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相似文献
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1.
目的探讨结直肠癌(CRC)患者应用扩增阻碍突变系统(Amplification Refractory Mutation System,ARMS)法检测KRAS、NRAS、PIK3CA及BRAF基因突变情况并分析其与临床病理特征的关系。方法收集中国医科大学附属盛京医院60例结直肠癌患者手术切除组织,采用ARMS法检测KRAS、NRAS、PIK3CA及BRAF基因突变情况。结果 KRAS基因突变23例,突变率为38.3%;NRAS基因突变1例,突变率为1.7%;PIK3CA基因突变4例,突变率为6.7%;BRAF基因突变3例,突变率为5%。检出双突变2例,分别为PIK3CA与KRAS突变,PIK3CA与BRAF突变。有淋巴结转移患者KRAS基因突变率显著高于无淋巴结转移患者(P=0.031)。KRAS、NRAS、PIK3CA、BRAF基因突变之间无明显相关性。结论在结直肠癌患者中,KRAS基因突变率最高,且多发生于有淋巴结转移患者,NRAS、PIK3CA、BRAF基因突变率较低。对结直肠癌患者进行KRAS、NRAS、PIK3CA、BRAF基因联合检测,为临床个体化靶向治疗提供更准确的理论依据。  相似文献   

2.
目的:探讨265例结直肠癌患者BRAF,KRAS,NRAS和PIK3CA基因突变及其病理特征关系。方法:选取2014年12月至2016年12月的265例结直肠癌患者肿瘤组织标本进行回顾性分析,采用PCR扩增–直接测序法检测BR AF基因(15外显子600密码子),KR AS基因(12,13,61密码子突变),NRAS(2号与3号外显子的12密码子、13密码子与61密码子常见的12个突变位点)及PIK3C A(第9,20外显子)基因的突变状态,分析其与结直肠癌临床病理特征的关系。结果:265例患者中存在BRAF基因突变率为6.8%(18/265),KRAS基因突变率为32.1%(85/265),NRAS基因突变率为5.7%(15/265),PIK3CA基因突变率为11.3%(30/265)。NRAS基因和KRAS基因突变与年龄有关(P0.05),与性别、原发部位、组织学类型、分化程度、TNM分期、区域淋巴结转移、远处转移、术后复发转移均无关(P0.05);BRAF,PIK3CA基因在原发部位为右半结肠患者中的突变率明显升高(P0.05),但与年龄、性别、组织学类型、分化程度、TNM分期、区域淋巴结转移、远处转移、术后复发转移均无关(P0.05)。结论:NRAS,PIK3CA基因在中国结直肠癌患者中的突变率较低。KRAS,NRAS基因突变与年龄相关,BRAF,PIK3CA基因与肿瘤原发部位相关,联合检测这些基因的突变情况可以判断疾病的发生发展。  相似文献   

3.
目的分析结直肠癌组织KRAS、NRAS、BRAF和PIK3CA基因突变与临床病理因素及MMR蛋白表达的相关性。方法采用扩增阻碍突变系统(ARMS)和免疫组化法对122例结直肠癌石蜡组织进行回顾性分析。结果 122例结直肠癌组织中KRAS、NRAS、BRAF和PIK3CA基因突变率分别为48.4%(59/122)、4.1%(5/122)、5.7%(7/122)和5.7%(7/122)。检出KRAS与PIK3CA双突变病例3例,BRAF与PIK3CA双突变1例,未发现BRAF与KRAS或NRAS基因同时突变病例。女性患者KRAS突变率高于男性患者(P0.05),低分化腺癌KRAS突变率高于高、中分化腺癌(P0.001)。女性患者、有淋巴结转移者和MLH1蛋白表达缺失者与男性患者、无淋巴结转移和MLH1表达者比(P0.05),PMS2蛋白表达缺失者比表达者的BRAF突变率更高。黏液腺癌PIK3CA突变率较其他肿瘤组织学类型高(P0.05)。结论该4种基因在结直肠癌的突变率依次为KRAS、 BRAF、PIK3CA、NRAS,不存在4种基因全突变及3种基因突变。BRAF与KRAS、NRAS基因突变存在相互排斥现象。KRAS、BRAF、PIK3CA基因突变与结直肠癌临床病理特征存在相关性。  相似文献   

4.
目的分析结直肠癌组织中KRAS、NRAS、BRAF、PIK3CA基因突变情况,探讨其与临床病理参数及MMR蛋白、p53蛋白表达的关系。方法回顾性分析140例结直肠癌组织的临床病理特征,应用扩增阻碍突变系统(ARMS)进行实时荧光定量PCR检测140例结直肠癌组织KRAS、NRAS、BRAF、PIK3CA基因突变情况;应用免疫组化方法分析MMR蛋白、p53蛋白表达情况;应用统计学方法分析KRAS、NRAS、BRAF、PIK3CA基因突变情况与临床病理特征、MMR蛋白、p53蛋白表达之间的关系。结果140例结直肠癌患者中,检测出KRAS基因突变者64例(45.7%),NRAS基因突变者6例(4.3%),BRAF基因突变者13例(9.3%),PIK3CA基因突变者5例(3.6%)。KRAS/BRAF基因双突变者6例,KRAS/PIK3CA基因双突变者4例,NRAS/KRAS基因双突变者1例。KRAS基因在右半结肠、左半结肠、直肠的突变率分别为54.5%、78.4%、24.2%(P=0.0000),在PMS2缺失者中的突变率显著低于无PMS2缺失者中(0 vs 49.6%,P=0.0043)。高分化腺癌、年龄≤30岁者中PIK3CA基因突变率高于中、低分化腺癌、30~60岁及>60岁者(P<0.05);在p53野生型中PIK3CA的突变率显著高于p53突变型(12.9%vs 0.9%,P=0.0087)。NRAS、BRAF基因突变在不同性别、年龄、直径、肿瘤原发部位、肿瘤分化程度、区域淋巴结转移、TNM分期、组织学类型、p53突变及MMR蛋白表达中的差异均无统计学意义(P<0.05)。结论结直肠癌患者中,KRAS基因突变率最高。KRAS、NRAS、PIK3CA与临床病理参数存在相关性。  相似文献   

5.
目的 分析结直肠黏液腺癌临床病理因素与MMR蛋白表达及KRAS、BRAF基因突变的相关性。方法 回顾性分析2014-01—2022-01山东省东阿县人民医院手术切除的33例黏液腺癌和307例非黏液腺癌患者的临床病理资料,采用免疫组化法和扩增阻滞突变系统(ARMS)对340例结直肠癌标本石蜡组织的MMR蛋白表达及KRAS、BRAF基因突变状态检测,并对其进行相关性分析。结果 黏液腺癌占结直肠癌的9.7%(33/340),与肿瘤大小、病变部位、浸润深度、错配修复蛋白表达及BRAF基因突变等临床病理因素有相关性(P<0.05)。结论 黏液腺癌是结直肠癌的少见组织学亚型,分析临床病例特征与错配修复蛋白联合KRAS、BRAF突变检测可为患者预后评估及个体化治疗提供依据。  相似文献   

6.
目的 检测结直肠癌(colorectal cancer, CRC) 患者血清外泌体KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 相关基因位点的突变,分析其与癌组织基因突变的一致性及其可能的影响因素。方法 2019 年2 月~ 2021 年1 月中国人民解放军联勤保障部队第九二〇医院100 例结直肠癌患者作为研究对象。提取患者血清外泌体,并用蛋白免疫印迹(Westernblot,WB)法检测外泌体标志物CD63 和TSG101 的蛋白表达;聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测血清外泌体及手术切除的癌组织中KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 基因突变情况,Kappa 一致性检验分析血清外泌体突变与组织突变的一致性,Logistic 单因素回归分析影响一致性的因素。结果 癌症基因组图谱(the cancer genomeatlas,TCGA)数据显示,KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 的结直肠癌突变率分别为35% ~ 96%,5% ~ 15%,5% ~ 30%和18% ~ 36%,且KRAS 和BRAF 的突变与结直肠癌患者的低存活率有关。血清外泌体中KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 的突变率分别为94.00%,11.00%,17.00% 和35.00%;结直肠癌组织KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 的突变率分别为34.00%,5.00%,6.00% 和16.00%;血清外泌体中KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 的突变率均高于组织,差异有统计学意义(χ2=101.027 ~ 256.250,均P < 0.05)。血清外泌体与组织中KRAS 突变的一致率为40.00%(Kappa值=0.064,P>0.05),BRAF 突变的一致率为99.00%(Kappa 值=0.599,P<0.05),NRAS 突变的一致率为89.00%(Kappa 值=0.475,P<0.05),KRAS 突变的一致率为81.00%(Kappa 值=0.523,P<0.05)。ECOG 评分、转移、临床分期是影响外泌体和组织KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 的突变检测一致性的因素。结论 结直肠癌患者血清外泌体KRAS,BRAF,NRAS 和PIK3CA 的突变率高于组织,二者BRAF,NRAS 和PIK3CA 的一致性中等,为外泌体的基因检测指导临床靶向治疗提供参考。  相似文献   

7.
目的 探讨结直肠癌患者癌组织中错配修复(MMR)蛋白表达、微卫星不稳定性(MSI)、大鼠肉瘤(RAS)基因和致癌同源体B1(BRAF)基因突变与临床病理特征的关系。方法 选取该院2022年1-12月接受根治手术治疗的352例结直肠癌患者的肿瘤组织和血液标本、42例非肠癌患者的实体瘤组织和血液标本,采用免疫组化法检测MMR蛋白表达,一代测序片段分析法检测MSI,实时荧光定量聚合酶链反应检测KRAS、NRAS和BRAF基因突变状态,分析MMR蛋白表达、MSI和3种基因突变状态与结直肠癌临床病理特征的关系。结果 352例CRC患者肿瘤组织中检出MMR缺陷(dMMR)29例(8.2%),高度微卫星不稳定(MSI-H)26例(7.4%),KRAS基因突变161例(45.7%),NRAS基因突变13例(3.7%),BRAF基因突变11例(3.1%)。与dMMR有关因素为低龄、黏液腺癌、原发于右半结肠癌(P<0.05);与MSI-H相关因素包括低龄、肿瘤家族史、原发于右半结肠癌(P<0.05);KRAS和NRAS基因高突变率分别与黏液腺癌和淋巴结转移有关(P<0.05);BRAF基...  相似文献   

8.
目的 探讨结直肠癌(CRC)的微卫星不稳定(MSI)状态与KRAS、NRAS、BRAF基因突变、临床病理特征及预后的相关性。方法 选取2015年3月至2020年12月于汕头市中心医院和中山大学肿瘤防治中心收治的经病理确诊为CRC的861例患者作为研究对象,检测其4种错配修复(MMR)蛋白表达、MSI状态,KRAS、NRAS、NRAS基因突变情况。分析MMR蛋白表达、KRAS、NRAS和BRAF基因突变与CRC患者临床病理特征的相关性,MMR蛋白表达与KRAS、NRAS和BRAF基因突变的相关性,并采用COX回归模型探讨CRC患者2年内死亡的独立影响因素。结果 CRC中的MMR蛋白表达总缺失率为12.08%,KRAS基因突变率为42.28%,NRAS基因突变率为2.21%,BRAF基因突变率为6.50%。不同年龄、肿瘤部位、组织学类型、肿瘤最大径、分化程度、TNM分期、淋巴结转移状态、CEA水平的患者MMR蛋白表达比较,差异有统计学意义(P<0.05)。不同性别、肿瘤部位、组织学类型、分化程度、TNM分期、淋巴结转移状态、CA199水平的患者KRAS基因突变比较,差异有统计学意义(...  相似文献   

9.
目的探讨高分辨率熔解曲线分析(HRM)法检测非小细胞肺癌(NSCLC)中KRAS和BRAF基因突变用于临床检测的可行性。方法用HRM法检测64例NSCLC患者KRAS基因第2外显子和BRAF基因第15外显子的突变情况,用直接测序法对结果进行验证。结果 HRM法检测结果表明有9例NSCLC患者发生KRAS基因突变(14.06%)、4例发生BRAF基因突变(6.25%),直接测序法证实两法的结果完全一致;共检测出4种KRAS基因突变类型,G12C(GGT>TGT)的突变率最高(44.4%),BRAF基因突变型均为V600E。结论用HRM法检测临床样本KRAS和BRAF基因突变,具有操作简便、结果准确、成本低的优点,适用于临床检测。  相似文献   

10.
目的研究甲状腺癌5种驱动基因RAS(KRAS,NRAS,HRAS)、BRAF和TERT突变与临床病理特征的关系,以期细化甲状腺癌主要驱动基因突变的人群特征,在临床实践中为患者提供更精准的分子分型检测指导。方法回顾性收集319例甲状腺癌患者的临床病理特征和5种基因突变状态资料,分析各基因突变状态与患者年龄、性别、病理类型的相关性。结果 319例患者的RAS(KRAS,NRAS,HRAS)、BRAF和TERT突变频率分别为5. 3%、45. 1%和12. 9%。其中37例患者检出双基因突变(11. 6%); BRAF和TERT共突变发生频率最高,为9. 4%;其次为NRAS/TERT共突变4例。RAS和BRAF的突变状态与患者病理类型显著相关(均P0. 01); RAS突变在滤泡性癌中比例高; BRAF突变主要见于乳头状癌,滤泡性癌中少见; TERT突变在乳头及滤泡性癌中均可见,在滤泡性癌中比例增高,但无统计学意义。此外,RAS/BRAF/TERT基因突变患者的平均年龄分别为52. 5岁、44. 6岁和59. 5岁,均显著高于总体平均年龄(40岁)(P 0. 01);而19岁的青少年患者(31例)仅1例检出BRAF基因突变;所有病例其他驱动基因均为阴性。结论甲状腺癌RAS(KRAS,NRAS,HRAS)、BRAF和TERT驱动基因突变与患者的病理分型及年龄相关。青少年甲状腺癌患者RAS(KRAS,NRAS,HRAS)、BRAF和TERT驱动基因突变发生频率极低,在临床实践中需有针对性的设计基因检测方案。  相似文献   

11.
目的:检测胰腺癌组织EGFR、KRAS、BRAF基因突变状况,为胰腺癌EGFR靶向治疗研究奠定基础.方法:提取胰腺癌及胰腺良性病变石蜡组织切片中基因组DNA,PCR扩增EGFR 18、19、21外显子片段,KRAS2、3外显子片段,BRAF15外显子片段,采用直接测序法检测其突变状况.结果:32例胰腺癌患者中有24例患者存在KRAS基因突变,10例良性病变组织均未发现突变,两者差异具有统计学意义(x2=14.57,P=1.35× 10-4),其中22例12密码子突变(G12D14例,G12V8例);2例61密码子突变(Q61L).所有检测样本中未见BRAF突变.共3例EGFR突变,其中包括1例19外显子突变(de1746-750),2例21外显子突变(L858R),10例良性病变组织未见突变.结论:在胰腺癌中KRAS基因突变可能为EGFR通路失调的主要原因,其次是EGFR突变,BRAF突变未见.  相似文献   

12.
The identification of KRAS and BRAF mutations as predictive molecular alterations of resistance to EGF receptor monoclonal antibody therapy in metastatic colorectal cancer have significantly improved the selection of patients more likely to be eligible for the treatment with these targeted agents. Several methods are available for KRAS and BRAF mutation detection but few studies have compared different techniques, especially in the clinical setting. In this article, we contextualize the wobble-enhanced amplification refractory mutation sequencing method for the identification of KRAS and BRAF mutations with the other methodologies frequently used for the assessment of these alterations in colorectal cancer, discussing advantages and limitations over other frequently used diagnostic methods.  相似文献   

13.
目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者功能性驱动基因表皮生长因子受体(EGFR)、间变淋巴瘤激酶(ALK)、Kirsten鼠肉瘤病毒癌基因(KRAS)和B-Raf原癌基因丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(BRAF)基因的突变状况。 方法选择2009年1月至2016年6月安徽省铜陵市人民医院及安徽省立医院呼吸科、胸外科、肿瘤科诊治的经病理诊断为NSCLC患者,共203例(其中铜陵市人民医院117例,安徽省立医院86例),收集患者的外科手术肿瘤组织标本和淋巴结活检、肺穿刺活检、气管镜活检和胸腔积液沉渣标本,应用突变扩增阻滞系统(ARMS)进行EGFR、KRAS和BRAF基因突变检测和免疫组化法进行ALK基因分析,采用χ2检验分析基因的突变率及其与临床特征的关系。 结果NSCLC患者EGFR、ALK、KRAS和BRAF基因的突变率分别为51.23%(104/203),4.88%(8/164),10.69%(17/159)和1.26%(2/159)。EGFR基因阳性突变率女性组66.67%(58/87)高于男性组36.21%(42/116),腺癌组48.80%(81/166)高于鳞癌组33.33%(7/21),非吸烟组63.38%(90/142)高于吸烟组16.39%(10/61),差异有统计学意义(χ2=18.45,113.13,37.69;均P<0.05)。而EGFR基因突变状况与标本来源类型如手术、淋巴结活检、肺穿刺活检、气管镜活检和胸腔积液沉渣标本间差异无统计学意义(χ2=3.91,P>0.05)。ALK基因突变状况与性别、病理类型、吸烟状态之间均差异无统计学意义(χ2=0.00,0.86,0.55;均P>0.05)。KRAS基因突变状况与性别、病理类型、吸烟状态之间均差异无统计学意义(χ2=3.63,2.13,2.36;均P>0.05)。此外BRAF基因突变均为男性、吸烟患者。检测中发现3例19,21外显子EGFR双突变;1例EGFR和ALK双突变。 结论NSCLC患者EGFR基因突变率最高,其次为KRAS、ALK、BRAF基因。EGFR基因突变以女性、不吸烟、腺癌为优势人群,EGFR与ALK双突变可共存。  相似文献   

14.
Clinical experience increasingly suggests that molecular prescreening and biomarker enrichment strategies in phase I trials with targeted therapies will improve the outcomes of patients with cancer. In keeping with the exigencies of a personalized oncology program, tumors from patients with advanced chemorefractory colorectal cancer were analyzed for specific aberrations (KRAS/BRAF/PIK3CA mutations, PTEN and pMET expression). Patients were subsequently offered phase I trials with matched targeted agents (MTA) directed at the identified anomalies. During 2010 and 2011, tumor molecular analysis was conducted in 254 patients: KRAS mutations (80 of 254, 31.5%), BRAF mutations (24 of 196, 12.2%), PIK3CA mutations (15 of 114, 13.2%), KRAS and PIK3CA mutations (9 of 114, 7.9%), low PTEN expression (97 of 183, 53.0%), and high pMET expression (38 of 64, 59.4%). In total, 68 patients received 82 different MTAs: phosphoinositide 3-kinase (PI3K) pathway inhibitor (if PIK3CA mutation, n = 10; or low PTEN, n = 32), PI3K pathway inhibitor plus MEK inhibitor (if KRAS mutation, n = 10; or BRAF mutation, n = 1), second-generation anti-EGF receptor monoclonal antibodies (if wild-type KRAS, n = 11), anti-hepatocyte growth factor monoclonal antibody (if high pMET, n = 10), mTOR inhibitor plus anti-insulin-like growth factor-1 receptor monoclonal antibody (if low PTEN, n = 5), and BRAF inhibitor (if BRAF mutation, n = 3). Median time-to-treatment failure on MTA was 7.9 versus 16.3 weeks for their prior systemic antitumor therapy (P < 0.001). Partial response was seen in 1 patient [1.2%, PI3K inhibitor with PIK3CA mutation] and stable disease >16 weeks in 10 cases (12.2%). These results suggest that matching chemorefractory patients with colorectal cancer with targeted agents in phase I trials based on the current molecular profile does not confer a significant clinical benefit. Mol Cancer Ther; 11(9); 2062-71. ?2012 AACR.  相似文献   

15.
目的 建立HRM法检测大肠癌患者肿瘤组织KRAS(v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog)基因突变的方法 .方法 采用HRM法对含不同比例KRAS基因突变型质粒的系列混合样本进行检测,以评价其灵敏度.应用HRM法检测60份大肠癌患者新鲜肿瘤组织KRAS基因密码子12和13的突变状况,并与直接测序法的结果 进行比较分析.结果 HRM法只需在PCR结束后直接运行高分辨熔解,即可获得检测结果 .HRM法可检出系列混合样本中突变型质粒比例为10%的突变,其检测灵敏度达10%.HRM法从60份大肠癌患者组织标本中,检出17份KRAS基因密码子12或13突变(28.3%);直接测序法检出15份(25.0%)突变,2份未检出KRAS基因突变.HRM法检测的敏感度为100%(15/15),特异度为96%(43/45).结论 HRM法在筛选大肠癌标本的KRAS基因突变类型时,具有操作简便、快速、灵敏,单管避免污染等优点,完全符合临床个体化治疗的要求,值得推广.  相似文献   

16.
Mutations in the oncogenes KRAS and BRAF have been identified as prognostic factors in patients with colorectal diseases and as predictors of negative outcome in epidermal growth factor receptor-targeted therapies. Therefore, accurate mutation detection in both genes, KRAS and BRAF, is of increasing clinical relevance. We aimed at optimizing allele-specific real-time PCR assays for the detection of common mutations in KRAS and the BRAF Val600Glu mutation using allele-specific PCR primers for allelic discrimination and probes (TaqMan) for quantification. Each reaction mix contains a co-amplified internal control to exclude false-negative results. Allele-specific real-time PCR assays were evaluated on plasmid model systems providing a mutation detection limit of 10 copies of mutant DNA in proportions as low as 1% of the total DNA. Furthermore, we analyzed 125 DNA samples prepared from archived, formalin-fixed, paraffin-embedded colorectal carcinomas and compared results with those obtained from direct-sequence analysis. All mutations determined by sequence analysis could be recovered by allele-specific PCR assays. In addition, allele-specific PCR assays clearly identified three additional samples affected by a mutation. We propose these allele-specific real-time PCR assays as a low-cost and fast diagnostic tool for accurate detection of KRAS and BRAF mutations that can be applied to clinical samples.  相似文献   

17.
ObjectiveThis study aimed to investigate the type and frequency of mutations in 10 genes in 85 colorectal cancer (CRC) patients in Huizhou and the guiding significance of targeted drug use.MethodsThe 10-gene panel next-generation sequencing (NGS) was used to assess genetic variants in 85 CRC patients from the Huizhou area combined with clinical information for a comprehensive analysis.ResultsUpon initial mutation testing, 68% (58/85) were positive. The mutation frequencies of these genes, including KRAS, PIK3CA, NRAS, ERBB2, BRAF, EGFR, and PDGFRA, were 51%, 20%, 5%, 4%, 4%, 1%, and 1%, respectively. Overall, 29 mutation types were detected from seven genes. More mutations were detected in more advanced cancers. There were three samples with multiple mutations of a single gene, including KRAS (n = 2) and ERBB2 (n = 2), 12 samples with multiple mutations of double genes, including KRAS/PIK3CA (n = 10), BRAF/PIK3CA (n = 1), and NRAS/PIK3CA (n = 1), and one sample with multiple mutations of three genes, including ERBB2/KRAS/PIK3CA (n = 1). Theoretically, 27 patients could receive targeted treatment. During the actual treatment, 10 patients received bevacizumab, cetuximab, or fruquintinib with no progression ranging from 12 to 24 months.ConclusionGene mutations detected by a 10-gene panel were useful for targeting therapy of CRC in Huizhou.  相似文献   

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