滇南小耳猪几个性状遗传参数的研究

滇南小耳猪是我国的地方良种之一。在云 南分布较广,数量较多,具有早熟易肥、骨细皮 薄、肉质细嫩、味道鲜美等优点。但个体偏小, 生长速度慢。有关小耳猪数量性状的遗传参数 在1977年9月做过初步估测。为探讨使用不 同方法估计遗传力的正确性和精确度,以便更 好地应用这些参数,我们又再次进行了测定。 本资料系1977-1979年本场培育的纯繁小耳 猪,期间饲管条件稳定。猪群采用随机交配,畜 群近交系数为0.0008.     

纳版河自然保护区橡胶和农作物种植对畜禽养殖数量的影响

为评价纳版河流域国家级自然保护区橡胶和农作物种植对畜禽养殖数量的影响,选取13个村寨、207户农户为调查对象,从种植业和养殖业两个方面进行了系统调查.结果表明:纳版河保护区饲养的畜禽主要是本地水牛、黄牛、滇南小耳猪、茶花鸡和少量版纳斗鸡,外来品种极少.1991-2008年,纳版河保护区橡胶种植面积逐年上升,影响了玉米、水稻和其他经济作物的种植和畜禽养殖数量.橡胶种植对水牛和滇南小耳猪养殖数量影响显著,未种植橡胶的家庭水牛和滇南小耳猪养殖数量显著高于种植橡胶的家庭;玉米、水稻和其他经济作物种植面积对水牛、黄牛和滇南小耳猪养殖数量产生积极影响;总种植面积对水牛和茶花鸡养殖数量有着积极的影响.橡胶的发展导致纳版河保护区土地利用方式发生明显改变,种植模式对畜禽养殖数量产生显著影响,随着橡胶种植面积的逐年上升,当地的畜牧业受到抑制.     

Sabin IPV疫苗在版纳小耳猪体内的免疫原性及安全性研究

目的评价Sabin株脊髓灰质炎灭活疫苗(inactivated poliovirus vaccine derived from Sabin strain,s IPV)在版纳小耳猪体内的免疫原性及安全性,为新型动物模型提供实验依据。方法采用中国医学科学院医学生物学研究所已经上市的s IPV疫苗,设计s IPV肌肉免疫实验组与野毒株IPV(IPV derived from wild strain,w IPV)肌肉免疫对照组,以及生理盐水阴性对照组,按0、1、2月基础免疫程序,接种版纳小耳猪,于免疫接种前及每剂免疫接种后第30天釆血,检测各组的血清中和抗体水平,评价免疫原性,并通过观察小耳猪的状态及体重情况,评价安全性。结果版纳小耳猪3剂免疫后,s IPV试验组与w IPV对照组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型抗体阳转率均达到了100%,各型中和抗体几何平均滴度(GMT)均远高于1∶8保护水平。版纳小耳猪接种疫苗后体重增加,结果表明s IPV疫苗在版纳小耳猪动物模型中具有良好的安全性。结论 s IPV疫苗在版纳小耳猪体内具有良好的免疫原性及安全性,版纳小耳猪可作为评价s IPV疫苗的新型实验动物模型。     

滇南小耳猪遗传多样性的血液蛋白电泳研究

本文采用蛋白电泳技术研究滇南小耳猪血液蛋白多态性。共分析了滇南小耳猪32个遗传位点,其中AKP、CAT、ES、PA、6PGD和TF等6个位点检测到多态性,多态位点百分比P＝0.1875, 平均杂合度H＝0.0712。结果表明滇南小耳猪的血液蛋白多态程度较高,反映在蛋白质水平上的遗传多样性较为丰富。     

用12对微卫星引物对版纳小耳猪近交系的遗传学分析

目的　分析版纳小耳猪近交系种群的遗传变异及近交程度。方法　利用 12个微卫星基因座对版纳小耳猪近交系进行了遗传检测。结果　两个亚系以及各家系的聚类情况与小型猪系谱分布一致。且各家系基因纯合率均较高。结论　版纳小耳猪近交系不仅分化为若干个含有不同性状的家系 ,而且也达到了一个很高的近交程度。     

西南地区地方品种猪血液蛋白遗传多样性研究

本实验采用水平板淀粉凝胶电泳技术,研究滇南小耳猪、迪庆藏猪、明光小耳猪、福贡猪、越南野猪和贵州从江香猪共20个个体共计42个基因座位的蛋白质多态性,发现其基因型和基因频率大部分相似,只有Tf、Hp、EsD、Amy－1、CEs和6PGD等六个座位具有多态性;多态座位百分比和平均杂合度分别为P=0．0714,H=0．051。用UPGMA法分别对由基因频率所计算的标准遗传距离和欧氏几何距离 进行聚类分析,结果表明贵州从江香猪和其他几个云南猪品种（系）的距离最远。     

10个地方猪群体的系统聚类分析

利用微卫星标记技术分析了中国10个地方猪群体的亲缘关系。结果表明：不同的聚类方法导致的结果不同,根据Nei’s距离所得的NJ聚类结果与实际情况较为符合,它将10个地方猪群体分为3个类群：五指山小型猪、滇南小耳猪、贵州小型香猪及其近交系4个小型猪为一类群：沂蒙黑猪、汉中黑猪与荣昌猪为一个类群;二花脸猪、金华猪与巴马香猪近交系为一个类群。     

三品系小型猪35个微卫星基因座的遗传学研究

利用35个微卫星基因座对中国三个品系的小型猪（贵州小型香猪、广西巴马小型猪、版纳小耳猪近交系）进行了遗传检测。计算出三个小型猪品系个体样本在35个微卫星基因座的纯合率,并对其进行t检验。计算出各品系的平均杂合度,多态信息含量（PIC）及品系间的遗传距离,并进行了系统聚类。结果表明三个品系的小型猪其基因纯合率均较高,其中版纳小耳猪近交系的基因纯合率最高;PIC和平均杂合度均较低;贵州小型香猪和广西巴马小型猪亲缘关系较近,并均与版纳小耳猪近交系的亲缘关系略远。 Abstract：The polymorphism of 35 microsatellites in the three miniature pig breeds in China(Guizhou miniature pig, Guangxi Bama miniature pig, Banna miniature pig inbred) was analysed. Rates of homozygote for 35 microsatellite loci in three miniature pig breeds were calculated,and t-test for them were performed. Mean heterozygosity and polymorphism information content(PIC) were calculated for all breeds, and genetic distances between these breeds were estimated. The dendrograms were obtained based on genetic distances. The results suggest that rates of homozygote in the three breeds are all high, and that is the highest in Banna miniature pig inbred. The results also suggest that polymorphism information content and mean heterozygosity in all the three breeds are low, and the genetic relationship between Guizhou miniature pig and Guangxi Bama miniature pig is closer than their relationship with Banna miniature pig inbred.     

西双版纳小耳猪群体遗传结构的RFLP分析

目的　对西双版纳小耳猪的群体遗传结构进行RFLP分析。方法　采用ECL核酸直接标记和检测系统,以HRP标记ɑ-珠蛋白-3’HVR多基因座小卫星探针,对西双版纳小耳猪的Hinf Ⅰ或HaeⅢ酶切片段进行Southern杂交,以化学发光法进行检测,获得了清晰可辨的、具有高度多态性的DNA指纹图谱。结果　2　kb以上的谱带数在6～15条之间,HinfⅠ酶切产生的图带数低于HaeⅢ。JB亚系内805、807家系和JS亚系内111、121、121、151家系不同个体间的相似系数分别为0.94±0.09、0.85±0.08、0.84±1.7、0.78±1.6、0.83±0.42、0.87±0.07,显著高于各家系间的相似系数,JB亚系内的805家系和JS亚系内的151家系不同个体间相似系数较大,分别为0.94和0.87。结论　西双版纳小耳猪近交程度较高,个体间差异较小,均一性较强。     

用RAPD标记中国小型地方猪品种的遗传多样性

在我国大型品种猪肉全部占领市场和改变肉食品结构的今天,我国地方品种的小型猪家畜资源显得十分宝贵,诸如香猪、滇南小耳猪、五指山猪、藏猪等,特别对它们的分子遗传研究就更是迫近眉梢。目前华中农业大学动物科技学院动物分子生物学与育种实验室樊斌博士等8位专家教授采用随机扩增多态DNA(Randomamplified palymorphic DNA,RAPD)法,在周俊玲等和刘德武等人对其他猪遗传变异的检测与分析和猪群体结构的基础上,采集了4种小型猪、二花脸猪和杜洛克猪的血液样品,应RAPD进行检测,所得数据进行统计分析并制成品种间NJ聚类图。樊斌博士选…     

滇南小耳猪精液的直接冷冻保存

目的建立滇南小耳猪精液冷冻保存方法,加速云南省特有小型猪种的小型化选育。方法利用脉冲电刺激模式诱导公猪输精管自助收缩排精。利用直接冷冻新技术（DFM）研究不同冷冻方案对精子的运动度、精子顶体完整性和体内授精胚胎发育能力的影响。结果在直接冷冻方法中,3%甘油防冻剂的作用下,60 s植冰时间和1.5 mm/s的冷冻降温参数对精子运动度保护良好,精子运动复苏率达到61.7%。但是,3%乙二醇虽然与甘油一样对精子的顶体完整性都有很好的保护作用,对精子运动度保护能力较差。此外,3%甘油、60 s植冰、1.5mm/s冷冻速度的直接冷冻的冻精解冻,移植到超数排卵的母猪子宫颈口实施人工授精,获得卵的受精和胚胎发育潜能尚可。结论玻璃管直接冷冻可以完成滇南小耳猪精子的冷冻保存。     

版纳小耳猪近交系5家系35个微卫星座位的遗传分析

利用35个微卫星座位对版纳小耳猪近交系5个家系进行了遗传检测。统计各家系的等位基因组成,计算各家系的平均基因纯合率,利用基因频率计算出各家系的平均杂合度及品系间的遗传距离,并进行系统聚类。结果表明各家系的平均基因纯合度均较高,其151家系达到88.79％;PIC（多态信息含量）和平均杂合度均较普通商品猪低;各家系等位基因组成差别较大;各家系间亲缘关系与其近交过程一致,据此认为版纳小耳猪近交系5家系均具有较高的近交程度;其基因多态性和遗传多样性较普通商品猪低;各家系均已构成独立遗传群体。     

不同猪种IGFBP3基因内含子2、3多态性分析

本研究采用PCR-SSCP技术结合DNA直接测序对滇南小耳猪、大白猪、梅山猪、香猪、海南五指山猪封闭群、近交系、海南黑猪系(临高猪,屯昌猪)等8个猪种的IGFBP3基因内含子1、2、3的SNP多态性进行检测,并分析其与五指山猪3个生长阶段体质量的关联性。结果表明:内含子2、3的PCR片断表现有多态性,且出现3种基因型。随后的测序结果表明,它们都在相应的区域存在着SNP变异;内含子3在地方猪种大多表现BB基因型和以B等位基因为主,尤其是小型猪;内含子2在中外不同猪种的基因型频率和等位基因的频率分布则不存在品种的特异性,在地方猪种和外来猪种的分布规律不明显。群体遗传多态性检测显示8个猪种在这2个位点均处于中度多态(0.25PIC0.5);关联分析显示五指山猪IGFBP-3内含子3 AA基因型和内含子2 DD基因型猪在8月龄、12月龄的生长体重分别与AB、BB基因型和CC、CD基因型个体存在显著性差异(p0.05),但在2月龄时没有此规律。     

异种源复合益生菌对杜滇仔猪肠道微生物多样性的影响

为研究异种源复合益生菌对超早期断奶（7日龄）的杜洛克×滇南小耳猪肠道微生物多样性的影响,选取30头7日龄杜洛克×滇南小耳猪,分为DD组哺喂代乳粉,DY组哺喂代乳粉+复合益生菌,对照组（DM组）母乳喂养,每组10头。试验期为21 d,采用IIIumina技术分析粪便菌群组成。结果表明,早期哺喂代乳粉,使杜洛克×滇南小耳猪肠道菌群多样性下降（P＜0.05）,厚壁菌门（P＜0.01）、螺旋菌门（P＜0.05）和Epsilonbacteraeota（P＜0.01）相对丰度降低,乳杆菌属相对丰度极显著提高（P＜0.01）,代乳粉中添加异种源复合益生菌后,拟杆菌门和普氏菌属的相对丰度显著提高（P＜0.05））,与碳水化合物代谢（Prevotella_7、Prevotella_2、Prevotella_9）及肠道抗炎症（Colilnsella）相关菌群的相对丰度也显著提高,具有降低仔猪断奶应激的潜能。     

利用商品猪群定位猪耳型QTL

由 19头杂种公猪 [皮特兰× (皮特兰×汉普夏 ) ]、5 2头杂种母猪 [Leicoma× (大约克×长白 ) ]及其 332头后代组成的商品群作为参考家系 ,选择 172个微卫星标记和 3个 1类标记 (RYR1、PRKAG3、PIT1)对参考家系的个体进行遗传标记分型 ,构建了猪的整个基因组微卫星连锁图谱。按照线性评分的方法 (竖耳 :1分 ;垂耳 :- 1分 ;半垂耳 :0分 )测定猪的耳型表型值。耳型测定值的平均值为 0 .2 3,标准差为 0 .82。应用最小二乘回归方法对耳型的QTL进行定位 ,结果仅在 6号染色体的末端 (Sw1881和Sw32 2 )之间以 1%基因组显著性水平检测出 1个耳型基因位点 ,而在其他染色体上即使 10 %染色体显著性水平上也没有发现QTL。     

中国三种实验用小型猪mtDNA D-l00P多态性分析

分析中国三种实验用小型猪线粒体DNA(mtDNA)D-loop的多态性,建立各品种品系猪的遗传标记,为各品种品系猪的鉴别提供依据.应用PCR对西双版纳近交系小耳猪、广西巴马小型猪、贵州小型香猪和长白猪血液总DNA样品中mtDNA D-loop进行扩增,用23种限制性内切酶消化,观察其酶切多态.PCR扩增其mtDNA D-lcop 5′端227 bp高变区域,应用PCR-SSCP和PCR直接测序分析,观察其单链构象多态和序列多态.结果显示:3种小型猪之间未见酶切长度多态、单链构象多态和序列多态;与长白猪之间表现出单链构象多态和序列多态.本研究认为:3种实验用小型猪之间mtDNA多态性贫乏,证明其在母系起源和进化上的一致性,亲源关系很近,应用PCR-RFLP、PCR-SSCP和PCR直接测序分析,尚不能作为3种实验用小型猪品种品系鉴定的依据,但与长白猪等欧系猪比较有一定差异.     

中国三种实验用小型猪mtDNA D—loop多态性分析

分析中国三种实验用小型猪线粒体DNA（mtDNA)D-loop的多态性,建立各品种系猪的遗传标记,为各品种品系猪的鉴别提供依据,应用PCR对西双版纳近交系小耳猪,广西巴马小型猪,贵州小型香猪和长白猪血液总DNA样品中mtDNA D-loop进行扩增,用23种限制性内切酶消化,观察其酶切多态,PCR扩增其mtDNA D－loop5‘端227bp高变区域,应用PCR－SSCP和PCR直接测序分析,观察其单链构象多态和序列多态结果显示,3种小型猪之间未见酶切长度多态,单链构象多态和序列多态,与长白猪之间表现出单链的构象多态和序列多态,本研究认为：3种实验用小型猪之间mtDNA多态性贫乏,证明其在母系起源和进化上的一致性,亲源关系很近,应用PCR－PFLP,PCR－SSCP和PCR直接测序分析,尚不能作为3种实验用小型猪品种品系鉴定的依据,但与长白猪等欧系猪比较有一定差异。     

栖息洞穴干扰对特有种大卫鼠耳蝠种群数量和基因丰富度的影响

大卫鼠耳蝠(Myotis davidii)为中国特有蝙蝠物种。选用8个微卫星位点,研究并评价了大卫鼠耳蝠种群数量、遗传多样性与其栖息洞穴干扰的关系。结果表明,各微卫星位点遵循HW平衡。在124个个体的8个微卫星位点中共检测到130个等位基因。平均NA、He和Ho分别为16.25、0.71和0.62。单位洞穴长度内大卫鼠耳蝠个体数量和等位基因丰富度随干扰强度增加呈现降低趋势。洞穴单位长度内个体数量则受湿度、干扰强度的显著影响。等位基因丰富度不受个体数量的影响,而受洞穴大小和干扰强度的显著影响。通过对大卫鼠耳蝠栖息洞穴的综合评价,82.35%的栖息洞穴已受到人类活动的影响。此外,种群瓶颈效应事件的出现和洞穴微环境的改变,将进一步影响大卫鼠耳蝠种群及其遗传多样性。因此,建议政府部门及当地群众要尽量缩减对其栖息洞穴的开发规划,减少人为干扰,加强就地保护以有效维持其种群良性发展。     

利用微卫星标记分析七品种（类群）小型猪的遗传多样性

采用世界粮农组织（FAO）和国际动物遗传学会（ISAG）推荐的27个微卫星,对久仰香猪、剑白香猪、从江香猪、环江香猪、黑香猪（贵州省种猪场）、五指山猪和滇南小耳猪等我国7小型猪种（类群）及杜洛克、长白和大白等3个外来猪种的群内遗传变异性和群间遗传差异进行了分析。结果表明,7个小型猪品种（类群）均有较高的群内遗传变异,但久仰、剑白、从江和环江4个香猪类群的群内遗传变异（平均多态信息含量（PIC）为0.61～0.64）显著低于其他3个小型猪种（平均PIC为0.80～0.84）。久仰、剑白、从江和环江4个香猪类群彼此间的遗传差异较小（奈氏标准遗传距离为0.12~0.22）,但它们与其他3个小型猪种有较大的遗传差异（奈氏标准遗传距离为1.61～1.96）,与3个外来猪种的遗传差异更大（奈氏标准遗传距离为1.99～3.30）。通过聚类分析,可将这些猪种清晰地分为3大类,久仰、剑白、从江和环江4个香猪类群紧密地聚为一类,其他3个小型猪种聚为一类,3个外来猪种聚为另一类。这一结果基本符合这些猪种的地理分布和品种来源。
     

五种品系猪亲缘关系的RAPD分析

应用190个RAPD引物对贵州小型猪,巴马小型猪、西双版纳近交系小耳猪JB和JS亚系、荣昌猪Ⅰ系、长白猪的亲缘关系进行了初步分析,其中39个引物的扩增结果具有非常明显的品系间多态性,将其扩增结果以RAPDistance package Version 1?04程序进行分析,计算相对遗传距离指数1－F,再用NJ法进行聚类分析,构建系统树。结果表明,三种小型猪相互间亲缘关系较近,尤以贵州小型猪与巴马小型猪更近。荣昌猪Ⅰ系和长白猪关系较近,但与小型猪关系较远。 关键词：随机扩增多态DNA;小型猪;亲缘关系 The phylogenetic relationship of five species of pigs including Guizhou miniature pig,Bama pig,Xisuangbanna inbred pig,Rongchang Pig and Landrance was studied by RAPD analysis.Thirty-nine single polymorphic primers were selected out of 190 primers.The amplified fragments of thirty-nine primers were analysed by the RAPDistance package version 1.04 and the phylogenetic tree was constructed using NJ method.The results indicated as the following: three strains of miniature pigs have close phylogenetic relationship and the phylogenetic relationship between Guizhou miniature pig and Bama miniature pig was much closer.Landrance and Rongchang pig have close phylogenetic relationship too,but their phylogenetic relationship is far from the three strains of miniature pigs.