结直肠癌的Wnt信号通路相关基因突变的研究

目的探究AXIN1、AXIN2基因多态性与结直肠癌遗传易感性的相关性。方法以临床确诊结直肠癌患者288例作为病例样本,健康对照者320例作为健康对照,使用激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术进行单核苷酸多态性(SNP)分型。SNP选择按照标签SNPs(tagSNPs)方法进行挑选,单体型的构建则应用SHESIS软件。结果等位基因模型下,AXIN1基因rs1805105等位基因增加结直肠癌的风险,OR值=1.53(1.351～1.732),P值0.001。其他相关SNP位点等位基因未发现相关性。逻辑回归分析显示AXIN1基因rs1805105 TT基因型相比,CT基因型与CC基因型与结直肠癌相关,P值均0.001。CT基因型联合CC基因型与TT基因型相比,结直肠癌的易感性风险比为3.212(2.466～4.184),P值0.001。单倍型分析显示AXIN1基因C-C-A单倍型与结直肠癌发病风险相关,OR=1.124(1.084～1.453),P值0.001。结论 AXIN1基因rs1805105基因多态性可能与结直肠癌的易感性相关。     

云南汉族非综合征性唇腭裂与p53基因多态性的相关性研究

目的:分析p53基因单核苷酸多态性(SNPs)位点的多态性,探究云南汉族非综合征性唇腭裂与p53基因的相关性。方法:选取2016年1月-2018年12月于笔者医院就诊的非综合征性唇腭裂患儿100例为试验组,选取医院同期无先天性畸形正常患儿100例为对照组。采用Taqman探针荧光定量PCR法对p53基因的SNPs位点rs12947788和rs1042522进行基因分型,并用χ^2检验和Logistic回归分析多态位点与非综合征性唇腭裂的相关性。结果:p53的基因SNPs位点rs12947788的等位基因变体A携带者(AA+GA vs GG)发生非综合征性唇腭裂的风险增加(OR=1.393,95%CI 1.030~1.884,P=0.032)。rs1042522(CC vs CG+GG)增加吸烟者母亲生下NSCL/P患儿的风险(OR=2.561,95%CI=1.146~5.721,P=0.022)。rs12947788(AA+GA vs GG)可明显增加有饮酒史母亲(OR=3.235,95%CI=1.158~9.040,P=0.025)生下NSCL/P患儿的风险。结论:云南汉族人群非综合征性唇腭裂与p53基因rs1042522、rs12947788多态具有一定的相关性。     

白介素-18基因多态性与结直肠癌易感性的关系

目的探讨白介素-18（m-18）基因单核苷酸多态性及其单倍型与结直肠癌易感性之间的关系。方法以170例结直肠癌患者和160名健康对照者为研究对象,应用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）的方法对IL．18基因-137G／C、-607C／A单核苷酸多态性进行基因分型,同时用SHEsis软件分析IL-18基因的连锁不平衡及单倍型频率。结果IL-18基因-607C／A多态性在结直肠癌患者和健康人群中的分布差异无统计学意义（P〉0．05）．而IL-18基因-137G／C多态性在两组人群中的分布差异有统计学意义（P〈0．05）。等位基因频率的相对风险分析显示．C等位基因携带者患结直肠癌的风险是G等位基因的1．814倍（OR=1．814,95％CI：1．246～2．642）。联合基因型分析显示,IL-18基因-137G／C、-607C／A单核苷酸多态性存在着强烈的连锁不平衡（ID＇｜=0．945）,-137C／-607A单倍型频率在结直肠癌患者中显著高于健康人群（P〈0．05）。-137C／-607A单倍型携带者显著增加了结直肠癌的发病风险（OR=1．637,95％CI：1．100～2．437）。结论IL—18基因-137G／C多态性和-137C／-607A单倍型与结直肠癌的发病具有相关性．其中-137C等位基因可能是结直肠癌的遗传易感基因。     

长链非编码RNA母系表达基因3多态性与胃癌关系的研究

目的探讨长链非编码RNA母系表达基因3(MEG3)多态性与胃癌的关系。方法选择2013年3月至2017年10月期间于云南省肿瘤医院住院治疗的汉族胃癌患者172例(胃癌组)及健康体检汉族个体224人(对照组)作为研究对象。采用Taq Man探针法对MEG3两个标签单核苷酸多态性(rs7158663和rs4081134)进行分型,并分析其与胃癌及其临床病理特征的关系。结果 MEG3 rs7158663以GG基因型作为参照,经χ~2检验并校正年龄和性别后发现, AG+AA基因型在胃癌组中的分布频率明显高于对照组[校正OR=1.71,95%CI为(1.14,2.56),P=0.010];以G等位基因作为参照,经χ~2检验并校正年龄和性别后发现, A等位基因在胃癌组中的分布频率明显高于对照组[校正OR=1.58,95%CI(1.15,2.19),P=0.005]。rs4081134多态性的基因型和等位基因在2组间比较差异均无统计学意义(P0.017)。MEG3 rs7158663和rs4081134两位点多态性与胃癌患者的临床病理特征均无关(P0.017)。结论 MEG3 rs7158663 AG+AA基因型可能是中国汉族人群胃癌的易感基因之一。     

瘦素基因启动子区-2548 G/A多态性与胆囊胆固醇结石的相关性分析

目的探讨瘦素基因启动子区-2548 G/A功能多态性与胆囊胆固醇结石之间的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术对118例胆囊结石患者和53例正常对照人群进行瘦素基因启动子区-2548 G/A基因多态性分析,研究等位基因和基因型分布规律。结果瘦素基因启动子区-2548 G/A多态性在2组中的分布差异有统计学意义,胆囊结石组中AA+GA基因型频率明显高于对照组(2χ=4.251,P=0.039),AA+AG基因型患胆囊结石的风险是GG基因型的2.813倍(OR=2.813,95%CI=1.020～7.757)。等位基因频率在2组中分布也存在差异,胆囊结石组A等位基因频率明显高于对照组(2χ=5.791,P=0.016),A等位基因携带者患胆囊结石的风险是G等位基因携带者的1.777倍(OR=1.777,95%CI=1.110～2.844)。结论瘦素基因启动子区-2548 G/A功能多态性与胆囊结石易感性有关,A等位基因是胆囊结石发病的遗传易感基因,G等位基因是胆囊结石的保护基因。     

基质金属蛋白酶-1基因多态性与结直肠癌易感性的荟萃分析

目的探讨通过系统评价人群MMP-1基因多态性在结直肠癌发生中的作用以揭示两者之间的相关性。方法通过检索MEDLINE、Embase、Cancerlit、AACR（American Associationfor Cancer Research）、中国生物医学文献数据库（CBMdisc）、中国知网、万方数据库等数据库,得到了5个关于MMP-1基因多态性和结直肠癌相关性的病例对照研究;利用Q-检验和I2检验以检验异质性,利用随机效应模型和固定效应模型以计算总的比值比（OR）、95%可信区间（CI）和总的效应P值。结果共选共5个病例-对照试验（case-control study）研究,其中包含599个结直肠癌病例和829个正常对照,MMP-1 1607 2G2G基因型和合并后的＊/2G基因型与结直肠癌发生相关性的OR和CI分别是[OR1.24,95%CI（0.79,1.96）;P=0.35]和[OR1.66,95%CI（1.14,2.42）;P=0.008]。结论 MMP-1 1607 2G2G基因型与结直肠癌发生可能无相关性,而2G等位基因携带者与结直肠癌的易感性显著相关。     

IL-17基因rs2275913多态性与胃癌易感性的Meta分析

目的:探讨IL-17基因rs2275913多态性与胃癌易感性的关系。方法:检索多个国内外数据库,收集有关IL-17基因GA多态性位点rs2275913(G197A)与胃癌易感性的病例-对照研究。筛选文献、提取数据和文献质量评价后,采用STATA 12.1统计软件进行Meta分析。结果:最终纳入10个病例-对照研究,其中病例组4 371例,对照组5 345例。Meta分析结果显示,IL-17基因rs2275913位点多态性的等位基因模型(A vs.G)(OR=1.22,95%CI=1.10~1.37)与相加模型(AA vs.GG)(OR=1.58,95%CI=1.23~2.04)胃癌风险增加,显性模型(AG+GG vs.AA)(OR=0.63,95%CI=0.48~0.84)、隐性模型(GG vs.AG+AA)(OR=0.86,95%CI=0.78~0.94)胃癌风险降低(均P0.05),但共显性模型(AG vs.AA+GG)(OR=0.91,95%CI=0.78~1.07)与罹患胃癌的风险无明显关系(P0.05)。结论:IL-17基因rs2275913多态性的与胃癌易感性密切相关。     

骨桥蛋白基因多态性与弱精子症的相关性分析

目的:探究骨桥蛋白(OPN)基因单核苷酸多态性(rs1126772、rs117291487、rs11730582、rs142608941、rs6813526)与男性弱精子症的关系。方法:选取135例弱精子症不育男性为病例组,239例有生育史的健康男性作为对照组,运用多重单碱基延伸PCR技术(SNaPshot)对OPN基因rs1126772、rs117291487、rs11730582、rs142608941、rs6813526位点进行基因分型检测,分析这5个位点多态性与男性弱精子症的相关性。结果:OPN基因rs1126772位点GA基因型和A等位基因与弱精子症发病风险存在相关性(GA vs AA:OR=0.55, 95%CI, 0.35～0.86,P=0.009;A vs G:OR=0.64, 95%CI, 0.46～0.89,P=0.007);rs11730582位点CT基因型和T等位基因与弱精子症发病风险相关(CT vs TT:OR=0.526, 95%CI, 0.34～0.82,P=0.009; T vs C:OR=0.60, 95%CI, 0.44-0.83,P=0.002),单倍型分析发现,AATCT单倍型可能具有降低弱精子症的发病风险(AATCT:OR=0.61, 95%CI, 0.42～0.88,P=0.008)。结论:OPN基因rs1126772和rs11730582位点多态性可能与降低弱精子症的发生相关。     

miR-143/145侧翼序列多态性与膀胱癌遗传易感性研究

目的 探讨miR-143/145侧翼序列rs4705342和rs4705343多态性与膀胱癌遗传易感性的关系。方法 采用基于医院的病例对照研究,收集106例膀胱癌患者和162例对照人群外周静脉血样本,TaqMan探针法和聚合酶链反应-限制性长度片段多态性分析rs4705342和rs4705343多态性。结果 rs4705342位点CC基因型和C等位基因显著降低了膀胱癌的发病风险（CC与TT相比,调整OR=0.30,95%CI:0.10～0.88,P=0.018;C与T相比,调整OR=0.60,95%CI:0.40～0.89,P=0.01）。 单倍型分析显示,rs4705342C-rs4705343T单倍型显著降低了膀胱癌的发病风险（OR=0.33,95%CI:0.15～0.74）。结论 miR-143/145侧翼序列rs4705342CC基因型可能是膀胱癌发病的保护因素。     

修复基因XRCC4多态性与膀胱癌易感性的Meta分析

目的 探讨XRCC4单核苷酸多态性与膀胱癌发病易感性的关联。方法 通过检索PubMed、CNKI和万方数据库,检索从1960年1月1日至2015年12月31日国内外已经公开发表的中、英文献,筛选合格文献行Meta分析。结果 最终纳入关于XRCC4基因多态性与膀胱癌易感性关联的病例-对照研究10项,计病例组2 689例,对照组2 915例。Meta分析结果显示,XRCC4基因rs28360317和rs1805377多态性位点与膀胱癌显著相关(rs28360317:B vs.A:OR=1.339,95%CI:1.088~1.649,P=0.006;BBvs.AA:OR=1.729,95%CI:1.137~2.629,P=0.010;BBvs.BA+AA:OR=1.638,95%CI:1.144~2.346,P=0.007;rs1805377:BAvs.AA:OR:1.242,95%CI:1.041~1.482,P=0.016;BA+BB vs.AA:OR=1.216,95%CI:1.023~1.445,P=0.027。以种族为依据的亚组分析揭示,XRCC4基因rs1805377多态性在高加索人群中与膀胱癌发病显著相关:B vs.A:OR=1.295,95%CI:1.070~1.566,P=0.008;BAvs.AA:OR=1.362,95%CI:1.101~1.684,P=0.004;BA+BB vs.AA:OR=1.348,95%CI:1.096~1.659,P=0.005。然而,XRCC4基因rs6869366和rs28360071多态性位点与膀胱癌的易感性无关。结论 XRCC4基因rs28360317和rs1805377单核苷酸多态性与膀胱癌发病风险呈显著正相关,可作为膀胱癌患者潜在诊断、筛查分子标志物。     

CIGALTl基因多态性与维吾尔族IgA肾病易感性的关联性分析

目的探讨β1,3-转移酶（C1GALTl）基因单核苷酸位点（SNP）rs9639031、rs5882115多态性与新疆维吾尔族IgA肾病（IgA ephropathy,IgAN）遗传易感性的关系。方法选取经肾活检明确诊断为IgAN的90例维吾尔族患者为实验组,以同期在同一医院体检的90例维吾尔族健康体检者作为对照组,2组的性别和年龄等相匹配。采集纳入研究对象的外周血,提取DNA,应用PCR法扩增C1GALT1因上2个SNP分别为rs9639031、rs5882115位点对应的基因片段;采用直接测序法检测2个SNP位点的基因型,分析rs9639031、rs5882115基因型及基因频率在2组间分布的差异,进一步分析C1GAT态性与IgAN发病的关系。结果（1）C1GALT1因SNPrs5882115中各基因型、等位基因频率在IgAN组与对照组的分布有显著性差异（基因型P=0．014,等位基因P=0．005）。IgAN组DI、Ⅱ型频率（32．2％、2．2％）较对照组（14．4％、1．1％）高,对照组DE）型频率（84．4％）较IgAN组（65．6％）高。单因素Logist回归分析显示,rs5882115多态性对IgAN患病风险可能有影响（P=0．005）,携带DI基因型的患病风险为携带DD基因型的2．874倍（OR=2．874,95％CI=1．3756．007）,而携带I等位基因的患病风险亦较携带D等位基因高（OR=2．469,95％CI=1．290～４.728）。（2）C1GALT1基因rs9639031中,IgAN组CC、CT、TT基因型及c、T等位基因频率分别为40．0％、42．2％、17．8％、61．1％、38．9％,对照组分别为32．2％、46．7oA、21．1％、55．6％、44．4％,但差异无统计学意义（P〉0．05）。结论C1GALTl基因上的SNP位点rs5882115多态性可能与维吾尔族IgAN发病风险有一定关系,但未发现C1GALT1基因上的SNP位点rs9639031多态性与维吾尔族IgAN发病风险的关联性。     

胃癌患者中hTERT启动子及外显子区域基因多态性的研究

目的:探讨端粒酶逆转录酶(hTERT)基因rs2853676和rs2853677位点单核苷酸多态性与胃癌遗传易感性的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法对297例胃癌患者、105例萎缩性胃炎患者及402例非萎缩性胃炎患者进行基因多态性分析,采用病理学诊断和13C尿素酶呼气试验(13C-UBT)检测幽门螺杆菌(Hp)感染情况。结果:rs2853676位点胃癌组AA基因型频率显著高于对照组(15.2%vs 6.5%),AA基因型携带者患胃癌风险增加2.47倍(95%CI 1.46-4.16);对照组、萎缩性胃炎组、胃癌组HP感染率分别为40.3%、64.8%、56.9%,与对照组相比,萎缩性胃炎组及胃癌组Hp感染率明显增加,差异有统计学意义(P均0.01),OR值分别为2.73(95%CI 1.74-4.26)、1.96(95%CI 1.44-2.67),经Logistic回归分析发现,Hp感染与基因突变无明显交互作用;rs2853677位点CC、TC、TT基因型频率在对照组、萎缩性胃炎组及胃癌组分布差异无统计学意义(P0.05)。结论:hTERT基因rs2853676基因多态性与胃癌遗传易感性有关,其增加胃癌风险与Hp感染可能无关。     

TERT基因多态性及HP感染与胃癌遗传易感性的研究

目的：探讨端粒酶逆转录酶（TERT）基因rs2075786单核苷酸多态性（SNP）、幽门螺杆菌（HP）与胃癌遗传易感性的关系。方法：采用聚合酶链反瘦一限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）法分析297例胃癌患者、105例萎缩性胃炎患者及402例非萎缩性胃炎患者的基因多态性,采用病理学诊断和13C尿素酶呼气试验（13C—UBT）检测幽门螺杆菌（Hp）感染。结果：rs2075786位点CC、TC、TT基因型频率在对照组与萎缩性胃炎组分布差异无统计学意义,胃癌组TT基因型频率显著高于对照组（25．6％VS125％）,TT基因型携带者患胃癌风险增加2．23倍（95％CI：1．46～3．40）,对照组、萎缩性胃炎组、胃癌组HP感染率分别为40．3％、64．8％、56．9％,差异有统计学意义（P〈0．01）,OR值分别为2．73（95％CI：1．74～426）、196（95％CI：1．44～2．67）。经Logistic回归分析,发现Hp感染与基因突变无明显交互作用。结论：TERT基因rs2075786基因多态性与胃癌遗传易感性有关。     

脂氧酶12 编码区遗传变异与胃癌发病的关系

目的：探讨位于脂氧酶12（LOX12）基因编码区Arg261Gln单核苷酸多态与胃癌发病风险的关系。方法：用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析（PCR-RFLP）方法检测148例胃癌患者和148例无肿瘤正常对照人群的LOX12的基因型,并以Logistic回归模型计算各基因型与胃癌发病风险的关系。结果：LOX12 Arg261Gln等位基因频率在胃癌组中（0.544）高于正常组（0.443）。与Arg/Arg基因型携带者相比,Gln/Gln基因型携带者发生胃癌的风险增加（OR=2.26,95%CI=1.15~4.46,P=0.018）,而杂合基因型Arg/Gln不增加胃癌发病风险（OR=1.37,95%CI=0.77~2.44,P=0.284）。结论：LOX12编码区Arg261Gln遗传变异可能是胃癌发病的重要遗传易感因素。     

新疆维吾尔族HLA—A、HLA-B基因多态性与HBV感染结局的相关性

目的：研究HLA-A、HLA-B基因多态性与新疆维吾尔族人群HBV感染结局的相关性。方法临床收集自限HBV感染者50例（RHBS组）、慢性HBV携带者80例（ASC组）、CHB患者100例（CHB组）,采用PCR-SSP法检测HLA-A、HLA-B基因型,比较组间基因频率差异。结果 HLA-A＊33在CHB组分布频率（2.50%）显著低于ASC组（8.75%）,差异具有统计学意义（χ2=7.355,P =0.007,OR =0.248,95%CI 0.085～0.722）。HLA-A＊33在RHBS组分布频率（1.00%）低于ASC组（8.75%）（χ2=7.242,P =0.007,OR =0.96,95%CI 0.012～0.756）,差异具有统计学意义。HLA-B＊52在CHB组分布频率（7.50%）高于ASC组（1.88%）,差异具有统计学意义（χ2=8.757,P =0.003,OR =5.634,95%CI 1.596～19.887）。HLA-B＊52在RHBS组分布频率（11.00%）高于ASC组（1.88%）（χ2=10.665,P =0.001,OR =7.239,95%CI 1.908～27.467）,差异具有统计学意义。结论 HLA-A、HLA-B基因多态性影响HBV感染临床结局,HLA-A＊33基因与病毒携带状态有关。HLA-B＊52基因具有较强的抗HBV感染能力,临床上易表现为HBV一过性感染或慢性乙型肝炎。     

DNA损伤修复基因XRCC1 Arg194Trp基因多态性与中国人群结直肠癌易感性的Meta分析

【摘要】 目的 探讨DNA损伤修复基因XRCC1 Arg194Trp基因多态性与中国人群结直肠癌易感性的关系。方法 按照制定的检索策略,通过计算机和手工检索相关数据库,收集有关XRCC1 Arg194Trp基因多态性与中国人群结直肠癌易感性的病例对照研究,按照纳入标准筛选文献、并从纳入文献中提取相关数据,以病例组和对照组基因型分布的比值比(OR)为效应指标,应用Stata12.0软件进行异质性检验,对各研究原始数据进行Meta合并,并行敏感性分析和发表偏倚的评估。结果〓本Meta分析共纳入11项病例对照研究,累积病例2710例,对照3567例。根据各研究间的异质性,采用不同的模型进行合并效应量。在等位基因比较(T vs C) [OR(95%CI)=1.18(1.01-1.39),P=0.036],纯合子比较模型(TT vs CC) [OR (95%CI)=1.39(1.02-1.90),P=0.038],显性模型(CT/TT vs CC) [OR(95%CI)=2.24(1.78-2.82),P<0.001] 以及隐性模型 (TT vs CT/CC) [OR(95%CI)=1.23(1.02-1.49),P=0.030]均存在显著的统计学差异。发表偏倚评估均未见明显偏倚。结论〓在中国人群中,携带突变等位基因T或突变纯合子TT的人群罹患CRC的风险有所升高,而在显性遗传模型中,携带有CT/TT基因型的人群其CRC的易感性明显升高。     

MicroRNA-34b/c rs4938723 T>C多态性与中国汉族人群肾细胞癌易感性的相关性

目的研究中国汉族人群microRNA-34b/c启动子区TC(rs4938723)多态性与肾细胞癌易感性之间的关系。方法采用病例对照研究模式,通过TaqMan探针PCR法检测年龄和性别匹配的710例中国汉族人群肾细胞癌患者和760例正常人群的microRNA-34b/c启动子区TC(rs4938723)基因型,探讨该位点基因多态性与肾细胞癌易感性之间的关系。结果与TT/TC基因型携带者相比,CC型(OR=1.53,95%CI=1.06~2.21,CC基因型比TT基因型;OR=1.48,95%CI=1.05~2.10,CC基因型比TT/TC基因型)携带者发生肾细胞癌的危险性明显升高。分层分析显示携带CC基因型的老年患者(OR=1.80,95%CI=1.08~3.01)、男性患者(OR=1.64,95%CI=1.08~2.51)、吸烟患者(OR=2.07,95%CI=1.16~3.69)及饮酒患者(OR=1.94,95%CI=1.01~3.73)发生肾细胞癌的危险性明显升高。结论 microRNA-34b/c启动子区TC(rs4938723)基因多态性与我国汉族人群肾细胞癌易感性有关,CC型携带者发生肾细胞癌的危险性要明显高于TT/TC型携带者。     

甲基化转移酶基因多态性与前列腺癌发病的相关性研究

目的:探讨DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)(rs16999593,rs2228611)及DNMT3B(rs2424908)基因多态性与南京地区前列腺癌发病风险及病理特征的相关性。方法:采用病例对照研究,招募前列腺癌患者155例设为病例组及155例正常男性设为对照组。采用Mass ARRAY分子量阵列技术进行基因分型技术检测3个多态性位点的基因型。采用Logistic回归模型分析各基因型与前列腺癌发生的关系及其病理参数的关系。结果:rs16999593位点的各基因型在2组中分布频率有显著性差异(P=0.041),CT基因型(OR=0.61,95%CI 0.38~0.99,P=0.043)及CT/CC(OR=0.59,95%CI 0.39~0.92,P=0.017)基因型在对照组的频率显著高于病例组。rs2424908的各基因型在两组中分布有显著性差异(P=0.025),CT基因型(OR=0.73,95%CI 0.58~0.91,P=0.007)及CT/CC基因型(OR=0.57,95%CI 0.36~0.94,P=0.023)在对照组的频率显著高于病例组。在Gleason分级7的病例组中,rs16999593CT/CC(OR=0.47,95%CI 0.28~0.85,P=0.008)及rs2424908CT/CC(OR=0.46,95%CI 0.26~0.85,P=0.009)基因型的频率均显著低于对照组。而在Gleason分级≥7的分组中上述3个多态性位点的基因型频率与对照组均无显著性差异(P均0.05)。结论:DNMT1基因rs16999593CT/CC及DNMT3B基因rs2424908CT/CC基因型与前列腺癌的低风险相关,且与Gleason低评分相关。