普通烟草NAC转录因子家族抗逆基因筛选与表达分析 |
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引用本文: | 余世洲,杨志晓,余婧,宋时浩,张孝廉,赵会纳,张长云,林英超,雷波.普通烟草NAC转录因子家族抗逆基因筛选与表达分析[J].中国烟草学报,2022,28(2):111-121. |
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作者姓名: | 余世洲 杨志晓 余婧 宋时浩 张孝廉 赵会纳 张长云 林英超 雷波 |
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作者单位: | 1.贵州省烟草科学研究院,烟草行业分子遗传重点实验室,贵阳市观山湖区龙滩坝路29号 550081 |
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基金项目: | 烟草基因组计划重大专项110202001027(JY-10)中国烟草总公司贵州省公司项目2021XM05贵州省科学技术基金项目黔科合基础[2020]1Y106 |
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摘 要: | 背景和目的 NAC(NAM/ATAF/CUS2)家族是植物特有且最大的转录因子家族之一,广泛参与植物的生长发育调控和逆境胁迫应答。为筛选烟草抗逆NAC目标基因。 方法 以公开的普通烟草品种K326的注释蛋白序列为参考,与拟南芥NAC蛋白序列同源比对,结合功能域分析,进行普通烟草的NAC转录因子鉴定,并利用生物信息学软件分析各烟草NAC转录因子的理化性质及系统进化关系。使用普通烟草TobEA表达谱数据对烟草NAC家族成员组织表达模式进行分析,通过qRT-PCR检测候选抗逆基因所在亚组AtNAC3和ATAF各成员在干旱、冷害、盐、ABA处理下的基因表达情况。 结果 从普通烟草中共鉴定出190个NtabNAC蛋白,平均氨基酸长度为347,除NtabNAC190外,其余蛋白为亲水性蛋白,大多数定位在细胞核。根据系统进化分析,将拟南芥和烟草NAC家族基因划分为18个亚组,各亚组基因在不同组织中显示表达特异性。AtNAC3和ATAF亚组的9个烟草NAC基因,在受到干旱、冷害、盐和ABA处理后基因表达量上调,且NtabNAC004、NtabNAC087和NtabNAC175表达量变化最为明显。 结论 NtabNAC004、NtabNAC087和NtabNAC175参与了烟草植株的逆境胁迫调控,研究结果有助于烟草抗逆调控网络解析和后续抗逆育种。
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关 键 词: | 普通烟草 NAC基因家族 转录因子 系统发育 表达模式 非生物胁迫 |
收稿时间: | 2021-09-08 |
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