表达谱基因芯片筛选前体脂肪细胞分化相关基因的研究

目的:运用基因芯片技术研究前体脂肪细胞分化相关基因表达谱的变化。方法:体外培养前体脂肪细胞(3T3-L1),诱导分化为成熟脂肪细胞。提取脂肪细胞总RNA,纯化mRNA后逆转录制备目标序列,应用含有45038种小鼠基因cDNA的表达谱芯片Mouse430_2进行差异表达谱分析。结果:在前体脂肪细胞分化的基因表达谱中差异表达基因共有640条,其中表达水平显著变化的有38条(表达水平改变5倍以上),上调基因24条,下调基因14条。差异表达基因中有细胞凋亡相关基因、原癌基因和抑癌基因、细胞信号和传递蛋白基因等多种基因。这些基因可能与脂肪细胞分化相关疾病的发病机制有关。结论:采用基因芯片技术筛选脂肪细胞分化相关基因,可能为脂肪细胞分化相关疾病病因和发病机制的研究提供新思路。     

基因芯片技术分析同种异基因大鼠心脏移植急性排斥反应的相关基因

目的:运用基因芯片技术分析同种异基因大鼠心脏移植后急性排斥反应的基因表达谱. 方法:建立大鼠颈部心脏移植模型,以同种同基因和异基因移植动物作为对照,术后5 d移植心脏中抽提总RNA,纯化后的mRNA进行逆转录制备杂交探针,应用含有4 096个靶基因的表达谱芯片对两组移植心脏组织进行差异表达谱分析.结果:在同种异基因心脏移植术后差异表达基因共有210条(下调96条,上调114条);其中已知基因有33条(下调13条,上调20条);未知基因177条(下调83条,上调94条),其中有15条已知基因(上调2条,下调13条)尚未见报道.结论:运用基因芯片技术研究同种异基因心脏移植术后急性排斥相关基因,可为进一步研究其发病机制和治疗提供新思路.     

60Co-γ照射后早期小鼠肝组织基因表达谱

目的:以基因芯片技术研究辐射后小鼠肝脏的基因表达谱,从分子水平探讨辐射引起小鼠肝脏损伤的机制.方法:采用小鼠基因表达谱芯片(4096个基因)对60Co-γ照射后48 h小鼠肝组织基因表达谱进行研究.RT-PCR验证基因芯片结果.结果:与正常小鼠相比,辐射后小鼠肝组织有124条基因差异表达,78条下调,46条上调.其中57条基因的功能已知,这些差异表达的基因按功能可分为6类:DNA修复和应激蛋白,细胞骨架,离子通道和转运蛋白,信号转导,免疫蛋白,代谢调控,其中下调基因主要为细胞骨架基因,而上调基因主要为细胞周期调控蛋白和转录因子.RT-PCR结果表明,Hspa5、Rasa3、Nqol基因的表达和芯片结果一致.结论:辐射造成的肝损伤具有多靶点、多层次及多通路的特点.     

肾阴虚证患者的基因差异表达

目的 探讨肾阴虚证的特征性基因差异表达谱.方法 选取IgA肾病以及亚健康状态肾阴虚证患者作为研究对象,确诊为肾阴虚证患者为实验组,选择健康志愿者作为正常对照组;应用基因芯片技术,研究肾阴虚证的基因表达谱;结合MAS软件对差异表达基因进行分析.结果 肾阴虚证组和正常对照组间存在差异基因表达特征图谱.获得差异表达基因共79条.其中,表达水平上调(Ratio值大于2)的有6条,表达水平下调(Ratio值小于0.5)的有73条.结论 基因芯片技术可以快速、高通量筛选肾阴虚证的相关基因;初步获得肾阴虚证的相关基因.     

基因芯片筛选喉鳞状上皮细胞癌相关基因的初步研究

目的:应用基因芯片技术进行喉鳞状上皮细胞癌相关基因表达谱差异分析,筛选喉鳞状上皮细胞癌相关基因.方法:从4例喉鳞状上皮细胞癌中相同患者体内取喉鳞状细胞癌组织和癌旁正常组织,应用含有人类全基因组的基因芯片进行分析.结果:在4例喉鳞状上皮细胞癌中共同基因表达显著差异的有349条,其中112条表达上调,237条表达下调.结论:基因芯片能提供大量喉癌相关基因表达谱的信息,分析这些差异表达的基因能够阐明喉鳞状上皮细胞癌复杂的生物学特性与基因表达之间的内在联系,并识别肿瘤的标记物,为进一步研究喉鳞状上皮细胞癌发生、发展相关基因打下基础.     

基因表达谱芯片在免疫高敏相关基因筛选中的应用

目的:探讨基因表达谱芯片技术在高通量筛查肾移植免疫高敏相关基因群中的应用价值,初步筛选肾移植免疫高敏的相关基因.方法:应用含有4 096条人类基因的cDNA表达谱芯片,对免疫高敏即群体反应性抗体(PRA)≥50%的尿毒症患者和PRA阴性的尿毒症患者外周血淋巴细胞的基因表达谱进行分析.结果:免疫高敏患者外周血淋巴细胞中差异表达的基因有17个,其中下调基因9个,上调基因8个.其中部分基因可能与免疫高敏的发生有关.结论:免疫高敏的发生机制涉及多个基因,应用基因芯片技术能够有效筛选出免疫高敏的相关基因.     

基因芯片分析釉基质蛋白对hBMSCs基因表达谱的影响

目的 应用基因芯片技术分析釉基质蛋白(EMPs)对人骨髓基质细胞(hBMSCs)基因表达谱的影响.方法 全骨髓法体外传代培养hBMSCs.以200 μg/mL EMPs刺激hBMSCs作为实验组,以正常培养的hBMSCs作为对照组.培养5 d后,选择含4 096种人类基因的cDNA基因芯片进行检测和分析.运用实时PCR方法对呈差异表达基因中的4条进行扩增和检测,以验证基因芯片分析结果.结果 hBMSCs经EMPs刺激后,有27条差异表达基因,其中18条基因表达上调,9条基因表达下调.经实时PCR检测的4条差异表达基因结果与基因芯片结果一致.结论 应用基因表达谱芯片可筛选经EMPs诱导后hBMSCs的差异表达基因.为进一步研究EMPs促进牙周组织再生的分子学机制奠定了基础.     

应用基因芯片技术筛选肝细胞癌相关基因

目的：应用基因芯片技术筛选肝细胞癌相关基因。方法：利用CapitalBio公司基因芯片,对肝细胞癌组织和正常组织基因表达谱进行检测,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析。结果：按差异显著性标准,从16000条基因中筛选出在肝细胞癌组织中共同差异表达基因326个,其中已知基因194个,新基因132个。在筛选出的已知基因中,表达上调113个,表达下调81个,包括原癌基因和抑癌基因、免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白相关基因、蛋白翻译和合成相关基因、代谢相关基因、细胞周期蛋白相关基因、细胞骨架相关基因、细胞凋亡相关基因、DNA合成和修复相关基因等。结论：基因表达谱芯片技术可以筛选出肝细胞癌表达异常的相关基因群,并高效对基因功能进行研究。基因表达谱的分析有助于研究肝细胞癌发病机制。     

食管癌基因表达谱及其与细胞分化的相关性研究

目的:研究原发性食管癌基因表达谱,筛选与肿瘤细胞分化相关的基因,旨在寻找或定位食管癌分化相关基因,加深对其癌变分子机制的了解. 方法: 应用基因芯片技术对15例ESCC癌组织和正常组织的mRNA进行检测,并用生物信息学对检测结果进行分析. 结果: 在886条目的基因中有110(12.42%)条至少2次出现差异表达,与肿瘤分化直接相关的基因有16条(1.81%),其中表达上调的9条(1.02%),表达下调的7条(0.79%). 结论: 高通量的基因芯片技术筛选出大量的ESCC相关基因,从中可分析出与肿瘤分化相关的基因. 对这些相关基因功能的验证将有助于找到ESCC发生、发展的关键基因或通路,并可作为ESCC诊断的指标和治疗的靶点.     

应用基因芯片技术初步探讨散发性甲状旁腺腺瘤基因表达谱

目的应用基因芯片技术研究散发性甲状旁腺腺瘤基因表达谱的改变,为进一步阐明其早期诊断和发病机理奠定基础。方法抽提正常甲状旁腺和甲状旁腺腺瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机扫描分析正常甲状旁腺和甲状旁腺腺瘤组织基因表达谱的差异情况。结果腺瘤组与正常组的ratio值相比,如以2倍为界,有2302条基因表达发生明显变化,其中1012条基因表达水平明显上调,1290条明显下调。以5倍为界,有10条基因上调,27条下调。基因的功能涉及运输、细胞黏附、信号转导、转录和离子结合等。结论高通量基因芯片技术筛选出大量的散发性甲状旁腺腺瘤相关基因,对这些基因功能的研究可能有助阐明其早期诊断及发病机理。     

原发性下肢深静脉瓣膜功能不全患者曲张大隐静脉组织内KIAA0353基因的表达缺失

目的　筛选原发性下肢深静脉瓣膜功能不全 (PDVI)患者中大隐静脉曲张的致病相关基因。方法　利用荧光差异显示技术 (FDD) ,比较 10例PDVI患者中曲张的大隐静脉隐 股瓣膜区组织与正常人相应组织中mRNA表达的差异。获得的差异表达cDNA片段经Northern印迹证实后进行克隆和测序 ,分析其来源。结果　发现 37条差异表达cDNA片断 ( 30条证实为阳性 ) ,其中一条 5 40bp的片断只在正常人组中特异性表达 ,与人类KIAA0 35 3基因的mRNA部分序列有 99%的同源性。结论　原发性下肢深静脉瓣膜功能不全患者中大隐静脉曲张的发生是一个多基因参与的过程 ;KIAA0 35 3基因的表达缺失可能与PDVI患者中大隐静脉曲张的发生有关。     

原发性大隐静脉曲张中lncRNAs的差异表达

目的 比较大隐静脉（great saphenous vein, GSV）曲张血管与正常血管差异表达的lncRNA对大隐静脉曲张的影响,并预测其可能潜在的功能。方法应用表达谱芯片检测6对配对的曲张静脉（varicose vein, VV）和相邻正常节段大隐静脉（normal vein, NV）组织lncRNA表达差异,以qRT-PCR对32例患者样本进行验证;同时以基因芯片lncRNAs和mRNA差异的分层聚类分析、基因本体及通路分析注释差异表达的mRNA通路。结果在6对VV和NV中,存在557个lncRNAs和980个mRNA表达差异;其中6个通路与代谢相关,均得到了qRT-PCR验证。编码-非编码基因共表达网络提示,这6个lncRNA中有4个可能与11个mRNAs相关,且可能与8个代谢通路有关。结论曲张大隐静脉中存在lncRNA异常表达,为lncRNAs生理功能和静脉曲张病理发生提供了新视角。     

泡沫硬化剂联合大隐静脉高位结扎治疗大隐静脉曲张

目的 探讨泡沫硬化剂联合大隐静脉高位结扎治疗下肢静脉曲张的安全性、有效性,以及预后情况.方法 采用单组前瞻性研究对186例采取泡沫硬化剂联合大隐静脉高位结扎术治疗原发性大隐静脉瓣膜功能不全引起的下肢静脉曲张及相关并发症,对手术时间、手术切口、住院时间、手术并发症、术后静脉曲张消失情况、复发情况、溃疡、皮炎、色素沉着、水肿的好转情况等结果等进行分析.结果 186例患者手术均顺利完成,每条肢体治疗时间为6～15min.手术切口1～3个.术后6h均下地行走,术后住院3～5d（平均4.2d）.术后1周内无严重并发症出现.结论 泡沫硬化剂联合大隐静脉高位结扎治疗大隐静脉曲张安全有效,创伤小,手术时间短,美容效果好,术后恢复快,住院时间短,值得临床推广应用.     

基因芯片技术筛选2型糖尿病胰岛素抵抗脂肪代谢相关差异表达基因

目的:应用基因芯片技术比较2型糖尿病胰岛素抵抗(IR)患者和正常人大网膜组织脂肪代谢相关基因表达谱的差异,探讨IR可能的发病机制.方法:分别用Cy5 和Cy3两种不同的荧光染料通过逆转录反应将IR组(n＝5)和正常对照组(n＝5)脂肪组织的mRNA标记成探针,并与载有一组靶基因的基因表达谱芯片进行杂交,通过扫描荧光强度,计算机软件分析,寻找两组差异表达基因.然后对芯片筛选结果中差异表达的FOXC2基因用Northern印迹法进行验证.结果:IR组和正常对照组之间共筛选出82条差异表达已知基因;其中脂肪代谢相关基因10条,表达增加的基因5条,表达降低的基因5条.Northern印迹证实IR组FOXC2 mRNA表达明显升高,与基因芯片检测结果一致. 结论:IR的发病与脂肪代谢相关,FOXC2可能是2型糖尿病IR的候选基因.     

柴胡疏肝散对体外静脉收缩的作用及其机制研究

目的 观察柴胡疏肝散对体外静脉环的收缩作用,探讨其作用机制。方法 选取人曲张大隐静脉及脐静脉血管环,采用微血管张力测定技术,以5-羟色胺、乙酰胆碱检测血管环内皮功能。依次由低至高加入不同浓度的柴胡疏肝散,测定曲张大隐静脉及脐静脉张力变化。用L-钙通道阻滞剂硝苯地平预处理后,测定不同浓度的柴胡疏肝散作用下曲张大隐静脉张力变化。结果 地奥司明对体外静脉无明显收缩作用;柴胡疏肝散能直接引起体外曲张大隐静脉及脐静脉收缩,呈一定剂量依赖性,其中脐静脉收缩幅度更大;硝苯地平可抑制柴胡疏肝散对体外曲张大隐静脉的收缩作用。结论 柴胡疏肝散能收缩体外静脉,其机制与促进细胞外钙内流有关。     

泡沫硬化剂治疗大隐静脉曲张的疗效分析

目的：探讨泡沫硬化剂治疗大隐静脉曲张的临床效果。方法：选择30例（条）下肢静脉曲张的患者,对其进行大隐静脉高位结扎,小腿曲张静脉内注射1％乙氧硬化醇泡沫硬化剂,观察大隐静脉曲张症状的改善。结果：30例患者（30肢）均成功接受治疗。平均每条患肢应用20ml泡沫硬化剂,无严重并发症发生。术后5例局部存留曲张静脉团块,但超声检查未见血流信号;3例曲张静脉附近出现炎性反应。24条患肢于治疗后2周、3个月后复诊血管超声时大隐静脉主干闭塞。平均随访3个月,24例患者下肢临床症状明显缓解,下肢明显的曲张静脉消失;2条患肢的溃疡于术后2个月愈合。结论：泡沫硬化剂疗法可有效治疗大隐静脉曲张,联合大隐静脉高位结扎可增加治疗的安全性,是治疗大隐静脉曲张的新方法。     

基因表达谱芯片在小鼠乳腺癌组织中基因差异性表达

目的：在TA2小鼠自发乳腺癌肺转移BCML模型上，采用了基因芯片技术，比较TA2小鼠低转移MA737模型与高转移BCML模型基因表达的差异。以期从基因水平上揭示乳腺癌的转移机制并为进一步寻找其新的防治手段打下基础。方法：采用上海联合基因公司提供的含2048个小鼠cDNA的C57BL-6的基因芯片，研究对象为TA2小鼠自发乳腺癌肺转移BCML模型。同时设TA2小鼠自发乳腺癌MA737模型为实验对照组。结果：筛选出包括与DNA结合，转录和转录因子，蛋白翻译，细胞周期，转移等相关的表达差异有基因共457个，其中210个表达上调，247个表达下调。结论：乳腺癌在转移过程中存在许多基因表达调控的改变，对于相关基因的研究有助于认识乳腺癌转移的分子机制。为进一步探讨乳腺癌的预防提供新的思路与实验依据。     

肿瘤转移相关基因的表达谱研究

目的：运用基因表达谱芯片技术对肿瘤转移相关基因的表达谱进行研究。方法：对临床切除的肝癌和胰腺癌组织及相应的对照正常组织进行总ＲＮＡ抽提,纯化后的ｍＲＮＡ进行逆转录制备杂交探针,应用ＢｉｏＤｏｏｒ４０９６和ＢｉｏＤｏｏｒ１２８００的全长基因ＤＮＡ芯片筛选与肝癌和胰腺癌转移相关的基因。杂交后的信号用ＳｃａｎＡｒｒａｙ３０００扫描,结果用ＩｍａＧｅｎｅ３．０软件分析。结果：对肝癌和胰腺癌基因表达谱进行分