代谢酶基因多态性与环境暴露交互作用的分析方法及其应用

目的 以肿瘤易感基因谷胱苷肽-S转硫酶（GST）M1缺失基因型为例,说明基因与环境暴露交互作用的分析方法以及应用。方法 采用社区为基础的病例对照研究方法,代谢酶基因多态性的检测用PCR技术,资料分析用多因素logistic回归模型。研究对象为1997年1月至1998年12月经扬中市人民医院确诊,肠型胃癌病例112例,以同期该地无上消化道肿瘤“健康”人群为对照,共675例。结果 调整混杂因素后,GST M1缺失基因型与既往吸烟史的交互作用系数为3.38,OReg值达8.40,有极显著意义,为4型交互作用中的超相乘模型;GST M1缺失基因型与吸烟量的交互作用呈高暴露-基因效应,交互作用系数分别为0.995、2.085和2.157,即随着暴露剂量增加,交互作用强度也逐渐增加;与饮酒量呈低暴露-基因效应,交互作用系数分别为1.01和0.97,交互作用强度随暴露剂量增加而逐渐降低。结论 基于logistic模型的分析方法,可用于评价基因-环境之间的交互作用,以及剂量反应关系的暴露基因效应。     

CYP2E1基因多态性与环境因素在胃癌发生中的交互作用

目的探讨CYP2E1基因多态性与环境因素在胃癌发生中的交互作用.方法采用1:1配对病例-对照研究方法,2003-2004年对南京地区121例原发性胃癌病例进行环境危险因素调查,并对CYP2E1基因多态性进行分析,筛选胃癌发生的环境及遗传危险因素,根据交互作用系数(γ,γ=βeg/βe)判断交互作用存在与否以及不同的基因-环境作用类型.结果CYP2E1 RsaⅠ基因多态性与消化系统疾病家族史、吸烟、食用腌制食品、三餐不定时等4项环境危险因素间存在一定的交互作用,交互作用系数分别为1.855、2.626、1.736、1.714;CYP2E1 RsaⅠ基因多态性与食用腌制食品及三餐不定时间的交互作用分别呈现低暴露-基因效应(low exposure-gene effect,LEG效应)、高暴露-基因效应(high exposure-gene effect,HEG效应).结论胃癌的发生是环境及遗传危险因素综合作用的结果.CYP2E1基因多态性与环境危险因素的暴露在胃癌发生中存在一定的交互作用.     

体内有机氯农药残留水平与CYP1A1、GSTMl、GSTT1基因多态性的交互作用对女性乳腺癌发病的影响

[目的]探讨体内有机氯农药残留水平与CYP1A1、GSTM1、GSTT1基因多态性的交互作用对女性乳腺癌发病的影响. [方法]用1:1配比的病例对照研究方法,自2006年9月～2007年10月收集女性乳腺癌病例及对照共70对.采用气相色谱法(GB/TS009.19-2003)检测血清中有机氯农药残留水平,用聚合酶链反应(PCR)检测细胞色素P4501A1 Msp Ⅰ(CYP1A1 Msp Ⅰ)、谷胱甘肽S-转移酶M1(GSTM1)和谷胱甘肽S-转移酶T1(GSTT1)3个位点的基因多态性.[结果]携带CYP1A1 MspⅠ突变等位基因与有机氧农药(HCH/DDT)高残留存在交互作用,交互作用系数γ分别为1.558和8.491;携带GSTT1缺失型基因与DDT高残留存在交互作用,交互作用系数γ为1.726. [结论]CYP1A1 MapⅠ突变基因型、GSTT1缺失基因型对有机氯农药的残留效应有放大作用.     

5种基因与某些环境因素在肺癌发生中交互作用的单纯病例研究

[目的]研究环境暴露因素与基因多态性对肺癌发生危险性的影响。[方法]对227例原发性肺癌病人进行单纯病例研究,应用Logistic回归对CYP1A1、mEH、NAT2、NQO1、XRCC3基因多态性与多种环境危险因素之间的交互作用进行了分析。[结果]吸烟指数超过20包年者携带CYP1A1至少一个MspⅠ突变等位基因的基因型的频率高于不吸烟者(OR=1.55,95%CI=1.15~2.09;ORadj=1.39,95%CIadj=0.94~2.07)。NAT2慢代谢基因型与烹饪时厨房充满油烟味存在一定交互作用(OR=1.96,95%CI=0.95~4.07;ORadj=2.15,95%CIadj=1.01~4.57)。未发现其它代谢酶和修复酶基因与环境因素之间存在明显交互作用。[结论]携带CYP1A1MspⅠ易感基因型同时吸烟指数超过20包年,NAT2慢代谢基因型同时长期油烟暴露可能增加肺癌发生的危险性。今后应加大样本含量,进行多基因与环境因素之间的联合作用分析。     

有机氯农药、CYP1A1易感基因型与乳腺癌的交互作用研究

[目的]分析血清有机氯农药水平与雌激素代谢基因CYP1A1易感基因型对乳腺癌患病风险的联合作用.[方法]采用成组病例对照研究方法,序贯收集乳腺癌确诊病例共102名,健康社区女性对照154名.采用气相色谱-电子捕获的方法(GC-ECD)检测血清中β-HCH,p,p'-DDT,和p,p'-DDE水平.用限制性内切酶PCR法(RFLPPCR)法检测CYP1A1基因型的m1突变型.采用logistic回归模型分析CYP1A1突变基因型对乳腺癌患病风险的相对危险度(OR),并计算交互作用系数γ.[结果]总病例对照中,CYP1A1 m1突变纯合型(v/v)的调整OR=3.26, 95%C.I.为1.12～9.53.携带CYP1A1 m1突变等位基因(wv vv)与有机氯农药(p,p'-DDT,β-HCH)高暴露的交互作用系数γ分别为8.86和8.47;绝经前女性中,上述交互作用系数γ分别为2.94和1.42.[结论]DDT及HCH可能是乳腺癌的危险因素,雌激素代谢相关的酶在其中起到协同促癌作用.     

CYP2E1、GSTT1基因多态性与胃癌易感性的关系

目的 探讨CYP2El、GSTTl基因多态性与胃癌遗传易感性的可能关系。方法 运用病例—对照分子流行病学研究方法和聚合酶链反应技术对胃癌病例组和正常对照组基因组DNA进行CYP2El、GSTTl基因分型。结果 RsaI酶切的CYP2El各基因型在胃癌病例组与对照组间的分布频率分别为A(c1/c1)型71．1％、52．2％，B(c1/c2)型24．4％、43．3％，C(c2／c2)型4．4％、4．4％，分布差异有显著性(X^2＝7．34，P＝0．025)，A型基因使胃癌发生的危险性增加(OR＝2．25，95％CI＝1．16-4．37)；cl等位基因在病例中的分布频率为83．3％，显著高于对照(73．9％)(X^2＝4．77，P＝0．028)。胃癌组GSTTl空白基因型(null)频率(60．0％)显著高于对照(43．3％，X^2＝5．0l，P＝0．025)，GSTTl基因缺失增加胃癌发生的危险性(OR＝1．96，95％口为1．04-3．71)。按GSTTl基因存在与否分层分析发现，当GSTTl基因存在时，CYP2El基因多态性与胃癌发生未见显著关联，而在GSTTl基因缺失组，CYP2ElA(c1/c1)基因型者发生胃癌的危险性显著增加。CYP2ElA(cl/c1)且GSTTl(null)型个体患胃癌的危险性是CYP2ElB(cl/c2)亿(c2/c2)且GSTTl(nonnull)个体的3．7l倍(95％CI＝1．54—8．94)。结论CYP2El、GSTTl基因多态性与胃癌的遗传易感性有关联，CYP2ElRsaI酶切A基因型是胃癌的易感基因型，GSTTl基因缺失使胃癌的易感性增加，CYP2El、GSTTl两基因间存在交互作用。     

蒙古族高血压肾素基因多态性与环境因素作用

目的 探讨肾素基因插入/缺失(REN基因I/D)多态性与环境因素相互作用对蒙古族人群高血压的影响.方法 以蒙古族人群中无血缘关系的501人(高血压者243人,正常血压者258人)为研究对象,进行有关环境因素的调查并采集血样,对REN基因I/D多态性采用PCR技术结合凝胶电泳和银染方法进行基因分型.结果 高血压组REN基因I/D多态性的DD基因型、D等位基因频率(36.21%,63.79%)高于对照组(29.84%,57.17%),差异均有统计学意义(P<0.05).REN基因(DD ID)基因型 吸烟的OReg为Ⅱ基因型 不吸烟的1.70倍(95%CI=0.69～4.48),REN基因、吸烟2个因素之间具有正相乘模型交互作用;REN基因(DD ID)基因型 饮酒的OReg为Ⅱ基因型 不饮酒的3.20倍(95%CI=1.42～7.61),REN基因、饮酒两因素之间具有负相乘模型交互作用.结论 REN基因(DD ID)基因型与吸烟或饮酒同时存在时可增加患高血压的危险性.     

CYP1A1及GSTP1基因多态性与肺癌易感性关系

目的 探讨细胞色素P4501 A1(CYP1A1) Exon7和谷胱甘肽硫转移酶P1(GSTPI) Ile105 Val基因多态性与内蒙古地区汉族人群肺癌易感性关系.方法 采用等位基因特异性扩增法分析216例汉族对照人群和116例肺癌患者CYP1A1 Exon7和GSTP1 Ile105 Val基因多态性.结果 携带CYP1A1 Exon7突变杂合型和纯合型的个体患肺癌的危险均升高(OR值分别为1.460和1.593),而携带GSTP1 Ile105 Val突变杂合型和纯合型的个体患肺癌的风险均降低(OR值分别为0.970和0.602);CYP1 A1 Exon7和GSTP1 Ile105 Val基因在肺癌易感性方面无协同作用;CYP1A1 Exon7与吸烟有协同作用(OR=2.637,95％ CI=1.056～6.530,P=0.032),GSTP1 Ile105Val与吸烟无协同作用.结论 CYP1 A1 Exon7突变基因型为肺癌的可疑易感因素,CYP1A1 Exon7突变基因型和吸烟对肺癌易感有协同作用,GSTP1 Ile105Val突变基因型可降低肺癌易感性.     

体内有机氯农药残留水平与CYP1A1、GSTM1、GSTT1基因多态性的交互作用对女性乳腺癌发病的影响

[目的]探讨体内有机氯农药残留水平与CYP1A1、GSTM1、GSTT1基因多态性的交互作用对女性乳腺癌发病的影响。[方法]用1︰1配比的病例对照研究方法,自2006年9月～2007年10月收集女性乳腺癌病例及对照共70对。采用气相色谱法(GB/T5009.19-2003)检测血清中有机氯农药残留水平,用聚合酶链反应(PCR)检测细胞色素P4501A1Msp I(CYP1A1Msp I)、谷胱甘肽S-转移酶M1(GSTM1)和谷胱甘肽S-转移酶T1(GSTT1)3个位点的基因多态性。[结果]携带CYP1A1Msp I突变等位基因与有机氯农药(HCH/DDT)高残留存在交互作用,交互作用系数γ分别为1.558和8.491;携带GSTT1缺失型基因与DDT高残留存在交互作用,交互作用系数γ为1.726。[结论]CYP1A1Msp I突变基因型、GSTT1缺失基因型对有机氯农药的残留效应有放大作用。     

亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与胃癌易感性的关系

[目的]探讨亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性与胃癌易感性的关系及与环境因素的交互作用。[方法]收集南京市原发性胃癌患者169例,采用1:1病例-对照研究方法随机选取非消化系统疾病、非肿瘤病人为对照,进行流行病学调查,取外周血,采用限制性片段长度多态性方法(PCR-RFLP)分析研究对象MTHFR1298位点的多态性,并分析MTHFR1298基因多态性与烟酒嗜好在胃癌发生中的交互作用。[结果]MTHFR1298C等位基因在病例组与对照组中的频率分别为21.6%和13.0%,差异具有显著性(χ2=8.693,P=0.003,OR=1.841,95%CI=1.223~2.772)。携带MTHFR1298A/C基因型者患胃癌危险性增高(χ2=10.994,P=0.001,OR=2.160,95%CI=1.365~3.419),携带A/C基因型同时又吸烟者患胃癌的危险性是A/A型不吸烟者的3.289倍(χ2=10.002,P=0.002,95%CI=1.573~6.880),携带A/C基因型不饮酒者患胃癌的危险性是携带A/A基因型不饮酒者的2.726倍(χ2=12.459,P<0.001,95%CI=1.562~4.758),同时携带A/C基因型、吸烟、饮酒者患胃癌的危险性是携带A/A基因型、不吸烟、不饮酒者的2.394倍(χ2=3.933,P=0.047,95%CI=1.010~5.672)。[结论]MTHFR1298A/C基因型可增加胃癌易感性,并与吸烟、饮酒间存在交互作用。     

Utility of the ESSENCE Surveillance System in Monitoring the H1N1 Outbreak

The Electronic Surveillance System for the Early Notification of Community-Based Epidemics (ESSENCE) enables health care practitioners to detect and monitor health indicators of public health importance. ESSENCE is used by public health departments in the National Capital Region (NCR); a cross-jurisdictional data sharing agreement has allowed cooperative health information sharing in the region since 2004. Emergency department visits for influenza-like illness (ILI) in the NCR from 2008 are compared to those of 2009. Important differences in the rates, timing, and demographic composition of ILI visits were found. By monitoring a regional surveillance system, public health practitioners had an increased ability to understand the magnitude and character of different ILI outbreaks. This increased ability provided crucial community-level information on which to base response and control measures for the novel 2009 H1N1 influenza outbreak. This report underscores the utility of automated surveillance systems in monitoring community-based outbreaks. There are several limitations in this study that are inherent with syndrome-based surveillance, including utilizing chief complaints versus confirmed laboratory data, discerning real disease versus those healthcare-seeking behaviors driven by panic, and reliance on visit counts versus visit rates.     

硫酸基转移酶SULT1E1、SULT1A1基因多态性与子宫平滑肌瘤易感性的关联研究

目的:探讨硫酸基转移酶SULT1E1、SULT1A1基因多态性对子宫平滑肌瘤易感性的影响。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析法检测子宫平滑肌瘤组和对照组SULT1E1基因rs3736599位点、SULT1A1基因rs9282861位点的多态性情况。结果:①病例组和对照组SULT1E1 rs3736599位点基因型分布差异有统计学意义(P=0.032),携带突变A等位基因(基因型为A/A和A/G)女性发生子宫平滑肌瘤的风险是野生型纯合子G/G女性的3.497倍(P=0.034,OR=3.497,95%CI:1.12～10.91)。②病例组和对照组SULT1A1 rs9282861位点基因型分布差异无统计学意义。结论:硫酸基转移酶SULT1E1基因rs3736599多态性可能与子宫平滑肌瘤易感性相关,携带突变A等位基因可能是子宫平滑肌瘤的危险因素。     

RD1/ESX-1分泌系统与结核分枝杆菌的毒力和致病性

结核分枝杆菌(MTB)全基因序列测定的完成和比较基因组学的发展,使得对MTB毒力和致病机制的认识不断深入,近年发现RDI区在MTB的致病机制中充当重要角色,而RDI区编码的ESX-1蛋白组成的分泌转运系统与MTB的毒力关系密切.此文主要从MTB RD1/ESX-1蛋白分泌转运系统对ESAT-6/CFP-10分泌输出的影响,探讨其与MTB的毒力和致病机制的关系.     

Enterostatin up-regulates the expression of the β-subunit of F1Fo-ATPase in the plasma membrane of INS-1 cells

Abstract

Exposure to high-fat diet easily promotes overeating while at the same time disrupting insulin secretion and islet function. Enterostatin is a peptide which is secreted from the pancreas in response to high-fat feeding and has been shown to inhibit fat intake as well as insulin secretion in experimental animal models. Until recently, there was no known receptor for enterostatin. In 2002, Berger and co-workers found enterostatin to target the β-subunit of the F₁-ATPase in rat brain membranes as well as in a clonal β-cell line (INS-1). In this study, we found the β-subunit of F₁-ATPase to be ectopically expressed in the plasma membrane of INS-1 cells using both immunohistochemistry and Western blotting. Incubation with enterostatin for 60 min resulted in a 3.5-fold increase of the protein expression of the β-subunit of F₁-ATPase in the plasma membrane. Furthermore, we found ATP to be able to displace the binding of enterostatin to purified bovine F₁-ATPase. This reported targeting of enterostatin to the β-subunit of F₁-ATPase in insulin cells may provide a link between high-fat intake and islet function.     

2000-2007年佛山市甲1亚型(H1N1)流感病毒监测情况及其HA1基因的变异

目的分析2000-2007年佛山市甲1亚型(H1N1)毒株流行情况及其HA1基因变异情况。方法用MDCK细胞分离流感病毒,采用血球凝集抑制试验进行型别鉴定,选取每年2~4株甲1亚型毒株的细胞培养物提取病毒核酸,进行HA1基因的逆转录,对其核苷酸和氨基酸序列及亲缘关系进行分析。结果病毒分离结果显示2000-2007年间甲1亚型流感病毒在佛山市人群中的流行是间断性的,只在2000、2001、2005、2006年4个年份分离到甲1亚型流感毒株。毒株的HA1区氨基酸序列与流感疫苗推荐株A/New Caledonia/20/99和A/Solomon Islands/3/2006相比,同源性分别为97.2%~99.7%和97.2%~98.5%。氨基酸残基平均替换数随年份的推移而增加,只有2006年的毒株在抗原决定簇发生了替换。结论与疫苗株比较,佛山市的甲1亚型流感毒株抗原性已逐渐发生了改变,应密切注意疫苗对毒株的免疫效果。     

DNA修复基因hOGG1多态性与HIV-1易感性的关系研究

目的探讨我国汉族人群中8-羟基鸟嘌呤糖苷酶1（hOGGl）基因Ser326Cys多态性与HIV感染间的关系。方法采用病例-对照的流行病学方法,运用PCR-限制性片段多态（restriction fragment length polymorphism,RFLP）技术,对126例HIV血清学阴性者和154例HIV血清学阳性者hOGG1基因第326位点Ser／Cys多态性进行分析,并比较hOGG1不同基因型与HIV感染间的关系。结果HIV血清学阴性组中3种基因型频率分布与现报道的中国汉族人群结果相近,其Ser／Ser、Ser／Cys和Cys／Cys基因型分布频率分别为20．6％,46．8％和32．5％,HIv血清学阳性组分别为16．2％,51．9％和31．8％,两组间差异无统计学意义（χ^2=1．12,P〉0．05）。HIV血清学阳性组人群中,合并HCV感染者与未合并HCV感染者Ser／Ser、Ser／Cys和Cys／Cys基因型频率分别为：HCV阳性组20．0％、48．9％和31．1％;HCV阴性组14．7％、53．2％和32．1％,两组间差异无统计学意义（χ^2=0．68,P〉0．05）。结论本研究未发现hOGG1基因Ser326Cys多态性与HIV感染及HIV与HCV共感染间的相关性。     

CYP1A1、GSTT1、GSTM1基因与乳腺癌易感性的病例对照研究

目的探讨雌激素代谢通路相关基因CYP1A1、GSTT1、GSTM1与乳腺癌易感性的关系。方法采用聚合酶链反应(PCR)、限制性片段长度多态性(RFLP)及琼脂糖凝胶电泳法,对天津市360例正常女性和315例女性乳腺癌患者的CYP1A1、GSTT1、GSTM1基因及多态性进行检测,Logistic回归分析评估单基因、联合基因以及相关因素对乳腺癌的危险度。结果 CYP1A1基因、GSTT1基因、GSTM1基因在两组间分布频率有差异(χ2值分别为20.677,47.250,43.621,P=0.000)。基因型联合分析显示,随着携带危险基因型数目的增加,个体罹患乳腺癌的危险性增加(χ2=51.366,P=0.000)。多因素非条件Logistic回归分析结果显示,CYP1A1基因与体育锻炼、摄入肉类(每日多于150g)、摄入蔬菜(每日超过300g)的交互作用有统计学意义[OR(95%CI)分别为0.465(0.362～0.597)、1.559(1.344～1.808)、0.465(0.362～0.597)];GSTT1基因缺失、GSTM1基因缺失是乳腺癌的危险因素[OR(95%CI)分别为3.245(1.645～6.375)、2.462(1.818～3.334)],且GSTT1基因与体育锻炼、累计行经年数的交互作用有统计学意义[OR(95%CI)分别为1.546(1.113～2.147)、3.735(1.401～9.956)],GSTM1基因与哺乳期限、绝育手术的交互作用有统计学意义[OR(95%CI)分别为1.206(1.024～1.420)、1.690(1.353～2.111)]。结论雌激素代谢通路相关基因与乳腺癌发生有关,且其与雌激素暴露影响因素、生活方式等存在交互作用。     

Factors in association with acceptability of A/H1N1 vaccination during the influenza A/H1N1 pandemic phase in the Hong Kong general population

A random population-based telephone survey (n = 301) was conducted among the Hong Kong general population in July 2009. Past history of seasonal influenza vaccination (OR = 2.59–3.13) was associated with intention to take up A/H1N1 vaccination under three hypothetical scenarios (provided at <HK$100, HK$100–200 and >HK$200). Adjusting background variables, other significant factors were identified by stepwise models: perceived side effects (OR = 0.33), family members’ recommendations and friends’ acceptability toward the vaccine (OR = 2.80–4.74). In contrast to other studies on seasonal influenza and A/H1N1 vaccination, perceived susceptibility and perceived severity related to influenza A/H1N1 were non-significant. Cultural differences may therefore exist.     

矽肺与人类白细胞抗原-DRB1·和-DQB1·基因相关性的研究

目的 探讨我国北方汉族人矽肺的易感性与人类白细胞抗原（HLA）－DRB1＊、DQB1＊位点等位基因多态的相关性。方法 用序列特异性引物的聚合酶链式反应（PCR－SSP）方法，分析48名汉族矽肺患者及100名汉族无血缘关系对照者（均为有过14年以上接尘史的井下凿岩工）HLA－DRB1＊、DQB1＊位点的基因频率分布，以相对危险度（RR）代表相关程度。结果 在矽肺患者组中，DRB1＊1401、DQB1＊05的等位基因频率明显高于对照组，经统计学处理，两组间差异具有显著性（χ^2=5.61,P=0.0066,RR=17.40;χ^2=10.70,P=0.0011,RR=3.81)；而DRB1＊09的等位基因频率则明显低于对照组，差异有显著性（χ^2=5.70,P=0.0187,RR=0.21)；其他等位基因频率的分布差异无显著性（P＞0．05）。结论 HLA－DRB1＊1401、DQB1＊05可能与矽肺的易感性有关，而DRB1＊09则可能与机体抗矽肺的保护性有关。HLA－DR位点与机体易感及保护的双重作用有关，等位基因之间的共同作用可能是影响矽肺发生的原因之一。     

甲型H1N1流感医学观察13例防控措施

目的探索对甲型H1N1流感患者的密切接触者进行医学留观集中管理的防控措施。方法本次防控工作结束后,回顾性总结对13例甲型H1N1流感患者的密切接触者进行医学留观处置过程、医务人员自身防护及存在缺陷。结果通过这次应急实施甲型H1N1流感医学留观人员防控措施,使防控工作符合程序,防护操作规范、标准。结论正确规范地实施消毒隔离措施和加强个人防护,是预防甲型H1N1流感发生医院感染的重要措施和医疗安全的基本保证。