丝组二肽对DNA的切割作用的研究

近20年来,人工核酸切割试剂的研究一直是生物化学中最为活跃的前沿领域之一,研究人工核酸切割试剂的主要目的是合成定点切割试剂,后者是一种重要的分子生物学工具,在疾病的基团治疗、反义PCR技术等领域中有着重要的应用价值。此外,人工核酸切割试剂还可以在足迹技术和核酸高级结构的研究中用作高分辨率的化学探针。     

新型的DNA切割试剂制备与应用

将具有DNA选择性识别的小分子与具有DNA切割活性的小分子缀合,合成对DNA具有定点切割效果的试剂是化学生物学研究领域具有挑战性的研究之一,它为化学、药学和生物学在生命科学中的相互渗透开辟了又一个广阔的空间.设计了具有切割系统和识别系统的定点切割试剂,识别系统由寡聚酰胺组成,含有N-甲基吡咯的寡聚酰胺能够穿透细胞膜与特定的碱基序列高亲和力地结合,并控制基因表达,是一类十分重要的化学物质;切割系统由大环多胺和它的金属配合物构成,大环多胺的金属配合物可作为仿酶催化剂.化合物1的锌配合物对pBR322DNA的切割见下图,此结果为进一步研究DNA特异识别及切割分子提供一个良好的基础.     

丝组二肽所含基团在其切割DNA反应中的作用

近 2 0年来 ,人工核酸切割试剂的研究一直是化学、生物化学和分子生物学中最为活跃的前沿领域之一[1,2 ] .人工核酸切割试剂可以在足迹技术和核酸高级结构的研究中用作高分辨率的化学探针 ,还可以用于合成定点切割试剂[3] .后者又被称为人工工具酶 ,是一种非常重要的分子生物学工具 ,在疾病的基因治疗、反义 PCR技术等领域中都具有重要的应用 .人工核酸切割试剂的切割机理主要有自由基机理和磷酸酯水解机理两大类 .相对于自由基机理 ,水解机理具有许多优点 ,使得水解型切割试剂具有更为广泛的应用 .对于 DNA,目前文献报道的水解型人工切…     

大环配合物在核酸切割中的应用

核酸切割试剂的研究是化学和分子生物学中最为活跃的前沿领域之一.研究核酸切割试剂,不仅是因为对核酸酶催化机理进行深入了解之需,同时还因为人工核酸酶在基因治疗中有着诱人的前景.大环配合物的合成、结构及其对核酸的切割作用已有广泛的文献报道.本文综述了作为重要的核酸切割试剂的大环多胺配合物和氮杂冠醚配合物对核酸的切割作用及其规律性,并展望了今后的发展与应用方向.     

金属配合物-寡聚核苷酸定位断裂剂研究进展

核酸切割试剂与寡聚核苷酸(ODN)偶联制得的人工核酸酶能在特定位点断裂DNA或RNA,为人工核酸酶的分子设计提供了一种新方法.本文综述了金属配合物-ODN识别切割试剂的偶联方式及其与靶分子的作用机制,并指出了今后的研究方向.     

(E)-2-乙氧基乙基-2-氰基-3-((4-(2,4-二氟苯氧基)苄基)氨基)-3-甲氧基丙烯酸酯对超螺旋质粒DNA的特异性切割(英文）

研究了一种新型丙烯酸酯 (E)-2-乙氧基乙基-2-氰基-3-((4-(2,4-二氟苯氧基)苄基)氨基)-3-甲氧基丙烯酸酯(MAZ)对超螺旋pUC19 DNA的定点切割作用。利用紫外吸收、荧光光谱、凝胶电泳和DNA测序技术研究其核酸切割特异性。紫外吸收光谱的红移和减色效应,以及静态荧光淬灭表明MAZ与DNA的作用属于典型的插入模式。不仅如此,凝胶电泳条带的变化以及DNA测序结果表明DNA的定点切割是通过DNA双链的分步水解完成。     

(E)-2-氰基-3-[4-(2,4-二氟苯氧基)-苄氨基]-3-甲氧基-丙烯酸2-乙氧基乙酯对超螺旋质粒DNA的特异性切割（英文）

研究了一种新型丙烯酸酯(E)-2-氰基-3-[4-(2,4-二氟苯氧基)-苄氨基]-3-甲氧基-丙烯酸2-乙氧基乙酯(MAE)对超螺旋pUC19 DNA的定点切割作用。利用紫外吸收、荧光光谱、凝胶电泳和DNA测序技术研究其核酸切割特异性。紫外吸收光谱的红移和减色效应,以及静态荧光猝灭表明MAE与DNA的作用属于典型的插入模式。不仅如此,凝胶电泳条带的变化以及DNA测序结果表明DNA的定点切割是通过DNA双链的分步水解完成。     

三螺旋脱氧核糖核酸的研究进展

阐述了三螺旋DNA的发展和最新动态,并从3个方面展开评述：(1)三螺旋DNA稳定性的研究。三螺旋DNA的稳定性不仅取决于寡聚核苷酸的内在结构,还受外界环境如溶液的pH值、阳离子的种类和价态、DNA分子嵌入试剂和共聚物等的影响;(2)三螺旋DNA的应用。三螺旋DNA的形成为基因操纵和基因疗法提供了新方法,它在抑制DNA转录、复制、基因定点诱变、定点切割和诱导基因重组等方面有重要的应用前景;(3)三螺旋DNA的检测方法,包括紫外-可见吸收光谱法、荧光分析法、原子力显微术和顺磁共振谱等。     

两亲性大环多胺La(Ⅲ)配合物的合成、表征及催化质粒DNA水解的研究

近年来,人工核酸切割试剂的研究一直是化学生物学、生物化学和分子生物学中最为活跃的前沿领域之一.     

ESI-MS离子阱中氮杂环多胺缀合物的分子离子反应

天然抗生素纺锤菌素(Netropsin)和偏端酶素(Distamycin)能够特异性地结合DNA双螺旋分子,这类聚酰胺同时具有多胺和氮杂环酰胺的结构[1],另外有实验证明天然多胺及多胺酰胺能够与细胞内带负电荷的组分如DNA分子结合,并可以调节其生物功能[2].合成并研究氮-杂环/多胺缀合物的结构和性质可以为合成定点切割试剂提供基础.电喷雾质谱作为一种快捷、简单的结构鉴定仪器,其质量分析器-离子阱处于高真空状态,在检测过程中氮-杂环/多胺缀合物易于发生分子离子反应.     

喜树碱类抗肿瘤药物作用模式的柔性分子对接研究

研究采用柔性分子对接技术，将15个喜树碱类化合物对接到拓扑异构酶I (Topo I)-DNA切割复合物中，从原子水平和分子力场角度阐明了喜树碱类抗肿瘤药 物与DNA，Topo I的相互作用机制。研究发现，喜树碱分子插入Topp I-DNA复合物 的切割位点，并与Asn722，Asp533，Lys532和Lys720形成氢键作用网络。定量构效 关系研究进一步表明喜树碱分子可以与Topo I-DNA切割复合物形成电荷迁移作用。 该对接模型系统解释了喜树碱类化合物的构效关系、定点突变等诸多实验事实，为 下一步设计、合成新型高效的喜树碱类衍生物打下了坚实基础。     

铜离子多核配合物切割DNA的研究

核酸的断裂与基因的重组技术是分子生物学与基因工程的核心技术,因而研究人工合成的定点切割核酸的切割剂,即核酸的"分子剪刀"在理论与应用上都具有十分重要的意义.目前在人工核酸切割剂的研究中,金属配合物占了很大的比重,由于自然界中许多与核酸有关的天然酶的活性部位,含有两个或多个相互协同作用的金属离子.     

微波辅助切割胸腺五肽树脂

采用美国CEM公司MARS 5型微波反应系统,微波辐射下切割胸腺五肽树脂,以HPLC定量,研究了微波辐射下切割试剂、反应时间和反应温度对胸腺五肽产率的影响,探讨了微波作用的机理,并用质谱、核磁共振测试技术对产物进行了表征. 结果表明,微波辐射下以V(TFA):V(H2 O):V(TIS)=95:2.5:2.5为切割试剂,50 ℃下反应5 min,胸腺五肽产率达到最高,为93.2%. 与常规方法相比,反应速率和胸腺五肽产率分别提高24倍和21.8%,降低了副反应的发生及多肽的制备成本.     

特异识别和切割DNA的过渡金属配合物

利用过渡金属配合物及其载体衍生物识别和切割ＤＮＡ是近十年来发展起来的新型分子生物学和基因工程工具试剂。作为ＤＮＡ构象变化的探讨，ＤＮＡ－蛋白质相互作用分析的足迹试，或基因组和染色体作图和测试的工具试剂已受到了广泛极大重视。     

特异切割点突变癌基因转录物的核酶设计与克隆

按“锤头结构”模型设计、合成,并筛选到了针对活化癌基因T24-ras第十二位密码子G→T点突变的核酶克隆。在镁离子存在条件下,该核酶能选择定点切割T24-ras转录物而对正常C-Ha-ras转录物不起任何破坏作用;在接近生理环境及C-Ha-ras与T24-ras mRNA同时存在条件下,该核酶仍能有效选择性切割突变基因产物。这为利用核酶技术治疗因基因突变引起的机体病变提供了现实的可能性。     

两亲性大环多胺La(III)配合物的合成、表征及催化质粒DNA水解的研究

近年来,人工核酸切割试剂的研究一直是化学生物学、生物化学和分子生物学中最为活跃的前沿领域之一。最近的研究结果表明大环多胺金属配合物在磷酸二酯水解方面表现出独特的催化性能,能作为化学核酸酶有效的催化DNA和RNA的磷酸二酯键的水解[1-2]。尤其是电荷较高的金属阳离子形     

胡蜂蜂毒肽的固相合成

采用Fmoc固相合成策略,合成了胡蜂蜂毒肽(COOH-Ile-Asn-Leu-Lys-Ala-Leu-Ala-Ala-Leu-Ala-Lys-Lys-Ile-Leu-NH₂)。以Wang树脂为载体,HBTU-HOBt为缩合剂,按照其氨基酸序列依次缩合,最终用切割试剂将其从树脂上切割下来,得到粗肽,经RP-HPLC纯化得到目标肽,纯度97.6%。经HR-MS（EI）分析,确定产物为胡蜂蜂毒肽。     

氨苯基卟啉化合物的合成

卟啉化合物大多对光敏感,被用于很多生理过程的模型研究。 我们合成了6个氨苯基卟啉化合物,其中5个是新化合物。它们的结构分别取得了质谱、核磁、红外、紫外、元素分析的确证,见表1。用推出切割柱层析分离卟啉混合物取得了省时、省试剂、分离纯度好的效果。     

小示波图及其应用

提出了小示波图的概念, 建立了基于小示波图的示波计时电位法. 在以汞电极为工作电极的示波计时电位法中, 采用端点去极剂切割经典示波计时电位图后形成的小示波计时电位图(简称为小示波图). 根据切割经典示波图所用的端点试剂不同, 将小示波图分为三种类型. 推导了小示波图的理论公式, 提出了小示波图的调节方法, 并将其用于几种物质的定量测定. 研究表明, 利用小示波图不仅能使在经典示波图端点附近不易准确测定的物质得以测定, 还可以在宽广的电位窗口内灵活、稳定、灵敏、高选择性地进行示波测定. 因此, 小示波图示波测定法是对经典示波测定法的一个重要的补充和发展.     

用铍试剂Ⅲ光度法测定钒

偶氮类化合物是钒的重要显色试剂,但是用铍试剂Ⅲ光度测定钒的方法尚未见报导。作者在研究钛的铍试剂Ⅲ多元络合物时发现,钒和铍试剂Ⅲ的反应灵敏,而且络合物形成后加入EGTA对吸光度无影响。本文对这一反应作了进一步研究,并拟定了铁矿石中钒的测定方法,获得了良好的结果。