MicroRNA参与肿瘤发生发展的调控机制

MicroRNAs（miRNAs）具有瘤基因或抑瘤基因的功能,其表达异常影响细胞增殖、凋亡、侵袭和转移等肿瘤恶性表型,从而参与肿瘤的发生发展及其转录调控网络。转录因子与miRNA,miRNA与靶基因之间一对多及多对一的调控关系,增加了miRNA调控的复杂性,从而影响肿瘤的生物学特征;miRNA加工过程中,Drosha和Dicer的表达和活性影响成熟miRNA的加工合成;竞争性内源RNA（ceRNA）与miRNA的靶基因竞争相同的miRNA,从而作为miRNA的拮抗子影响miRNA功能的发挥,ceRNA表达和结构异常是肿瘤发生发展的又一重要分子机制。这种多维调控模式构成了miRNA调控的复杂网络,参与肿瘤发生发展的精细调控,从而为肿瘤诊断和治疗提供了新的靶点。     

miRNA在结直肠癌发生发展过程中的调控机制

内源的功能性非编码小分子RNA-miRNA,在转录后水平调控目的基因的表达,进而参与调节细胞周期、凋亡、分化、发育以及肿瘤发生等多种生物学过程。miRNA能够调节DNA甲基化修饰,并对许多结直肠癌相关重要信号通路具有调控作用。miRNA表达异常会引起WNT、EGFR通路过度激活,TGFβ信号响应缺失,以及p53等抑癌基因的失活,导致结直肠癌发生。miRNA的甲基化修饰及其与靶基因的单核苷酸多态性(SNP)是miRNA调控结直肠癌发生的重要分子机理。本文总结了miRNA在结直肠癌发生发展过程中的调控作用及其分子机制,并初步探讨了miRNA表达异常致使肿瘤发生的影响因素。     

LncRNA与miRNA的交互作用及调控机制对肿瘤发生与发展过程的影响

长链非编码RNA(LncRNA)被作为人类基因组中重要的调控分子之一,通过多种方式发挥其生物学调控功能。研究表明,LncRNA也可作为一种竞争性的内源性RNA与非编码微RNA(miRNA)交互作用,共同参与靶向基因的调控,对肿瘤发生与发展过程产生重要影响。同时,miRNA通过大量蛋白质编码基因靶向调控LncRNA的表达,miRNA和LncRNA在调节细胞过程均有重要作用。该文在分别介绍miRNA与LncRNA功能的基础上,总结miRNA与LncRNA交互作用及调控机制对肿瘤发生与发展过程的影响。     

微RNA在骨肉瘤中的研究进展

微RNA(miRNA)是一类长度为21~23个核苷酸的调控性小RNA分子,通过mRNA剪切和抑制蛋白质翻译两种方式,负性调控其靶基因。miRNA可以调控约50%的蛋白编码基因,并且参与了包括细胞分化、细胞凋亡等在内的多种生理过程。近年来发现,miRNA在肿瘤相关方面发挥重要作用。该文从miRNA在骨肉瘤中的发生发展、侵袭转移、与药物的协同作用及在血液循环当中的应用4个方面予以综述,并对miRNA在骨肉瘤方面的前景进行展望。     

非编码小RNA在肝癌发生中的作用及机制研究进展

MicroRNA(miRNA)是一类约22个核苷酸组成的小分子非编码RNA,主要在转录后水平通过促进靶基因mRNA的降解或抑制其翻译过程而发挥负调控作用.miRNA不但参与生命活动的一些基本过程,如细胞分化、细胞增殖、细胞凋亡和细胞代谢等,而且与人类疾病,尤其与恶性肿瘤的发生发展密切相关,可作为一类新的癌基因及抑癌基因,在癌症的发生发展中起重要作用.近年,我们首次在肝癌染色体变异区内发现新的肝癌转移促进因子miR-151并阐明了其分子作用机制,即RhoGDIA是miR-151下游靶基因,介导了miR-151的促肝癌转移功能;miR-151与其宿主基因FAK协同作用,活化Rac,cdc42及Rho GTPase,进而促进肝癌细胞的迁移、侵袭与转移,为阻断肝癌转移提供了新的治疗靶点.研究发现多个用于肝癌诊断及转移、复发、预后预测的miRNA分子标志物,建立了肝癌诊断、转移、复发及预后的miRNA预测模型;鉴定miR-125b为肝癌侯选抑癌基因,主要通过抑制癌基因LIN28B发挥抑癌作用;发现miR-30d为肝癌转移促进基因,转移抑制基因GNAI2为其功能靶基因;另外,发现miRNA不仅与mRNA的3’非翻译区结合,而且能与基因家族的蛋白编码区结合从而调控基因表达,为研究miRNA在肿瘤中的调控机制提供了新的思路;采用实验方法论证了单个基因能同时被多个miRNA所调控,为建立miRNA与mRNA复杂的相互作用调控网络提供了良好的实验基础.     

MicroRNA与骨肉瘤研究进展

MicroRNA(miRNA)是一类长度为21～23个核苷酸的调控性小RNA分子,通过mRNA剪切和抑制蛋白质翻译两种方式,负性调控其靶基因。miRNA可以调控约50%的蛋白编码基因,并且参与了包括细胞分化、细胞凋亡等在内的多种生理过程。近来的研究表明,miRNA参与多种肿瘤的发生、发展,与人类骨肉瘤的发生、发展以及侵袭转移等密切相关,发挥着癌基因或抑癌基因的作用。该文结合国内外最新报道,对miRNA在骨肉瘤中的研究进展予以综述。     

微小RNA:肿瘤生物学研究的新热点

微小RNA(microRNA,miRNA)是一类碱基长度为19～24 bp的内源性非编码RNA分子,在生命活动中通过识别mRNA的3’-非翻译区抑制其翻译,广泛调控肿瘤相关蛋白的表达,在肿瘤等疾病的发生与发展中扮演重要角色。随着调控的靶基因的不同,miRNA在肿瘤中分别表现为原癌基因和肿瘤抑制基因的作用。miRNA和靶基因之间的关系有着高度的复杂性,而miRNA自身的加工成熟过程也受到多种因素的影响,是系统生物学和生物信息学重要的潜在应用领域。作者就miRNA等有关与肿瘤分子调控和其在肿瘤组织中差异性表达方面的文献报道作一综述。     

MicroRNA在心血管疾病中的研究进展

微小RNA(miRNA)是一类内源性长约22个核苷酸的非编码RNA分子,进化中具有高度保守性,在转录后水平调控基因的表达从而在生物过程中发挥重要的作用,生物信息学分析表明人类全部基因的1/3都受到miRNA的调控。目前的研究表明,miRNA广泛调控机体各种生理和病理过程,在生物体发育、心血管疾病以及肿瘤的发生等过程中发挥重要作用。     

miRNA在人类肿瘤中的研究及治疗进展

microRNA(miRNA)是一类近年来新发现的非编码小RNA分子,通常在转录后水平调控基因表达。成熟miRNA通过与mRNA完全或不完全配对,降解靶mRNA或阻遏其转录后翻译,从而参与调控个体发育、细胞凋亡、增殖及分化等生命活动。实验证据表明,miRNA可通过调控其靶标基因参与的信号通路,影响肿瘤的发生和发展,发挥着类似于癌基因或抑癌基因的功能。本综述主要介绍近年来miRNA与肿瘤的研究及治疗的进展。     

微小RNA与胃癌

胃癌的发生是基因和环境共同作用的结果。微小RNA(miRNA)分子可以调控细胞的增殖、分化和凋亡等过程,并对胃癌的发生、发展发挥重要的调节作用。近年来,miRNA与胃癌的相关性研究不断深入,从miRNA表达谱研究、miRNA与表观遗传相互调控及幽门螺杆菌感染相关miRNA等方面揭示了miRNA在胃癌发生发展中的作用。miRNA在血液中有高稳定性,循环miRNA无创诊断胃癌有着广阔的临床应用前景。     

基于miRNA-mRNA调控网络的鼻咽癌相关分子机制研究

目的 通过构建鼻咽癌微小核糖核酸(miRNA)调控网络筛选与鼻咽癌发病相关的分子标志物.方法 从基因表达数据库(GEO)数据库下载鼻咽癌miRNA芯片数据GSE70970和基因芯片数据GSE12452,利用R软件筛选出差异表达miRNA和mRNA,并对其进行功能富集分析.应用FunRich软件预测差异miRNA的转录因子及靶基因,将靶基因与差异基因取交集获得核心基因,并通过Cytoscape软件构建miRNA-mRNA调控网络.通过Kaplan-Meier plotter数据库对核心基因进行生存分析.结果 一共筛选出47个差异表达miRNA、797个差异表达基因.功能富集分析表明差异表达的miRNA主要参与信号转导、转录调控等过程,差异表达基因主要参与细胞因子受体相互作用、细胞周期、小细胞肺癌等信号通路.靶基因与差异表达基因取交集后筛选出23个核心基因,构建miRNA-mRNA调控网络.生存分析显示其中4个核心基因对鼻咽癌患者的预后有影响,包括多聚磷酸肌醇磷酸酶1(MINPP1)、锌指环指蛋白3(ZNRF3)、纤毛顶结构蛋白(SNTN)、β微管蛋白2A(TUBB2A),其相对应的miRNA分别为hsa-miR-199b-5p、hsa-miR-520e、hsa-miR-107、hsa-miR-421.结论 通过构建miRNA-mRNA调控网络同时结合生存分析,筛选鼻咽癌相关的分子标志物,为鼻咽癌诊断、治疗提供潜在的分子靶点.     

病毒性传染病感染中miRNA的功能及检测

miRNA是一类具有转录后调控基因表达功能的非编码小RNA分子。它调控着人类三分之一的基因表达,是一类非常重要的基因调控分子。近年来有研究发现miRNA在病毒感染机体致病过程中发挥着重要作用。病毒性传染病一直威胁着人类的健康,目前仍有许多病毒性传染病难题未能攻克。miRNA在病毒感染中的重要功能的研究为解决当今的病毒性传染病难题提供了新思路。本文将对miRNA在病毒感染中的相关功能进行总结,并对当前miRNA在病毒性传染病中的潜在应用价值及当前主要的几种miRNA检测技术进行阐述。     

微小RNA在免疫调节中的作用研究进展

微小RNA(miRNA)是一类新发现的内源性非编码RNA分子,能在转录后水平调控基因的表达.研究证实,miRNA在细胞增殖、发育、分化、凋亡、代谢、信号转导以及肿瘤发生中发挥重要的调节作用.近年来,一系列的miRNA已被证实参与了免疫反应调控,如固有性免疫应答,T、B淋巴细胞的分化,病原体感染与免疫及炎症的免疫调控等.文中就miRNA在固有性与获得性免疫应答中的调控作用作一综述.     

miR-143及miR-145在肿瘤患者中表达的研究进展

<正>microRNA即miRNA是一类由内源基因编码的非编码单链RNA分子,长度为18～25nt,它能在转录后水平抑制靶基因的表达或翻译。1993年,Lee等在秀丽新小杆线虫中发现了第一个miRNA即lin-4,2000年Reinhart等在线虫发育调控研究中发现了let-7,从而拉开了miRNA研究的序幕。至今提     

主动脉瓣钙化患者基因表达与microRNA调控研究

目的 通过microRNA (miRNA)-基因表达的联合分析,寻找主动脉瓣钙化(calcific aortic valve disease, CAVD)的关键基因、分子通路和miRNA,寻找潜在的疾病发生机制。方法 本研究在GEO数据库上挖掘了CAVD相关的基因表达及miRNA数据,筛选差异基因与miRNA。对差异表达的基因进行生物学过程与分子通路的聚类分析,并且分析了miRNA-基因调控网络。结果 CAVD患者的上调基因主要聚类到对外界刺激的反应、生物高分子代谢、免疫细胞激活上,而下调基因则集中在对外界刺激的反应、心肌细胞发育、离子稳态上。另外,多种CAVD病因的相关基因均有部分差异表达。同时,110个miRNA表达发生显著差异。在下调miRNA-上调基因模式中,找到了可调控HLA-DRB1和HLA-DRB5的3个miRNA以及5个可调控VCAM1的miRNA。上调miRNA-下调基因中,HAND2与hsa-miR-6081、ACTC1与hsa-miR-4793-5p存在相互作用。结论细胞对压力与外界刺激的应答过程发生紊乱、免疫反应的增强与心肌细胞发育相关基因的下调参与了CAVD的发生。而hsa-miR-1250-3p等10种miRNA的调控可能是CAVD发生的原因之一。     

MicroRNA在乳腺肿瘤诊治和预后中的研究进展

微小核糖核酸(miRNA)是近年来发现的一类由内源基因编码的参与基因转录后水平调控的长度约为22个核苷酸的小RNA分子,在生物体内参与胚胎发育、细胞增殖等重要生命进程,调控细胞的分化、生长和凋亡,间接发挥促进与抑制癌症的作用。最近有研究表明,miRNA作为医学生物领域中重要的肿瘤分子标志物,在乳腺癌的发生、发展进程中发挥着重要作用。该文对miRNA在乳腺癌的诊断、治疗、预后等方面的相关研究进展予以综述。     

基于生物信息学探讨骨关节炎miRNA-mRNA调控网络及其作用机制

目的: 基于生物信息学探讨骨关节炎miRNA mRMA调控网络的作用机制并筛选Hub基因,分析其在骨关节炎中的分子调控机制。方法: 通过GEO数据库获取骨关节炎的miRNA芯片数据集(GSE105027)和mRNA芯片数据集(GSE55235),分析两者的差异表达基因。利用FunRich软件预测差异表达miRNAs的转录因子、功能富集分析及其靶基因预测,再将预测的靶基因与差异表达mRNAs进行交叉匹配,获得miRNA mRNA调控网络。然后利用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络,并筛选出Hub基因。最后利用R语言分析Hub基因的主要生物功能与相关信号通路。结果: ① 筛选得到265个miRNAs和838个mRNAs存在差异表达。② 对265个miRNAs进行预测共得到203个转录因子,其中早期生长反应因子1（EGR1）差异最显著。富集分析显示miRNAs主要涉及核碱基、核苷、核苷酸和核酸代谢的调控,调节细胞生长,转录等过程。③ 共预测到3 572个靶基因,依据miRNA和mRNA的负调节关系,筛选出交叉表达负调控的mRNAs 96个、miRNAs 25个。④ 原癌基因Jun(JUN)、原癌基因Fos（FOS）、白介素6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）、白介素1β（IL-1β）、趋化因子CXCL8（CXCL8）为蛋白互作网络中的Hub基因。⑤ 富集分析主要涵盖对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应、DNA结合转录因子活性的调节等生物学过程,涉及IL-17、Toll样受体、AGE RAGE、TNF和NOD样受体信号通路。结论: 成功筛选并构建了骨关节炎的miRNA-mRNA调控网络,在一定程度上阐明了miRNA及其靶基因在骨关节炎发生和发展中的分子调控机制。     

基于生物信息学分析的子宫内膜异位症miRNA-mRNA调控网络的初步构建*

目的 用生物信息学分析方法初步构建子宫内膜异位症miRNA-mRNA的调控网络,探索其在子宫内膜异位症中的分子调控机制。方法 从GEO下载数据集GSE7305,使用R语言软件对其进行差异表达基因分析。使用DAVID在线网站对获得的差异表达基因进行基因功能和KEGG信号通路富集分析。通过HMDD v3.0精准查询与子宫内膜异位症相关且经过验证（≥2次）的miRNA,并使用miRwalk 2.0数据库预测其靶基因。将预测的靶基因和GSE7305中的差异表达基因求得交集,获得miRNA和mRNA相互作用关系对。在Cytoscape v3.6.1中绘制miRNA-mRNA调控网络图,并运用CytoHubba插件进行核心mRNA及miRNA的筛选,构建相应的子网络。结果 从GSE7305中共获得655个差异表达基因,其主要富集于补体信号通路、p53信号通路、细胞黏附相关信号通路中。成功构建子宫内膜异位症miRNA-mRNA分子调控网络,并筛选出核心mRNA和miRNA： hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-141-3p、hsa-miR-200b-3p、hsa-miR-449b-3p属于高频下调表达的miRNA,且均可靶向作用于GATA6;高频上调表达的hsa-miR-125-5p可同时作用于PGR、ESR1,并下调两者表达水平。结论 通过基因芯片分析和数据库挖掘方法构建miRNA-mRNA调控网络,为研究子宫内膜异位症发病机制、探索联合miRNA及其靶基因作为临床诊断标志物提供可靠的研究方向。     

高尿酸血症患者外周血miRNA表达谱的分析及ceRNA网络构建

目的:探讨高尿酸血症(HUA)患者外周血miRNA表达谱及ceRNA网络构建。方法:对5例HUA患者及5名体检健康者外周血单个核细胞miRNA表达水平进行检测并测序,筛选出差异表达的miRNA分子。利用miRwalk、miRBD、miRTarBase和targetscan数据库预测miRNA的靶基因;circbank数据库预测circRNA-miRNA的靶向结合关系。通过DAVID和Metascape数据库对靶基因的基因功能和通路富集分析。利用Cytoscape构建主要信号通路的circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果:在HUA患者与体检健康者中,共发现47种已知miRNA和4种新miRNA差异表达,其中已知差异表达miRNA有25种上调,22种下调。差异表达miRNA的靶基因主要富集在癌症和细胞衰老相关信号通路。基于ceRNA理论构建的癌症相关信号通路circRNA-miRNA-mRNA调控网络,涉及96个circRNA节点、13个miRNA节点及212个mRNA节点。结论:HUA患者外周血miRNA表达谱与健康体检者存在差异,且差异表达miRNA靶基因与癌症的发生发展密切...     

微小RNA与肿瘤相关性研究

微小(microRNA,miRNA)是一种内源性的类似于siRNA的小RNA分子,由高等真核生物基因组编码、非编码蛋白,长度大约为22个核苷酸RNA片段,通过核酸序列的互补性结合到特定的靶mRNA上,并调节、翻译或降解靶mRNA来调控基因表达。近年来,miRNA作为生物体重要的基因调控分子与疾病的关系尤其是与肿瘤的关系备受关注。现就miRNA与肿瘤相关性作一综述。