吉林省致泻大肠埃希氏菌分子分型与耐药性研究

目的了解吉林省食源性疾病患者中致泻大肠埃希氏菌的毒力基因分布、流行特征、耐药情况、以及PFGE分子分型特征,为致泻大肠埃希氏菌的监测、爆发预警、耐药抗生素规避使用提供依据。方法对2016年从吉林省食源性疾病患者粪便中获得的26株致泻大肠埃希氏菌进行生化鉴定、多重PCR检测毒力基因、MIC微量肉汤稀释法药敏实验以及PFGE脉冲场凝胶电泳分子分型。结果26株致泻大肠埃希氏菌中13株(50%)为EAEC;7株(26.92%)为EPEC;4株(15.38%)为ETEC;2株(7.69%)为EHEC;对四环素、甲氧苄啶/磺胺甲噁唑、环丙沙星耐药极为严重,分别高达92.30%、88.46%和84.62%;XbaI酶切后进行PFGE脉冲场凝胶电泳分为23个型别。结论吉林省腹泻患者中致泻大肠埃希氏菌感染类型以EAEC为主,存在混合感染情况;耐药、多重耐药情况较为严重应加强规范抗生素的使用;在DNA水平上呈现出多态性。     

2015~2019年北京市海淀区食源性腹泻患者致泻大肠埃希氏菌型别分布和耐药性分析

目的　分析北京市海淀区食源性腹泻患者致泻大肠埃希氏菌(diarrheagenic Escherichia coli,DEC)的感染状况、型别分布和耐药情况,为致泻大肠埃希氏菌的防控和临床合理用药提供科学依据。方法　对2015~2019年海淀区食源性疾病监测哨点医院送检的1 810份腹泻患者粪便标本直接划线接种在麦康凯培养基上培养,挑取可疑菌落进行生化鉴定、毒力基因测定,对确认为致泻大肠埃希氏菌的菌株进行药敏检测。结果　1 810份粪便标本中检出致泻大肠埃希氏菌214株,检出率为11.8%,各年度的检出率差异有统计学意义（χ2=10.858,P=0.028）。检出的致泻大肠埃希氏菌共有4种型别,其中集聚性大肠埃希氏菌（EAEC）96株（44.9%）,产肠毒素大肠埃希氏菌（ETEC）89株（41.6%）,肠道致病性大肠埃希氏菌（EPEC）24株（11.2%）,肠道侵袭性大肠埃希氏菌（EIEC）5株（2.3%）。在12种抗生素的药敏试验中,70株（32.7%）全部敏感,144株（67.3%）耐药;氨苄西林的耐药率最高（54.7%）,其次是四环素（38.8%）和复方磺胺（36.9%）,对3种及以上抗生素的多重耐药率为46.3%。结论　北京市海淀区2015~2019年致泻大肠埃希氏菌感染以EAEC和ETEC为主,耐药菌株的多重耐药谱广。应加强对抗生素的使用管理,延缓耐药株的产生和传播。     

746例婴幼儿秋季腹泻大便标本致泻性大肠菌群分析

目的 对婴幼儿秋季腹泻标本进行致泻性大肠菌群分析.方法 对746例大便标本严格按照致病性大肠埃希菌分离鉴定程序操作分离致病菌,接种血平板和麦康凯平板,筛选出大肠埃希菌,做致病性大肠埃希菌鉴定和药敏试验.结果 共检测出45例致泻性大肠菌群,阳性率为6.03%,以致病性大肠埃希菌(EPEC)为主,血清型分布较广泛,最多见为O127a:K63,共8例,占17.8 %,见2株肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)(4.4%).药敏结果显示耐药率较高,产ESBLs菌达68.9%.结论 婴幼儿秋季腹泻除常见沙门志贺菌外,致泻性大肠菌也是重要的致病菌群,且耐药情况较严重,临床实验室应加强致泻性大肠菌的分离培养.     

2015-2019年上海某院致泻性大肠埃希菌流行与耐药特征

目的 了解上海市青浦区腹泻病监测定点医院上海复旦大学附属中山医院青浦分院(以下简称该院)2015-2019年腹泻门诊致泻性大肠埃希菌的流行和耐药特征。方法 收集该院2015-2019年腹泻门诊患者中经传统细菌学分离鉴定的致泻性大肠埃希菌菌株,使用微量肉汤稀释法测定抗菌药物敏感性,进行耐药性分析。结果 2015-2019年该院腹泻门诊患者中致泻性大肠埃希菌的检出率为11.42%(513/4 494),主要为肠产毒性大肠埃希菌(66.08%、339株),其次为肠致病性大肠埃希菌(18.91%、97株)和肠集聚性大肠埃希菌(14.42%、74株)。完成500株致泻性大肠埃希菌的药物敏感性试验,耐药以萘啶酸(60.20%)最严重,其次为氨苄西林(57.80%),其他依次为复方磺胺甲噁唑(31.40%)、磺胺异噁唑(30.20%)和四环普林(27.60%)。各毒力分型致泻性大肠埃希菌对不同抗菌药物的耐药性不同,肠产毒性大肠埃希菌对11种抗菌药物的耐药率低于肠致病性大肠埃希菌、肠集聚性大肠埃希菌,差异有统计学意义(P<0.05)。2015-2019年多重耐药(MDR)率为46.40%;不同毒...     

2016年福建省永安及南平监测点五种致泻性大肠埃希菌监测分析

目的 对福建永安及南平两个检测哨点2016年的281份腹泻病例进行5种致泻性大肠埃希菌病原检测,为病例的确诊及致泻性大肠埃希菌流行病学的提供实验数据.方法 收集281份其他感染性腹泻病例(排除霍乱、菌痢、伤寒副伤寒)的粪便标本,接种麦康凯平板,选取初步生化符合大肠杆菌的菌落,然后用致泻性大肠埃希菌多重PCR和单重PCR检测方法确定其致病型别.结果 281份腹泻病例粪便标本共检出致泻性大肠埃希菌17株,检出率6.05%,其中aEPEC 4株,ETEC 6株,EAEC 7株,其他型别未检出.结论 福建地区致泻性大肠埃希菌致病型别以aEPEC,ETEC,EAEC为主,多重PCR检测方法能有效的对致泻性大肠埃希菌病进行确诊及了解菌株的毒力基因携带情况,并为我省的致泻性大肠埃希菌的流行病学资料的积累及疾病防控提供快速客观的依据.     

安徽省马鞍山市2014-2018年腹泻患者中致泻性大肠埃希菌病原学及流行特征分析

目的了解安徽省马鞍山市腹泻患者中致泻性大肠埃希菌（DEC）的感染情况、毒力基因、耐药性以及分子分型,为DEC的防治提供依据。方法2014 — 2018年,对马鞍山市三家哨点医院门诊急性腹泻患者粪便标本进行DEC的分离、鉴定与毒力基因检测,并对阳性菌株进行药敏试验及脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型。结果1 711份腹泻粪便标本中有120份检出阳性,共分离得到123株DEC,标本检出阳性率为7.01%。 DEC阳性病例年龄分布以0～5岁的婴幼儿及20～39岁青壮年为主;病例集中在夏季（6 — 8月）。 DEC分型中以肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）和肠致病性大肠埃希菌（EPEC）为主,分别占58.54%和31.71%。 123株DEC菌株的药敏试验结果显示,超广谱β-内酰胺酶（ESBL）阳性菌株耐药严重,所有菌株耐≥6种药物。 PFGE分子分型产生119种带型,带型相对分散,相似度为49.7%～97.7%。结论2014 — 2018年马鞍山市腹泻患者DEC的感染类型以ETEC和EPEC为主,存在年龄及季节分布特征,本地分离DEC菌株的耐药程度较为严重,PFGE带型分散,应控制抗生素的滥用,重点关注ETEC或EPEC的流行风险。     

食品和公共场所从业人员致泻性大肠埃希菌携带情况分析

目的了解食品和公共场所从业人员的致泻性大肠埃希菌携带情况。方法 2013年4月至2014年12月对新建县食品和公共场所从业人员采集肛拭子标本共计3032例,进行致泻性大肠埃希菌的检测。按照GB4789.6—2003对致泻性大肠埃希菌进行生化鉴定、血清学分型,用荧光PCR进行分子生物学鉴定。结果 3032例标本中,共检出致泻性大肠埃希菌12株,检出率为3.96‰,其中食品从业人员1694例检出11株,公共场所从业人员1338例检出1株;沙门菌3株,检出率为0.99‰;志贺菌2株,检出率0.66‰,致泻性大肠埃希菌的检出率明显高于沙门菌、志贺菌的检出率。检出的12株致泻性大肠埃希菌有7株肠侵袭性大肠埃希菌,其中1株携带毒力基因ipa H;5株肠致病性大肠埃希菌,其中2株携带毒力基因,分别为eae和bfp。结论在食品从业人员预防性健康体检项目中增加致泻性大肠埃希菌的检测具有一定的可行性,为预防和控制腹泻病病原及食源性食物中毒等有重要意义。     

儿童肠道感染中致泻性大肠埃希菌的检测

目的了解儿童肠道感染中致泻性大肠埃希菌的感染情况。方法对95份腹泻患儿粪标本中分离出的大肠埃希菌,用荧光聚合酶链反应（PCR）的方法检测毒力基因,鉴定致泻性大肠埃希菌。结果检测出15株阳性菌株,阳性率为15．8％,其中肠聚集性大肠埃希菌（EAEC）6株、肠致病性大肠埃希菌（EPEC）4株、弥散聚集性大肠埃希菌（DAEC）4株和肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）1株。结论致泻性大肠埃希菌是引起儿童腹泻的主要致病菌,临床实验室应加强对致泻性大肠埃希菌的检测。     

产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希氏菌感染的监测

目的　了解临床病人感染大肠埃希氏菌超广谱 β 内酰胺酶 (ESBLs)产生情况及耐药性。 方法　采用表型确认实验检测ESBLs ,用Kirby Bauer琼脂扩散法作药敏实验 ;ESBLs阳性菌株进行 14种抗生素的药敏实验。结果　 16 8株大肠埃希氏菌中 ,共检出产ESBLs菌 30株 ,检出阳性率为 17 9% ,以呼吸道和泌尿道感染为主。对青霉素类、头孢菌素类、喹诺酮类或氨曲南几乎全部耐药 ,对亚胺培南、阿莫西林 /克拉维酸敏感。结论　大肠埃希氏菌产ESBLs菌株对大多数抗生素耐药 ,故应重视ESBLs的检测。根据细菌耐药特性 ,合理使用抗生素。     

产ESBLs大肠埃希菌对抗生素的耐药性分析

目的：探讨产与非产ESBLs大肠埃希菌对抗生素耐药性的差异,指导临床合理用药。方法：应用WHONET 5.0分析我院临床分离的201株大肠埃希菌的药敏情况。结果：大肠埃希菌对头孢替坦、亚胺培南、美洛培南和哌拉西林/他唑巴坦未发生耐药 对丁胺卡那霉素、妥布霉素和呋喃妥因的耐药性较低而对其他种类抗生素已高度耐药,临床不宜选用 产ESBLs的大肠埃希菌对多种抗生素耐药率明显高于非产ESBLs株。结论：及时掌握医院大肠埃希菌的耐药状况与变迁趋势,对临床合理用药有重要的指导意义。     

临床来源碳青霉烯耐药大肠埃希菌药物敏感性及分子流行病学特征分析

目的 探讨临床分离的碳青霉烯耐药大肠埃希菌药物敏感性特征及分子流行病学特征,为院内感染控制及临床治疗提供基础数据。方法 收集某医院临床分离的21株对碳青霉烯类药物耐药的大肠埃希菌,采用琼脂稀释法测定菌株对11种临床常用药物的最低抑菌浓度（MIC）;Carba NP试验检测菌株产碳青霉烯酶情况;采用PCR扩增及序列比对检测耐药基因（包括blaNDM、blaKPC、blaIMP、blaVIM、blaOXA）携带状况;采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）和多位点序列分型（MLST）对菌株进行分子分型。结果 21株碳青霉烯耐药大肠埃希菌中,对哌拉西林、头孢吡肟、头孢曲松、头孢他啶等-内酰胺类药物和左氧氟沙星耐药率为100.00%;对甲氧苄啶-磺胺甲恶唑的耐药率也高达76.19%;对米诺环素、阿米卡星和磷霉素的耐药率相对较低,分别为23.81%、23.81%和19.05%。Carba NP试验阳性菌株17株,均携带blaNDM-1基因,其余4种基因检测均为阴性。MLST显示21株菌株共有9种ST型别,其中携带blaNDM-1基因的大肠埃希菌主要为ST167型和ST540型。PFGE显示来自泌尿外科的3株菌株电泳图谱完全相同,另外来自不同病房的2株菌株电泳图谱也完全相同,提示医院内存在同一克隆菌株传播的可能。结论 该医院碳青霉烯耐药大肠埃希菌基因型分布呈现多态性;对碳青霉烯类药物耐药的机制主要是携带blaNDM-1基因;携带该基因的大肠埃希菌对临床常用抗菌药物往往呈现多重耐药,给临床治疗带来了困难。加强对碳青霉烯耐药菌株基因型和耐药基因的检测,将对减缓或阻断耐药菌的传播具有重要意义。     

血清群6肺炎链球菌分子分型与耐药特征研究

目的 比较不同方法鉴别血清群6肺炎链球菌不同血清型的能力,了解血清群6肺炎链球菌的耐药性与分子特征。 方法 采用荚膜肿胀分型方法与聚合酶链反应(PCR)分型方法鉴别33株血清群6肺炎链球菌的血清型及相应的基因型;检测菌株对6种常用抗生素的敏感性;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法分析不同血清型菌株的基因组特征。 结果 PCR分型方法与传统的血清学分型方法结果一致。全部菌株对阿奇霉素均耐药,对利福平及左氧氟沙星均敏感;6B型菌株呈现较高的多重耐药特征。根据PFGE带型特征,所有菌株可分为2个簇,6C菌株之间、6B菌株之间带型呈现较高相似性。 结论 PCR分型方法可用于鉴别血清群6菌株的不同血清型;菌株耐药情况严重,且大多数菌株呈多重耐药特征;PFGE对鉴别肺炎链球菌不同菌株间的差异有较高的分辨率。     

Antibiotic resistance and molecular epidemiology of Escherichia coli O26, O103 and O145 shed by two cohorts of Scottish beef cattle

OBJECTIVES: The aim of this study was to identify the profile of antibiotic resistance among E. coli O26, O103 and O145 in two cohorts of Scottish beef cattle on two farms and to determine whether there is an association between resistant phenotypes and the genotypic PFGE patterns to suggest clonality among resistant strains. METHODS: MICs of 11 antibiotics for 297 E. coli O26, 152 E. coli O103 and 13 E. coli O145 were determined. Isolates were screened for the presence integrons 1 and 2 and the virulence factors stx1, stx2, eaeA and ehxA by PCR with specific primers. PFGE subtyping was performed after digestion with XbaI endonuclease. RESULTS: Among E. coli O26, O103 and O145 there were four, four and one isolates, respectively, that harboured a class 1 integron. A class 2 integron was detected in only one O145 isolate. Diversity in PFGE patterns was higher among E. coli O103 and O145 strains compared with the O26 serotype; and PFGE demonstrated 13, 27 and 6 different patterns among O26, O103 and O145 isolates, respectively. Selective PFGE types that harboured virulence factors were widespread among the cattle population throughout the sampling period. There were multiply resistant isolates that were of similar PFGE patterns. CONCLUSIONS: The dissemination and persistence of certain PFGE genotypes among the cattle population was evident in this study. Certain resistance phenotypes, especially among E. coli O26 isolates, were associated with distinct PFGE clones.     

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌不同来源株耐药性及流行特征分析

目的 探索耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）在动物食品、动物临床及人医临床中的分布和流行情况,对其耐药情况进行研究分析,为控制MRSA的感染和临床用药提供理论支持。方法 对采集安徽省不同地区动物食品、动物临床及人医临床的标本进行分离培养。采用法国生物梅里埃公司的Vitek全自动微生物分析系统,对分离菌株进行细菌鉴定和药敏试验;应用聚合酶链反应（PCR）方法检测mecA基因;应用脉冲场凝胶电泳（PFGE）对MRSA进行脉冲电泳,BioNumerics软件进行聚类分析。结果 从安徽省淮北、合肥和马鞍山地区共采集动物性食品450份、动物临床标本90份、人医临床标本150份。共分离MRSA 82株,其中动物性食品MRSA（Food-MRSA）14株、动物临床MRSA（La-MRSA）23株、人医临床MRSA（Hu-MRSA）45株,分离培养率为3.1%、30.0%和25.6%;不同来源的MRSA菌株对万古霉素、达福普丁和利奈唑胺100%敏感;对青霉素和苯唑西林100%耐药;对头孢唑啉、红霉素、克林霉素、四环素、庆大霉素、左氧氟沙星、利福平、甲氧嘧啶和氨苄西林有不同程度的耐药,但不同来源MRSA间无差异。82株不同来源的MASA经PFGE分型可分为49个型别,同源性较低。结论 动物临床标本和人医临床标本的MRSA的分离培养率显著高于动物食品的分离率,不同来源的MRSA在药物敏感性方面差异无统计学意义。PFGE 和聚类分析显示,安徽省不同地区不同来源的MRSA其亲缘关系较远,显示其菌株来源的多克隆特征。     

婴幼儿腹泻感染的非伤寒沙门菌分子分型和耐药情况研究

目的研究婴幼儿感染的非伤寒沙门菌的分子流行病学特点和耐药情况。方法收集上海地区腹泻婴幼儿粪便标本,进行沙门菌的分离培养,生化鉴定,血清型分型,分子分型和药物敏感性检测实验。结果 583份婴幼儿粪便中分离出沙门菌共19株,主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)带型相似度较高(88.7%),且主要带型为上海近年流行的优势带型。药物敏感性实验结果显示,菌株对测试的15种抗生素的总体耐药率为78.95%(15/19),对萘啶酸(68.42%)和氨苄西林(63.20%)的耐药率较高,对环丙沙星(10.53%)和庆大霉素(10.53%)的耐药率较低,对三代头孢类抗生素的耐药率较高(40%)。菌株耐药谱分布广泛,发现多重耐药菌株13株。结论本研究中,婴幼儿感染的非伤寒沙门菌耐药情况比较严重;不同血清型和分子分型的菌株耐药性差异无统计学意义。     

北京市昌平区食源性金黄色葡萄球菌药敏分析及分子流行病学特征研究

目的 对北京市昌平区2011-2014年分离获得的74株食源性金黄色葡萄球菌耐药谱、毒力因子编码基因携带情况和分子流行病学特征进行研究分析,为金黄色葡萄球菌食源性疾病的预防控制提供参考。方法 依据GB 4789.10-2010进行菌株分离和鉴定,用全自动微生物鉴定及药敏分析系统VITEK2 Compact进行16种药物敏感性试验,并使用检测试剂盒进行－内酰胺酶的检测;利用PCR方法检测分离菌株肠毒素,杀白细胞素和耐热磷酸酶等毒力因子编码基因;脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法对分离株进行分子分型。结果 74株金黄色葡萄球菌中68株(91.89%)有不同程度的耐药,其中对青霉素耐药率(87.84%)最高,其次为红霉素(44.59%)和克林霉素(39.19%)。毒力因子检测结果显示肠毒素阳性率64.86%(48/74),产2种以上肠毒素菌株占72.92%(35/48)。耐热磷酸酶阳性率89.19%,杀白细胞素编码基因lukF阳性率77.03%。PFGE分型结果显示除9株菌不可分型外,其余65株菌分为40个不同型别,无优势型别。结论 昌平区2011-2014年分离的食源性金黄色葡萄球菌具有较强的耐药性、分子多态性和毒力因子携带率较高的特征,说明这些菌株可以导致潜在的食品安全问题。     

不同来源STECO157:H7生物学特性研究

目的 探讨浙江省产志贺毒素大肠埃希菌O157:H7菌株PFGE分型及携带毒力基因以及耐药情况.方法 菌株生化、血清鉴定按API 20E鉴定系统;大肠杆菌O157:H7诊断血清凝集试验;采用聚合酶链反应(PCR)法检测O、H抗原及毒力基因SLT1、SLT2、Hly、eaeA;STEC O157:H7分型用脉冲场凝胶电泳(pulse field gel electrophoresis,PFGE)方法进行;14种抗生素进行药敏试验采用K-B法.结果 5株可疑菌株经生化和血清鉴定符合O157:H7特性;毒力基因检测所有分离株SLT2、Hly、eaeA三种毒力基因均阳性而SLT1均阴性;脉冲场凝胶电泳分型结果显示,有2株菌PFGE电泳条带完全相同,其余3株菌电泳条带不同,5株菌共分为4个带型;经耐药性分析,菌株对头孢噻吩、头孢噻肟、庆大霉素、环丙沙星100%敏感;对复方新诺明、氨苄西林100%耐药.结论 STEC O157:H7菌株在浙江省一些地区存在,并且携带SLT2毒力基因,PFGE型别较多,同时也有人间感染病例的出现,提示应加强O157:H7监测力度,防止该菌在人间的感染和流行.     

2007-2011年江苏省南京市细菌性痢疾病原学监测结果分析

目的 对江苏省南京市2007-2011年细菌性痢疾的血清群(型)分布、耐药谱、毒力基因携带情况及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,为江苏省南京市细菌性痢疾的防控提供依据。 方法 对从江苏省南京市2007-2011年各医院腹泻病患者中分离的75株志贺菌进行血清群(型)、耐药性和毒力基因检测,并进行PFGE分子分型。 结果 75株志贺菌包括宋内志贺菌54株(72.0%),福氏志贺菌21株(28.0%),除2010年福氏X型为优势血清型外,其余年份宋内志贺菌为优势血清群;75株菌普遍对氨苄西林、四环素和磺胺甲恶唑耐药,耐药率在61.1%~95.2%之间;三重及以上耐药菌株占所有测试菌株的88.0%;毒力基因ipaH、sen、set1、ial阳性率分别为100%、46.7%、24.0%、48.0%;福氏志贺菌优势毒力基因模式为Ⅰ型(66.7%),宋内志贺菌优势基因模式为Ⅶ型(61.1%)和Ⅳ型(25.9%);宋内志贺菌分为20个PFGE基因型,其中以S7、S8、S10三个带型为主,占宋内志贺菌的 53.7%;相似度>95%,可能来自于同一克隆系;福氏志贺菌分为17种带型,各带型较散在分布。 结论 江苏省南京市志贺菌流行菌群不断变迁,宋内志贺菌有取代福氏志贺菌成为流行菌群的趋势;多重耐药现象严重;福氏志贺菌优势毒力基因模式为Ⅰ型、宋内志贺菌为Ⅶ型和Ⅳ型;PFGE型别呈现多元化流行特点。     

2012－2018年江苏省无锡市肠炎沙门菌药物敏感性与分子分型研究

  目的   分析2012 — 2018年江苏省无锡市肠炎沙门菌分离株的药物敏感性和分子分型。   方法   收集2012 — 2018年分离自无锡市食源性疾病监测哨点医院门诊腹泻患者、从业体检人员、食物中毒以及环境水样监测的110株肠炎沙门菌菌株,采用BD Phoenix全自动细菌鉴定/药敏系统测试方案和脉冲场凝胶电泳（PFGE）方法,进行药物敏感性试验和PFGE分子分型分析。   结果   110株肠炎沙门菌对环丙沙星、厄他培南、亚胺培南、美罗培南、阿奇霉素和头孢他啶/阿维巴坦6种抗生素均敏感,对萘啶酮酸、氨苄西林和氨苄西林/舒巴坦的耐药率较高;77（70.00%）株菌为多重耐药,以耐3种抗生素为主（45.45%,50/110）。PFGE将110株菌分为39个带型,各带型包含1～31株菌,EN17、EN21和EN24为优势带型。   结论   无锡市肠炎沙门菌耐药状况严重,应引起重视,菌株的分子分型多样,具有优势带型。