速冻水饺中金黄色葡萄球菌的DiversiLab分型研究

目的:对速冻水饺中分离的20株金黄色葡萄球菌进行DiversiLab分型,研究其基因特征和聚类分布。方法:采用DiversiLab自动分型系统扩增金黄色葡萄球菌基因组中广泛分布的重复序列,然后在Agilent2100自动生物分析仪上对扩增片段进行微流体电泳分离,并使用DiversiLab Software软件实时分析和处理数据,对20株金黄色葡萄球菌进行分子分型。结果:DiversiLab分型系统将20株金黄色葡萄球菌分为13个型别,其中P1型包含菌株L17、L14、L11,P2型包含L16、L12、L19、L4菌株,P3型包含菌株L3、L18、L13,其余10株金黄色葡萄球菌的每一个菌株被分为一个单独的型别。结论:20株金黄色葡萄球菌从基因型来看有一定的聚集性,可能来自相近的污染源。同时也有一些金黄色葡萄球菌菌株之间的基因型差异较大,遗传学上关系较远,可能来自不同的污染途经。Diversilab自动化分型技术方便快捷,是监控食品及其生产企业细菌性污染的有力工具。     

应用DiversiLab分型系统对沙门氏菌进行同源性分析

目的:为研究食品污染中沙门氏菌间的同源性关系,建立起沙门氏菌基于重复序列的分型技术。通过建立DiversiLab基因图谱数据库,以便对将来不同来源的沙门氏菌的基因图谱进行即时比较,确定其同源性,进而追溯污染来源,切断传播途径,为预测预警保障食品安全提供科学依据,为防止食源性疾病的发生提供技术支持。同时进行血清分型,比较分析2种方法的优劣和之间的关系。方法:对2002～2010年福建省出入境检验检疫局从各类食品及饲料中分离出的沙门氏菌先进行血清分型,然后进行DiversiLab分型,其中包括:DNA提取,rep-PCR和微电泳芯片分离检测。rep-PCR条件:94℃预变性2min;94℃变性30s,50℃退火30s,70℃延伸90s,35个循环,最后70℃延伸3min。结果:23株沙门氏菌被分成6个血清型,DiversiLab分型能将相同血清型的菌株分为不同的亚型。同一企业来源的菌株具有同源性。结论:DiversiLab分型系统是一种快速、易于操作、高重复性、高分辨率的基因分型方法,可作为食源性疾病同源性分型工具。结论:DiversiLab分型的分辨率高于血清型,2种分型方法密切相关。     

禽肉制品中单增李斯特菌的DiversiLab分型

目的：研究从同一类食品中分离出的单增李斯特菌间的同源性关系,为预测预警保障食品安全和食源性疾病溯源提供科学依据和技术支持。方法：应用DiversiLab分型系统对2001-2010年福建出入境检验检疫局从各类禽肉制品中分离出的25 株单增李斯特菌进行分型,其中包括：DNA提取、重复序列-聚合酶链式反应（repetitivesequence-based polymerase chain reaction,rep-PCR）、微电泳芯片分离检测及数据分析。结果：DiversiLab分型中,相似系数为95%时,25 株菌被分为了6 组（G）;相似系数为97%时,25 株菌被分为11 组（P）。结论：DiversiLab分型结果较准确地揭示了25 株菌株间的亲缘性关系。基于rep-PCR的DiversiLab分型系统,是一种操作简单、分辨率高、重复性好且高效快速的基因分型方法,可作为食源性病原体检测及食源性疾病溯源的工具。     

应用DiversiLab分型系统对奶制品中的阪崎肠杆菌进行同源性分析

为研究奶制品污染中阪崎肠杆菌的同源性关系,并建立起阪崎肠杆菌基于重复序列的分型技术。对2005-2006年福建省出入境检验检疫局从各类奶制品中分离出的阪崎肠杆菌先进行API鉴定,然后进行DiversiLab分型。其中DiversiLab分型包括:DNA提取,rep-PCR和微电泳芯片分离检测。rep-PCR条件为:94℃预变性2 min;94℃变性30 s,55℃退火30 s,70℃延伸90 s,35个循环;最后70℃延伸3 min。结果表明:31株阪崎肠杆菌被API分成了5种不同的生物型,DiversiLab分型能将阪崎肠杆菌分为不同的亚型,但它们之间没有必然的联系。部分同一企业来源的菌株具有同源性,样品的同源性与采样地无关。DiversiLab分型系统是一种快速,高效,易于操作,高重复性,高分辨率的基因分型方法,可作为食源性污染的同源性分型工具。     

金黄色葡萄球菌分离株自动化核糖体分型的研究

运用自动化核糖体基因分型系统(Riboprinter),用EcoRI酶,对实验室分离的31株金黄色葡萄球菌进行分子分型研究。31株菌均被鉴定为金黄色葡萄球菌,并获得25种Riboprinter核糖体基因条带型。     

2006—2011年西安市食品及食物中毒中金黄色葡萄球菌毒素基因分布及分型研究

了解2006—2011年西安市污染食品及食物中毒中金黄色葡萄球菌(S.aureus)分离株肠毒素(SEs)、杀白细胞素(PVL)、表皮剥落毒素(ETs)、毒性休克综合征毒素-1(TSST-1)等毒素基因的分布状况,并比较两种分离株在基因分布及分型上的差异。方法 采用多重PCR 法检测61株S.aureus(包括40株食品分离株和21株食物中毒分离株)sea、seb、sec、sed、pvl、eta、etb、tsst-1基因,其中sea、seb、sec、sed基因引物加入同一反应体系,剩余4对基因引物加入另一反应体系。结果 40株食品分离株中17株检出毒素基因(42.50%);21株食物中毒分离株中18株检出毒素基因(85.71%),食物中毒分离株毒素基因的检出率明显高于食品分离株(P<0.01)。食品分离株中主要流行的毒素基因为sea(25%)、eta(12.5%),未检测到携带etb、tsst-1基因的菌株;同时得到8种毒素基因型,主要流行的基因型为sea(10.00%)、sea+eta(7.50%)。食物中毒分离株中主要流行的毒素基因为sea(76.19%)、sec(28.57%),未检测到携带pvl基因的菌株;同时得到6种毒素基因型,主要流行的基因型为sea(42.86%)、sea+sec+tsst-1(14.29%)。结论 S.aureus食品分离株和食物中毒分离株在毒素基因的分布及分型上存在较大差异。     

食品中金黄色葡萄球菌多重PCR检测方法的研究

以耐热核酸酶基因nuc、纤维蛋白原结合蛋白基因clfA和SmaI限制性酶切片段特异序列为靶基因,设计筛选引物,建立并优化了检测金黄色葡萄球菌(Staphylococus aureus,SA)的多重PCR体系。采用10株SA和46株非SA验证了该多重PCR具有很好的特异性。PCR检测的灵敏度在DNA水平上达到1.197 3 ng。人工污染样品,当起始污染量为1.2个/g时,37℃增菌培养6 h即可检出。一共检测了43份样品,检出3份阳性样品,其中有2份阳性样品与传统方法一致,另外一份阳性样品用测序验证。作者建立的多重PCR方法可特异、快速地实现对SA的检测。     

辽宁省2018年食源性金黄色葡萄球菌脉冲场凝胶电泳分子分型及毒力基因的研究

目的 了解辽宁省食源性金黄色葡萄球菌的肠毒素分布情况及基因分型特征。方法 采用脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis, PFGE)和肠毒素分型方法在不同角度和层次对2018年辽宁省内分离出的18株食源性金黄色葡萄球菌进行肠毒素检测与PFGE同源性分析。结果 PCR方法及酶联免疫吸附测定(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA)方法对肠毒素结果显示, 18株菌分别存在SEB、SEC、SED、SEH 4种肠毒素, PFGE聚类分析显示, 18株金黄色葡萄球菌相似系数在60.3%~100%之间。结论 金黄色葡萄球菌均可以用PFGE和PCR进行分型, 都具有较好地分型能力, 辨识度高, 对菌株有很好的溯源性。     

食品中金黄色葡萄球菌的PCR检测思路构建

本文对金黄色葡萄球菌的相关内容展开论述,并阐释了PCR技术检测原理与应用特点,通过研究细菌培养与DNA提取、合理设计引物、多重PCR反应条件优化、PCR反应检测等内容,以期提高食品中金黄色葡萄球菌的PCR检测结果的准确性,确保市场中流通食品的安全性。     

猪肉源金黄色葡萄球菌生物膜能力与MLST分型检测

金黄色葡萄球菌在生鲜猪肉中有较高的检出率,是污染生鲜猪肉的主要食源性致病菌之一,对食品安全和人体健康造成巨大威胁。采用刚果红琼脂法定性,96孔微量板定量结合扫描电镜检测其成膜能力,用PCR法检测其成膜基因和黏附基因,最后对分离株进行多位点序列分型分析(MLST)。结果表明,刚果红琼脂法定性试验显示84.93%(62/73)的菌株成生物膜阳性,96孔微量板定量试验显示94.52%(69/73)的菌株成生物膜阳性,扫描电镜观察到不同黏附能力的菌株在钢板上梯度富集,PCR试验发现分离株均含有多重黏附基因,其中同时携带icaD、clfA、clfB、fnbA、fnbB;icaD、clfA、clfB、fnbA、fnbB、cna;icaA、icaD、clfA、clfB、fnbA、fnbB、cna多重黏附基因的菌株数最多,分别为30.14%(22/73),20.55%(15/73),15.07%(11/73)。MLST试验中73株菌分为26个ST型,夏季20个、冬季12个,夏季以CC1、CC5为优势克隆群,冬季以CC15、CC1、CC5为优势克隆群。系统发育树中,分离株与国内食源性、医源性和动物源性分离株有一定的相关性,呈现遗传多样性。研究结果可为生鲜猪肉的安全监管和金黄色葡萄球菌的传播及溯源调查提供一定的科学依据。     

广州市白云口岸航空食品中金黄色葡萄球菌凝固酶基因分型及肠毒素基因研究

目的对2013—2015年从广州市白云口岸航空食品中分离的金黄色葡萄球菌进行基因分型研究,为食源性金黄色葡萄球菌分子溯源提供基础数据。方法以血浆凝固酶和肠毒素为目标基因,采用聚合酶链式反应(PCR)方法对9株金黄色葡萄球菌进行基因分型,其中6株为航空食品分离株,1株为配餐车间大门手拭分离株,2株为标准菌株。肠毒素基因检测包括5种传统肠毒素基因(sea、seb、sec、sed、see)和6种新型肠毒素基因(ser、seg、seh、sei、sej、sep)。结果 6株航空食品分离株的血浆凝固酶基因扩增分型结果为2个PCR型,酶切后得3种亚型;肠毒素基因检测结果显示有2株航空食品分离株含有肠毒素基因,检出率为33.3%(2/6),检出的基因为2种传统肠毒素基因(sec、sed)和4种新型肠毒素基因(ser、seg、sei、sej),均同时携带2种以上肠毒素基因。结论血浆凝固酶基因扩增分型结果显示,不同时间、不同采集地点存在相同的基因型,提示金黄色葡萄球菌存在交叉污染的可能性;航空食品分离株共检出6种肠毒素基因,提示金黄色葡萄球菌基因型多样性,应加强其他新型肠毒素基因检测。     

金黄色葡萄球菌食品分离株肠毒素基因分布及分型研究

目的 对2006-2009年上海市Staphylococcus aureus(S.aureus)食品分离株进行肠毒素基因检测和基因分型研究,以了解肠毒素基因的分布规律及S.aureus的流行特点.方法 利用PCR方法检测食品中金黄色葡萄球菌肠毒素基因,包括5种传统肠毒素基因(SEA-SEE)和4种新型肠毒素基因(SEG-SEJ);利用脉冲场凝胶电泳法对49株食品分离株进行基因分型.结果 本研究发现49株食品分离株中有19株含有肠毒素基因,16株含有传统肠毒素SEA和SEC,且SEC占93.8％,并检测到新型肠毒素SEG、SEI、SEJ和SEH.PFGE法基因分型显示5株菌不能被分型,其余44株可分为28个基因型,表现为基因型的多样性,且分离自不同时间的菌株具有相同的带型.结论 应加强食品中S.aureus的监测分析,为其引起的食物中毒的预防和控制提供科学依据.     

进出口食品中金黄色葡萄球菌spa基因的分型

目的对我国进出口食品中分离得到的金黄色葡萄球菌进行spa基因分型。方法对36株金黄色葡萄球菌的spa基因进行PCR扩增,并对产物进行测序分析,测序结果通过数据库进行spa基因分型。结果共分出16个基因型,分别为t189、t091、t164、t002、t899、t197、t1044、t034、t156、t7400、t2592、t4209、t127、t437和两株新发现的基因型。其中t189型共有13株,t091型共4株,t164和t002型分别为3株,其余型分别为1株。结论 食品中分离出的36株金黄色葡萄球菌spa分型以t189居多,t091型次之,其他14型相对较少。     

采用高级微生物基因分型系统对食品中单核细胞增生李斯特菌进行同源性分析

采用高级微生物基因分型系统(DiversiLab系统)对食品中单核细胞增生李斯特菌进行基因型分析,将分型结果与血清型和菌株的耐药性进行比对研究。方法 DiversiLab系统是基于rep-PCR原理对微生物进行分型,将分型结果与菌株的血清型进行比较研究,同时对菌株的耐药性与rep-PCR型别进行研究。结果 采用DiversiLab系统将46株单核细胞增生李斯特菌分为9个型别A～I。血清型为1/2a的分离株以A型为主,所测试的6株血清型为4b的分离株均为H型;14株呋喃妥因耐受菌株9株为A型、1株为B型、3株为C型、1株为F型,除2株血清型为3a外,其余均为1/2a。结论 DiversiLab系统分析结果,揭示了46株从食品中分离的单增细胞增生李斯特菌间的亲缘关系,rep-PCR分型结果与H抗原结合位点存在一定联系,呋喃妥因耐受菌株的DNA指纹图谱相似度高,与耐药基因有关。     

食品和临床来源金黄色葡萄球菌对Caco-2细胞侵袭力的比较研究

目的 比较研究食品和临床来源金黄色葡萄球菌不同克隆系(Clonal complex,CC)菌株对Caco-2细胞的侵袭力和菌膜形成能力。方法 采用Caco-2细胞体外培养方法、庆大霉素与溶葡萄球菌酶保护试验,研究金黄色葡萄球菌12个不同来源的克隆系菌株对人体肠道表皮细胞的体外侵袭力;采用96孔板结晶紫染色法,评估不同菌株的菌膜形成能力。结果 体外侵袭能力试验结果表明CC5、CC30、CC25、CC59、CC239、 CC50和CC398等克隆系都具有细胞强侵袭株,与牲畜特异相关的CC9也展现出细胞强侵袭力,而CC1、CC72 、CC20和CC121等克隆系则明显具有较弱的细胞侵袭能力。此外,不同克隆系菌株菌膜形成的能力也具有一定差异,其中CC5、CC9、CC25和CC239等克隆系菌膜形成能力相比较强,而CC1、CC72、CC59和CC121等则菌膜形成能力较弱。进一步分析发现不同克隆系菌株的菌膜形成能力与细胞侵袭力呈现正相关(R=0.743)。结论 金黄色葡萄球菌不同克隆系菌株的细胞侵袭能力、菌膜形成能力具有一定差异,本研究结果能够为有效防控金黄色葡萄球菌临床感染提供重要支持。     

Genotype analysis of enterotoxin H-positive Staphylococcus aureus strains isolated from food samples in the Czech Republic

Twenty-eight enterotoxin H-positive Staphylococcus aureus strains isolated from food samples collected in eleven districts of the Czech Republic between 2000 and 2005 were genotypically characterized by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) profiling, spa gene polymorphism analysis, enterobacterial repetitive intergenic consensus sequence-based PCR (ERIC-PCR) fingerprinting and prophage carriage detection. These strains accounted for about 21% of the food-derived, staphylococcal enterotoxin (SE)-positive isolates. One strain, detected in feta cheese, was implicated in a case of enterotoxinosis. Sixteen of the twenty-eight isolates carried the seh gene alone. The remaining twelve strains harbored the seh gene in combination with other enterotoxin genes, most often the seg and sei genes, followed by the sea, seb, sec and sed genes. Comparison of various genomic profiles resulted in the determination of twenty genotypes designated G-1 to G-20. Two new, to date not defined, spa types (t2000 and t2002) were identified in one strain isolated from raw meat and two strains obtained from prepacked pizza. Evidence has been given that the seh-positive S. aureus isolates from foodstuffs did not originate from a single source or a common ancestor.     

The distribution of enterotoxin and enterotoxin-like genes in Staphylococcus aureus strains isolated from nasal carriers and food samples

Staphylococcus aureus strains were examined for the presence of 18 enterotoxin (se) and enterotoxin-like (sel) genes by PCR and four classic enterotoxins SEA to SED by reverse passive latex agglutination. We screened three groups of isolates: 53 recovered from food samples collected in years 2004-2005, 18--from food samples collected in the 1960s and 1970s and 30--from nasal carrier samples collected in the years 2000-2002. Eighty percent of all tested strains were se and sel positive, but the frequency of these genes was higher among nasal carrier strains (93%) than among food samples isolates (circa 76%). The enterotoxin genes cluster (egc) was the most prevalent among carrier strains (18/30-60%) and the least--among food strains isolated in the 1960s and 1970s (6/18 strains--33%). sea coding enterotoxin A, which was recognised as the major cause of staphylococcal food poisoning so far, was more often found among carrier strains than among the years 2004-2005 food strains (27% versus 11%), but it was the most frequent se/sel gene among food strains isolated in the 1960s and 1970s (10/18 strains). Moreover in our results certain se and sel genes coexisted, which was in accordance with current knowledge about movable genetic elements carrying those genes. The exception was for only one strain, which harboured the sole selr gene on a possibly new genetic element not yet described. As we found both types of egc, as well as seh (especially food samples strains) occurred alone in a majority of positive strains for each of those genes. The analysis of the results obtained by SET-RPLA method for the productivities of classical enterotoxins A-D and the results obtained by PCR for the presence of sea-sed genes revealed the correlation between each other. Only three of all sea-sed positive strains had silent genes--sed.     

Enterotoxigenic and antibiotic resistance determination of Staphylococcus aureus strains isolated from food handlers in Gaborone, Botswana

The prevalence, antibiotic resistance, and enterotoxigenic potential of Staphylococcus aureus strains from different anatomical sites on food handlers in Gaborone, Botswana, were determined. Of a total of 200 food handlers tested, 115 (57.5%) were positive for S. aureus. Of the 204 S. aureus isolates, 63 (30.9%), 91 (44.6%), and 50 (24.5%) were isolated from the hand, nasal cavity, and face, respectively, and 43 (21%) of the isolates were enterotoxigenic. The most prevalent enterotoxin was type A, which accounted for 34.9% of all the enterotoxigenic strains, and enterotoxin D was produced by the fewest number of strains (9.3%). Resistance to methicillin was encountered in 33 (22.4%) of the penicillin G-resistant isolates, and 9 (27.3%) of these methicillin-resistant isolates also were resistant to vancomycin. Nineteen antibiotic resistance profiles were determined, and the nasal cavity had the highest diversity of resistance profiles. The nasal cavity also had the highest number of resistant strains, 77 (53%), whereas the hand and face had 49 (32%) and 24 (16.0%) resistant strains, respectively. To reduce the Staphylococcus carriage rate among food handlers, training coupled with a commitment to high standards of personal and environmental hygiene is recommended.