新型冠状病毒实验室检测技术及其进展

2019年,新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染在中国湖北省武汉市暴发,该病毒引发的疾病(COVID-19)已对公共卫生构成严重威胁。快速、早期检测SARS-CoV-2有助于疫情的控制。该文拟分析SARS-CoV-2现有实验室检测方法的优点与不足,同时展望检测技术未来的研发方向,为SARS-CoV-2及未来可能出现的其他未知病毒引起的疾病的诊疗提供指导。     

北京某综合三甲医院对COVID-19疑似和非疑似患者进行SARS-CoV-2核酸筛查结果分析

目的以北京综合三甲医院为例,对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疑似患者和非疑似患者的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸筛查结果进行分析,为COVID-19的实验室诊断提供实验依据。方法SARS-CoV-2核酸检测的咽拭子标本来自2595例患者,COVID-19疑似患者81例,非疑似患者2514例。咽拭子标本采用QIAamp Viral RNA Mini Kit试剂提取RNA,分别采用国家药品监督管理局批准的3种(A、B、C)不同灵敏度试剂盒进行实时荧光PCR平行检测。结果81例COVID-19疑似患者标本中SARS-CoV-2核酸阳性检出率为6.17%(5/81),2514例非疑似患者标本中均没有检出SARS-CoV-2核酸。确诊的5例COVID-19患者,A试剂检出率为80.00%,B、C试剂检出率均为100.00%。结论在COVID-19低流行区(北京)综合三甲医院筛查的COVID-19疑似患者中SARS-CoV-2核酸阳性检出率较低。无症状的非疑似患者中SARS-CoV-2感染的概率极低,为减少核酸筛查的工作量,可采用混合标本检测。在实验室诊断中,对于低病毒载量的患者,可采用两种试剂盒平行检测,以提高实验室诊断的准确性。     

新型冠状病毒引起的临床相关疾病及其分子生物学检测

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)潜伏期长,传染性强,发病机制不明确,在临床上引起以发热、干咳和乏力等为主要症状的新型冠状病毒肺炎(COVID-19),同时还可引起心血管等其他系统合并症状,临床尚无特效的治疗药物。目前抗疫工作重心倾向于防控,治疗感染患者的同时切断病毒传播途径,保护健康人群。因此,及时、准确地进行SARS-CoV-2核酸检测将更有利于病毒的防控。该文主要介绍了SARS-CoV-2的基因结构特征、分子生物学检测及其所引起的相关临床疾病,为临床诊断提供一定的参考依据。     

新型冠状病毒的流行现状与研究进展

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)对整个世界乃至人类健康体系造成了巨大影响,目前对SARS-CoV-2甚至冠状病毒的了解还不够充分。1流行病学冠状病毒是一类包膜RNA病毒,冠状病毒的系统分类为冠状病毒科,属于冠状病毒属。由于冠状病毒有广泛宿主特征,以及其自身的复杂基因组进化结构,在生物进化的过程中很容易发生重组和遗传变异,呈现出生物遗传上的多样性。新亚型和新的冠状病毒不断结合存在,使该冠状疾毒至少能够同时发生一种跨越亲属型的感染,预防和早期治疗困难较大[1]。     

一种国产新型冠状病毒核酸检测试剂盒的性能验证

目的　评估一种国产新型冠状病毒（SARS-CoV-2）核酸检测试剂盒是否满足临床SARS-CoV-2 核酸检测要求。 方法　采用15 例SARS-CoV-2 核酸阳性和15 例SARS-CoV-2 核酸阴性的临床样本,1 支SARS-CoV-2 RNA 干粉标准 品,5 支阳性定值参考品和5 支阴性定值参考品,对该试剂盒检测SARS-CoV-2 阴性和阳性符合率、精密度、检出限和 交叉反应进行验证。结果　20 例阴性和20 例阳性样本的N 基因和ORF1ab 基因阴阳符合率均为100%。2 例阳性样本 ORF1ab 基因重复性CV 为0.41%~0.56%,优于N 基因重复性,N 基因和ORF1ab 基因重复性、实验室总不精密度CV 均＜ 5%。检出限重复20 次的检出率为100%,SARS-CoV-2 与常见呼吸道病原体、与SARS-CoV-2 同种属病毒（人副 流感病毒1 型、鼻病毒、MERS,SARS,甲型流感病毒、乙型流感病毒、冠状病毒HKU1,NL63,229E 和OC43）之间不 产生交叉反应。 结论　该试剂盒阴阳性符合率一致,重复性好。SARS-CoV-2 与常见呼吸道病原体,与SARS-CoV-2 同 种属病毒不会产生交叉反应,适用于临床实验室和检测机构进行SARS-CoV-2 核酸筛查。     

22种呼吸道病原体核酸多重联检试剂盒检测效能评估

目的 通过对1种新型呼吸道病原体核酸多重联检试剂盒检测效能评价,为新型冠状病毒(SARS-CoV-2)、流行性感冒(流感)病毒等叠加流行的大规模检测提供适宜技术方法.方法 收集北京地区急性呼吸道感染病例阳性标本252份,采用4种核酸检测试剂盒(3种核酸多重检测试剂盒A、B、C及1种SARS-CoV-2检测试剂盒D)分别...     

新型冠状病毒肺炎患者出院标准探讨并文献复习

目的基于新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的临床表现、实验室检查特点、影像学特点,探讨COVID-19的出院标准。方法对5例COVID-19确诊患者进行影像学、血清学、流式细胞学、实时荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检查。结果5例患者经RT-PCR确诊为新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染,实验室检查及影像学检查符合COVID-19特点。经治疗患者体温<37℃,呼吸道症状消失,胸部CT显示病灶明显吸收好转,白细胞、淋巴细胞计数正常,炎性指标[C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)、白细胞介素-6(IL-6)]正常,CD4+T淋巴细胞>500/μL,SARS-CoV-2 IgG抗体阳性且滴度为急性期4倍以上,连续2次(间隔1 d)鼻咽拭子SARS-CoV-2核酸检查阴性,连续2次粪便SARS-CoV-2核酸检查阴性,肛拭子SARS-CoV-2核酸检查阴性1次后准予出院,随访2周未见复发且SARS-CoV-2核酸检查阴性。结论基于《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第五版)》及炎性指标、CD4+T淋巴细胞计数、IgG抗体滴度作为该地区COVID-19确诊患者解除隔离和出院标准可行。     

新型冠状病毒肺炎临床实验室相关检测现状

正近来,由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)仍全球持续蔓延,形势极其严峻,影响不容小觑~([1-3])。对COVID-19的实验室相关检测已有了诸多报道,已知COVID-19患者发病早期外周血白细胞总数正常或减低,淋巴细胞计数减少,部分患者出现肌酸激酶(CK)、乳酸脱氢酶     

1例COVID-19患者的实验室指标变化及意义

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)是单链正义RNA病毒,属于β类冠状病毒,与严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合症冠状病毒(MERS-CoV)同种属^[1-2]。现有的研究结果显示,新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的传染性和病死率都非常高,围绕该病毒的诊断和治疗亟待突破。尤其是对病毒感染免疫的研究将在实验室诊断和疫苗的研发中发挥至关重要的作用。本文就上海首例COVID-19患者整个诊治过程中的实验室指标变化进行报道,为COVID-19的诊断治疗提供信息。     

新型冠状病毒核酸检测的性能验证及评价

目的 验证实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)检测系统的主要性能.方法 参考《医学实验室质量和能力的要求》第1部分通用要求GB/T22576.1-2018和第10部分分子生物检验学领域的要求GB/T22576.10-2018对该实验室RT-qPCR检测SARS-CoV-2核...     

新型冠状病毒的研究现状与实验室诊断

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)在全球范围内的传播对世界公共健康构成了巨大威胁。目前,预防和治疗SARS-CoV-2的选择仍然非常有限。解析病毒感染宿主的致病机制及治疗性疫苗的研制迫在眉睫。与此同时,研发快速、有效的SARS-CoV-2实验室检测技术,对于实现快速确诊感染病例、排除疑似病例、促进疫情的防控与临床救治至关重要。该文首先从SARS-CoV-2的结构特征、分子遗传变异特征、致病机制及潜在的药物靶点等方面介绍了“如何认识SARS-CoV-2”;同时立足于临床检验,重点介绍了现有的病毒实验室检测技术及问题解析、即时检验及高通量病毒筛查芯片等病毒筛查新技术,回答了“如何检测SARS-CoV-2”。最后对实验室从业人员如何安全防护进行了要点总结。     

2020－2021年度新型冠状病毒肺炎疫情发展趋势分析与应对

新型冠状病毒（新冠病毒）具有自然疫源性和流感病毒的流行特性,病毒复制快、细胞嗜性广、存活能力强,而且其无症状感染者普遍、传播隐蔽,病毒已经在人群适应,控制难度大。在新冠病毒疫苗发挥广泛保护效应之前,2020 — 2021年度全球疫情可能进一步恶化,我国仍然面临境外多渠道持续输入和局部暴发或疫情重现风险。 因此,应进一步开展我国疫情高发区人群携带新冠病毒状况和相应环境中新冠病毒的监测;建立国家超级可移动新冠病毒检测网络实验室,能够执行超大规模检测任务;实施差异化疫苗接种策略并密切跟踪监测疫苗接种的效果和效率;应继续强化戴口罩、勤洗手、保距离、常开窗、少聚会等行之有效的公共卫生措施。 新冠病毒疫情再一次警告大家,野生动物源性未知病原体所导致的新发传染病病原不断地出现已经成为“新常态”,必须前瞻性系统开展未知微生物发现和反向病原学研究,主动防卫和应对未来新发传染病疫情。     

临床生化检验指标在COVID-19疾病进展及治疗中的应用评价

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引发新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的流行,该病为新发的传染病,其来源、病理机制等诸多方面尚未完全清楚。该病的诊断、变化及治疗评价需要检验提供重要的依据,该病在发生、发展过程中会引起肺、肾脏、肝脏、心脏等多器官损伤,而这些器官是否受损及受损的程度依赖临床检验的结果。该文重点阐述COVID-19发生、发展及治疗过程中合理选择实验室检查项目及检查结果的临床意义,以期为该病的准确治疗、疾病进展、疗效评估等提供理论依据。     

新型冠状病毒实验室检测专家共识

新型冠状病毒肺炎疫情仍在全球肆虐,实验室检测是疫情防控的关键环节.基于目前实验室检测所积累的经验和难点,结合当前最新研究进展,中国医院协会临床微生物实验室专业委员会组织临床微生物学、分子生物学和免疫学检验相关专家共同制定了《新型冠状病毒实验室检测专家共识》.本共识对新型冠状病毒临床常用检测方法,尤其是核酸、抗体及抗原检...     

Fourty-nine years old woman co-infected with SARS-CoV-2 and Mycoplasma: A case report

BACKGROUNDSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is a new virus responsible for the outbreak of respiratory illness known as coronavirus disease 2019 (CoVID-19). Mycoplasma is an uncommon co-infected pathogen with SARS-CoV-2 and has not yet been reported. Computed tomography (CT), used as an accessory examination, may play a more significant role in this co-infection. CASE SUMMARYA 49-year-old female presented with a cough, expectoration and chest congestion followed by elevated C-reactive protein and erythrocyte sedimentation rate. CT images showed ground-glass opacities in bilateral lower lobes and a patchy and striate shadow in the right upper lobe. Immunoglobulin M antibody of Mycoplasma pneumoniae was positive and real-time fluorescence polymerase chain reaction of sputum was positive for SARS-CoV-2 nucleic acid. The diagnosis of CoVID-19 was made based on laboratory results, chest CT images, clinical manifestations and epidemiologic characteristics. She was treated with combination therapy for 17 d and showed a marked reCoVery.CONCLUSIONCo-infection with SARS-CoV-2 and Mycoplasma in CoVID-19 patients appears to be uncommon. CT is an acceptable method for the primary diagnosis and treatment should be initiated as soon as possible. Combination therapy with antiviral, anti-inflammatory, traditional Chinese herbal medicine and interferon inhalation may be a reference for further progress in treating this co-infection.     

COVID-19: An overview and a clinical update

The outbreak of coronavirus disease-2019 (COVID-19, previously known as 2019 nCoV) caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection in Wuhan City, China, has spread rapidly around the world. Most patients from the first cluster had an epidemiological connection to the Wuhan's Huanan Seafood Wholesale Market. Available evidence has shown that SARS-CoV-2 can be easily transmitted from person to person through close contact and respiratory droplets, posing a substantial challenge to public health. At present, the research on SARS-CoV-2 is still in the primary stages. However, dexa-methasone and remdesivir are appeared to be promising medical therapies. Still, there is no definite specific treatment, and the mainstay of treatment is still focused on supportive therapies. Currently, over 150 vaccines are under investigation. It is necessary to understand the nature of the virus and its clinical characteristics in order to find effectively manage the disease. The knowledge about this virus is rapidly evolving, and clinicians must update themselves regularly. The present review comprehensively summarizes the epidemiology, pathogenesis, clinical characteristics, and management of COVID-19 based on the current evidence.     

新型冠状病毒在环境中的存活潜力和感染风险

新型冠状病毒肺炎（COVID-19）传播速度快、范围广,主要通过飞沫和接触传播。 本研究通过整理新型冠状病毒（SARS-CoV-2）在不同物体表面的存活时间及主要影响因素的相关研究,发现SARS-CoV-2的稳定性与重症急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）相近,室温下可在多种物体表面或介质中存活数天（不锈钢表面2 d、塑料表面3 d、玻璃表面4 d）。 在低温、低相对湿度条件下,存活时间更长,给人们的健康带来极大威胁,也给疫情防控带来严峻挑战。 SARS-CoV-2的流行特点与甲型流感病毒相似,传染性高,隐蔽性强。 通过了解SARS-CoV-2在环境中的存活潜力和感染风险,进行针对性消毒和采取相应的防护措施,可以减少疾病的发生。     

新型冠状病毒疑似感染病例下呼吸道病原谱分析

  目的  了解2020年1 — 3月北京市朝阳区100例新型冠状病毒（SARS-CoV-2）疑似感染病例的下呼吸道病原谱。  方法  采用实时荧光定量聚合酶链式反应（real-time PCR）方法检测疑似病例痰标本中28种呼吸道病原,包括 14种病毒、11种细菌、肺炎支原体、肺炎衣原体、真菌。  结果  100份SARS-CoV-2疑似感染病例痰标本中,所检测病原核酸阳性率为72.00%（72/100）,SARS-CoV-2阳性率为15.00%（15/100）,革兰阴性菌、革兰阳性菌、真菌、肺炎支原体、肺炎衣原体的阳性率分别为32.00%（32/100）、24.00%（24/100）、39.00%（39/100）、6.00%（6/100）、3.00%（3/100）,甲型流感病毒、乙型流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒均有检出。 混合感染（同时检出≥2种病原）的检出率为35.00%（35/100）。 15份SARS-CoV-2阳性标本中混合感染标本13份。  结论  北京市朝阳区2020年1 — 3月的100例SARS-CoV-2疑似感染病例的下呼吸道病原谱多样,以真菌、SARS-CoV-2、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌为主,SARS-CoV-2阳性病例下呼吸道混合感染以金黄色葡萄球菌合并真菌为主。     

Stem cell therapy: A promising treatment for COVID-19

Novel coronavirus disease 2019 (COVID-19) caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has become a global pandemic. SARS-CoV-2 is an RNA virus and has a glycosylated spike (S) protein used for genome encoding. COVID-19 can lead to a cytokine storm and patients usually have early respiratory signs and further secondary infections, which can be fatal. COVID-19 has entered an emergency phase, but there are still no specific effective drugs for this disease. Mesenchymal stem cells (MSCs) are multipotent stromal cells, which cause antiapoptosis and can repair damaged epithelial cells. Many clinical trials have proved that MSC therapy could be a potential feasible therapy for COVID-19 patients, especially those with acute respiratory distress syndrome, without serious adverse events or toxicities. However, more studies are needed in the future, in order to confirm the effect of this therapy.