准进行.结果 91例肺部感染老年患者痰和BALF标本共分离出71株铜绿假单胞菌、21株肺炎克雷伯菌、15株大肠埃希菌和14株鲍曼不动杆菌.BALF病原菌检出率为92.3%,明显高于痰培养(76.9%,χ2=10.90,P<0.01).药敏结果显示铜绿假单胞菌和肺炎克雷伯菌对氨曲南、头孢吡肟和左氧氟沙星耐药,耐药率分别为81.1%,64.9%,86.5%和75.0%,66.7%,75.0%;铜绿假单胞菌对阿米卡星、庆大霉素和妥布霉素敏感;肺炎克雷伯菌对替卡西林/克拉维酸、阿米卡星和亚胺培南敏感.28例病原菌检出阳性结果患者根据药敏结果指导抗生素治疗后BALF和痰培养阳性率分别下降到35.7%和21.4%.结论 BALF细菌培养和药敏试验可明显提高老年肺部感染患者病原诊断率,可更好地指导临床选择有效抗菌药物.     

脑脊液二代测序在中枢神经系统感染中的病原学诊断价值北大核心CSCD

目的探讨宏基因组二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)在中枢神经系统(central nervous system,CNS)感染性疾病中的病原学诊断价值。方法以2018年1月至2020年6月郑州大学第一附属医院收治的中枢神经系统感染患者为研究对象,根据纳入和排除标准最终确定170例患者。收集患者的一般临床资料以及病原体检测结果。纳入患者均送检常规以及mNGS检测,将检测结果分为常规方法检测组及mNGS检测组。符合正态分布的计量资料用均数±标准差(x±s)表示;不符合正态分布的计量资料用中位数及四分位数表示;分类资料采用例数及百分比[n(%)]表示;比较采用χ2检验或Fisher's精确检验;一致性检验以Kappa值表示;对比分析两种方法对病原微生物的检出情况及检出病原谱的规律。结果在CNS感染性疾病中mNGS检测的总体阳性率高于常规方法(58.23%vs.18.82%),且差异有统计学意义(P<0.01)。两种检测方法均阳性的20例样本中,所检出病原体种类完全一致者10例,完全不一致者和部分一致者各5例。在结核性神经系统感染病例检测中,检测阳性率从高到低依次为血T-SPOT、脑脊液mNGS、结核杆菌DNA、腺苷脱氨酶(ADA)以及结核特异性抗原抗体检测,分别为66.7%、53.8%、40.0%、24.0%、4.0%,抗酸染色阳性率为0%;mNGS与常规方法结合的检测阳性率为80.8%。结论脑脊液mNGS在CNS感染中病原菌检出率总体优于常规方法;但对结核杆菌的检测阳性率较T-SPOT未显示出明显优势;mNGS检测的病原菌更为广泛,有助于深入全面地了解中枢神经系统感染的菌种特点,两者结合在一定程度上弥补了临床常规检测的不足,可最大化提升检出率。     

宏基因组二代测序技术在脑脓肿病原菌检测中的应用

目的分析宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)技术在脑脓肿病原菌检测中的应用价值。方法回顾性分析天津市环湖医院2019年1月至2021年12月年脑脓肿患者资料, 所有患者均行立体定向下脓肿穿刺引流。根据病原菌检测方法不同, 分为细菌培养组(仅行细菌培养)与mNGS组(行mNGS同时行细菌培养)。比较两组患者的临床症状、脓肿部位、细菌培养和mNGS结果, 抗生素应用方案及预后, 对两组患者细菌检测结果进行分析, 并对患者抗生素应用情况及预后进行比较。采用X2检验或精确概率法及Mann-WhitneyU检验, 比较两组差异有无统计学意义。结果共纳入脑脓肿患者43例, 其中细菌培养组21例, mNGS组22例。细菌培养组细菌阳性率42.9%(9/21), mNGS组细菌培养阳性率45.5%(10/22)。mNGS检测阳性率100%(22/22), 细菌培养组仅3例有较明确的细菌来源, mNGS组根据细菌结果17例明确细菌来源, 两组差异有统计学意义(χ2=19.69, P<0.001)。细菌培养回报时间为7.0(4....     

Bactec9120血培养系统检测细菌影响因素的探讨

目的探讨Ｂａｃｔｅｃ９１２０血培养系统（９１２０系统）检测细菌的影响因素以提高细菌的检出率。方法将加入不同浓度标准菌株的培养瓶放置不同温度和不同时间后，移置仪器中，观察检出时间和检出率；在树脂培养瓶和标准培养瓶中加入一定量的抗生素和菌液，比较两种培养瓶对抗生素的吸附能力。结果大肠埃希菌ＡＴＣＣ２５９２２的检出时间较金黄色葡萄球等３种细菌短。含１０２和１０６标准菌株的培养瓶置于２３℃下２～２４小时，不影响检出结果，但放置３０℃１６小时及２４小时，大肠埃希菌ＡＴＣＣ２５９２２（１０６ｃｆｕ／ｍｌ）检出假阴性。标准菌株在含４倍最低抑菌浓度抗生素的树脂培养瓶中仍能生长，但在含同样抗生素的标准培养瓶中不生长。应用９１２０系统检测２８０瓶标本，分离出５６株菌，其中２４小时内检出的阳性率为７０．５％，４８小时内检出的阳性率为９３．２％，假阳性率为０．３６％，未发现假阴性。革兰阴性杆菌最快检出为１．２小时，革兰阳性球菌最快检出为２．３小时。结论细菌的种类、浓度、生长期等因素影响仪器检出时间；培养瓶的种类影响检出率；培养瓶进入仪器前不宜久置高室温中以免出现假阴性。     

宏基因组二代测序技术在肺泡灌洗液病原检测中的应用

目的:为了探讨宏基因组二代测序技术(mNGS)对于下呼吸道标本的病原诊断效率.方法:选取65例被诊断为肺部感染的病例,行支气管肺泡灌洗,取2份标本,1份做mNGS,另外一份同时做细菌培养,真菌培养,抗酸染色和六胺银染色.通过分析mNGS和传统培养与涂片染色的检出病原分布,检出阳性率,对比两者的检出效率.通过分析mNGS...