基于网络药理学探讨通窍活血汤治疗颅脑损伤的作用机制

目的：基于网络药理学探讨通窍活血汤治疗颅脑损伤(TBI)的作用机制。方法：通过检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库筛选出通窍活血汤潜在活性成分及靶点,采用GeneCard与OMIM数据库获得颅脑损伤疾病靶点,得到通窍活血汤的中药与TBI的交集靶点,使用Cytoscape 372软件绘制活性成分靶点疾病交互网络图。采用String数据库构建靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。结果：筛选后收集得所有中药成分127个,收集疾病靶点1 811个,疾病与药物交集靶点共62个。PPI网络提示核心靶点为ALB、IL6、CASP3、EGFR、VEGFA等;GO功能注释得到73条富集结果,包括DNA结合转录激活剂活性,RNA聚合酶Ⅱ特异性等,富集得到PI3K-AKT等75条核心的KEGG通路。结论：通窍活血汤治疗颅脑损伤具有多成分、多靶点、多通路的作用机制特点。     

基于网络药理学方法探究补肾活血汤治疗激素性股骨头坏死的作用机制

目的:探讨补肾活血汤治疗激素性股骨头坏死(steroid-induced osteonecrosis of the femoral head,SONFH)的作用机制。方法:通过中医药整合药理学网络计算研究平台(integrative pharmacology-based network computational research platform of Traditional Chinese Medicine,TCMIP)v2.0预测、筛选补肾活血汤组方中14味中药的作用靶标,通过GeneCards、CTD和OMIM数据库查询SONFH的疾病靶点。根据获取的药物靶标和疾病靶点,进一步利用TCMIP v2.0中医药关联网络分析模块构建"药物靶标-疾病靶点"相互作用网络,根据网络拓扑特征值筛选补肾活血汤治疗SONFH的核心作用靶点。利用GO和KEGG数据库,采用富集算法挖掘上述方剂核心作用靶点的生物学功能和通路信息。结果:共获得891个补肾活血汤药物靶标和365个SONFH疾病靶点。经"药物靶标-疾病靶点"相互作用网络分析,最终筛选出31个补肾活血汤治疗SONFH核心靶点,GO功能分析富集出生物过程532条、分子功能29条,KEGG信号通路富集分析出相关通路共12条,主要涉及炎症免疫调节(chemokine signaling pathway,Toll-like receptor signaling pathway,NOD-like receptor signaling pathway,leukocyte transendothelial migration,Complement and coagulation cascades,cytokine-cytokine receptor interaction)、血管新生及血液循环调节(VEGF signaling pathway)、神经系统调节(neuroactive ligand-receptor interaction)和细胞功能调节(apoptosis,regulation of actin cytoskeleton)等方面。结论:结合SONFH的病理机制,排除缺乏特异性的信号通路,我们推测补肾活血汤可能通过调节TLR4/NF-κB和VEGF信号通路发挥补肾壮骨、活血化瘀的功效,这可能是其治疗SONFH的作用机制之一。     

基于网络药理学和分子对接探究补肾活血汤“从虚从瘀从毒”治疗膝骨关节炎的作用机制

目的:"从虚从瘀从毒"三个角度,采用网络药理学和分子对接技术探讨补肾活血汤治疗膝骨关节炎的内在分子机理。方法:将补肾活血汤中的药物在TCMSP、TCM Database@Taiwan数据库查询相关化学成分及作用靶点,然后对靶点进行基因注释;在PharmGkb、OMIM、DrugBank、GeneCards、TTD 5个数据库中进行疾病相关靶点检索,获取其对应靶点;然后通过Cytoscape 3.8.2软件将药物成分、疾病及靶点的对应关系构建"中药-成分-靶点-疾病"网络可视化,并从String数据库获取交集靶点数据,构建PPI蛋白互作网络;利用R语言软件对基因进行GO和KEGG富集分析;最后对核心化合物及核心靶点进行分子对接。结果:共获取补肾活血汤活性化合物163种,共筛选出10个核心成分,预测出对应靶点244个,KOA相关靶点1921个,两者的交集基因共129个;利用PPI蛋白互作网络共筛选到3个核心靶点蛋白;GO和KEGG富集分析分别得到2604个、159个富集结果;分子对接结果显示补肾活血汤治疗骨质疏松过程中,其核心化合物quercetin、luteolin、kaempferol与核心靶点TP53、JUN、RELA具有良好的结合性能。结论:补肾活血汤在促进细胞增殖、抗黏附及维持血管内稳定、抗炎等方面发挥其重要作用,并通过网络药理学和分子对接阐释了其"从虚从瘀从毒"治疗膝骨关节炎的内在分子机制。     

基于网络药理学的苓桂术甘汤治疗阿尔茨海默病的潜在作用机制研究

目的利用网络药理学技术研究苓桂术甘汤治疗阿尔茨海默病(AD)的潜在作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)、Swiss、SuperPred和Stitch数据库寻找与苓桂术甘汤中4味中药相关的化学成分及其作用靶点,并以口服利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为阈值对化合物进行筛选,再通过文献查找加以补充;通过OMIM、TTD、GAD、Pharm Gkb数据库获取与AD疾病相关的靶标,并进一步筛选得到苓桂术甘汤治疗AD的潜在作用靶点;采用DAVID6.8数据库对相关潜在作用靶点进行GO分析及KEGG代谢通路富集分析;利用Cytoscape软件构建"单味药-活性成分-作用靶点"相互作用网络并进行度值和中介度分析,确认可能的关键靶点和关键通路。结果在苓桂术甘汤中,共筛选出126个与AD相关的潜在活性成分和120个潜在作用靶点;GO生物功能分析共包含565条富集结果,其中生物过程396条,分子功能121条,细胞组成48条,主要涉及蛋白结合、细胞、氧化还原过程等;KEGG富集得到67条代谢通路,主要包括神经活性配体-受体相互作用通路、癌症通路、5-羟色胺能突触通路和钙信号通路等。结论网络药理学研究结果揭示了苓桂术甘汤治疗AD的多成分、多靶点、多途径的作用特点,并预测了其可能的活性成分、作用通路和关键靶点,为其药效物质基础和作用机制研究提供了理论基础。     

基于网络药理学分析藿朴夏苓汤作用机制以探讨新型冠状病毒肺炎的治疗

目的:通过网络药理学分析藿朴夏苓汤的成分、靶点及其潜在的作用机制,探讨其对新型冠状病毒肺炎的治疗作用。方法:通过TCMSP搜集藿朴夏苓汤组方的活性成分及靶点,运用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,使用Cytoscape 3.6.0软件构建网络,并进行模块化、拓扑学分析筛选关键靶点,将筛选到的关键靶点导入DAVID数据库,进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果:藿朴夏苓汤的11味中药含71个活性成分235个靶点,蛋白质-蛋白质相互作用网络具有4个模块,筛选出41个关键靶点,GO功能富集分析涉及72个条目,KEGG通路富集分析涉及73个通路。结论:藿朴夏苓汤的成分具有抗炎、免疫调节、抗肺纤维化的作用,可能通过调控肿瘤坏死因子信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路、HIF-1信号通路等发挥对新型冠状病毒肺炎的治疗作用。     

基于网络药理学分析当归活血汤治疗下肢动脉硬化闭塞症的作用机制

目的：分析当归活血汤治疗下肢动脉硬化闭塞症的有效活性成分及靶点的药理作用。方法：通过中药系统药理数据库与分析平台（TCMSP）筛选当归活血汤有效活性成分及靶点,运用GeneCard及OMIM数据库获取下肢动脉硬化闭塞症（ASO）相关蛋白;通过String平台对药物-疾病靶蛋白进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络构建,利用DAVID数据库,将所得到的当归活血汤-下肢ASO靶点进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：当归活血汤药物有效活性成分234个,当归活血汤-下肢ASO作用靶点共26个;PPI网络分析结果发现IL-6、VEGFA、MMP-9、IL-10等可能是当归活血汤治疗ASO的关键靶点。共获得46条GO生物过程和167条相关信号通路,其中HIF-1、AGE-RAGE、IL-17、TNF等信号通路与下肢ASO的治疗密切相关。结论：基于网络药理学探究当归活血汤主要成分的靶点网络及其治疗下肢ASO的作用机制,为进一步对本病的基础实验研究提供新思路及科学依据。     

基于网络药理学方法探讨四妙勇安汤治疗动脉粥样硬化的作用机制

目的:通过网络药理学方法探讨四妙勇安汤治疗动脉粥样硬化的作用机制。方法:从中药系统药理学分析平台(TCMSP)中寻找与四妙勇安汤中四味中药相关的所有化学成分和作用靶点,构建化合物靶点相互作用网络图;通过OMIM数据库,TTD数据库以及PharmGkb数据库筛选动脉粥样硬化相关的靶点,进而构建疾病靶点相互作用网络图;筛选药物靶点和疾病靶点相互作用图的核心靶点,利用ClueGO对核心靶点进行GO分析,利用KEGG数据库对核心靶点进行相关通路富集。结果:选择口服利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18作为化合物分子的筛选条件,筛选出四妙勇安汤132个活性成分和163个相应蛋白靶点;通过度、介度中心度、接近中心度等网络拓扑特征评价筛选出与四妙勇安汤在动脉粥样硬化方面作用核心靶点196个,GO分析共包含117条富集结果,其中生物过程77条,分子功能23条,细胞组成17条。利用KEGG数据库对入选靶标进行相关通路富集,筛选出20条通路在动脉粥样硬化方面具有作用。结论:通过网络药理学证实了四妙勇安汤多成分、多靶点、整体调节的作用特点,预测了四妙勇安汤治疗动脉粥样硬化的主要可能的作用机制,为其活性成分研究和实验研究提供理论依据。     

基于网络药理学与分子对接法探讨补肾骨蚀方治疗膝骨关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学与分子对接法探讨补肾骨蚀方治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制.方法:通过TCMSP数据库筛选补肾骨蚀方的活性成分及相关靶点,通过Genecards、OMIM数据库获取KOA相关基因数据.使用R软件获取补肾骨蚀方与疾病的交集靶点,利用STRING数据库对交集靶点构建蛋白互作网络,利用R软件进行GO与KEGG富集分析,运行Autodock Vina对活性成分及关键蛋白进行对接.结果:补肾骨蚀方有效成分84种,相关靶点240个,KOA相关靶点2270个,交集靶点124个.GO富集显示包括生物过程相关条目2334条,细胞成分相关条目70条,分子功能相关条目169条.KEGG功能富集分析发现前列腺癌、肿瘤坏死因子信号通路、人巨细胞病毒感染、流体切应力和动脉粥样硬化、糖尿病并发症中AGE-RAGE信号通路、卡波济肉瘤相关疱疹病毒感染等132条信号通路.分子对接初步验证了补肾骨蚀方主要活性成分能与关键靶点发生相互作用.结论:补肾骨蚀方可能通过抑制炎症因子表达,调节骨代谢及抗氧化治疗KOA,这对后续方药研究及临床应用具有指导意义.     

乌梅治疗变应性鼻炎的网络药理学机制探究

目的：运用网络药理学方法筛选乌梅对变应性鼻炎（Allergic Rhinitis,AR）的作用靶点,明确其作用机制。方法：经中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索乌梅的化学成分并筛选其作用靶点;通过GeneCards、OMIM等数据库查询AR的疾病靶点;利用Venny映射得到乌梅与AR的共同靶点,进而构建靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络图;基于Metascape数据库对靶点进行基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：共筛选出乌梅的8个主要活性成分和194个相应靶点蛋白,与1 092个AR靶点相交的核心靶点有87个。KEGG通路富集分析得到癌症通路、流体动力与动脉粥样硬化通路、肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor,TNF）信号通路、弓形虫通路、核因子-κB(Nuclear Factor-κB,NF-κB)信号通路等21条通路;GO通路富集分析得到53条结果,其中生物过程包括脂多糖反应通路等18条,细胞组成包括膜筏通路等15条,分子功能包括细胞因子受体结合通路等20条。结论：乌梅的主要活性成分通过调控白细胞介素-...     

基于网络药理学探讨补虚与活血配伍治疗股骨头坏死的作用机制研究

目的探讨补虚与活血配伍治疗股骨头坏死(ONFH)的潜在作用机制。方法以使用频率最高的当归、熟地黄、续断、杜仲、黄芪和丹参、牛膝、红花、川芎、骨碎补为例,利用中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)筛选补虚药与活血药的有效成分,并收集其对应的预测靶点;采用Cytoscape 3.7.2软件进行“药物-成分-靶点”网络构建与分析;利用DisGeNET、PharmGKB、CTD、GAD、OMIM、GeneCards、KEGG等数据库检索与ONFH相关作用靶点;借助OmicShare平台筛选补虚药与活血药配伍治疗ONFH的作用靶点;采用STRING数据库进行蛋白质相互作用(PPI)网络的构建与分析,通过DAVID生物信息学资源数据库进行GO分析和KEGG通路富集分析。结果共筛选出补虚药有效成分53个、预测靶点142个,活血药有效成分118个、预测靶点148个;检索出ONFH相关作用靶点1159个,补虚药与活血药预测靶点与疾病ONFH的交集靶点有53个;PPI网络共包含节点52个、边477条,平均节点度值为18,平均介数为0.718;GO分析结果显示,交集靶点生物过程主要涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子转录正调控等,细胞组分主要包括细胞核、细胞质等,分子功能主要包括蛋白质结合、金属离子结合等;KEGG通路富集分析结果显示,交集靶点主要与癌症通路、PI3K-Akt信号通路、肺结核、HIF-1信号通路、南美锥虫病等通路有关。结论补虚药与活血药配伍主要通过潜在的“多成分-多靶点-多通路”来发挥作用,并通过不同成分作用于相同靶点、相同通路协同起效来达到治疗ONFH的目的。     

淫羊藿治疗股骨头坏死的分子机制分析

目的:基于网络药理学和生物信息学研究淫羊藿治疗股骨头坏死可能的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台对淫羊藿可能的活性成分和靶点进行筛选和预测,针对TTD,Drug Bank,OMIM,GAD,Pharm GKB等数据库与股骨头坏死相关的作用靶点进行挖掘,结合生物信息学手段,明确淫羊藿防治股骨头坏死的特异性靶点,采用Clue GO进行信号通路富集分析,以进一步分析其可能的分子机制。结果:在中药系统药理学数据库和分析平台中共检索出与淫羊藿相关成分130个,根据口服生物利用度(OB)和药物相似性(DL)参数筛选获得入血活性成分23个,利用相关靶点预测技术预测可能的靶点102个;通过上述疾病基因相关数据库共检索到与股骨头坏死发生,发展密切相关的已知靶点72个。利用Cytoscape软件构建活性成分及疾病的蛋白质-蛋白质相互作用关系网络图,合并网络图并行拓扑分析筛选出关键基因135个;采用Clue GO信号通路富集分析显示,淫羊藿作用于股骨头坏死的关键节点涉及的信号通路主要被富集在细胞增殖、细胞凋亡、炎症、应激及癌症相关等80条信号通路。结论:淫羊藿治疗股骨头坏死具有多成分,多靶点的特点;其主要通路不仅直接参与骨重建的细胞增殖、凋亡及分化,调节成骨、破骨代谢平衡,还通过调节免疫、炎症及应激反应等干预和影响骨微环境以达到控制疾病发生发展的目的,与目前治疗股骨头坏死的作用机制相符合。     

基于网络药理学的黄连解毒汤治疗高血压潜在机制研究

目的利用网络药理学技术预测黄连解毒汤治疗高血压的作用机制。方法从中药系统药理学分析平台(TCMSP)中寻找与黄连解毒汤中4味中药相关的所有化学成分和作用靶点,构建化合物靶点相互作用网络图;通过OMIM数据库、TTD数据库以及PharmGkb数据库筛选高血压疾病相关的靶标;PPI数据库构建黄连解毒汤和高血压的交互靶标;筛选药物靶点和疾病靶点相互作用的核心靶点,采用Davidv6.8数据库对核心靶点进行GeneOntology(GO)分析,利用KEGG数据库对核心靶点进行相关通路富集。结果选择口服利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18作为化合物分子的筛选条件,并通过文献查找加以补充,共筛选出黄连解毒汤的61个潜在活性成分和154个潜在靶点;通过度、介度中心度、接近中心度等网络拓扑特征评价筛选出与黄连解毒汤在高血压方面作用核心靶点228个,GO分析共包含118条富集结果,其中生物过程59条,分子功能31条,细胞组成28条。利用KEGG数据库对入选靶标进行相关通路富集,筛选出45条通路在高血压疾病方面具有作用。结论黄连解毒汤具有多成分、多途径、多靶点协同作用的作用特点,预测了黄连解毒汤治疗高血压疾病的可能作用机制,为寻找其有效成分和作用机制及临床应用奠定基础。     

基于网络药理学与实验验证探讨凉膈散加减方治疗急性呼吸窘迫综合征的作用机制

基于网络药理学策略,结合分子对接和体外实验验证,研究凉膈散加减方(modified Liangge San, MLGS)治疗急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)的潜在靶点和分子机制。在TCMSP数据库筛选MLGS的活性成分及靶点,整合GeneCards、DisGeNET数据库得到ARDS疾病靶点,两者取交集得到MLGS治疗ARDS的潜在靶点。利用Cytoscape 3.7.2软件构建MLGS的“中药-活性成分-靶点的网络”及“MLGS治疗ARDS的调控网络”,在STRING数据库制作蛋白质相互作用网络,使用Metascape数据库对共同靶点靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,使用分子对接及体外实验对分析结果进行验证。共筛选得到MLGS活性成分211个、关键靶点54个;GO富集分析得到GO条目(P<0.05)709个,包括生物过程(BP)457个、细胞成分(CC)50个和分子功能(MF)98个,主要涉及对脂多糖、对活性氧的反应、凋亡信号通路;KEGG通路富集分析共得到266条通路,主要涉及癌症信号通路、...     

基于网络药理学探讨六君子汤治疗非小细胞肺癌的作用机制

目的基于网络药理学探究六君子汤治疗非小细胞肺癌的作用靶点,探索其作用机制。方法通过TCMSP数据库检索六君子汤6味中药所含活性化学成分,通过Swiss Target Prediction数据库进行靶点的搜集整理;通过Gene Cards、Pharm GKB和TTD数据库查询非小细胞肺癌的靶点,将药物与疾病的靶标基因交集后得到六君子汤治疗非小细胞肺癌的潜在靶点;采用Cytoscape3.7. 2软件筛选核心靶点,使用R软件(v. 4.0. 2)对靶点进行GO富集和KEGG富集分析。结果通过网络药理学方法,筛选出六君子汤6味中药101个活性成分,944个相应靶点,与非小细胞肺癌5152个疾病相关靶点交集后得到579个靶点,根据Cytoscape3.7. 2软件进行分析,共确定18个核心靶点。对18个核心靶点进行GO富集和KEGG富集分析,GO富集得到1482条富集结果,其中生物过程1339条,细胞组成46条,分子功能97条; KEGG富集得到131条非小细胞肺癌相关通路。结论六君子汤可能通过多靶点、多通路协同治疗非小细胞肺癌。     

基于网络药理学的当归补血汤辅助治疗肺癌的作用机制研究

[目的]运用网络药理学的方法,探究当归补血汤作为化疗后辅助用药治疗肺癌的可能作用机制。[方法]通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库查询当归补血汤中的成分,并通过口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18,筛选出活性成分,通过中药成分靶点数据库(HIT)及Swiss Target Prediction Database进行成分靶点的垂钓,通过Therapeutic Target Database(TTD)、Drugbank、DisGeNET数据库查询肺癌相关靶点,利用Cytoscape 3.2.1构建成分-靶点等多层次网络图。使用DAVID数据库对当归补血汤辅助治疗肺癌的潜在作用靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。[结果]当归补血汤中共筛选得到27个活性成分,其中23个属于黄芪,4个属于当归,黄芪中的山奈酚、槲皮素、芒柄花素可能是辅助治疗肺癌比较重要的成分,微管相关蛋白Tau(MAPT)、细胞色素P450 19A1(CYP19A1)、雌激素受体α(ESR1)可能是当归补血汤辅助治疗肺癌比较重要的潜在作用靶点。GO富集分析显示,靶点涉及到170个生物过程相关条目、30个细胞组成相关条目、54个分子功能相关条目。KEGG通路富集分析显示,癌症通路(pathwanys in cancer)、癌症蛋白聚糖(proteoglycans in cancer)、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)等是比较重要的通路。[结论]当归补血汤中的活性成分山奈酚、槲皮素、芒柄花素可能通过作用于MAPT、CYP19A1、ESR1发挥辅助治疗肺癌的作用,为进一步研究其辅助治疗肺癌的作用机制奠定基础。     

基于网络药理学探讨固本止崩汤对功能失调性子宫出血的机制研究

目的:运用网络药理学的方法探讨固本止崩汤对功能失调性子宫出血的可能性机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台筛选固本止崩汤的活性成分并预测其潜在作用靶点,将获得靶点导入UNIPROT数据库进行基因的标准化处理;在GeneCards和OMIM数据库查找功能失调性子宫出血的相关靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络图,将二者交集靶点运用STRING平台分析蛋白间的相互作用关系。用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体（GO）生物功能和富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,并以图表形式展示。结果:以口服生物利用度(OB)和类药性(DL)2个筛选标准得到固本止崩汤中有效活性成分58个,得到靶点135个;在GeneCards和OMIM查找功能失调性子宫出血靶点共2 164个,韦恩图获得药物与疾病的交集靶点共85个,关键靶点涉及IL6、VEGFA、TP53、TNF、EGF等。以P富集分析得到GO条目135条,其中生物过程38条、分子功能36条、细胞组分61条,主要涉及对缺氧的反应、一氧化氮生物过程的正向调节、细胞外空间、细胞外区域、酶结合、类固醇结合等;KEGG富集分析得到25条通路(P<0.05,FDR＜0,05),靶基因主要富集在癌症信号通路等信号通路中。结论:固本止崩汤治疗功能失调性子宫出血具有多成分、多靶点、多通路的特点,其作用机制较为复杂,为后续的实验验证提供物质基础和理论依据。     

基于网络药理学的四妙勇安汤在血管新生中的作用机制研究

目的采用网络药理学方法探讨四妙勇安汤的功效物质基础和在"异病同治"模式下对血管新生方面的作用机制。方法依托中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索四妙勇安汤全方4味中药相关的所有化学成分、作用靶点,进而构建化合物-靶点网络图;通过OMIM数据库、TTD数据库以及PharmGkb数据库筛选血管新生相关的靶点,进而构建疾病靶点相互作用网络图;筛选药物靶点和疾病靶点相互作用图的核心靶点,利用ClueGO对核心靶点进行GO分析,利用DAVID和KEGG数据库对核心靶点进行相关通路富集。结果选择口服利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18作为化合物分子的筛选条件,筛选出四妙勇安汤中的120个活性成分和155个相应蛋白靶点;通过度、介度中心度、接近中心度等网络拓扑特征评价筛选出与四妙勇安汤在血管新生方面作用的核心靶点197个,GO分析共包含942条富集结果,其中生物过程685条,分子功能164条,细胞组成93条。利用KEGG数据库对相关通路富集,筛选出20条通路在血管新生方面具有作用。结论通过网络药理学验证了四妙勇安汤多成分、多靶点、整体调节的作用特点,预测了四妙勇安汤在血管新生中的主要作用机制,为其活性成分研究和实验研究提供理论依据。     

基于网络药理学探讨黄芪治疗2型糖尿病有效成分及作用机制

目的:探讨黄芪治疗2型糖尿病(T2DM)的有效成分及潜在靶点。方法:利用中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)筛选黄芪的有效成分,并收集对应的作用靶点;使用Gene Cards、OMIM数据库获取T2DM相关靶点,并筛选黄芪有效成分与T2DM的交集靶点,采用Cytoscape v3.7.2软件和String数据库进行"药物-活性成分-靶蛋白-疾病"及蛋白互作(PPI)网络的构建与分析;通过DAVID数据库对核心靶点进行GO注释和KEGG通路富集分析。结果:筛选出黄芪有效成分20个,与T2DM交集靶点57个。"药物-活性成分-靶蛋白-疾病"网络中Degree排前5的成分为槲皮素、山萘酚、异鼠李素、刺芒柄花素、毛蕊异黄酮。GO功能注释与KEGG通路富集分析共得到116个GO注释,46条KEGG通路,按P值大小,筛选出靠前20个GO注释和KEGG富集通路。结论:结果显示黄芪治疗T2DM的主要有效成分与潜在作用机制具有多成分、多靶点、多通路等特点,为后续深入探讨其具体机制提供思路和基础。     

基于网络药理学探讨清热活血方抗类风湿性关节炎的作用机制

目的:清热活血在治疗类风湿性关节炎(RA)中效果显著,但其成分多样,作用机制不明,通过网络药理学方法探讨清热活血方抗RA的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选药物成分并利用SwissTargetPrediction数据库预测药物靶点,同时通过药物数据库(Drugbank)和在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)收集疾病靶点。将药物靶点与疾病靶点取交集,拓展并拓扑获取关键靶点,利用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体论(GO)分类富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,通过Centiscape计算获取hub节点。结果:从清热活血方中筛选出活性成分31个,预测靶点419个,数据库挖掘疾病靶点共430个。将药物靶点与疾病靶点取交集、拓扑分析获得清热活血方治疗类风湿性关节炎的关键靶点113个,GO分析共获得生物过程、分子功能、细胞组分共479个富集结果。KEGG富集表明清热活血方可能通过MAPK、Estrogen、PI3K-AKT、Thyroid hormone、Neurotrophin、HIF-1、ErbB、FoxO、B cell receptor等通路干预RA。拓扑得到CULI、EP300、HSP90AA1、TP53、HSPA8、CDC5L、UBC、RPS27A共8个干预RA的Hub节点。结论:清热活血方可能通过多靶点、多通路进行调控,达到治疗类风湿性关节炎的作用。     

基于网络药理学探讨橘皮竹茹汤治疗胃食管反流病的作用机制

目的:运用网络药理学方法筛选经典名方橘皮竹茹汤主要活性成分,构建活性成分-靶点网络,初步探索其治疗胃食管反流病的作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选橘皮竹茹汤活性成分,利用Pharm Mapper服务器依据“反向药效团匹配方法”预测橘皮竹茹汤活性成分的靶点,与DrugBank、GeneCards、DisGeNET数据库中与胃食管反流病相关靶点拟合筛选。利用Cytoscape软件构建中药-活性成分-靶点网络并进行网络拓扑学分析。通过生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点信息进行GO富集分析和KEGG通路注释分析。结果:橘皮竹茹汤中筛选出24个活性成分,主要活性成分有黄柏酮、白桦脂酸、植物甾醇、β-谷甾醇,作用靶点24个,EGFR为最重要作用靶点,GO分析52个生物学过程,20个分子功能,9个细胞组分(P<0.05),KEGG分析得到14条信号通路(P<0.05)。结论:橘皮竹茹汤治疗胃食管反流病具有多成分、多靶点、多通路的特点。